Gene sequences

How To ▶︎

JA

EN

TOP > About the Species(Zea mays ) > genome data >Gene sequences

Search

By Traits

Let’s Analyze!!

SNP Detection
(lang=JA only)

Other Tools

Data List

All

Trait-Related Loci

Zea mays

CDS Sequence

CDS ID	Zm00001d043426_T001
CDS Infomation	cds chromosome:B73_RefGen_v4:3:199479040:199481034:1 gene:Zm00001d043426 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding description:Pentatricopeptide repeat-containing protein
Sequence	ATGCCGCGTCCAAGCCCGCCGCTCTCCGAGTCCCTCTTCAACTCCCTCATCGCCTCCCGC TCCCGCACCGGTCGCGTTGTCGACGCCCTCTCGCTCCTCACGCGCATGCTTGCTGCCGGC GTCGCCCCGACCGCGTTCACCTTCTCACCGATCCTCGCCTCGCCTTCCGCCACCGCCTGC TGTGCCGCGCAGCTGCACCCGCACATTCTCAAGAGGGGCCTGCTCCACTGCGAGCCCTAC TCGGGGACCTCGCTAGTGGGGTTCTTCGGGCGAAGCGGGCGCTTCGACGAGGCGCTCAAG GTGTTCGGTGAAATGACCGTAAGGAGCGTTGTCACCTGGAATTGTCTCATCTATTCGTTT GTGCAGTTTGGACACAGCCGCGCTGCAGTGTCCTGGTTCAGGGAGCTCGTGAGAAGTGGC GATGGCTTGTCAGATGGCTCGTTTGTTGCCATATTGCCTTCGTTTGGGTTGCCAGAGCAA GTTCATGGTGTAATGAACAAAATTGGAATGGGTTCCCTCTCAGCAGTTGCAAATGCATTG CTGAATTCATACTGTACTTGTGGTGCAATAGATGTGGCAGAGAAGCTATTCAATGAGATA ATGTTTAGAGATGTGGTTTGTTGGAATACAATGATAACTGGTTTTGCAAGGAGTCATGTC CCAGAGAGAGCTTTTGAGCTTTTCTTGAGTATGCAACGTCAGGGCATTTTTCCAAATGAA ATTACATTTGCCAGTGTTCTGTATGCTTGCACCGTTATAGATGGACACAAACATGGGAGA TTTGTTCATGCGAAAATTATCAAGCACAATCTCAGCACAAGTGTGTCCGTGAACACTTCA TTGGTTGGTTTCTATGCAAATTGTAGTAGGGGTGATGCTCATAAAGTGCTTGAAGGGGTT CATGGAAATAGCACCACGTGTTGGAATGCTCTGATTTCTGGTCACTCTGATTGTGATGAT CCAACTTATTTGGTTATTGTGAGACACATGCTGCAATCAGGGATTAAACCAAATGAAGTT ACTTTGTCATCTCTCAAGGATCCATCACTATTGGATCTCCAGCAGGTTCACTCATTGGTC ATAAGATTGGGTCATGGTGGTAATGACTATGTTTCAAGTGCTATCATATCATCGTATGCT TCACATGGCATTATTTTTGATGCCTTATCTTATGGAGCTGCACTGGATCCAGACTCATGT AGTGTTTCTATGAATGTTTTAGCTGGTGTCTGTAACAAAGCTCACATGTACCAAGAAACT AAGGACCTACTTCTACATAAGCGAGATCGAGATACTATTTCATGGAGCATACTCATTACT GCTTGCGCACGGAATGGTGATTTCATTGAAGCTTTTGGATTTTTCAGGCAGATGAGGATC TTTGGGCACCGTTTTGATAGTTATGTATGTGTGAGCTTGCTGGGCATTTGTACCAAAAAC AATAGCCTTTATCTTGGTAAGTTGATTCATGGACTTTTCATCAAGACCAATTCCAGTTGC TCTGACAGTTATGTTGATAATATGTTGCTAGATATGTATGCTAAATGTGGTAGAATTGAA GACTGTCTCAGAGTCTTTGAGGAAATGGAAGACAGGAACCTTATATCATGGACAACTGTG ATTTCAGGACTTGGACTTAATGGTTTTTCTCGTAAGGCCTTGGCATTGTTTAAAGCCATG GAAAAGGATGGCTGCAAACCTGACAAAGTAGCAATTCTAGCAGTCCTGTCATCTTGTAGA CATGGTAGGCTTGTGCAGGAGGGGATGAAGATATTCAAAAATTTGAAAGCTGATTATTCA ATTGAAGCTGATATGGAGCATTACATTTGTGTGGTGGACATGCTATGCAAGTGTGGTTAT TTGAAGGAAGCTGAGGTCGTGATTAGAGGCATGCCTTTCCAACCAAGCACTGCCATATGT CGCACATTCCTCCAAGGATGCAAGACATATGGTGTTACAGAGGCACAAGTTTTTAGCCAG CCGTGGATCAAATAG

Peptide Sequence

PEP ID	Zm00001d043426_P001
PEP Infomation	pep chromosome:B73_RefGen_v4:3:199479040:199481034:1 gene:Zm00001d043426 transcript:Zm00001d043426_T001 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding description:Pentatricopeptide repeat-containing protein
Sequence	MPRPSPPLSESLFNSLIASRSRTGRVVDALSLLTRMLAAGVAPTAFTFSPILASPSATAC CAAQLHPHILKRGLLHCEPYSGTSLVGFFGRSGRFDEALKVFGEMTVRSVVTWNCLIYSF VQFGHSRAAVSWFRELVRSGDGLSDGSFVAILPSFGLPEQVHGVMNKIGMGSLSAVANAL LNSYCTCGAIDVAEKLFNEIMFRDVVCWNTMITGFARSHVPERAFELFLSMQRQGIFPNE ITFASVLYACTVIDGHKHGRFVHAKIIKHNLSTSVSVNTSLVGFYANCSRGDAHKVLEGV HGNSTTCWNALISGHSDCDDPTYLVIVRHMLQSGIKPNEVTLSSLKDPSLLDLQQVHSLV IRLGHGGNDYVSSAIISSYASHGIIFDALSYGAALDPDSCSVSMNVLAGVCNKAHMYQET KDLLLHKRDRDTISWSILITACARNGDFIEAFGFFRQMRIFGHRFDSYVCVSLLGICTKN NSLYLGKLIHGLFIKTNSSCSDSYVDNMLLDMYAKCGRIEDCLRVFEEMEDRNLISWTTV ISGLGLNGFSRKALALFKAMEKDGCKPDKVAILAVLSSCRHGRLVQEGMKIFKNLKADYS IEADMEHYICVVDMLCKCGYLKEAEVVIRGMPFQPSTAICRTFLQGCKTYGVTEAQVFSQ PWIK

Transcript Sequence

Transcript ID	Zm00001d043426_T001
Transcript Infomation	cdna chromosome:B73_RefGen_v4:3:199479040:199481034:1 gene:Zm00001d043426 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding description:Pentatricopeptide repeat-containing protein
Sequence	ATGCCGCGTCCAAGCCCGCCGCTCTCCGAGTCCCTCTTCAACTCCCTCATCGCCTCCCGC TCCCGCACCGGTCGCGTTGTCGACGCCCTCTCGCTCCTCACGCGCATGCTTGCTGCCGGC GTCGCCCCGACCGCGTTCACCTTCTCACCGATCCTCGCCTCGCCTTCCGCCACCGCCTGC TGTGCCGCGCAGCTGCACCCGCACATTCTCAAGAGGGGCCTGCTCCACTGCGAGCCCTAC TCGGGGACCTCGCTAGTGGGGTTCTTCGGGCGAAGCGGGCGCTTCGACGAGGCGCTCAAG GTGTTCGGTGAAATGACCGTAAGGAGCGTTGTCACCTGGAATTGTCTCATCTATTCGTTT GTGCAGTTTGGACACAGCCGCGCTGCAGTGTCCTGGTTCAGGGAGCTCGTGAGAAGTGGC GATGGCTTGTCAGATGGCTCGTTTGTTGCCATATTGCCTTCGTTTGGGTTGCCAGAGCAA GTTCATGGTGTAATGAACAAAATTGGAATGGGTTCCCTCTCAGCAGTTGCAAATGCATTG CTGAATTCATACTGTACTTGTGGTGCAATAGATGTGGCAGAGAAGCTATTCAATGAGATA ATGTTTAGAGATGTGGTTTGTTGGAATACAATGATAACTGGTTTTGCAAGGAGTCATGTC CCAGAGAGAGCTTTTGAGCTTTTCTTGAGTATGCAACGTCAGGGCATTTTTCCAAATGAA ATTACATTTGCCAGTGTTCTGTATGCTTGCACCGTTATAGATGGACACAAACATGGGAGA TTTGTTCATGCGAAAATTATCAAGCACAATCTCAGCACAAGTGTGTCCGTGAACACTTCA TTGGTTGGTTTCTATGCAAATTGTAGTAGGGGTGATGCTCATAAAGTGCTTGAAGGGGTT CATGGAAATAGCACCACGTGTTGGAATGCTCTGATTTCTGGTCACTCTGATTGTGATGAT CCAACTTATTTGGTTATTGTGAGACACATGCTGCAATCAGGGATTAAACCAAATGAAGTT ACTTTGTCATCTCTCAAGGATCCATCACTATTGGATCTCCAGCAGGTTCACTCATTGGTC ATAAGATTGGGTCATGGTGGTAATGACTATGTTTCAAGTGCTATCATATCATCGTATGCT TCACATGGCATTATTTTTGATGCCTTATCTTATGGAGCTGCACTGGATCCAGACTCATGT AGTGTTTCTATGAATGTTTTAGCTGGTGTCTGTAACAAAGCTCACATGTACCAAGAAACT AAGGACCTACTTCTACATAAGCGAGATCGAGATACTATTTCATGGAGCATACTCATTACT GCTTGCGCACGGAATGGTGATTTCATTGAAGCTTTTGGATTTTTCAGGCAGATGAGGATC TTTGGGCACCGTTTTGATAGTTATGTATGTGTGAGCTTGCTGGGCATTTGTACCAAAAAC AATAGCCTTTATCTTGGTAAGTTGATTCATGGACTTTTCATCAAGACCAATTCCAGTTGC TCTGACAGTTATGTTGATAATATGTTGCTAGATATGTATGCTAAATGTGGTAGAATTGAA GACTGTCTCAGAGTCTTTGAGGAAATGGAAGACAGGAACCTTATATCATGGACAACTGTG ATTTCAGGACTTGGACTTAATGGTTTTTCTCGTAAGGCCTTGGCATTGTTTAAAGCCATG GAAAAGGATGGCTGCAAACCTGACAAAGTAGCAATTCTAGCAGTCCTGTCATCTTGTAGA CATGGTAGGCTTGTGCAGGAGGGGATGAAGATATTCAAAAATTTGAAAGCTGATTATTCA ATTGAAGCTGATATGGAGCATTACATTTGTGTGGTGGACATGCTATGCAAGTGTGGTTAT TTGAAGGAAGCTGAGGTCGTGATTAGAGGCATGCCTTTCCAACCAAGCACTGCCATATGT CGCACATTCCTCCAAGGATGCAAGACATATGGTGTTACAGAGGCACAAGTTTTTAGCCAG CCGTGGATCAAATAG