Gene sequences

How To ▶︎

JA

EN

TOP > About the Species(Zea mays ) > genome data >Gene sequences

Search

By Traits

Let’s Analyze!!

SNP Detection
(lang=JA only)

Other Tools

Data List

All

Trait-Related Loci

Zea mays

CDS Sequence

CDS ID	Zm00001d046591_T003
CDS Infomation	cds chromosome:B73_RefGen_v4:9:97600605:97604393:-1 gene:Zm00001d046591 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding gene_symbol:vacuolar-type H+-pyrophosphatase5 description: vacuolar-type H+-pyrophosphatase5
Sequence	ATGGGCATTTTTGCTGTCCTGATCTTCCTCTTCCTTGGTTCTGTTGAGAGCTTCAGTACC AAGAGTCAGCCATGCCACTACAGCAAGGGCAAGACGTGCAAGCCTGCCCTTGCCAATGCT ATCTTCAGCACCATTGCCTTTGTGCTTGGTGCAGTCACCTCTCTTGTTTCTGGTTTCCTT GGAATGAAGATTGCCACATATGCAAATGCCAGGACAACTCTTGAGGCTAGGAAGGGTGTT GGAAAGGCATTCATTACCGCTTTCCGCTCTGGTGCTGTGATGGGCTTCCTGCTTGCTGCT AGTGGCCTTTTTGTTCTTTATATTGCAATCAACTTGTTTGGAATTTATTATGGTGATGAC TGGGAGGGCCTTTATGAGGCTATCACTGGTTATGGTCTTGGTGGTTCTTCTATGGCTCTT TTTGGTCGTGTTGGTGGTGGGATTTACACTAAAGCTGCTGATGTTGGTGCTGATCTTGTT GGGAAAGTCGAAAGGAATATCCCTGAAGATGATCCGAGAAACCCAGCTGTCATTGCGGAC AATGTTGGTGACAATGTTGGAGATATTGCTGGTATGGGGTCAGATCTCTTTGGCTCTTAT GCTGAGTCTTCATGCGCTGCGCTTGTCGTTGCCTCAATCTCTTCATTCGGGATCAATCAT GAATTCACCCCTATGTTGTACCCACTCCTCATTAGCTCTGTGGGTATCATAGCTTGCTTG ATAACCACTCTTTTTGCAACTGATTTCTTTGAGATCAAGGCTGTAGATGAAATTGAGCCG GCTCTCAAGAAGCAGCTTATAATTTCCACTGCTGTGATGACTGTTGGCATTGCACTTGTC AGTTGGTTAGGGCTTCCATATACATTCACAATCTTCAACTTTGGTGTGCAGAAGACGGTG TATAACTGGCAATTATTCCTATGCGTGGCAGTTGGTCTGTGGGCAGGACTAGTTATTGGA TTTGTTACGGAGTATTACACAAGCAATGCATACAGTCCTGTACAGGATGTTGCTGATTCC TGCAGAACTGGAGCTGCTACGAATGTCATCTTTGGCCTTGCTCTGGGATATAAATCCGTC ATTATCCCTATTTTTGCTATTGCTTTTAGTATTTTTCTCAGCTTCAGCCTTGCTGCCATG TACGGTGTTGCTGTGGCTGCTCTTGGAATGCTCAGCACAATCGCTACTGGCCTTGCCATT GATGCCTATGGTCCTATCAGTGACAATGCTGGAGGAATTGCTGAAATGGCTGGCATGAGC CACAGAATCCGTGAGAGAACTGATGCTCTTGATGCTGCTGGAAATACTACTGCTGCCATT GGGAAGGGTTTTGCAATAGGTTCAGCAGCCTTGGTGTCTCTTGCCCTCTTTGGTGCTTTT GTCAGCCGTGCTGAGATCTCGACTGTTGATGTTCTGACACCCAAAGTTTTCATTGGACTG ATTGTTGGTGCCATGCTCCCATACTGGTTCTCAGCGATGACAATGAAGAGTGTTGGAAGT GCAGCACTCAAGATGGTTGAGGAAGTCCGCAGGCAGTTCAACACCATCCCTGGGCTCATG GAGGGCATTACCAAGCCTGACTATGCGACGTGTGTTAAGATCTCTACTGATGCATCTATC AAGGAGATGATCCCACCTGGTGCACTTGTCATGCTTACACCTCTTATTGTGGGGATCTTC TTTGGTGTTGAAACCCTCTCTGGAGTTCTTGCTGGTGCTCTTGTTTCTGGTGTCCAGATT GCCATCTCTGCATCCAACACTGGAGGTGCCTGGGACAACGCAAAGAAATACATTGAGGCT GGTGCATCTGAGCATGCAAGAACCTTGGGCCCGAAAGGTTCAGACCCACACAAGGCTGCT GTCATCGGTGACACCATCGGTGATCCCCTCAAGGACACCTCAGGCCCCTCGCTGAACATC CTCATCAAGCTCATGGCTGTCGAGTCCCTTGTCTTTGCTCCCTTCTTCGCCACCCATGGA GGCATCCTCTTCAAATGGCTTTAG

Peptide Sequence

PEP ID	Zm00001d046591_P003
PEP Infomation	pep chromosome:B73_RefGen_v4:9:97600605:97604393:-1 gene:Zm00001d046591 transcript:Zm00001d046591_T003 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding gene_symbol:vacuolar-type H+-pyrophosphatase5 description: vacuolar-type H+-pyrophosphatase5
Sequence	MGIFAVLIFLFLGSVESFSTKSQPCHYSKGKTCKPALANAIFSTIAFVLGAVTSLVSGFL GMKIATYANARTTLEARKGVGKAFITAFRSGAVMGFLLAASGLFVLYIAINLFGIYYGDD WEGLYEAITGYGLGGSSMALFGRVGGGIYTKAADVGADLVGKVERNIPEDDPRNPAVIAD NVGDNVGDIAGMGSDLFGSYAESSCAALVVASISSFGINHEFTPMLYPLLISSVGIIACL ITTLFATDFFEIKAVDEIEPALKKQLIISTAVMTVGIALVSWLGLPYTFTIFNFGVQKTV YNWQLFLCVAVGLWAGLVIGFVTEYYTSNAYSPVQDVADSCRTGAATNVIFGLALGYKSV IIPIFAIAFSIFLSFSLAAMYGVAVAALGMLSTIATGLAIDAYGPISDNAGGIAEMAGMS HRIRERTDALDAAGNTTAAIGKGFAIGSAALVSLALFGAFVSRAEISTVDVLTPKVFIGL IVGAMLPYWFSAMTMKSVGSAALKMVEEVRRQFNTIPGLMEGITKPDYATCVKISTDASI KEMIPPGALVMLTPLIVGIFFGVETLSGVLAGALVSGVQIAISASNTGGAWDNAKKYIEA GASEHARTLGPKGSDPHKAAVIGDTIGDPLKDTSGPSLNILIKLMAVESLVFAPFFATHG GILFKWL

Transcript Sequence

Transcript ID	Zm00001d046591_T003
Transcript Infomation	cdna chromosome:B73_RefGen_v4:9:97600605:97604393:-1 gene:Zm00001d046591 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding gene_symbol:vacuolar-type H+-pyrophosphatase5 description: vacuolar-type H+-pyrophosphatase5
Sequence	GGCTGGATTCTGGCCATGTCTTTGCTCAGGATTTGTTTCTTACAATAGGATTAGCATTAT GGTGATTGGTTTATGCTTCCCTTGCAGAGCCATACTATGCTCATTATCCTTACAGGAATC AGCAGAGTAGTCCGTATGAAGATTTTTGTGAACCAGCAGAGTAGTCCATATGAAGATTTT GTGAACCAGCAGAGTAGTCCGTATGAAGATTTTGAGCAACTTCTTTCCTTTTCACTGAAT ACAAGTATGTGGGACTATTCATGGGCATTTTTGCTGTCCTGATCTTCCTCTTCCTTGGTT CTGTTGAGAGCTTCAGTACCAAGAGTCAGCCATGCCACTACAGCAAGGGCAAGACGTGCA AGCCTGCCCTTGCCAATGCTATCTTCAGCACCATTGCCTTTGTGCTTGGTGCAGTCACCT CTCTTGTTTCTGGTTTCCTTGGAATGAAGATTGCCACATATGCAAATGCCAGGACAACTC TTGAGGCTAGGAAGGGTGTTGGAAAGGCATTCATTACCGCTTTCCGCTCTGGTGCTGTGA TGGGCTTCCTGCTTGCTGCTAGTGGCCTTTTTGTTCTTTATATTGCAATCAACTTGTTTG GAATTTATTATGGTGATGACTGGGAGGGCCTTTATGAGGCTATCACTGGTTATGGTCTTG GTGGTTCTTCTATGGCTCTTTTTGGTCGTGTTGGTGGTGGGATTTACACTAAAGCTGCTG ATGTTGGTGCTGATCTTGTTGGGAAAGTCGAAAGGAATATCCCTGAAGATGATCCGAGAA ACCCAGCTGTCATTGCGGACAATGTTGGTGACAATGTTGGAGATATTGCTGGTATGGGGT CAGATCTCTTTGGCTCTTATGCTGAGTCTTCATGCGCTGCGCTTGTCGTTGCCTCAATCT CTTCATTCGGGATCAATCATGAATTCACCCCTATGTTGTACCCACTCCTCATTAGCTCTG TGGGTATCATAGCTTGCTTGATAACCACTCTTTTTGCAACTGATTTCTTTGAGATCAAGG CTGTAGATGAAATTGAGCCGGCTCTCAAGAAGCAGCTTATAATTTCCACTGCTGTGATGA CTGTTGGCATTGCACTTGTCAGTTGGTTAGGGCTTCCATATACATTCACAATCTTCAACT TTGGTGTGCAGAAGACGGTGTATAACTGGCAATTATTCCTATGCGTGGCAGTTGGTCTGT GGGCAGGACTAGTTATTGGATTTGTTACGGAGTATTACACAAGCAATGCATACAGTCCTG TACAGGATGTTGCTGATTCCTGCAGAACTGGAGCTGCTACGAATGTCATCTTTGGCCTTG CTCTGGGATATAAATCCGTCATTATCCCTATTTTTGCTATTGCTTTTAGTATTTTTCTCA GCTTCAGCCTTGCTGCCATGTACGGTGTTGCTGTGGCTGCTCTTGGAATGCTCAGCACAA TCGCTACTGGCCTTGCCATTGATGCCTATGGTCCTATCAGTGACAATGCTGGAGGAATTG CTGAAATGGCTGGCATGAGCCACAGAATCCGTGAGAGAACTGATGCTCTTGATGCTGCTG GAAATACTACTGCTGCCATTGGGAAGGGTTTTGCAATAGGTTCAGCAGCCTTGGTGTCTC TTGCCCTCTTTGGTGCTTTTGTCAGCCGTGCTGAGATCTCGACTGTTGATGTTCTGACAC CCAAAGTTTTCATTGGACTGATTGTTGGTGCCATGCTCCCATACTGGTTCTCAGCGATGA CAATGAAGAGTGTTGGAAGTGCAGCACTCAAGATGGTTGAGGAAGTCCGCAGGCAGTTCA ACACCATCCCTGGGCTCATGGAGGGCATTACCAAGCCTGACTATGCGACGTGTGTTAAGA TCTCTACTGATGCATCTATCAAGGAGATGATCCCACCTGGTGCACTTGTCATGCTTACAC CTCTTATTGTGGGGATCTTCTTTGGTGTTGAAACCCTCTCTGGAGTTCTTGCTGGTGCTC TTGTTTCTGGTGTCCAGATTGCCATCTCTGCATCCAACACTGGAGGTGCCTGGGACAACG CAAAGAAATACATTGAGGCTGGTGCATCTGAGCATGCAAGAACCTTGGGCCCGAAAGGTT CAGACCCACACAAGGCTGCTGTCATCGGTGACACCATCGGTGATCCCCTCAAGGACACCT CAGGCCCCTCGCTGAACATCCTCATCAAGCTCATGGCTGTCGAGTCCCTTGTCTTTGCTC CCTTCTTCGCCACCCATGGAGGCATCCTCTTCAAATGGCTTTAGAGGAAGAATGGAAGAT GGATGGGTAGTTTATTTTTGCCGGGGGAGAGCACTAGATATATGTCATAGAGAAGTTTCA GTTTACCCATATGGTGCACTTCATCCTTTTTTGTTTCGCTTGTACTGTGTCGCAGTCTTG TTGAACTTGTCAGCCGTGGTATCACCTAGTTTTTGGGTCTAGATGCAGTAGCCGAGTGGA GCAAAAACGTCTAGCATTCTACAGGATTGGAATTTGGACATGGATGTGTTGGGAAGTTTG ATACTGCATGTAGATATTTCGATGATGATGATCAAGGAATGCACAAGTCAG