Gene sequences

How To ▶︎

JA

EN

TOP > About the Species(Zea mays ) > genome data >Gene sequences

Search

By Traits

Let’s Analyze!!

SNP Detection
(lang=JA only)

Other Tools

Data List

All

Trait-Related Loci

Zea mays

CDS Sequence

CDS ID	Zm00001d041556_T004
CDS Infomation	cds chromosome:B73_RefGen_v4:3:127113443:127118515:-1 gene:Zm00001d041556 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding description:Importin subunit beta-1
Sequence	ATGGCGCTGGAGGACGGCTTCACGGCGACGTGCTTGGCTGCCGGTGTCCGGGCGGACAGG GGCTGGGCTACCGGTGGCCGGGCGACGTGCCCTGCCTGGGATCTGGACCTGGACGCAGAG TGCTGGACTGCCGGTGGCTGGGCGGCTGGCAGTAGCAGCTTGGGATATGCCTGGGCCCGG TGGCCGGCTCCTGCCTTGGAGTGCAGTGACGCAAGGGCCTTGGAGTGCAGTGACGCAAGG GCAAGGAGCCAGGTGCTAGGGACGCAGGATCCTAGGGTCGCTCGACGCCTCGGCTTGATG CCTGCTGCTGGCGGGTGGCGACTGGGTGGTTGGGGCAGAGTCAATATGTCGCTTGACGTT ACTCAAGTTCTCTTAAGTGCACAATCTGCTGATGGCGCAATTAGGAAGCATGCTGAAGAA AGCCTCATGCAATTCCAGGAGCAGAACCTCCCTGGGTTCTTGCTCTCCCTCTCAAGCGAG ATGGCCAGTGAAGAGAAACCTGAGGAGAGCCGCAGGTTAGCTGGCTTGATTCTGAAGAAT GCACTGGATGCAAAGGAGCAGCACAGGAAGAATGAACTTTTCCAGAGATGGCTGGCACTC GATACTGGTGCCAAGGCACATATTAAAGGATTGTTGTTGCAAACGCTCACATCTTCTGTC GCAAGTGCCAGATCCACTGCTTCCCAAGTTATTGCCAAGGTTGCCGGTATTGAGATTCCA CAGAAGCAATGGCCAGAGCTTATAGGGTCATTGCTCGCAAACATACATCAGGTTCAGCCA AATGTCAAGCAAGCAACACTTGAGACGCTTGGCTATTTATGTGAGGAAGTTTCTCCAGAT GCTGTTGAGCAAGATCAAGTCAATAAAATACTTACAGCTGTTGTTCAGGGTATGAATGCT TCTGAGGCAAACTCTGATGTGAGGCTTGCAGCTACACGGGCATTGTATAATGCTTTGGGC TTTGCTCAGGTTAACTTCTCAAATGACATGGAGCGTGACTATATCATGAGAGTAGTTTGT GAAGCGACACAGTCTCCAGAGGTGAAGATAAGGCAGGCCGCCTTTGAGTGTTTGGTGGCT ATCTCGTCTACTTATTATGATAAGCTGGCAACAGACATGCAGGATATATTTAATATAACT GCAAAAGCTGTGAGGGGAGATGAGGAGTCAGTTGCACTCCAGGCTATTGAATTCTGGAGT TCCATATGCGATGAGGAAATTGATATTCTGGATGAGTACAGCAGTGAATTTACAGCTGAT TCCGATGTTCCTTGCTACTACTTTATCAAGCAGGCTCTTCCTGCCTTGGTGCCTATGTTG TTGGAAACTCTCCTCAAGCAAGAGGAAGACCAAGACTTGGATGAAGGTGCTTGGAATCTT GCAATGGCTGGGGGAACTTGTTTGGGCCTGGTGGCAAGGACCGTTGGTGATGACATTGTT CCTCTTGTAATGCCTTTTGTGGAGGAGAACATAACCAAGTCTGAGTGGAGACAAAGAGAG GCTGCAACATATGCCTTTGGCTCTATCTTGGAGGGCCCATCAGCTGATAAACTGGCTCCT CTTGTTAATGTTGCATTGGGCTTCATGCTGTCTGCACTGATGAAGGATCCAAGCAACCAT GTGAAGGACACAACTGCTTGGACCCTTGGGAGAATCTTTGAGTTCCTTCATGGTTCAGCG CTTGAAACTCCTCCTATCATCACAGGTGAGAATTGTCAGCAAATACTTACTGTGCTGCTT CACAGCATGAAGGATGTCCCAAATGTGGCTGAAAAGGCATGTGGAGCCCTATATTTCCTT GCACAAGGCTATGTTGATGCTGGATCTGCATCACCATTATCCCCTTTCTTTCAAGATATC GTTCAGAACCTGCTTATGGTCACTCACAGGGACGATGCTGGAGAATCTCGGTTGCGAACA GCAGCATATGAGACCCTAAATGAAGTTGTCAGGTGCTCCACTGAGGAGACGGCCCCTATT GTTATGCAGTTAGTACCTGTGATCATGGTGGAGCTCCATCAGACACTGGAAGCTGAAAAG CTGTCAACTGATGAGAGGGAGAAGAGGAGCGAACTGCAGGGCCTCCTTTGTGGTTGCTTG CAGGTCATAATCCAAAAGTTAGGGGGGATGGAGTCAACTAAGTACTCTTTCTTGCAGTAT GCTGATCAGATGATGGATCTGTTTTTGAAAGTTTTCGCATGTCGAAATGCCACAGTACAC GAAGAAGCTATGCTTGCTATTGGTGCATTGGCATATGCAGCTGGCCCAAACTTTGCAAAG TACATGACACAGTTTTATCAGTATTTGGAGATGGGACTTCAGAACTTTGAGGAGTATCAG GTGTGTGCCATTACCGTGGGTGTTGTTGGTGACCTCTGCAGAGCACTGGAAGACAAAATT TTACCCTTCTGCGATGGCATCATGACCCAGCTCCTGAAGGACCTGTCCAGTAACCAGTTG CACAGATCTGTGAAACCACCGATATTTTCGTGCTTTGGTGATATAGCACTGGCAATTGGG GAGGACTTTGAGAAGTATTTGATCTATGCGATGCCTATGCTGCAAAGTGCTGCTGATTTG TCGGCCCATACCACTGCAACTGATGATGAGATGCTCGACTACACCAATCAGCTAAGAAAT GGAATCTTGGAAGCCTACTCTGGTATCCTGCAAGGATTTAAGAGTTCACCTAAGACACAA CTGCTGATGCCATTCGCTCCGCATATTATTCAGTTCCTTGATGCTCTGTACAATGGGAAG GATATGGATGATACTGTGATGAAGACTGCAATAGGTGTCTTGGGAGATCTGGCTGACACA TTAGGTGTCCATGCTGGCCCTTTGATCAATCAATCCACCTCAAGCCAGGCATTTTTAGAG GAATGCTTGGCATCAGACGATCCTTTGGTGAAAGAATCTGCCGATTGGGCGAGGATAGCA GTCAGCCGTGCAGTTTCGGGTTGA

Peptide Sequence

PEP ID	Zm00001d041556_P004
PEP Infomation	pep chromosome:B73_RefGen_v4:3:127113443:127118515:-1 gene:Zm00001d041556 transcript:Zm00001d041556_T004 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding description:Importin subunit beta-1
Sequence	MALEDGFTATCLAAGVRADRGWATGGRATCPAWDLDLDAECWTAGGWAAGSSSLGYAWAR WPAPALECSDARALECSDARARSQVLGTQDPRVARRLGLMPAAGGWRLGGWGRVNMSLDV TQVLLSAQSADGAIRKHAEESLMQFQEQNLPGFLLSLSSEMASEEKPEESRRLAGLILKN ALDAKEQHRKNELFQRWLALDTGAKAHIKGLLLQTLTSSVASARSTASQVIAKVAGIEIP QKQWPELIGSLLANIHQVQPNVKQATLETLGYLCEEVSPDAVEQDQVNKILTAVVQGMNA SEANSDVRLAATRALYNALGFAQVNFSNDMERDYIMRVVCEATQSPEVKIRQAAFECLVA ISSTYYDKLATDMQDIFNITAKAVRGDEESVALQAIEFWSSICDEEIDILDEYSSEFTAD SDVPCYYFIKQALPALVPMLLETLLKQEEDQDLDEGAWNLAMAGGTCLGLVARTVGDDIV PLVMPFVEENITKSEWRQREAATYAFGSILEGPSADKLAPLVNVALGFMLSALMKDPSNH VKDTTAWTLGRIFEFLHGSALETPPIITGENCQQILTVLLHSMKDVPNVAEKACGALYFL AQGYVDAGSASPLSPFFQDIVQNLLMVTHRDDAGESRLRTAAYETLNEVVRCSTEETAPI VMQLVPVIMVELHQTLEAEKLSTDEREKRSELQGLLCGCLQVIIQKLGGMESTKYSFLQY ADQMMDLFLKVFACRNATVHEEAMLAIGALAYAAGPNFAKYMTQFYQYLEMGLQNFEEYQ VCAITVGVVGDLCRALEDKILPFCDGIMTQLLKDLSSNQLHRSVKPPIFSCFGDIALAIG EDFEKYLIYAMPMLQSAADLSAHTTATDDEMLDYTNQLRNGILEAYSGILQGFKSSPKTQ LLMPFAPHIIQFLDALYNGKDMDDTVMKTAIGVLGDLADTLGVHAGPLINQSTSSQAFLE ECLASDDPLVKESADWARIAVSRAVSG

Transcript Sequence

Transcript ID	Zm00001d041556_T004
Transcript Infomation	cdna chromosome:B73_RefGen_v4:3:127113443:127118515:-1 gene:Zm00001d041556 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding description:Importin subunit beta-1
Sequence	ATGGCGCTGGAGGACGGCTTCACGGCGACGTGCTTGGCTGCCGGTGTCCGGGCGGACAGG GGCTGGGCTACCGGTGGCCGGGCGACGTGCCCTGCCTGGGATCTGGACCTGGACGCAGAG TGCTGGACTGCCGGTGGCTGGGCGGCTGGCAGTAGCAGCTTGGGATATGCCTGGGCCCGG TGGCCGGCTCCTGCCTTGGAGTGCAGTGACGCAAGGGCCTTGGAGTGCAGTGACGCAAGG GCAAGGAGCCAGGTGCTAGGGACGCAGGATCCTAGGGTCGCTCGACGCCTCGGCTTGATG CCTGCTGCTGGCGGGTGGCGACTGGGTGGTTGGGGCAGAGTCAATATGTCGCTTGACGTT ACTCAAGTTCTCTTAAGTGCACAATCTGCTGATGGCGCAATTAGGAAGCATGCTGAAGAA AGCCTCATGCAATTCCAGGAGCAGAACCTCCCTGGGTTCTTGCTCTCCCTCTCAAGCGAG ATGGCCAGTGAAGAGAAACCTGAGGAGAGCCGCAGGTTAGCTGGCTTGATTCTGAAGAAT GCACTGGATGCAAAGGAGCAGCACAGGAAGAATGAACTTTTCCAGAGATGGCTGGCACTC GATACTGGTGCCAAGGCACATATTAAAGGATTGTTGTTGCAAACGCTCACATCTTCTGTC GCAAGTGCCAGATCCACTGCTTCCCAAGTTATTGCCAAGGTTGCCGGTATTGAGATTCCA CAGAAGCAATGGCCAGAGCTTATAGGGTCATTGCTCGCAAACATACATCAGGTTCAGCCA AATGTCAAGCAAGCAACACTTGAGACGCTTGGCTATTTATGTGAGGAAGTTTCTCCAGAT GCTGTTGAGCAAGATCAAGTCAATAAAATACTTACAGCTGTTGTTCAGGGTATGAATGCT TCTGAGGCAAACTCTGATGTGAGGCTTGCAGCTACACGGGCATTGTATAATGCTTTGGGC TTTGCTCAGGTTAACTTCTCAAATGACATGGAGCGTGACTATATCATGAGAGTAGTTTGT GAAGCGACACAGTCTCCAGAGGTGAAGATAAGGCAGGCCGCCTTTGAGTGTTTGGTGGCT ATCTCGTCTACTTATTATGATAAGCTGGCAACAGACATGCAGGATATATTTAATATAACT GCAAAAGCTGTGAGGGGAGATGAGGAGTCAGTTGCACTCCAGGCTATTGAATTCTGGAGT TCCATATGCGATGAGGAAATTGATATTCTGGATGAGTACAGCAGTGAATTTACAGCTGAT TCCGATGTTCCTTGCTACTACTTTATCAAGCAGGCTCTTCCTGCCTTGGTGCCTATGTTG TTGGAAACTCTCCTCAAGCAAGAGGAAGACCAAGACTTGGATGAAGGTGCTTGGAATCTT GCAATGGCTGGGGGAACTTGTTTGGGCCTGGTGGCAAGGACCGTTGGTGATGACATTGTT CCTCTTGTAATGCCTTTTGTGGAGGAGAACATAACCAAGTCTGAGTGGAGACAAAGAGAG GCTGCAACATATGCCTTTGGCTCTATCTTGGAGGGCCCATCAGCTGATAAACTGGCTCCT CTTGTTAATGTTGCATTGGGCTTCATGCTGTCTGCACTGATGAAGGATCCAAGCAACCAT GTGAAGGACACAACTGCTTGGACCCTTGGGAGAATCTTTGAGTTCCTTCATGGTTCAGCG CTTGAAACTCCTCCTATCATCACAGGTGAGAATTGTCAGCAAATACTTACTGTGCTGCTT CACAGCATGAAGGATGTCCCAAATGTGGCTGAAAAGGCATGTGGAGCCCTATATTTCCTT GCACAAGGCTATGTTGATGCTGGATCTGCATCACCATTATCCCCTTTCTTTCAAGATATC GTTCAGAACCTGCTTATGGTCACTCACAGGGACGATGCTGGAGAATCTCGGTTGCGAACA GCAGCATATGAGACCCTAAATGAAGTTGTCAGGTGCTCCACTGAGGAGACGGCCCCTATT GTTATGCAGTTAGTACCTGTGATCATGGTGGAGCTCCATCAGACACTGGAAGCTGAAAAG CTGTCAACTGATGAGAGGGAGAAGAGGAGCGAACTGCAGGGCCTCCTTTGTGGTTGCTTG CAGGTCATAATCCAAAAGTTAGGGGGGATGGAGTCAACTAAGTACTCTTTCTTGCAGTAT GCTGATCAGATGATGGATCTGTTTTTGAAAGTTTTCGCATGTCGAAATGCCACAGTACAC GAAGAAGCTATGCTTGCTATTGGTGCATTGGCATATGCAGCTGGCCCAAACTTTGCAAAG TACATGACACAGTTTTATCAGTATTTGGAGATGGGACTTCAGAACTTTGAGGAGTATCAG GTGTGTGCCATTACCGTGGGTGTTGTTGGTGACCTCTGCAGAGCACTGGAAGACAAAATT TTACCCTTCTGCGATGGCATCATGACCCAGCTCCTGAAGGACCTGTCCAGTAACCAGTTG CACAGATCTGTGAAACCACCGATATTTTCGTGCTTTGGTGATATAGCACTGGCAATTGGG GAGGACTTTGAGAAGTATTTGATCTATGCGATGCCTATGCTGCAAAGTGCTGCTGATTTG TCGGCCCATACCACTGCAACTGATGATGAGATGCTCGACTACACCAATCAGCTAAGAAAT GGAATCTTGGAAGCCTACTCTGGTATCCTGCAAGGATTTAAGAGTTCACCTAAGACACAA CTGCTGATGCCATTCGCTCCGCATATTATTCAGTTCCTTGATGCTCTGTACAATGGGAAG GATATGGATGATACTGTGATGAAGACTGCAATAGGTGTCTTGGGAGATCTGGCTGACACA TTAGGTGTCCATGCTGGCCCTTTGATCAATCAATCCACCTCAAGCCAGGCATTTTTAGAG GAATGCTTGGCATCAGACGATCCTTTGGTGAAAGAATCTGCCGATTGGGCGAGGATAGCA GTCAGCCGTGCAGTTTCGGGTTGATGCCACAACCTGCTCTTCGGTGAAGTCCAACATCTT TACAGCAGAGTCGGAGGGTCCCCACTAACTCATGCATCAGTACATGTGTCAACCCGCGCC CCGCTTCGGCGGGAAAAGAAGGGTTCAAGTTGGCCGCCCACTAACTTTCGCCAAATGCAT CTGCAACCTTCATGTCTTGTTGGAGGTGAGATGAGGTTCTATTATCGCATGACATGCTCA CAGATTCCTGTGCATGGCATGCCTATGATATGTGGCCCATCATTTCCTCCCCTGTATCCA TCCCATGCATCAAAGTTTGGTCAGATGGCCACGTGGGACAAAAGGCGCAGTTTCTTGCTG CTGCTCCAGTAAGAAAGAGCGGGCTCGAATCGCGTTGTCACAGGATTATTTTTGTATCGA TCAGGGTGGCCAAGTCCATTTATGTCAGACATATCCTCCCTGCTGCTGCTGGTAGGTTGT GAATTTCCTAGCATTCTTTTCCCTTTGGCCGCTTGCATTGTCTTTGCATTTCATTCTTGG TCGGTCTATTTTGTAAGAGTTGCTTTGGGGGCAAAACATGTGTCCTGTCCGGTCTGCTAC CG