Gene sequences

How To ▶︎

JA

EN

TOP > About the Species(Zea mays ) > genome data >Gene sequences

Search

By Traits

Let’s Analyze!!

SNP Detection
(lang=JA only)

Other Tools

Data List

All

Trait-Related Loci

Zea mays

CDS Sequence

CDS ID	Zm00001d032575_T014
CDS Infomation	cds chromosome:B73_RefGen_v4:1:231057980:231063440:-1 gene:Zm00001d032575 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding description:WAPL (Wings apart-like protein regulation of heterochromatin) protein
Sequence	ATGGCGTCGCCATATCTGCTGCTAAGTGTGACCTGTTTTAATTTACAAGGCATTCTAATC TCATTTTGTTCCTTCCAGACCCATTTGCTCAGCATGAGTCGAAAATTGAGCCCTAAATGC CGCTCACTTTCTTTTGTTGGTGTCATTCTCAACATTGTTGAGTTACTATCAGCTCTCTCT CTCCTTCAGAAACCTTCCACTGTTTCAAGAAAAGCAGATCCAAAAAATACTAAAGTTTGC AACGGGGCCTGCTCTGCAGACAGTAGAGGTTTGAGCTTATTGAATCATCATTGCAAGTGC AATAACTCAAAGAAAAAGAGCATTTTACTGAACCGAAGGTGCCAGTATTGTTCATCCACC AAATCAGAAGCTTCTCATGTTACCCTCTCTTCTAGTAGTGATGTCAGTCAGTCAGAAAGG ATACTCAATTGCTCATCTTTTTCAAGCAATGGGACATCAAGTGGTTCATTTGGAGTGAAA CATATTAATGGTGCTAGTTTGAAGCTCAATGTAAGAATGGATCGTTCTAAAGCTTATCCA GTCAGAGGCTCAACTGGTTGGATTTCTATGAAAGCACAAACTTCTGATTGGAACTCCAGA GAAATGGCAAAAAAGCGGCGCCTATCTGAAAATGTACGCACTGATTTGAGTAATGGTGGT GATGATCCATTTGCATTTGATGATATTGATCAAGAACCTTCAAATTGGGATCTATTTGGT CCAAAAAGGAAATCACCACAGAAGCGAGCGAAAAGAACTAATGGAGAAGTGTTGGATGAT TGTGGAACTGCATTAATGGGAAGTCCTAAATTATGTCAACCTGAAGATATTTATCAGTCA GTTGCAACTTCTGGTTCTAAGGTTGTAGATGAGTCCAATCTTTTGGAGGATTGCCTTTTG GCGTCAGTTAAGGTTCTTATGAACTTGGCAAATGACAACCCGTCTGGTTGCGAACAGATC GCGTCATGTGGCGGACTTAATAACATGGCCTCCTTGATCATTAAACATTTCCCCTCATTT GATTTCTCCATGAACAGTAACAATCAAATGAATGAAAGTGTGTCCTCTGGTGATCCGTTG TCTTCCCAGAACAGCAAGTCACCCCAAATCAAAACTAAGCAGTTGCGGGACTATGAACTT GATTTTCTAGTTGCCATATTGGGATTGCTTGTGAACCTTGTGGAGAAGGATAGCCTTAAT AGGGTACGACTTGCGAATGCTCGTGTTTCTGTTAATCTATCTCAAAATCCAGATAGCAAA GAGGTACAGAGGGATGTCATACCCCTGCTCTGTTCAATATTCTTAGCGAGTCAAGGTACC GGGGAAACTGCTGAAGCTATATCACCGGTAATTATAATCATCATGTTTTCATATTTTACA ACATAA

Peptide Sequence

PEP ID	Zm00001d032575_P014
PEP Infomation	pep chromosome:B73_RefGen_v4:1:231057980:231063440:-1 gene:Zm00001d032575 transcript:Zm00001d032575_T014 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding description:WAPL (Wings apart-like protein regulation of heterochromatin) protein
Sequence	MASPYLLLSVTCFNLQGILISFCSFQTHLLSMSRKLSPKCRSLSFVGVILNIVELLSALS LLQKPSTVSRKADPKNTKVCNGACSADSRGLSLLNHHCKCNNSKKKSILLNRRCQYCSST KSEASHVTLSSSSDVSQSERILNCSSFSSNGTSSGSFGVKHINGASLKLNVRMDRSKAYP VRGSTGWISMKAQTSDWNSREMAKKRRLSENVRTDLSNGGDDPFAFDDIDQEPSNWDLFG PKRKSPQKRAKRTNGEVLDDCGTALMGSPKLCQPEDIYQSVATSGSKVVDESNLLEDCLL ASVKVLMNLANDNPSGCEQIASCGGLNNMASLIIKHFPSFDFSMNSNNQMNESVSSGDPL SSQNSKSPQIKTKQLRDYELDFLVAILGLLVNLVEKDSLNRVRLANARVSVNLSQNPDSK EVQRDVIPLLCSIFLASQGTGETAEAISPVIIIIMFSYFTT

Transcript Sequence

Transcript ID	Zm00001d032575_T014
Transcript Infomation	cdna chromosome:B73_RefGen_v4:1:231057980:231063440:-1 gene:Zm00001d032575 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding description:WAPL (Wings apart-like protein regulation of heterochromatin) protein
Sequence	CACTTATCTCGAAGTTGCCTTCACCTAGATGATTACATGGTGGAGAAAAGCTATTAATTT CCATTATGTTTTCTCTTTTAGCTGCAACCACTTCTTTCGCATTACAATGCCACCTGTTTT CACATTACAAGGCTGACATGTTCTATTAGAAAACCAAACAAGAAACACCATGAGTTTAAT CTCAATATTTTTTAATATATAAACTAACTAGAAATTTGTTGGAGGTAAAATCTCAGGCAA TGTTGACATTTAACCTTTTTCATTAGTTTAAGTGTTTGACCTAAATGACTATCTCTCGAG GGGAAAAGGCCTTCTGTTTCTGCTGTTATTCAGGAAGCTGCTTATGAAGGTGCCATTTGG TGTAGGGAAGGTGCCAGTGCCCTCCAAGAGCTCCTGGCACGTCAGTTCAACCTTGGAAAT TGGTTGTGGTGTTAGTGGTTGGGTGTGGGGTCTGTTGTTTTGGTGGCCTTGAGGATATCA TATAGGCGTTCAGGTCATAGCCAACCATTGTACCGGGGGCTCACCTTTCGGTAGTCTTTT ATCTTTCTTTCTTAATGACTCACAGATCTCCTGCGTTGTTCTAAAAAAACCACATCCTTT CTTTTCTACTTAATAAAGTTTTTGACTTTTCATTGTCTATGAGATGCAACTTTGTCCATT GGTACAACTTAATGGAGGCATTCGAACGATAACTCTAATGATATTTTTATATAGTGAATC TATGTAACTCTAACCTTACAGGCATACAAATGGTCAACCTTTAGAATTTGATTGATGGCA CTAGATTCTGGAACTCAGGTAGTAATACTTCAATACTTGTTCTGCTTATTGTTTCCTTTG TTATTATTCAGGTCCAAGACAATAATTTGCTGTCTTCAGAAACTTGTGTCCATTTCCTCC TCAAATTATTAAACCCTCCGGTGAATGTTGTTGATGCCAAAGCACCATCAATAGGTTCCA AACTTCTTGGAATCAGTAAATTTCAGATGCTTAACGGTTCCAATAAGGATGTGGACTCTT GTTCAGAGGACATACTTTTAAAAGTTGAAGAAATCCTCTTAAGCTGCAAAGAGATCAAAC CAGCAGACAGGGATTATAAGAGAACAACAAGGCCGGAACTATGTTCAAAGTGGCTTGCTT TGTTGACAATGGAAAAGGCGTGCTTGTCTGCTGTTGCATTAGAGGATACATCTGACATGG TCTTAGAACTCGGAGGAAATTTCAAAGAAACATTAAGGCAGTTGGGTGGCCTTGATGATA TTTTTAATGTCATGGTGAATTGCCATTCAGAATTGGAGGTAAGACCTTATTTGTGTGTAT GTATGTTCTCTAACAGTTTATACAAAACTATTAAATTGGCATTATTTGTTATTTTGTTCT GCTATGGTAAAGGATGGTTAACTTTTGAGCCTTGTACAATTCATACTCCAGTATACTTGG AGCTGCAATCTGATGAATATTATTTTGAGCAACATGAAAAACATGTTGCAAGACAAGGAT ATGTTGCAGTAATTGCTTTGGTTGAAATGTTTTAGATTTCAAATGTACTGTTGGGTTTGT GTTGGCTTTCAACTCTAGCCTACCTCAACTTGCTCGGGACTAAAAGACTTTGTTGTTGTT GTTCATGTACTCTTACTGTGATTACCAATACATTTTGAACTTTGGAGAAATGATGAAGTA ATCCTTTGAAAGCCTTGAAATTTGAATTTCCCATCCCATATACTCCCAAGCTGATGATTA TTAACAGTCCCATCAAATAGTGTCATCAATGGGGTGTTTGGTTCGAGGAATCACCTTATC CTTGATGGGGTGGTCCATCATCAGGTGATCCTATATGAATTTGGTGGGATGATCCCATTC TCCATACATATACTAATTGTGTGCATATGAGGAATGTGGTGATGATAGATCACCCTATTC CAATACTTAAACCAAGCATTAATTTGAGGTGTGAGATGATGATGGACCACCTCTTTACAA AACCGAATACAACATAGATGTCTTTTTGAGTTTTTGTTCTGTTGAGTATTACAATTTTGT TGATAATTGCCTTTTCTGGATATGCAAGTACCCTAGTACTGACCTTTAGGATTTTCATAT TTTTATCCTTAGGGTGCCAATCTGTATATTGCTTGTCCTCATCTTTACATGTCACCTGTT TGACACTTATATGCAATAGTAATATATGTTCATGCTAAGTGACTGCAATAACAGTCTGTC TCTGGCGTCGAACCTTGTTTATTAGAAACTTGTAAAGGATGCCTCCACTACGGTTGTGGA GGGAAAAGAAGGTGCTCCTCTACAAAGCACCACACTCCTCTTGAAATGTTTGAAAATTTT GGAGAATGCCACATTTCTAAGTGACAACAACAAGGTAACCTTCAGTATCTTGTTTGCTCG ATTTGCTTCTTTTTCACTGCTTTCTATGTTGTTTTTGTCCTCTCTGCTATAATGGCGTCG CCATATCTGCTGCTAAGTGTGACCTGTTTTAATTTACAAGGCATTCTAATCTCATTTTGT TCCTTCCAGACCCATTTGCTCAGCATGAGTCGAAAATTGAGCCCTAAATGCCGCTCACTT TCTTTTGTTGGTGTCATTCTCAACATTGTTGAGTTACTATCAGCTCTCTCTCTCCTTCAG AAACCTTCCACTGTTTCAAGAAAAGCAGATCCAAAAAATACTAAAGTTTGCAACGGGGCC TGCTCTGCAGACAGTAGAGGTTTGAGCTTATTGAATCATCATTGCAAGTGCAATAACTCA AAGAAAAAGAGCATTTTACTGAACCGAAGGTGCCAGTATTGTTCATCCACCAAATCAGAA GCTTCTCATGTTACCCTCTCTTCTAGTAGTGATGTCAGTCAGTCAGAAAGGATACTCAAT TGCTCATCTTTTTCAAGCAATGGGACATCAAGTGGTTCATTTGGAGTGAAACATATTAAT GGTGCTAGTTTGAAGCTCAATGTAAGAATGGATCGTTCTAAAGCTTATCCAGTCAGAGGC TCAACTGGTTGGATTTCTATGAAAGCACAAACTTCTGATTGGAACTCCAGAGAAATGGCA AAAAAGCGGCGCCTATCTGAAAATGTACGCACTGATTTGAGTAATGGTGGTGATGATCCA TTTGCATTTGATGATATTGATCAAGAACCTTCAAATTGGGATCTATTTGGTCCAAAAAGG AAATCACCACAGAAGCGAGCGAAAAGAACTAATGGAGAAGTGTTGGATGATTGTGGAACT GCATTAATGGGAAGTCCTAAATTATGTCAACCTGAAGATATTTATCAGTCAGTTGCAACT TCTGGTTCTAAGGTTGTAGATGAGTCCAATCTTTTGGAGGATTGCCTTTTGGCGTCAGTT AAGGTTCTTATGAACTTGGCAAATGACAACCCGTCTGGTTGCGAACAGATCGCGTCATGT GGCGGACTTAATAACATGGCCTCCTTGATCATTAAACATTTCCCCTCATTTGATTTCTCC ATGAACAGTAACAATCAAATGAATGAAAGTGTGTCCTCTGGTGATCCGTTGTCTTCCCAG AACAGCAAGTCACCCCAAATCAAAACTAAGCAGTTGCGGGACTATGAACTTGATTTTCTA GTTGCCATATTGGGATTGCTTGTGAACCTTGTGGAGAAGGATAGCCTTAATAGGGTACGA CTTGCGAATGCTCGTGTTTCTGTTAATCTATCTCAAAATCCAGATAGCAAAGAGGTACAG AGGGATGTCATACCCCTGCTCTGTTCAATATTCTTAGCGAGTCAAGGTACCGGGGAAACT GCTGAAGCTATATCACCGGTAATTATAATCATCATGTTTTCATATTTTACAACATAACAA AGCGAGACCATGGTCACCTTCCTGCTTGCTTCGAAATAGAAATTTCAACACCTGTCAGAT GGCAATTCTAACTGATGGGCATGGTGTAATGTTACCAATGACACGCTGCCCTTATCTTGG CTATATATATGGAAATTGGAAAATATGTAGTTGTAGTGTAAACCACATCTTAGGTGGAAA CATGGAAACCTACTCAAAACTCATACGTGGAACTTGGCACATTCATAATGCAACCACGAA CCATGGATGTACTTTGTCCTAAAGGTTTGGATGCAAACTCATTTTTAAAAACAATTC