Gene sequences

How To ▶︎

JA

EN

TOP > About the Species(Zea mays ) > genome data >Gene sequences

Search

By Traits

Let’s Analyze!!

SNP Detection
(lang=JA only)

Other Tools

Data List

All

Trait-Related Loci

Zea mays

CDS Sequence

CDS ID	Zm00001d044336_T001
CDS Infomation	cds chromosome:B73_RefGen_v4:3:225403807:225406983:-1 gene:Zm00001d044336 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding description:Putative pentatricopeptide repeat-containing protein
Sequence	ATGCACCGGAAGGTAAGGGTGCCGCCATTACCTCACCTCACGCTCCGCTGCGCCTCTTCC TCTTCAGCCGCTGCCTCCGTTTCCCCGCCGCCACCTAGACGCCTCCCTCCTCCCGTCCCA CTCTGCGACCTCCTTGCTCACCGTCTCGGGCCTCCTCGCTCGCCGCTCTCACCTCCACCG CCTCGCCCTCACGCCGACCTCCTCCCCCTGCTCCGCCGCGGCGGCGACGCCAACTCTCCG GAAAACCTCCACGTCGAGCTCATCAAGCGGGGCCTCAATCATGACCTCTTCTTATGCAAC CATCTCGTCAACTCCTACGCCAAGGGCGCGCGCCTGGCTGCCGCGAGCCAGGTGTTCGAC GAAATGCCCGAGCGGAACGCCGTCTCCTGGACCTGCCTCGTCTCCGGGTACGTGCTGCAT GGAATCGCCGAAGAGGCCTTCCGGGTGTTCCGCGCCATGCTGAGGGAGGTGCAGGCTGGG TGCAGGCCCACGTCCTTCACCTTCGGGACCTTGCTCCGGGCGTGCCAGGATGGGGGACCC GACCGTCTGGGCTTCGCAGTCCAGGTCCATGGGTTGGTGTCGAAGACGGAGTATGCGTCA AATACTACTGTGTGCAATGCCCTGATCTCAATGTATGGTAGCTGCACTGTTGGCCCGCCG ATCCTAGCGCAGCGGGTGTTTGATGGCACGCCGATCAGGGACTTGATCACATGGAACGCA TTGATGTCTGTTTATGCTAAGAAAGGTGATGTGGCTTCAACGTTCACACTGTTCAAGGAT ATGCAGCGAGGTGATTCCAGGATTCAGCTGCGTCCGACAGAGCATACCTTTGGCAGTTTG ATCACTGCTGCATCTCTGTCATCAGGCAGCTCGGCTGTGCTTGACCAAGTATTGGTGTGG GTGCTCAAATCTGGCTGTTCTAGTGACCTCTATGTGGGTAGTGCTCTGGTTAGCGCTTTT GCTAGACATGGCTTGACTGATGAAGCTAAGGACATATTTCTCAGTCTGAAACAGAAGAAT GCAGTTACCTTAAACGGTTTGATAGTTGGGTTGGTCAGGCAAGACTTCAGTGAAGAAGCA GTGAAGATTTTTGTGGGGACAAGGAATACTGTTGATGTTAACGCAGATACATATGTTGTA TTGCTCAGTGCATTAGCTGAGTATTCTATATCTGAAGAAGGGCTGAGGATAGGTAGGGTA GTCCACGGGCATATGCTTAGAACTGGACTTACTGATCTAAAAATCGCTGTTAGTAATGGA CTGGTTAATATGTATGCCAAATGTGGTGCCATCGAGAGTGCCTCTAAAATTTTTCAGTTA ATGGAAGCAACGGATAGGATTTCCTGGAACACCATCATCTCAGCTCTCGATCAGAATGGT AACTGTGAAGAAGCAGTTATGCATTACTCTCTTATGAGACAAAGTTGCATAAGCCCATCA AATTTTGCACTAATCAGTTCCTTGAGTTCATGTGCAGGTTTGAAACTTTTAACTGCTGGT CAGCAAGTGCATTGTGATGCTGTTAAGTGGGGTCTAGATTTAGATACTTCTGTTTCAAAT GTACTGGTTAAAATGTATGGGGAATGTGGAGCTATGTCAGATTACTGGAAGGTTTTCAAC TCTATGGCTGAACACGATGAAGTTTCTTGGAACACTATGATGGGTGTCATGGCCAGTTCA CAAACACCTATTTCTGAAATTGTCAAAGTTTTCAACAATATGATGAGGGGTGGTTTGATC CCAAATAAAGTAACATTTATAAACTTACTTGCTGCTTTGTCTCCACTGTCCGTTCTTGAA TTGGGGAAGCAAGTTCATGCTGCAGTGATGAAGCATGGAGTTATGGAAGATAATGTGGTA GATAATGCCCTCATATCATGCTATGCAAAATCAGGAGATATGGGTTCCTGTGAGCATCTG TTTACTAACATGTCTGACAGAAGGGATGCCATCTCGTGGAATTCTATGATTTCAGGTTAC ATCTACAATGGCAATCTACAGGAGGCTATGGATTGTGTATGGCTTATGATACACAGTGGC CAAATCATGGATTGTTGCACTTTCTCCATTATACTCAATGCATGTGCTTCTGTGGCAGCA TTGGAGCGTGGAATGGAGTTGCATGCTTTTGGTATTAGGTCACACTTGGAATCAGATGTC GTGGTTGAGAGTGCTCTTGTTGATATGTACTCCAAGTGTGGTAGGGTGGATTATGCCTCT AAGCTTTTCAATTCTATGACTCAGAGAAATGAATTTTCATGGAATTCTATGATTTCTGGT TATGCAAGACATGGTCTTGGAAGGAAAGCCATTGAGATATTTGAGGAAATGCTGCGCAGC AGAGAGAGTCCAGACCATGTCACTTTTGTCAGTGTCCTATCTGCCTGCAGTCATGCTGGA TTGGTGGAAAGAGGTTTAGAATACTTCGAAATGATGCCGGATCATGGTATACTACCACAG ATTGAACATTATTCTTGTGTCATAGACCTTCTCGGTCGAGCTGGTAAGATTGACAAGATA AAGGAGTACATTCAAAGAATGCCAATTGAACCTAACGCTCTCATATGGAGGACTGTTTTA GTTGCTTGTCGACAATCAAAAGACGGGTCTAACATTGATCTGGGGAGAGAAGCTTCAAGG GTGCTTTTGGAAATAGAGCCTCAAAATCCTGTAAACTATGTTCTGGCATCTAACTTTCAT GCAGCTACAGGAATGTGGGAAGATACAGCCAAAGCCCGAACTGCAATGAGGCAAGCGACA GAGAAAAAGGAGGCTGGTCGCAGTTGGGTAACCCTAAATGATGGAGTCCATACTTTCATC GCTGGTGATAGATCACATCCAAACACCAAAGAAATATATGAAAAACTGAATTTTTTGATA CAGAATATAAGAAATGCTGGTTATGTTCCCCTGACAGAGTATGCCTTGTATGATCTTGAA GAAGAAAACAAAGAAGAGCTGTTGAGCTATCATAGTGAGAAGCTAGCCATTGCCTTTGTT CTGACTCGTTCCTCAAGTGGCCCAATAAGAATAATGAAGAACCTTCGGGTTTGCGGAGAT TGTCACATAGCATTTCGATACATTTCTCAGATGATTAGCCGGCAAATCATTTTAAGGGAT TCTATCCGATTTCATCATTTCAAAGATGGGAAGTGTTCTTGTGGAGATTACTGGTAA

Peptide Sequence

PEP ID	Zm00001d044336_P001
PEP Infomation	pep chromosome:B73_RefGen_v4:3:225403807:225406983:-1 gene:Zm00001d044336 transcript:Zm00001d044336_T001 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding description:Putative pentatricopeptide repeat-containing protein
Sequence	MHRKVRVPPLPHLTLRCASSSSAAASVSPPPPRRLPPPVPLCDLLAHRLGPPRSPLSPPP PRPHADLLPLLRRGGDANSPENLHVELIKRGLNHDLFLCNHLVNSYAKGARLAAASQVFD EMPERNAVSWTCLVSGYVLHGIAEEAFRVFRAMLREVQAGCRPTSFTFGTLLRACQDGGP DRLGFAVQVHGLVSKTEYASNTTVCNALISMYGSCTVGPPILAQRVFDGTPIRDLITWNA LMSVYAKKGDVASTFTLFKDMQRGDSRIQLRPTEHTFGSLITAASLSSGSSAVLDQVLVW VLKSGCSSDLYVGSALVSAFARHGLTDEAKDIFLSLKQKNAVTLNGLIVGLVRQDFSEEA VKIFVGTRNTVDVNADTYVVLLSALAEYSISEEGLRIGRVVHGHMLRTGLTDLKIAVSNG LVNMYAKCGAIESASKIFQLMEATDRISWNTIISALDQNGNCEEAVMHYSLMRQSCISPS NFALISSLSSCAGLKLLTAGQQVHCDAVKWGLDLDTSVSNVLVKMYGECGAMSDYWKVFN SMAEHDEVSWNTMMGVMASSQTPISEIVKVFNNMMRGGLIPNKVTFINLLAALSPLSVLE LGKQVHAAVMKHGVMEDNVVDNALISCYAKSGDMGSCEHLFTNMSDRRDAISWNSMISGY IYNGNLQEAMDCVWLMIHSGQIMDCCTFSIILNACASVAALERGMELHAFGIRSHLESDV VVESALVDMYSKCGRVDYASKLFNSMTQRNEFSWNSMISGYARHGLGRKAIEIFEEMLRS RESPDHVTFVSVLSACSHAGLVERGLEYFEMMPDHGILPQIEHYSCVIDLLGRAGKIDKI KEYIQRMPIEPNALIWRTVLVACRQSKDGSNIDLGREASRVLLEIEPQNPVNYVLASNFH AATGMWEDTAKARTAMRQATEKKEAGRSWVTLNDGVHTFIAGDRSHPNTKEIYEKLNFLI QNIRNAGYVPLTEYALYDLEEENKEELLSYHSEKLAIAFVLTRSSSGPIRIMKNLRVCGD CHIAFRYISQMISRQIILRDSIRFHHFKDGKCSCGDYW

Transcript Sequence

Transcript ID	Zm00001d044336_T001
Transcript Infomation	cdna chromosome:B73_RefGen_v4:3:225403807:225406983:-1 gene:Zm00001d044336 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding description:Putative pentatricopeptide repeat-containing protein
Sequence	ATGCACCGGAAGGTAAGGGTGCCGCCATTACCTCACCTCACGCTCCGCTGCGCCTCTTCC TCTTCAGCCGCTGCCTCCGTTTCCCCGCCGCCACCTAGACGCCTCCCTCCTCCCGTCCCA CTCTGCGACCTCCTTGCTCACCGTCTCGGGCCTCCTCGCTCGCCGCTCTCACCTCCACCG CCTCGCCCTCACGCCGACCTCCTCCCCCTGCTCCGCCGCGGCGGCGACGCCAACTCTCCG GAAAACCTCCACGTCGAGCTCATCAAGCGGGGCCTCAATCATGACCTCTTCTTATGCAAC CATCTCGTCAACTCCTACGCCAAGGGCGCGCGCCTGGCTGCCGCGAGCCAGGTGTTCGAC GAAATGCCCGAGCGGAACGCCGTCTCCTGGACCTGCCTCGTCTCCGGGTACGTGCTGCAT GGAATCGCCGAAGAGGCCTTCCGGGTGTTCCGCGCCATGCTGAGGGAGGTGCAGGCTGGG TGCAGGCCCACGTCCTTCACCTTCGGGACCTTGCTCCGGGCGTGCCAGGATGGGGGACCC GACCGTCTGGGCTTCGCAGTCCAGGTCCATGGGTTGGTGTCGAAGACGGAGTATGCGTCA AATACTACTGTGTGCAATGCCCTGATCTCAATGTATGGTAGCTGCACTGTTGGCCCGCCG ATCCTAGCGCAGCGGGTGTTTGATGGCACGCCGATCAGGGACTTGATCACATGGAACGCA TTGATGTCTGTTTATGCTAAGAAAGGTGATGTGGCTTCAACGTTCACACTGTTCAAGGAT ATGCAGCGAGGTGATTCCAGGATTCAGCTGCGTCCGACAGAGCATACCTTTGGCAGTTTG ATCACTGCTGCATCTCTGTCATCAGGCAGCTCGGCTGTGCTTGACCAAGTATTGGTGTGG GTGCTCAAATCTGGCTGTTCTAGTGACCTCTATGTGGGTAGTGCTCTGGTTAGCGCTTTT GCTAGACATGGCTTGACTGATGAAGCTAAGGACATATTTCTCAGTCTGAAACAGAAGAAT GCAGTTACCTTAAACGGTTTGATAGTTGGGTTGGTCAGGCAAGACTTCAGTGAAGAAGCA GTGAAGATTTTTGTGGGGACAAGGAATACTGTTGATGTTAACGCAGATACATATGTTGTA TTGCTCAGTGCATTAGCTGAGTATTCTATATCTGAAGAAGGGCTGAGGATAGGTAGGGTA GTCCACGGGCATATGCTTAGAACTGGACTTACTGATCTAAAAATCGCTGTTAGTAATGGA CTGGTTAATATGTATGCCAAATGTGGTGCCATCGAGAGTGCCTCTAAAATTTTTCAGTTA ATGGAAGCAACGGATAGGATTTCCTGGAACACCATCATCTCAGCTCTCGATCAGAATGGT AACTGTGAAGAAGCAGTTATGCATTACTCTCTTATGAGACAAAGTTGCATAAGCCCATCA AATTTTGCACTAATCAGTTCCTTGAGTTCATGTGCAGGTTTGAAACTTTTAACTGCTGGT CAGCAAGTGCATTGTGATGCTGTTAAGTGGGGTCTAGATTTAGATACTTCTGTTTCAAAT GTACTGGTTAAAATGTATGGGGAATGTGGAGCTATGTCAGATTACTGGAAGGTTTTCAAC TCTATGGCTGAACACGATGAAGTTTCTTGGAACACTATGATGGGTGTCATGGCCAGTTCA CAAACACCTATTTCTGAAATTGTCAAAGTTTTCAACAATATGATGAGGGGTGGTTTGATC CCAAATAAAGTAACATTTATAAACTTACTTGCTGCTTTGTCTCCACTGTCCGTTCTTGAA TTGGGGAAGCAAGTTCATGCTGCAGTGATGAAGCATGGAGTTATGGAAGATAATGTGGTA GATAATGCCCTCATATCATGCTATGCAAAATCAGGAGATATGGGTTCCTGTGAGCATCTG TTTACTAACATGTCTGACAGAAGGGATGCCATCTCGTGGAATTCTATGATTTCAGGTTAC ATCTACAATGGCAATCTACAGGAGGCTATGGATTGTGTATGGCTTATGATACACAGTGGC CAAATCATGGATTGTTGCACTTTCTCCATTATACTCAATGCATGTGCTTCTGTGGCAGCA TTGGAGCGTGGAATGGAGTTGCATGCTTTTGGTATTAGGTCACACTTGGAATCAGATGTC GTGGTTGAGAGTGCTCTTGTTGATATGTACTCCAAGTGTGGTAGGGTGGATTATGCCTCT AAGCTTTTCAATTCTATGACTCAGAGAAATGAATTTTCATGGAATTCTATGATTTCTGGT TATGCAAGACATGGTCTTGGAAGGAAAGCCATTGAGATATTTGAGGAAATGCTGCGCAGC AGAGAGAGTCCAGACCATGTCACTTTTGTCAGTGTCCTATCTGCCTGCAGTCATGCTGGA TTGGTGGAAAGAGGTTTAGAATACTTCGAAATGATGCCGGATCATGGTATACTACCACAG ATTGAACATTATTCTTGTGTCATAGACCTTCTCGGTCGAGCTGGTAAGATTGACAAGATA AAGGAGTACATTCAAAGAATGCCAATTGAACCTAACGCTCTCATATGGAGGACTGTTTTA GTTGCTTGTCGACAATCAAAAGACGGGTCTAACATTGATCTGGGGAGAGAAGCTTCAAGG GTGCTTTTGGAAATAGAGCCTCAAAATCCTGTAAACTATGTTCTGGCATCTAACTTTCAT GCAGCTACAGGAATGTGGGAAGATACAGCCAAAGCCCGAACTGCAATGAGGCAAGCGACA GAGAAAAAGGAGGCTGGTCGCAGTTGGGTAACCCTAAATGATGGAGTCCATACTTTCATC GCTGGTGATAGATCACATCCAAACACCAAAGAAATATATGAAAAACTGAATTTTTTGATA CAGAATATAAGAAATGCTGGTTATGTTCCCCTGACAGAGTATGCCTTGTATGATCTTGAA GAAGAAAACAAAGAAGAGCTGTTGAGCTATCATAGTGAGAAGCTAGCCATTGCCTTTGTT CTGACTCGTTCCTCAAGTGGCCCAATAAGAATAATGAAGAACCTTCGGGTTTGCGGAGAT TGTCACATAGCATTTCGATACATTTCTCAGATGATTAGCCGGCAAATCATTTTAAGGGAT TCTATCCGATTTCATCATTTCAAAGATGGGAAGTGTTCTTGTGGAGATTACTGGTAA