Gene sequences

How To ▶︎

JA

EN

TOP > About the Species(Zea mays ) > genome data >Gene sequences

Search

By Traits

Let’s Analyze!!

SNP Detection
(lang=JA only)

Other Tools

Data List

All

Trait-Related Loci

Zea mays

CDS Sequence

CDS ID	Zm00001d039078_T001
CDS Infomation	cds chromosome:B73_RefGen_v4:6:169680125:169682173:-1 gene:Zm00001d039078 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding description:Putative pentatricopeptide repeat family protein
Sequence	ATGGCCAGACCCTGCGGCGCCGCGCTCCAGCGGCACGCGGCAGTGGCCGTCCTTCGCGCG GCCGCCGCCGCTGGCGACCTGTCCAAGGGGAAGGCGCTCCACGCCCGTCTCATCACAGCC GCCCATTTCGACGTCGTCCTGCACAACAACCTCATCTCCTTCTACGCCAAGTGCGGCCGG GTCGGGCTCGCCCGCACGGTGTTCGACGCCATGCCCTTCCGGAACGCCGTGTCCGCAAAC CTCCTCATGTCCGGATACGCTTCCTCGGGGCGCCATAAGGAATCGCTCCAGCTGCTCAGG GTGGTCGACTTTGGCATGAACGAGTACGTTCTGTCGGCAGCGGTGTCCGCGACCGCCAAT GTCAGGAGCTATGACATGGGGAGGCAGTGCCATGGGTATGCTGTTAAGGCTGGCTTCGCG GAGCAACGCTATGTTTTCAACGCGGTGCTATATATGTACTGCCAGTGTGCTCACATGGAG GATGCGTCCAAGGTATTTGAGAGTGTGTCCGGTTTTGATGCATTCGCGTTCAACTCAATG ATAAATGGGTATCTTGATCGAGGGCAACTGGATGGTTCATTAGGGATTGTGAGAAATATG ACCGGGGAGGCTGAGAAATGGGATTATGTGTCTTATGTCGCAGTTCTTGGTCATTGTGCT AGCATGAAGGACTCTGTTCTTGGGGCTCAGGTGCATGCCCAGGCTTTGAAGAAGAGGCTA GAACTAAATGTGTATGTGGGGAGTGCACTTGTTGATATGTATGGGAAATGTGACCATGTT CATGATGCTAATCGTGCATTTGAGGTTTTGCCAGAAAAGAATGTTGTTTCTTGGACAGCT GTTATGACTGCTTACACCCAGAATGAGCTGTATGAAGATGCATTGCAGTTGTTCTTGGAC ATGGAGATGGAAGGAGTTCAACCCAATGAGTTCACTTATGCTGTGGCTCTCAACAGCTGT GCTGGCCTTGCAGCCTTGAGAACTGGTAACGCCCTTGGTGCCTGTGTTATGAAAACTGGG CATTGGGACCATTTGCTAGTCAGTAATGCCCTCATGAACATGTACTCAAAGAGTGGAAGC ATTGAGGATGCGCACAGGGTCTTCATTTCCATGCCACTTCGTGATGTAGTCTCTTGGAAT TTGATCATCACAGGCTATGCGCATCATGGCCTTGCAAGGGAAGGAATGGAAGCATTTCAC AGTATGCTATCAGCAGCAGTGATCCCATCCTATGTCACCTTTGTCGGAGTATTGTCAGCT TGTGCTCAGTTGGGTCTTGTTGATGAAGCATTCTACTACTTGAATACTATGATGAAGGAA GTTGGAATTACACCTGGGAAGGAACATTATACTTGTATGGTTGGTTTATTATGCAGAGTT GGAAGGCTAGATGAGGCTGAGAGGTTCATAGTGAATAACTGCATTGGCACAGATGTTGTT GCATGGCGATCACTGCTAAATTCTTGTCAGGTATATAAAAATTATGGTCTTGGTCATCGA GTAGCTGAACAGATTCTTCAGTTGGAGCCCAGTGATGTTGGAACCTATGTTTTACTCTCT AACATGTATGCAAAAGCCAACCGATGGGATGGCGTTGTGAAGGTCCGGAAGCATATGAGG GAGAGGGCCGTTAGGAAGTCACCTGGTGTTAGTTGGATTCACGTGGGAAGTGATGTTCAT GTTTTCACATCGGAGGAGAAGGTACATCCGCAGATGGACCAAATCGCCAAAAAACTTGAA GAGCTGATCGACCAGATAAAAGCTATCGGATATGTTCCAAACTTCGCAGTGGTCCTTCAT GATATTGATGATGAACGAAAAGAGGAGCACCTTATGTATCATAGTGAGAAATTGGCTCTA GCCTTTGGCCTTATTCACACACCTAAGGGAGCAACAATCCATATCATGAAAAACCTCAGG ATATGTGATGATTGCCATGTTGCTATCAAACTCATATCAGTTGTTACTAGCAGAAAAATA GTTGTAAGAGATGCTGTTCGATTTCATTGTATAGAAGGTGGCATTTGCTCATGCAATGAT TATTGGTGA

Peptide Sequence

PEP ID	Zm00001d039078_P001
PEP Infomation	pep chromosome:B73_RefGen_v4:6:169680125:169682173:-1 gene:Zm00001d039078 transcript:Zm00001d039078_T001 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding description:Putative pentatricopeptide repeat family protein
Sequence	MARPCGAALQRHAAVAVLRAAAAAGDLSKGKALHARLITAAHFDVVLHNNLISFYAKCGR VGLARTVFDAMPFRNAVSANLLMSGYASSGRHKESLQLLRVVDFGMNEYVLSAAVSATAN VRSYDMGRQCHGYAVKAGFAEQRYVFNAVLYMYCQCAHMEDASKVFESVSGFDAFAFNSM INGYLDRGQLDGSLGIVRNMTGEAEKWDYVSYVAVLGHCASMKDSVLGAQVHAQALKKRL ELNVYVGSALVDMYGKCDHVHDANRAFEVLPEKNVVSWTAVMTAYTQNELYEDALQLFLD MEMEGVQPNEFTYAVALNSCAGLAALRTGNALGACVMKTGHWDHLLVSNALMNMYSKSGS IEDAHRVFISMPLRDVVSWNLIITGYAHHGLAREGMEAFHSMLSAAVIPSYVTFVGVLSA CAQLGLVDEAFYYLNTMMKEVGITPGKEHYTCMVGLLCRVGRLDEAERFIVNNCIGTDVV AWRSLLNSCQVYKNYGLGHRVAEQILQLEPSDVGTYVLLSNMYAKANRWDGVVKVRKHMR ERAVRKSPGVSWIHVGSDVHVFTSEEKVHPQMDQIAKKLEELIDQIKAIGYVPNFAVVLH DIDDERKEEHLMYHSEKLALAFGLIHTPKGATIHIMKNLRICDDCHVAIKLISVVTSRKI VVRDAVRFHCIEGGICSCNDYW

Transcript Sequence

Transcript ID	Zm00001d039078_T001
Transcript Infomation	cdna chromosome:B73_RefGen_v4:6:169680125:169682173:-1 gene:Zm00001d039078 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding description:Putative pentatricopeptide repeat family protein
Sequence	ATGGCCAGACCCTGCGGCGCCGCGCTCCAGCGGCACGCGGCAGTGGCCGTCCTTCGCGCG GCCGCCGCCGCTGGCGACCTGTCCAAGGGGAAGGCGCTCCACGCCCGTCTCATCACAGCC GCCCATTTCGACGTCGTCCTGCACAACAACCTCATCTCCTTCTACGCCAAGTGCGGCCGG GTCGGGCTCGCCCGCACGGTGTTCGACGCCATGCCCTTCCGGAACGCCGTGTCCGCAAAC CTCCTCATGTCCGGATACGCTTCCTCGGGGCGCCATAAGGAATCGCTCCAGCTGCTCAGG GTGGTCGACTTTGGCATGAACGAGTACGTTCTGTCGGCAGCGGTGTCCGCGACCGCCAAT GTCAGGAGCTATGACATGGGGAGGCAGTGCCATGGGTATGCTGTTAAGGCTGGCTTCGCG GAGCAACGCTATGTTTTCAACGCGGTGCTATATATGTACTGCCAGTGTGCTCACATGGAG GATGCGTCCAAGGTATTTGAGAGTGTGTCCGGTTTTGATGCATTCGCGTTCAACTCAATG ATAAATGGGTATCTTGATCGAGGGCAACTGGATGGTTCATTAGGGATTGTGAGAAATATG ACCGGGGAGGCTGAGAAATGGGATTATGTGTCTTATGTCGCAGTTCTTGGTCATTGTGCT AGCATGAAGGACTCTGTTCTTGGGGCTCAGGTGCATGCCCAGGCTTTGAAGAAGAGGCTA GAACTAAATGTGTATGTGGGGAGTGCACTTGTTGATATGTATGGGAAATGTGACCATGTT CATGATGCTAATCGTGCATTTGAGGTTTTGCCAGAAAAGAATGTTGTTTCTTGGACAGCT GTTATGACTGCTTACACCCAGAATGAGCTGTATGAAGATGCATTGCAGTTGTTCTTGGAC ATGGAGATGGAAGGAGTTCAACCCAATGAGTTCACTTATGCTGTGGCTCTCAACAGCTGT GCTGGCCTTGCAGCCTTGAGAACTGGTAACGCCCTTGGTGCCTGTGTTATGAAAACTGGG CATTGGGACCATTTGCTAGTCAGTAATGCCCTCATGAACATGTACTCAAAGAGTGGAAGC ATTGAGGATGCGCACAGGGTCTTCATTTCCATGCCACTTCGTGATGTAGTCTCTTGGAAT TTGATCATCACAGGCTATGCGCATCATGGCCTTGCAAGGGAAGGAATGGAAGCATTTCAC AGTATGCTATCAGCAGCAGTGATCCCATCCTATGTCACCTTTGTCGGAGTATTGTCAGCT TGTGCTCAGTTGGGTCTTGTTGATGAAGCATTCTACTACTTGAATACTATGATGAAGGAA GTTGGAATTACACCTGGGAAGGAACATTATACTTGTATGGTTGGTTTATTATGCAGAGTT GGAAGGCTAGATGAGGCTGAGAGGTTCATAGTGAATAACTGCATTGGCACAGATGTTGTT GCATGGCGATCACTGCTAAATTCTTGTCAGGTATATAAAAATTATGGTCTTGGTCATCGA GTAGCTGAACAGATTCTTCAGTTGGAGCCCAGTGATGTTGGAACCTATGTTTTACTCTCT AACATGTATGCAAAAGCCAACCGATGGGATGGCGTTGTGAAGGTCCGGAAGCATATGAGG GAGAGGGCCGTTAGGAAGTCACCTGGTGTTAGTTGGATTCACGTGGGAAGTGATGTTCAT GTTTTCACATCGGAGGAGAAGGTACATCCGCAGATGGACCAAATCGCCAAAAAACTTGAA GAGCTGATCGACCAGATAAAAGCTATCGGATATGTTCCAAACTTCGCAGTGGTCCTTCAT GATATTGATGATGAACGAAAAGAGGAGCACCTTATGTATCATAGTGAGAAATTGGCTCTA GCCTTTGGCCTTATTCACACACCTAAGGGAGCAACAATCCATATCATGAAAAACCTCAGG ATATGTGATGATTGCCATGTTGCTATCAAACTCATATCAGTTGTTACTAGCAGAAAAATA GTTGTAAGAGATGCTGTTCGATTTCATTGTATAGAAGGTGGCATTTGCTCATGCAATGAT TATTGGTGA