Plant GARDEN How To ▶︎

JA

EN

Zea mays

CDS Sequence

CDS ID

Zm00001d043613_T013

CDS Infomation

cds chromosome:B73_RefGen_v4:3:205193019:205197541:-1 gene:Zm00001d043613 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding description:CHY-type/CTCHY-type/RING-type Zinc finger protein

Sequence

ATGGGCGCCTTGGACCTACACCTTGACTTTGCTTCTGCTCAACATGGACAAGCCAAGTTA
AAGGAATATGCCAAGAGCTCTTTGTTGTCTGATGGAAACTACAATACAGACAAGATCAAT
GGTTCAAACCCTGATGACTATGAGAAATTTGAGAAAGGGATAATGCACTATGGGTGTCCA
CATTATAGAAGGAGATGCCGCATAAGAGCTCCTTGCTGCAATGAAATTTTTGATTGCCGA
CACTGCCACAATGAAACTAAGAATTCCATTAAAATTGATAAAATGAAGAGGCATGAACTT
CCACGCCATGAAGTGCAGCAGGTTGTATGCTCATTGTGTGGCACTGAACAGGAGGTGCGA
CAAGTATGTATCAATTGCGGTGTTTGCATGGGGAAATACTTCTGTGGTTTGTGCAAACTC
TTCGACGATGATGTCTCTAAACAGCAGTATCACTGCAACGGATGTGGAATATGTAGAATC
GGAGGGAGGGAGAATTTCTTCCACTGTTCAAAATGTGGATGTTGCTATTCAATTGCGCTG
AAGAATAGTCATGCATGTGTTGAAGGGGCGATGCATCATGACTGTCCAATCTGCTTCGAG
TACTTGTTCGATTCGACAAATGATGTTTCCGTCCTGCCTTGTGGTCATACCATTCATGTA
AAGTGCCTGAAAGAAATGGAAGAGCACTGCCAGTTTGCATGCCCCCTTTGCTCCAAGTCG
GTTTGTGACATGTCGAAGGCATGGGAAAGGCTCGACATGGAGCTGGCAACTCTGTCTGAC
TCCTGTGATCACAAAATGGTCCGCATATTATGCAACGACTGCGGGGCAATATCAGATGTG
CAGTTCCATTTGATTGCGCACAAGTGCCAGAATTGCAAGTCATACAACACCCGCCAGATT
TGA

Peptide Sequence

PEP ID

Zm00001d043613_P013

PEP Infomation

pep chromosome:B73_RefGen_v4:3:205193019:205197541:-1 gene:Zm00001d043613 transcript:Zm00001d043613_T013 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding description:CHY-type/CTCHY-type/RING-type Zinc finger protein

Sequence

MGALDLHLDFASAQHGQAKLKEYAKSSLLSDGNYNTDKINGSNPDDYEKFEKGIMHYGCP
HYRRRCRIRAPCCNEIFDCRHCHNETKNSIKIDKMKRHELPRHEVQQVVCSLCGTEQEVR
QVCINCGVCMGKYFCGLCKLFDDDVSKQQYHCNGCGICRIGGRENFFHCSKCGCCYSIAL
KNSHACVEGAMHHDCPICFEYLFDSTNDVSVLPCGHTIHVKCLKEMEEHCQFACPLCSKS
VCDMSKAWERLDMELATLSDSCDHKMVRILCNDCGAISDVQFHLIAHKCQNCKSYNTRQI

Transcript Sequence

Transcript ID

Zm00001d043613_T013

Transcript Infomation

cdna chromosome:B73_RefGen_v4:3:205193019:205197541:-1 gene:Zm00001d043613 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding description:CHY-type/CTCHY-type/RING-type Zinc finger protein

Sequence

GTGGCACAATACTATGGCCCAGTTTTGAACCTATGGCCCAACACTCTTAGCTAATAACTC
AACTAATTGTTAACTAACTCGCAGCTAACAATTAGTTCATTAGCTGCCTCAATCCAGCTA
ACAATTTGTTAGCTGGCTAACTATTAGATTTAGGGGTTCCAAACATGACTGTATCAATTG
ACTTCCTCTGTTGGCCGACCTTTGCATATATCATCAATGAGCAGAAAAAAAACAGGTTTT
GTTTTTGCTAAATTAAGGAGAAGTATCGCTCGAATTTAGCATCGTAATGGGGGAACACAT
CATCTTCTCGATGAATTCCGCTATATGCCCCAGCTATACCCAGATGAGAACAGGAAGGGA
CAGTTTGTGGACTACTTGCAGGCTATTGATTTATGTATTCTTTGGTAAAGAATCGGGAAG
GGCATTTTTCTTATGCAGGTTGCATAACCACTGGTGATATGAGATGATCTCTATTCGCTT
GGAAAGTAGAGATAGGTTAAATTTCGGTCTGAACGGTGAAACCTTAAATAAAATCTTAGG
ATGCTGTGTGAGAGAAGCATGCTGGCTCCCTCAAAGGTATGTTTGATTGAAGAATCAACG
GATTGAAAATCTCTTATGGATAGAAGTGCTTATTAACTAAAGATTTTGAAGAAGAAGCTG
CTGTCTGCTGGAGGTAGGCTTCCTTGAAATCTAACGTCTTAATGAACCTTTAAGATCATA
ACAACGTGCACGAGTGGTACATGCTAACACGTCGAAACCCTTGTCACGAAAGAATCATGT
TTCTTTCTTCCTTCCATTTCCTGGCATTTGATGCTATGATGTGTTCCTCTTGCCAGAGAA
TGGTGTGGACAACGCGGTAAATTTGGTGCAGATGGATGGTGTGTTCAAATTGATCGGAGT
TCTCTGGATGGATACCTATCGAGTAGTATAATTCCTCTCTCAGCTCACTGTCCAGACAAT
TAGTGCTATCTGTGACTGTTGGGCAATCAGGTTATCGAGATTTTGCTGGTTGGAGCTGTC
CGGCATTGCTTTCATCTTTTATCAATATGCCGGTCTTTGGCAGCATATGGCGATTCAGAA
CTGTGCGCAGTGGTATTGTGTTGTGTTTGCAACGTGATAGCTTGTACTGGGAACAAAGGT
CAAGATGGGCGCCTTGGACCTACACCTTGACTTTGCTTCTGCTCAACATGGACAAGCCAA
GTTAAAGGAATATGCCAAGAGCTCTTTGTTGTCTGATGGAAACTACAATACAGACAAGAT
CAATGGTTCAAACCCTGATGACTATGAGAAATTTGAGAAAGGGATAATGCACTATGGGTG
TCCACATTATAGAAGGAGATGCCGCATAAGAGCTCCTTGCTGCAATGAAATTTTTGATTG
CCGACACTGCCACAATGAAACTAAGAATTCCATTAAAATTGATAAAATGAAGAGGCATGA
ACTTCCACGCCATGAAGTGCAGCAGGTTGTATGCTCATTGTGTGGCACTGAACAGGAGGT
GCGACAAGTATGTATCAATTGCGGTGTTTGCATGGGGAAATACTTCTGTGGTTTGTGCAA
ACTCTTCGACGATGATGTCTCTAAACAGCAGTATCACTGCAACGGATGTGGAATATGTAG
AATCGGAGGGAGGGAGAATTTCTTCCACTGTTCAAAATGTGGATGTTGCTATTCAATTGC
GCTGAAGAATAGTCATGCATGTGTTGAAGGGGCGATGCATCATGACTGTCCAATCTGCTT
CGAGTACTTGTTCGATTCGACAAATGATGTTTCCGTCCTGCCTTGTGGTCATACCATTCA
TGTAAAGTGCCTGAAAGAAATGGAAGAGCACTGCCAGTTTGCATGCCCCCTTTGCTCCAA
GTCGGTTTGTGACATGTCGAAGGCATGGGAAAGGCTCGACATGGAGCTGGCAACTCTGTC
TGACTCCTGTGATCACAAAATGGTCCGCATATTATGCAACGACTGCGGGGCAATATCAGA
TGTGCAGTTCCATTTGATTGCGCACAAGTGCCAGAATTGCAAGTCATACAACACCCGCCA
GATTTGAAGTAAGAATCGCAAGTCACACAACACCGTCAGATCTGAAATAGCAAATCCTGT
GGGGGTTTCTGCATTTCTTCAAGAAGCGTGATGGACTGATGGCCCCTTCCCGTGAGCTGC
TGAGCACCGGGATATCTGGCAAGACACTCATCACTGTATCCACTCCACTGGGTCCTGCGG
AGGCAAACAGCTCGAGATTGTATATCTGCTGCTAGCTGCCGCCCTTCGTTATGCATAAGC
CTACTCTTGCCGTTTTACTCCTGTCGCTCCGTGATTCTAGTGTAATAATGTCATATTTAC
TGTTGC