Gene sequences

How To ▶︎

JA

EN

TOP > About the Species(Zea mays ) > genome data >Gene sequences

Search

By Traits

Let’s Analyze!!

SNP Detection
(lang=JA only)

Other Tools

Data List

All

Trait-Related Loci

Zea mays

CDS Sequence

CDS ID	Zm00001d048988_T034
CDS Infomation	cds chromosome:B73_RefGen_v4:4:11651005:11657972:1 gene:Zm00001d048988 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding description:Non-lysosomal glucosylceramidase
Sequence	ATGTGCTCCAGACCAGGATCATCAATAGGGGCAGCTATCGCTGCTTCAGTTAAGCTGGCT CCCAAGGCAACCCAGGATATTTCATTTTCACTTGCATGGGCTTGTCCTGAAGTGAAGTTC TCTAGTGGGAAAACCTATCATAGGCGTTACACCAAATTTTATGGCACAGACGGTGATGCA GCAGCAGCCCTTGCTCACGATGCCATTCTTGAGCATGCTTCCTGGGAGAGACAAATTGAG GAGTGGCAGGATCCTATTTTGCAAGATGAGAGGTTTCCTGCTTGGTATCCAGTTACACTT TTCAATGAACTATACTATCTTAATGCTGGAGGAACTATATGGACAGATGGATTACCACCA ATTCAAAGCTTGACAGCAGTTGGCTGGAAAAAGTTTTCTCTTGACATGTTAAATGGTGAA TCTGATGATTTCAATGAGATGGTTCGACAGAATAATACTGCTTCTGATATTCTTCATCGA ATGGCATCAGTATTTGAGAGGATGCATGCATCTATTGCATCAAATTCTGCTATAGGAACA ACTTTGCTTCAGGGTGAAGAGAACATTGGCCAGTTTCTATACCTCGAGGGCATCGAGTAT TATATGTGGAACACATATGATGTTCATTTTTATGCATCATTTTCACTGATCATGTTGTTT CCAAAGCTTCAACTCAGCGTCCAGAGAGACTTTGCTGCTGCTGTTATGATGCATGATCCT GAAAAGCTGAGGATCTTGCATGATGGAAAATGGGCTGCAAGAAAAGTTCTCGGTGCTGTT CCTCATGATCTTGGATTATATGACCCATGGTTCAAGGTCAATGCGTACACTCTCTATAAT ACAGATCGGTGGAAAGATTTGAATCCGAAGTTTGTGCTGCAAGTTTATAGAGATGTGGTG GCCACAGGCGACAAATCCTTTGCTCGAGCTGTTTGGCCATCAGTTTATATAGCAATGGCA TATATGGAGCAATTTGATAAGGATAAAGATGGGATGATAGAAAATGAGGATTTCCCAGAT CAAACATATGACGTGTGGTCAATGGCTGGTATAAGTGCATACTGTGGTGGTCTTTGGGTG GCTGCTCTTCAGGCAGCATCGGCCTTGGCACGTGAGGTTGGTGACAAAGCTTCTGAAAAG CTTTTTTGGGACAAATATGAGAAGGCCAAGTTTGTCTATAGCAAGCTGTGGAATGGTTCT TACTTCAGTTATGATGATGGCGACAACAAAATGAGCACATCTATCCAAGCAGATCAATTG GCTGGACAATGGTATGCCAAAGCCTGTGGTCTCTTCCCAATTGTTGACAAAGACAAGGCA CAAAGTGCGCTAGAGAAGGTATATTCTTTCAATGTGATGAAGTTCAAGGGTGGTACAAGG GGAGCCATGAATGGGATGTGGCCAGATGGCACTGTGGACATGTCTGCAATGCAATCTAGG GAGATATGGCCAGGGGTGACATATGCACTAGCTGCAAGCATGATTCAGGAAGGCATGGTT GAGCAGGGATTTAAAACAGCTGAAGGGGTCTATCATGCTGCCTGGTCACCAGGAGGACTT GGGTGA

Peptide Sequence

PEP ID	Zm00001d048988_P034
PEP Infomation	pep chromosome:B73_RefGen_v4:4:11651005:11657972:1 gene:Zm00001d048988 transcript:Zm00001d048988_T034 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding description:Non-lysosomal glucosylceramidase
Sequence	MCSRPGSSIGAAIAASVKLAPKATQDISFSLAWACPEVKFSSGKTYHRRYTKFYGTDGDA AAALAHDAILEHASWERQIEEWQDPILQDERFPAWYPVTLFNELYYLNAGGTIWTDGLPP IQSLTAVGWKKFSLDMLNGESDDFNEMVRQNNTASDILHRMASVFERMHASIASNSAIGT TLLQGEENIGQFLYLEGIEYYMWNTYDVHFYASFSLIMLFPKLQLSVQRDFAAAVMMHDP EKLRILHDGKWAARKVLGAVPHDLGLYDPWFKVNAYTLYNTDRWKDLNPKFVLQVYRDVV ATGDKSFARAVWPSVYIAMAYMEQFDKDKDGMIENEDFPDQTYDVWSMAGISAYCGGLWV AALQAASALAREVGDKASEKLFWDKYEKAKFVYSKLWNGSYFSYDDGDNKMSTSIQADQL AGQWYAKACGLFPIVDKDKAQSALEKVYSFNVMKFKGGTRGAMNGMWPDGTVDMSAMQSR EIWPGVTYALAASMIQEGMVEQGFKTAEGVYHAAWSPGGLG

Transcript Sequence

Transcript ID	Zm00001d048988_T034
Transcript Infomation	cdna chromosome:B73_RefGen_v4:4:11651005:11657972:1 gene:Zm00001d048988 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding description:Non-lysosomal glucosylceramidase
Sequence	GCTAAAGATATGTGGAATTCTGTGAAAGAGGTTGGTTAAGCTGGAATCACTCTGAAATAA CAAGCAGCATGGATCTTTTGATCATCTTGATCCCATCAAGACATCGATGTGCTCCAGACC AGGATCATCAATAGGGGCAGCTATCGCTGCTTCAGTTAAGCTGGCTCCCAAGGCAACCCA GGATATTTCATTTTCACTTGCATGGGCTTGTCCTGAAGTGAAGTTCTCTAGTGGGAAAAC CTATCATAGGCGTTACACCAAATTTTATGGCACAGACGGTGATGCAGCAGCAGCCCTTGC TCACGATGCCATTCTTGAGCATGCTTCCTGGGAGAGACAAATTGAGGAGTGGCAGGATCC TATTTTGCAAGATGAGAGGTTTCCTGCTTGGTATCCAGTTACACTTTTCAATGAACTATA CTATCTTAATGCTGGAGGAACTATATGGACAGATGGATTACCACCAATTCAAAGCTTGAC AGCAGTTGGCTGGAAAAAGTTTTCTCTTGACATGTTAAATGGTGAATCTGATGATTTCAA TGAGATGGTTCGACAGAATAATACTGCTTCTGATATTCTTCATCGAATGGCATCAGTATT TGAGAGGATGCATGCATCTATTGCATCAAATTCTGCTATAGGAACAACTTTGCTTCAGGG TGAAGAGAACATTGGCCAGTTTCTATACCTCGAGGGCATCGAGTATTATATGTGGAACAC ATATGATGTTCATTTTTATGCATCATTTTCACTGATCATGTTGTTTCCAAAGCTTCAACT CAGCGTCCAGAGAGACTTTGCTGCTGCTGTTATGATGCATGATCCTGAAAAGCTGAGGAT CTTGCATGATGGAAAATGGGCTGCAAGAAAAGTTCTCGGTGCTGTTCCTCATGATCTTGG ATTATATGACCCATGGTTCAAGGTCAATGCGTACACTCTCTATAATACAGATCGGTGGAA AGATTTGAATCCGAAGTTTGTGCTGCAAGTTTATAGAGATGTGGTGGCCACAGGCGACAA ATCCTTTGCTCGAGCTGTTTGGCCATCAGTTTATATAGCAATGGCATATATGGAGCAATT TGATAAGGATAAAGATGGGATGATAGAAAATGAGGATTTCCCAGATCAAACATATGACGT GTGGTCAATGGCTGGTATAAGTGCATACTGTGGTGGTCTTTGGGTGGCTGCTCTTCAGGC AGCATCGGCCTTGGCACGTGAGGTTGGTGACAAAGCTTCTGAAAAGCTTTTTTGGGACAA ATATGAGAAGGCCAAGTTTGTCTATAGCAAGCTGTGGAATGGTTCTTACTTCAGTTATGA TGATGGCGACAACAAAATGAGCACATCTATCCAAGCAGATCAATTGGCTGGACAATGGTA TGCCAAAGCCTGTGGTCTCTTCCCAATTGTTGACAAAGACAAGGCACAAAGTGCGCTAGA GAAGGTATATTCTTTCAATGTGATGAAGTTCAAGGGTGGTACAAGGGGAGCCATGAATGG GATGTGGCCAGATGGCACTGTGGACATGTCTGCAATGCAATCTAGGGAGATATGGCCAGG GGTGACATATGCACTAGCTGCAAGCATGATTCAGGAAGGCATGGTTGAGCAGGGATTTAA AACAGCTGAAGGGGTCTATCATGCTGCCTGGTCACCAGGAGGACTTGGGTGAGTATGCGC ATATAAATTGAGGTTTGATGTTTTTTTTTGTTGTCAACAGGCGTGTATGTGTTTGGACGT GGTATAACATCTGAAATATAGAACTTTTCCTGAGCCTAGTTATTTAATATAGCTTTTTTT TTGAAAGATTGTTATTCAATATAGTGTCATGAACTTAGTTATAAGAATAATGCATTAACT TTGTGGATGGAAAGTTCGTTCCTAAATCTCTATCTTCTGAACCTTTTATAATGTAAAAAC CAGTAAGACATGTAGTGAATGTTGGGATCTCCCTATATCTGCTTGATTTTTTTCCTGAAC TTTAATTTTGCACACTAAATGACTTGCTGTTTTTTCTTGAATGTAATCTACAGAAACATG CATCAATCAGACGTTAATGTGTACCACTAATTCCACTCGATTTGTATTTATATTTTTGTA TATGGATAGAATGCTGTACACTAATGTTGTGACAAGTGTCCGAACAAGTGATGGAGACAC CGATGACTTTCCAATTAACATAGGACTACATCAAGGGTCGGCTTTGAGCCCTTATCTTTT CGCTTTGGTGATAGATGAGGTCACAAGGGACATACAAGGAGTTTTACCGTGGTGTATGCT TTTTGCCGATGATGTGGTACTTATTGAGGAGAGTAGGAGTGGTGTTTCTCAAAAGTTGGA ATTGTGGAGGCAGACGCTGGAAGCAAAAGGTTTTAGGCTTAGTAGGTCTAAAACAGAGTA TATGAAGTGTGATTTCAGTGCCATGGGGTATGAGGATGGCGATGTTAGTCTTGATGGGCA AGTGGTACCCAAGAAAGACACTTTTCGTTACTTAGGATTAATGCTTCAAAAGGAGGGAGA CATCGATGAGGATGTCAGTCATAGAATTAAAGCCGGATGGTTGAAGTGGCGACAAGCTGC GGGTGTCTTATGCGACCACCGGGTGCCACACAAACTAAAAGGCAAATTCTACAGGACAGC AATCCGGCCGGCTATGTTGTATGGAGCAGAATGTTGGCCCACCAAAAGACGACATGTCCA ACAACTAAGTGTGGCAGAGATGCGTATGTTGCGCTGGATATGTGGCCACACAAGGAGAGA TCGAGTCCGGAATGATGATATACGAGAGAGAGTAGGAGTGGCGCCAATTGAGGAGAAGCT TATGCAACATCGCTTGAGATGGTTTGGACATATCCAACGAAGACCTGAAGAGGCACCAGT GCATATCGGAATAATTAGGCGTCCCGAAAATGTGAAGAGAGGTAGAGGTCGACCAACTTT GACGTGGACAGAGGCTGTGAAGAGAGACCTGAAGGAGTGGAATATTGACAAAGAGCTCGC CGCAGATAGGAAGGGGTGGAAGTGTGCAATTCACGTGCCAGAACCCTGATTGATAGTTTC GCTTTTCCTCCTTAATCGTTTGACCTTTTCTTGTGTCCATTTTAGATCTTGCTGGTCCTT GTGGGTTTTATCTCTTTTATGTGTTTCCCCGTTTCGTTGTTTTCGGTTCTCCTTTGCCTT TGTTTCCCTTTTCTGTTCTTTGGGGGTTGAGCTCTGAGGTTTTCATACGGGGTTTCATCT CTAGCCTACCCCAACGTGCTTGGGACAAAAAGGCTTTGTTGTTGTTGTTGTATATGGATA GAATGCCTGGTGCGGCCTTTCTTATGCTATAAATGAGACCTGACAGTTTGAGTTCTTCAG ATACTCATTCCAAACCCCTGAAGCCTGGAACAACGACGACGAGTACAGGTCCCTGTGCTA CATGCGCCCGCTCGCCATATGGGCAATGCAATGGGCACTGTCGAAGCCGAAGCTCCACAA CACTCCACAGGCAGATATACCCCAGGACTCATTCCCCAAGAACCAGTTCGCCTACGCGCG GATCACAAAGCTCCTGCAGCTGCCTGAAGACGAATCGTCCAAAAGCTTCGTCCGGGTGGT GTACGAGATCATCCGGAACAGGTTTAGGTCCTGATCGCCGCCTCCGCACGCCTGTGCGCT GAGTGTCCGAATTCTTGATGATACAATTCATTAGTCACTGTCATTGTTGCTGTTGGATCC CGCGGATTCGTATATGAAACTGGTGGTAATAAACTTGCCAAGTGCGGTAGTTC