Plant GARDEN
How To ▶︎

JA

EN

TOP > About the Species(Zea mays ) > genome data >Gene sequences

Search

By Species By Keywords Genes By Markers By Traits

Let’s Analyze!!

SNP Detection
(lang=JA only) Sequences Other Tools

Data List

All Markers Trait-Related Loci
Zea mays

CDS Sequence

CDS ID

Zm00001d034776_T006
CDS Infomation

cds chromosome:B73_RefGen_v4:1:301956138:301960341:1 gene:Zm00001d034776 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding description:Elongation factor 2

Sequence

ATGGTGAAGTTCACAGCTGAAGAGCTCCGCGCTATCATGGACAAAAAGAACAACATTCGT
AACATGTCTGTCATTGCTCATGTGGACCATGGCAAGTCTACGCTTACAGATTCCCTTGTG
GCAGCTGCTGGGATTATTGCCCAGGAAGTTGCTGGTGATGTTCGCATGACTGATACTCGG
GCAGATGAAGCAGAGCGTGGCATTACAATCAAATCTACTGGTATCTCTCTTTACTATGAG
ATGACTGACGAGTCACTGAAGAACTACAAGGGTGAGAGAGATGGTAACCAATACTTGATC
AACCTTATTGACTCGCCTGGACACGTTGATTTTTCTTCGGAAGTCACAGCTGCTCTTCGC
ATCACCGATGGTGCTCTGGTTGTGGTTGACTGTATTGAAGGTGTCTGTGTGCAAACTGAA
ACTGTGCTTCGCCAAGCCCTTGGTGAGAGGATTAGGCCAGTTCTCACGGTGAACAAGATG
GACAGGTGCTTCCTTGAGCTTCAGGTTGAGGGTGAGGAAGCGTATCAGACTTTCTCCCGT
GTCATTGAGAATGCCAATGTCATCATGGCAACATATGAAGATAAGCTCCTTGGTGATGTC
CAAGTATACCCAGAGAAGGGGACAGTTGCTTTTTCTGCTGGTCTGCACGGATGGGCCTTC
ACCCTCACTAACTTCGCAAAGATGTATGCATCTAAGTTTGGAGTTGATGAAACTAAGATG
ATGGAGAGGCTATGGGGTGAGAACTTCTTTGACCCTGCCACAAAGAAGTGGACCACCAAG
AACACAGGTTCTCCTACCTGCAAGAGAGGATTTGTTCAGTTCTGCTATGAGCCAATCAAG
CAAATCATCAAGACCTGCATGAATGACCAGAAGGAGAAATTGTGGCCCATGCTGCAAAAG
CTCAATGTTACCATGAAGGCTGATGAGAAGGAGTTGATTGGCAAAGCTTTGATGAAGCGT
GTTATGCAAACGTGGCTTCCAGCTAGCACTGCTCTGCTTGAGATGATGATATTCCACCTT
CCTTCCCCAGCAAAGGCTCAAAAGTATCGTGTGGAGAACTTGTACGAGGGACCCCTTGAT
GATGTGTATGCAACTGCTATCAGAAACTGTGATCCAGAGGGTCCTCTTATGCTGTATGTT
TCAAAGATGATTCCTGCATCTGACAAGGGCAGGTTCTTTGCCTTCGGTCGTGTCTTCTCA
GGGAAGGTTGCTACTGGTATGAAGGTTCGGATCATGGGTCCCAACTATGTCCCCGGGCAG
AAGAAGGATCTGTATGTCAAGAGTGTCCAGCGTACTGTTATCTGGATGGGAAAGAAGCAA
GAGTCGGTTGAGGATGTTCCGTGTGGTAACACTGTTGCTATGGTTGGTCTGGATCAGTTC
ATCACGAAGAATGCTACACTCACTAATGAGAAGGAGACTGACGCTTGCCCAATCAGAGCA
ATGAAGTTCTCCGTCTCTCCTGTTGTGCGTGTTGCTGTTCAGTGCAAGGTTGCCTCTGAC
CTTCCCAAGCTAGTCGAAGGTTTGAAGCGTCTAGCAAAGTCCGATCCTATGGTTCTCTGT
ACAATGGAAGAATCTGGTGAGCATATCATTGCTGGAGCTGGTGAGCTTCATCTTGAGATT
TGCCTGAAGGATCTGCAGGAGGACTTCATGGGTGGTGCTGAAATTATTGTTTCCCCTCCC
GTCGTCTCCTTCCGTGAAACGGTTCTTGAGAAGTCCTGCCGTACTGTCATGAGCAAGTCT
CCCAACAAGCACAACCGTCTGTACATGGAAGCGCGCCCCTTGGAGGAGGGTCTCGCTGAG
GCCATCGATGACGGCCGTATTGGCCCACGTGATGATCCGAAGGTGCGCTCCCAGATCCTC
TCTCAGGAGTTTGGGTGGGACAAGGACCTGGCCAAGAAGATTTGGTGTTTTGGACCTGAG
ACCACTGGCCCGAACATGGTTGTAGATATGTGCAAGGGAGTGCAGTATCTCAATGAAATC
AAGGATTCTGTTGTGGCTGGTTTCCAGTGGGCATCAAAGGAGGGTGCACTGGCTGAGGAG
AACATGCGTGGAATTTGCTTTGAGGTATGTGATGTCGTTCTTCATGCTGATGCTATCCAC
AGGGGTGGTGGTCAGGTCATTCCCACTGCCAGGAGGGTCATCTATGCCTCTCAGCTCACG
GCCAAGCCAAGGCTGCTGGAGCCAGTCTACCTGGTGGAGATCCAGGCCCCAGAAAATGCA
CTTGGTGGTATCTACGGTGTTCTGAACCAGAAGAGAGGTCATGTCTTTGAGGAGATGCAG
AGGCCGGGTACCCCGCTCTACAACATCAAGGCTTTCCTCCCTGTCATCGAGTCCTTTGGT
TTCTCCAGCCAACTGAGGGCCGCAACCTCTGGTCAGGCGTTCCCCCAGTGTGTCTTTGAC
CATTGGGACATGATGGGCTCAGATCCTTTGGAGGCCGGCTCCCAGGCTGCTCAGCTGGTG
CTGGATATCCGCAAGAGGAAGGGTCTCAAGGAACAGATGACCCCTCTTTCTGAGTTTGAG
GACAAGCTCTAA

Peptide Sequence

PEP ID

Zm00001d034776_P006
PEP Infomation

pep chromosome:B73_RefGen_v4:1:301956138:301960341:1 gene:Zm00001d034776 transcript:Zm00001d034776_T006 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding description:Elongation factor 2

Sequence

MVKFTAEELRAIMDKKNNIRNMSVIAHVDHGKSTLTDSLVAAAGIIAQEVAGDVRMTDTR
ADEAERGITIKSTGISLYYEMTDESLKNYKGERDGNQYLINLIDSPGHVDFSSEVTAALR
ITDGALVVVDCIEGVCVQTETVLRQALGERIRPVLTVNKMDRCFLELQVEGEEAYQTFSR
VIENANVIMATYEDKLLGDVQVYPEKGTVAFSAGLHGWAFTLTNFAKMYASKFGVDETKM
MERLWGENFFDPATKKWTTKNTGSPTCKRGFVQFCYEPIKQIIKTCMNDQKEKLWPMLQK
LNVTMKADEKELIGKALMKRVMQTWLPASTALLEMMIFHLPSPAKAQKYRVENLYEGPLD
DVYATAIRNCDPEGPLMLYVSKMIPASDKGRFFAFGRVFSGKVATGMKVRIMGPNYVPGQ
KKDLYVKSVQRTVIWMGKKQESVEDVPCGNTVAMVGLDQFITKNATLTNEKETDACPIRA
MKFSVSPVVRVAVQCKVASDLPKLVEGLKRLAKSDPMVLCTMEESGEHIIAGAGELHLEI
CLKDLQEDFMGGAEIIVSPPVVSFRETVLEKSCRTVMSKSPNKHNRLYMEARPLEEGLAE
AIDDGRIGPRDDPKVRSQILSQEFGWDKDLAKKIWCFGPETTGPNMVVDMCKGVQYLNEI
KDSVVAGFQWASKEGALAEENMRGICFEVCDVVLHADAIHRGGGQVIPTARRVIYASQLT
AKPRLLEPVYLVEIQAPENALGGIYGVLNQKRGHVFEEMQRPGTPLYNIKAFLPVIESFG
FSSQLRAATSGQAFPQCVFDHWDMMGSDPLEAGSQAAQLVLDIRKRKGLKEQMTPLSEFE
DKL

Transcript Sequence

Transcript ID

Zm00001d034776_T006
Transcript Infomation

cdna chromosome:B73_RefGen_v4:1:301956138:301960341:1 gene:Zm00001d034776 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding description:Elongation factor 2

Sequence

GCACGCAGACCGGGGTAAATGGACTACGAGCCAGTTTCTTCTCTGTCACCTCTCCCTTAC
GCTCCTACTGCCGATTATCCTTAGTCCAATTGCCTGTCTGTCTGGCACCTGTAGCCTTGT
AGGATTGTGGACGGGATCCTGTCCTCATTCCCTAGTCGAATCGTCTGTTTGGTCACTTGT
AAGATTGTGGACGGGATCCAGCCCTTTAGGATATATGATAGTTTTATTAATTTCCTGCCA
TGTGCCCGTTTCATGTTTTCTGAATTTTTTTGATTCTCCATATCCGCATCCTCTTGGTAC
AGAGTCCATATCCGTGCATAGATATGGAATAAATATTGGTATTGGTAGTGTGATATCTAT
AAGAAGTCAAGATGGTGAAGTTCACAGCTGAAGAGCTCCGCGCTATCATGGACAAAAAGA
ACAACATTCGTAACATGTCTGTCATTGCTCATGTGGACCATGGCAAGTCTACGCTTACAG
ATTCCCTTGTGGCAGCTGCTGGGATTATTGCCCAGGAAGTTGCTGGTGATGTTCGCATGA
CTGATACTCGGGCAGATGAAGCAGAGCGTGGCATTACAATCAAATCTACTGGTATCTCTC
TTTACTATGAGATGACTGACGAGTCACTGAAGAACTACAAGGGTGAGAGAGATGGTAACC
AATACTTGATCAACCTTATTGACTCGCCTGGACACGTTGATTTTTCTTCGGAAGTCACAG
CTGCTCTTCGCATCACCGATGGTGCTCTGGTTGTGGTTGACTGTATTGAAGGTGTCTGTG
TGCAAACTGAAACTGTGCTTCGCCAAGCCCTTGGTGAGAGGATTAGGCCAGTTCTCACGG
TGAACAAGATGGACAGGTGCTTCCTTGAGCTTCAGGTTGAGGGTGAGGAAGCGTATCAGA
CTTTCTCCCGTGTCATTGAGAATGCCAATGTCATCATGGCAACATATGAAGATAAGCTCC
TTGGTGATGTCCAAGTATACCCAGAGAAGGGGACAGTTGCTTTTTCTGCTGGTCTGCACG
GATGGGCCTTCACCCTCACTAACTTCGCAAAGATGTATGCATCTAAGTTTGGAGTTGATG
AAACTAAGATGATGGAGAGGCTATGGGGTGAGAACTTCTTTGACCCTGCCACAAAGAAGT
GGACCACCAAGAACACAGGTTCTCCTACCTGCAAGAGAGGATTTGTTCAGTTCTGCTATG
AGCCAATCAAGCAAATCATCAAGACCTGCATGAATGACCAGAAGGAGAAATTGTGGCCCA
TGCTGCAAAAGCTCAATGTTACCATGAAGGCTGATGAGAAGGAGTTGATTGGCAAAGCTT
TGATGAAGCGTGTTATGCAAACGTGGCTTCCAGCTAGCACTGCTCTGCTTGAGATGATGA
TATTCCACCTTCCTTCCCCAGCAAAGGCTCAAAAGTATCGTGTGGAGAACTTGTACGAGG
GACCCCTTGATGATGTGTATGCAACTGCTATCAGAAACTGTGATCCAGAGGGTCCTCTTA
TGCTGTATGTTTCAAAGATGATTCCTGCATCTGACAAGGGCAGGTTCTTTGCCTTCGGTC
GTGTCTTCTCAGGGAAGGTTGCTACTGGTATGAAGGTTCGGATCATGGGTCCCAACTATG
TCCCCGGGCAGAAGAAGGATCTGTATGTCAAGAGTGTCCAGCGTACTGTTATCTGGATGG
GAAAGAAGCAAGAGTCGGTTGAGGATGTTCCGTGTGGTAACACTGTTGCTATGGTTGGTC
TGGATCAGTTCATCACGAAGAATGCTACACTCACTAATGAGAAGGAGACTGACGCTTGCC
CAATCAGAGCAATGAAGTTCTCCGTCTCTCCTGTTGTGCGTGTTGCTGTTCAGTGCAAGG
TTGCCTCTGACCTTCCCAAGCTAGTCGAAGGTTTGAAGCGTCTAGCAAAGTCCGATCCTA
TGGTTCTCTGTACAATGGAAGAATCTGGTGAGCATATCATTGCTGGAGCTGGTGAGCTTC
ATCTTGAGATTTGCCTGAAGGATCTGCAGGAGGACTTCATGGGTGGTGCTGAAATTATTG
TTTCCCCTCCCGTCGTCTCCTTCCGTGAAACGGTTCTTGAGAAGTCCTGCCGTACTGTCA
TGAGCAAGTCTCCCAACAAGCACAACCGTCTGTACATGGAAGCGCGCCCCTTGGAGGAGG
GTCTCGCTGAGGCCATCGATGACGGCCGTATTGGCCCACGTGATGATCCGAAGGTGCGCT
CCCAGATCCTCTCTCAGGAGTTTGGGTGGGACAAGGACCTGGCCAAGAAGATTTGGTGTT
TTGGACCTGAGACCACTGGCCCGAACATGGTTGTAGATATGTGCAAGGGAGTGCAGTATC
TCAATGAAATCAAGGATTCTGTTGTGGCTGGTTTCCAGTGGGCATCAAAGGAGGGTGCAC
TGGCTGAGGAGAACATGCGTGGAATTTGCTTTGAGGTATGTGATGTCGTTCTTCATGCTG
ATGCTATCCACAGGGGTGGTGGTCAGGTCATTCCCACTGCCAGGAGGGTCATCTATGCCT
CTCAGCTCACGGCCAAGCCAAGGCTGCTGGAGCCAGTCTACCTGGTGGAGATCCAGGCCC
CAGAAAATGCACTTGGTGGTATCTACGGTGTTCTGAACCAGAAGAGAGGTCATGTCTTTG
AGGAGATGCAGAGGCCGGGTACCCCGCTCTACAACATCAAGGCTTTCCTCCCTGTCATCG
AGTCCTTTGGTTTCTCCAGCCAACTGAGGGCCGCAACCTCTGGTCAGGCGTTCCCCCAGT
GTGTCTTTGACCATTGGGACATGATGGGCTCAGATCCTTTGGAGGCCGGCTCCCAGGCTG
CTCAGCTGGTGCTGGATATCCGCAAGAGGAAGGGTCTCAAGGAACAGATGACCCCTCTTT
CTGAGTTTGAGGACAAGCTCTAAAATTTTTGGCTGTTGGTGATACTGTTTCATCTGCCGG
TTTAATCATCAATTCGTCTACTGTAATAGCAGCGACTTCAATATTTTATTTTGTTTTAGT
TGTCAAATGCACCTGTTTTTGAACAATATTTGTGATGTAGTGCCCTGCCGCGCTTAGAGT
CTGAGACTATTTTGTTATCTGCTGTGATGTTTCAGATGAAACAGAGTTGATGTCTGGTTT
AGTAAATGGTTATATTCTTAGTGTATTGCTCTTTTGTATTGTCTTGTCTTATTAAGACCT
GTTTGTGGAAAATGAAGTGGCATTCAAACAGGTGC