Plant GARDEN
How To ▶︎

JA

EN

TOP > About the Species(Zea mays ) > genome data >Gene sequences

Search

By Species By Keywords Genes By Markers By Traits

Let’s Analyze!!

SNP Detection
(lang=JA only) Sequences Other Tools

Data List

All Markers Trait-Related Loci
Zea mays

CDS Sequence

CDS ID

Zm00001d048783_T004
CDS Infomation

cds chromosome:B73_RefGen_v4:4:5488017:5501595:1 gene:Zm00001d048783 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding description:Beta-galactosidase 5
Sequence

ATGCTAAGTGTTGCCTGTGGATTGCCGAATGTTGGAGTGCATTATGAGACGTGGAACACT
GGTGTTGGTGGTCCTGTTGTGCTTCATAGGCTGGATGAAGGTTCACGAGACCTTACTTGG
CAGACTTGGTCCTATCAGTGGCTTCCCAGTTTGGTTGAAGTATGTACCGGACTACCGGGC
ATCAGCTTCAGGACAGACAACGAACCTTTCAAGATGGCCATGCAGGGTTTCACTCAGAAA
ATTGTGGGAATGATGAAGAGCGAAAACCTCTTTGCATCCCAAGGTGTCCCAATTATCCTC
TCTCAGGCAAGTATAATATTTTCCTTAGGTTTGATTGAGAATGAATACGGGCCAGAAGGC
AGGGAGTTTCGTCCCGCAGGTCAGGCATATATCAACAAGGCAGCAAAGATGGCAGTCGGA
TTGGGTACTGGTGTGCCGTGGGTGATGTGGAAGGAGGAGGATGCACCTGATCCAGTGATC
AATGCATGCAATGGTTTCTACTGTGATGCATTTTCTCCTAACAAACCTTACAAGCCCACA
ATGTGGACTGAAGCTTGGAGTGGCTACAAGTGTGCCCTAACAAATGTCCACAACATTTTA
GGTTCACGGAATTTGTTGGGACCATCCGCCAACGGCCGGTTGAAGATCTTGCATTTGCTC
GATTTGTACAAAAGGGTGGTTCTTTTATCAATTACTACATGTACCATGGAGGAACAAATT
TTGGGCGCACTGCTGGGGGTCCCTTCATCACAACAAGCTATGATTATGATGCTCCAATTG
ATGAATATGGACTTTTTAGAGAACCAAAGCACAGTCATCTTAAAGAACTCCACAGAGCTG
TTAAGTTATGCGAGCAGGCTTTGGTTTCTGTTGACCCAGCAATTACTACCCTTGTACCAT
GCAAGAGGTATGCTGGCCCACGTCTTCCAATCTCCATCTGGTTGTGCAGCTTTCCTTGCA
AACTACAATTCTAACTCCTATGCGAATGTTGTATTCAACAATGAGCAATACAGCCTACCA
CATTGGTCGATTAGCATCCTTCCTGATTGCAAAAATGTTGTTTTTAACAGTGTCACAGTT
GGTGTTCAGACATCTCAGATGCAAATGTGTGGAGATGATGCCTCATCAATGACGTGGAAG
AGGTATGATGAGGAGGTTTATTCTCTGGCAGCTGCTCCATTGCTCACCACGACTAGTTTG
CTTGAGCAGCTTAATGTCACGAGAGACAACAGTGATTATTTGTGGTACATCACCAGTGTT
GACATAAGCTCATCTGAAAACTTTCTACAAGGTGGCGGCAAGCCTCTGTCTCTCAGTGTG
CAGTCTGCTGGTCATGCCTTGCATGTCTTTGTCAATGGACAGCTTCAAGGTTCTGCATAT
GGTACTAGGGAAGATTGA

Peptide Sequence

PEP ID

Zm00001d048783_P004
PEP Infomation

pep chromosome:B73_RefGen_v4:4:5488017:5501595:1 gene:Zm00001d048783 transcript:Zm00001d048783_T004 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding description:Beta-galactosidase 5
Sequence

MLSVACGLPNVGVHYETWNTGVGGPVVLHRLDEGSRDLTWQTWSYQWLPSLVEVCTGLPG
ISFRTDNEPFKMAMQGFTQKIVGMMKSENLFASQGVPIILSQASIIFSLGLIENEYGPEG
REFRPAGQAYINKAAKMAVGLGTGVPWVMWKEEDAPDPVINACNGFYCDAFSPNKPYKPT
MWTEAWSGYKCALTNVHNILGSRNLLGPSANGRLKILHLLDLYKRVVLLSITTCTMEEQI
LGALLGVPSSQQAMIMMLQLMNMDFLENQSTVILKNSTELLSYASRLWFLLTQQLLPLYH
ARGMLAHVFQSPSGCAAFLANYNSNSYANVVFNNEQYSLPHWSISILPDCKNVVFNSVTV
GVQTSQMQMCGDDASSMTWKRYDEEVYSLAAAPLLTTTSLLEQLNVTRDNSDYLWYITSV
DISSSENFLQGGGKPLSLSVQSAGHALHVFVNGQLQGSAYGTRED

Transcript Sequence

Transcript ID

Zm00001d048783_T004
Transcript Infomation

cdna chromosome:B73_RefGen_v4:4:5488017:5501595:1 gene:Zm00001d048783 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding description:Beta-galactosidase 5
Sequence

TACCGGGCATCAGCTTCAGGACAGACAACGAACCTTTCAAGATGGCCATGCAGGGTTTCA
CTCAGAAAATTGTGGGAATGATGAAGAGCGAAAACCTCTTTGCATCCCAAGGTGTCCCAA
TTATCCTCTCTCAGATTGAGAATGAATACGGGCCAGAAGGCAGGGAGTTTCGTCCCGCAG
GTCAGGCATATATCAACAAGGCAGCAAAGATGGCAGTCGGATTGGGTACTGGTGTGCCGT
GGGTGATGTGGAAGGAGGAGGATGCACCTGATCCAGTGATCAATGCATGCAATGGTTTCT
ACTGTGATGCATTTTCTCCTAACAAACCTTACAAGCCCACAATGTGGACTGAAGCTTGGA
GTGGCTAGTTCACGGAATTTGTTGGGACCATCCGCCAACGGCCGGTTGAAGATCTTGCAT
TTGCTCGATTTGTACAAAAGGGTGGTTCTTTTATCAATTACTACATGTACCATGGAGGAA
CAAATTTTGGGCGCACTGCTGGGGGTCCCTTCATCACAACAAGCTATGATTATGATGCTC
CAATTGATGAATATGGACTTTTTAGAGAACCAAAGCACAGTCATCTTAAAGAACTCCACA
GAGCTGTTAAGTTATGCGAGCAGGCTTTGGTTTCTGTTGACCCAGCAATTACTACCCTTG
TACCATGCAAGAGGCCCACGTCTTCCAATCTCCATCTGGTTGTGCAGCTTTCCTTGCAAA
CTACAATTCTAACTCCTATGCGAATGTTGTATTCAACAATGAGCAATACAGCCTACCACA
TTGGTCGATTAGCATCCTTCCTGATTGCAAAAATGTTGTTTTTAACAGTGTCACAGTTGG
TGTTCAGACATCTCAGATGCAAATGTGTGGAGATGATGCCTCATCAATGACGTGGAAGAG
GTATGATGAGGAGGTTTATTCTCTGGCAGCTGCTCCATTGCTCACCACGACTAGTTTGCT
TGAGCAGCTTAATGTCACGAGAGACAACAGTGATTATTTGTGGTACATCACCAGGTGGCG
GCAAGCCTCTGTCTCTCAGTGTGCAGTCTGCTGGTCATGCCTTGCATGTCTTTGTCAATG
GACAGCTTCAAGGTTCTGCATATGGTACTAGGGAAGATTGAAGAATCAAATACAATGGCA
ATGCTAACCTTCGAGCCGGCACTAACAAAATTTCCATGCTAAGTGTTGCCTGTGGATTGC
CGAATGTTGGAGTGCATTATGAGACGTGGAACACTGGTGTTGGTGGTCCTGTTGTGCTTC
ATAGGCTGGATGAAGGTTCACGAGACCTTACTTGGCAGACTTGGTCCTATCAGTGGCTTC
CCAGTTTGGTTGAAGTATGTACCGGACTACCGGGCATCAGCTTCAGGACAGACAACGAAC
CTTTCAAGATGGCCATGCAGGGTTTCACTCAGAAAATTGTGGGAATGATGAAGAGCGAAA
ACCTCTTTGCATCCCAAGGTGTCCCAATTATCCTCTCTCAGGCAAGTATAATATTTTCCT
TAGGTTTGATTGAGAATGAATACGGGCCAGAAGGCAGGGAGTTTCGTCCCGCAGGTCAGG
CATATATCAACAAGGCAGCAAAGATGGCAGTCGGATTGGGTACTGGTGTGCCGTGGGTGA
TGTGGAAGGAGGAGGATGCACCTGATCCAGTGATCAATGCATGCAATGGTTTCTACTGTG
ATGCATTTTCTCCTAACAAACCTTACAAGCCCACAATGTGGACTGAAGCTTGGAGTGGCT
ACAAGTGTGCCCTAACAAATGTCCACAACATTTTAGGTTCACGGAATTTGTTGGGACCAT
CCGCCAACGGCCGGTTGAAGATCTTGCATTTGCTCGATTTGTACAAAAGGGTGGTTCTTT
TATCAATTACTACATGTACCATGGAGGAACAAATTTTGGGCGCACTGCTGGGGGTCCCTT
CATCACAACAAGCTATGATTATGATGCTCCAATTGATGAATATGGACTTTTTAGAGAACC
AAAGCACAGTCATCTTAAAGAACTCCACAGAGCTGTTAAGTTATGCGAGCAGGCTTTGGT
TTCTGTTGACCCAGCAATTACTACCCTTGTACCATGCAAGAGGTATGCTGGCCCACGTCT
TCCAATCTCCATCTGGTTGTGCAGCTTTCCTTGCAAACTACAATTCTAACTCCTATGCGA
ATGTTGTATTCAACAATGAGCAATACAGCCTACCACATTGGTCGATTAGCATCCTTCCTG
ATTGCAAAAATGTTGTTTTTAACAGTGTCACAGTTGGTGTTCAGACATCTCAGATGCAAA
TGTGTGGAGATGATGCCTCATCAATGACGTGGAAGAGGTATGATGAGGAGGTTTATTCTC
TGGCAGCTGCTCCATTGCTCACCACGACTAGTTTGCTTGAGCAGCTTAATGTCACGAGAG
ACAACAGTGATTATTTGTGGTACATCACCAGTGTTGACATAAGCTCATCTGAAAACTTTC
TACAAGGTGGCGGCAAGCCTCTGTCTCTCAGTGTGCAGTCTGCTGGTCATGCCTTGCATG
TCTTTGTCAATGGACAGCTTCAAGGTTCTGCATATGGTACTAGGGAAGATTGAAGAATCA
AATACAATGGCAATGCTAACCTTCGAGCCGGCACTAACAAAATTTCCATGCTAAGTGTTG
CCTGTGGATTGCCGAATGTTGGAGTGCATTATGAGACGTGGAACACTGGTGTTGGTGGTC
CTGTTGTGCTTCATAGGCTGGATGAAGGTTCACGAGACCTTACTTGGCAGACTTGGTCCT
ATCAGGTCGCCCGAGTGCTACTTGTGCTACCGAGTGCTGCTGTGCAGCCTATGCTACCTG
GTGTGTGACTGCGTGGTGACTGCTTGGTGCTTGGCTGCTTGCTGCCGAGTGTAAGACGCC
AGGACCAGGAGGCAGGACCGCCGGAGCAGCGAGTAGGAGCCAGGAGCCCAACCTAGGTCC
ATGTGGCGAGCACAGATGTGCAGAGAAGATAGGCAGACAACAAAATCTACCTTGTAGTTC
AAGTATACCCTTACCCAAACCCAATACTTTGGGTACTTGAAATTTCAGGTACCTAAAATA
TTCAGCTCAAGTTCGGTTTGACCTGTTAGATACCTGAAATATATAAAACCCGAACT