Gene sequences

How To ▶︎

JA

EN

TOP > About the Species(Zea mays ) > genome data >Gene sequences

Search

By Traits

Let’s Analyze!!

SNP Detection
(lang=JA only)

Other Tools

Data List

All

Trait-Related Loci

Zea mays

CDS Sequence

CDS ID	Zm00001d037492_T005
CDS Infomation	cds chromosome:B73_RefGen_v4:6:127211187:127215144:1 gene:Zm00001d037492 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding description:Pyrophosphate-energized vacuolar membrane proton pump 1
Sequence	ATGTCCATCTTTGCTGTTGTGATCTTCCTCTTCCTTGGTTCGGTTGAGGGATTCAGCACG AAGAGCCAGCCCTGCACCTATAGCAAGGACAAGTACTGCAAGCCTGCACTGTTCACTGCA CTCTTTAGCACTGTGTCCTTCTTGCTTGGAGCCATCACCTCTCTGGTCTCCGGTTTCCTT GGCATGAAGATTGCCACATATGCGAATGCCAGAACTACCCTGGAAGCTAGGAAGGGTGTT GGCAAGGCTTTTATCACCGCTTTTCGCTCTGGTGCTGTTATGGGCTTCCTGCTTGCATCA AGTGGGCTTGTGGTTCTGTACATCACCATTAATGTATTTAAGTTGTATTACGGTGATGAC TGGGAGGGTCTTTTTGAGTCTATCACTGGCTATGGCCTTGGTGGGTCGTCCATGGCTCTC TTTGGAAGAGTTGGTGGAGGCATCTACACAAAGGCTGCTGACGTTGGTGCTGATCTTGTT GGAAAGGTCGAGAGGAACATTCCTGAGGATGATCCTAGGAACCCAGCTGTGATTGCTGAT AATGTCGGTGACAATGTTGGTGACATTGCTGGAATGGGATCTGATCTCTTTGGGTCATAT GCAGAGTCTTCCTGTGCTGCCCTTGTTGTTGCGTCTATTTCATCTTTCGGAATCAACCAT GATTTCACTGGGATGTGCTACCCACTCCTTGTTAGCTCTGTTGGTATCATTGTCTGCTTG ATCACCACCCTTTTTGCTACTGATTTCTTTGAAGTCAAGGCTGTGAAAGAAATTGAGCCT GCACTTAAGAAGCAGCTCATCATCTCCACTGTCCTGATGACTGTTGGTATTGCTGTAATC AGCTGGTTGGCCCTTCCAGCTAAGTTTACCATCTTCAACTTTGGTACTCAGAAGGATGTC TCCAACTGGGGCTTGTTCTTCTGTGTTGCAATTGGTCTGTGGGCTGGTCTGATTATTGGT TTTGTCACAGAATACTACACTAGCAATGCATACAGTCCTGTGCAAGACGTTGCAGATTCT TGCAGAACTGGTGCTGCCACTAATGTCATTTTTGGTCTTGCTCTTGGATACAAGTCAGTT ATCATCCCGATTTTCGCTATCGCTGTTAGCATCTATGTCAGTTTCTCCATTGCTGCAATG TACGGCATCGCAGTTGCCGCTCTTGGTATGCTGAGCACAATTGCAACTGGTCTTGCTATT GATGCTTATGGTCCCATCAGTGACAATGCTGGTGGTATTGCTGAGATGGCTGGAATGAGT CACAGAATCCGTGAGAGAACTGATGCTCTTGATGCTGCTGGCAACACCACTGCCGCTATT GGAAAGGGATTTGCCATTGGTTCAGCTGCTCTTGTGTCTCTGGCGCTTTTTGGTGCCTTC GTCAGCAGAGCTGGAGTGAAGGTTGTCGATGTCCTCTCCCCCAAGGTTTTCATTGGTTTG ATTGTTGGAGCCATGCTTCCCTATTGGTTCTCTGCCATGACCATGAAGAGTGTTGGAAGT GCCGCCCTAAAGATGGTGGAGGAGGTCCGCAGACAGTTCAACACCATTCCTGGGTTGATG GAGGGAACTGCCAAGCCTGACTATGCAACCTGTGTGAAGATCTCCACTGATGCTTCCATC AAGGAGATGATTCCTCCTGGTGCTCTGGTCATGCTCACTCCCCTCATTGTTGGAACCCTC TTCGGTGTTGAGACTCTCTCTGGTGTTCTTGCCGGTGCCCTGGTTTCTGGAGTGCAGATT GCCATCTCTGCTTCCAACACCGGTGGTGCATGGGACAATGCTAAGAAGTACATTGAGGCT GGTGCCAGCGAGCATGCCAGGACCCTCGGCCCCAAGGGATCTGACTGCCACAAGGCTGCT GTGATAGGTGACACCATTGGTGACCCCCTGAAGGACACCTCGGGCCCGTCCCTCAACATC CTGATCAAGCTCATGGCGGTGGAGTCCCTTGTGTTTGCCCCCTTCTTCGCCACCCACGGT GGCCTGCTGTTCAAGTACCTGTAA

Peptide Sequence

PEP ID	Zm00001d037492_P005
PEP Infomation	pep chromosome:B73_RefGen_v4:6:127211187:127215144:1 gene:Zm00001d037492 transcript:Zm00001d037492_T005 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding description:Pyrophosphate-energized vacuolar membrane proton pump 1
Sequence	MSIFAVVIFLFLGSVEGFSTKSQPCTYSKDKYCKPALFTALFSTVSFLLGAITSLVSGFL GMKIATYANARTTLEARKGVGKAFITAFRSGAVMGFLLASSGLVVLYITINVFKLYYGDD WEGLFESITGYGLGGSSMALFGRVGGGIYTKAADVGADLVGKVERNIPEDDPRNPAVIAD NVGDNVGDIAGMGSDLFGSYAESSCAALVVASISSFGINHDFTGMCYPLLVSSVGIIVCL ITTLFATDFFEVKAVKEIEPALKKQLIISTVLMTVGIAVISWLALPAKFTIFNFGTQKDV SNWGLFFCVAIGLWAGLIIGFVTEYYTSNAYSPVQDVADSCRTGAATNVIFGLALGYKSV IIPIFAIAVSIYVSFSIAAMYGIAVAALGMLSTIATGLAIDAYGPISDNAGGIAEMAGMS HRIRERTDALDAAGNTTAAIGKGFAIGSAALVSLALFGAFVSRAGVKVVDVLSPKVFIGL IVGAMLPYWFSAMTMKSVGSAALKMVEEVRRQFNTIPGLMEGTAKPDYATCVKISTDASI KEMIPPGALVMLTPLIVGTLFGVETLSGVLAGALVSGVQIAISASNTGGAWDNAKKYIEA GASEHARTLGPKGSDCHKAAVIGDTIGDPLKDTSGPSLNILIKLMAVESLVFAPFFATHG GLLFKYL

Transcript Sequence

Transcript ID	Zm00001d037492_T005
Transcript Infomation	cdna chromosome:B73_RefGen_v4:6:127211187:127215144:1 gene:Zm00001d037492 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding description:Pyrophosphate-energized vacuolar membrane proton pump 1
Sequence	AATATCTGCGTGGGGGTGTCGGTACCTCTGTGGGGGCTGCCAATTGGTGTACCCCCTTCA AAAGTTCAAACCATGCACATTTTCTATGATATTTTTGGTTGCTACTGGCACCTGTCCCAC AACGTGGATTTTTAAGAGCAACATCGTTTCTTTTCACTGAGTACCAATATGTTGGTATCT TCATGTCCATCTTTGCTGTTGTGATCTTCCTCTTCCTTGGTTCGGTTGAGGGATTCAGCA CGAAGAGCCAGCCCTGCACCTATAGCAAGGACAAGTACTGCAAGCCTGCACTGTTCACTG CACTCTTTAGCACTGTGTCCTTCTTGCTTGGAGCCATCACCTCTCTGGTCTCCGGTTTCC TTGGCATGAAGATTGCCACATATGCGAATGCCAGAACTACCCTGGAAGCTAGGAAGGGTG TTGGCAAGGCTTTTATCACCGCTTTTCGCTCTGGTGCTGTTATGGGCTTCCTGCTTGCAT CAAGTGGGCTTGTGGTTCTGTACATCACCATTAATGTATTTAAGTTGTATTACGGTGATG ACTGGGAGGGTCTTTTTGAGTCTATCACTGGCTATGGCCTTGGTGGGTCGTCCATGGCTC TCTTTGGAAGAGTTGGTGGAGGCATCTACACAAAGGCTGCTGACGTTGGTGCTGATCTTG TTGGAAAGGTCGAGAGGAACATTCCTGAGGATGATCCTAGGAACCCAGCTGTGATTGCTG ATAATGTCGGTGACAATGTTGGTGACATTGCTGGAATGGGATCTGATCTCTTTGGGTCAT ATGCAGAGTCTTCCTGTGCTGCCCTTGTTGTTGCGTCTATTTCATCTTTCGGAATCAACC ATGATTTCACTGGGATGTGCTACCCACTCCTTGTTAGCTCTGTTGGTATCATTGTCTGCT TGATCACCACCCTTTTTGCTACTGATTTCTTTGAAGTCAAGGCTGTGAAAGAAATTGAGC CTGCACTTAAGAAGCAGCTCATCATCTCCACTGTCCTGATGACTGTTGGTATTGCTGTAA TCAGCTGGTTGGCCCTTCCAGCTAAGTTTACCATCTTCAACTTTGGTACTCAGAAGGATG TCTCCAACTGGGGCTTGTTCTTCTGTGTTGCAATTGGTCTGTGGGCTGGTCTGATTATTG GTTTTGTCACAGAATACTACACTAGCAATGCATACAGTCCTGTGCAAGACGTTGCAGATT CTTGCAGAACTGGTGCTGCCACTAATGTCATTTTTGGTCTTGCTCTTGGATACAAGTCAG TTATCATCCCGATTTTCGCTATCGCTGTTAGCATCTATGTCAGTTTCTCCATTGCTGCAA TGTACGGCATCGCAGTTGCCGCTCTTGGTATGCTGAGCACAATTGCAACTGGTCTTGCTA TTGATGCTTATGGTCCCATCAGTGACAATGCTGGTGGTATTGCTGAGATGGCTGGAATGA GTCACAGAATCCGTGAGAGAACTGATGCTCTTGATGCTGCTGGCAACACCACTGCCGCTA TTGGAAAGGGATTTGCCATTGGTTCAGCTGCTCTTGTGTCTCTGGCGCTTTTTGGTGCCT TCGTCAGCAGAGCTGGAGTGAAGGTTGTCGATGTCCTCTCCCCCAAGGTTTTCATTGGTT TGATTGTTGGAGCCATGCTTCCCTATTGGTTCTCTGCCATGACCATGAAGAGTGTTGGAA GTGCCGCCCTAAAGATGGTGGAGGAGGTCCGCAGACAGTTCAACACCATTCCTGGGTTGA TGGAGGGAACTGCCAAGCCTGACTATGCAACCTGTGTGAAGATCTCCACTGATGCTTCCA TCAAGGAGATGATTCCTCCTGGTGCTCTGGTCATGCTCACTCCCCTCATTGTTGGAACCC TCTTCGGTGTTGAGACTCTCTCTGGTGTTCTTGCCGGTGCCCTGGTTTCTGGAGTGCAGA TTGCCATCTCTGCTTCCAACACCGGTGGTGCATGGGACAATGCTAAGAAGTACATTGAGG CTGGTGCCAGCGAGCATGCCAGGACCCTCGGCCCCAAGGGATCTGACTGCCACAAGGCTG CTGTGATAGGTGACACCATTGGTGACCCCCTGAAGGACACCTCGGGCCCGTCCCTCAACA TCCTGATCAAGCTCATGGCGGTGGAGTCCCTTGTGTTTGCCCCCTTCTTCGCCACCCACG GTGGCCTGCTGTTCAAGTACCTGTAAGGGCCACACCAATCATCACAGCAGAAATATACGA CCGACCGACCGTGGACATCTCGAATAACTCCTGCCAAATCGCCAGTTCATGTGTATTGTG CGCTAGCCGCCTAGCTGCACTGCTGTTTTTTTGGTCTCATTGTTCGTATTTTCTCCTTGG CCCCTCCCCCTAGAGGCGTTACTGTTAGCCTTACTCTTACTCCCTGTAGCTGCACGTAGA AGAGAACTGTTGTCCTGCAGGTCTGGCAAATTTTCCCAGTCTCTTGATGATGGCGATGAT GTTGAAATCTTTGAACAATGATACATGATTGTTGCATTTTACTGGTG