Gene sequences

How To ▶︎

JA

EN

TOP > About the Species(Zea mays ) > genome data >Gene sequences

Search

By Traits

Let’s Analyze!!

SNP Detection
(lang=JA only)

Other Tools

Data List

All

Trait-Related Loci

Zea mays

CDS Sequence

CDS ID	Zm00001d031535_T001
CDS Infomation	cds chromosome:B73_RefGen_v4:1:193452711:193455986:1 gene:Zm00001d031535 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding description:Tetratricopeptide repeat (TPR)-like superfamily protein
Sequence	ATGGCGACGCCTCCGCTCTACTCCGTTTCCACTCACCACCGCGCCCCACCACCATGGCCG CCTCCCAAGGCTGCCACTAGTCCGCGAATAACCTTTCGGTGTAGCGTGCTGGCGGCACCG GCTGGCCGAGTCCTGGAGGCGCCCACCGCTGCTCCAAGCTCATGGAGCACCAAGAATCCG CCAAGTCGGGCCCTGAGTTCCGACGTGAACCTGCGAATCCAGCGCCTCTGTCAGGCGGGT GACCTCGCGGGCGCTCTGAGGCTGCTGGGCTCTGACGGCGGCGTCGACGTGCGGAGCTAC TGCATGGTCGTTCAGCTCTGCGGGGAGGAGCGGTCGTTGGAGGCTGCCAAGAGAGCGCAT GCCTTAATTCGCGCGTCCAGTGCCGCTGCAACGGGTGGAAAAGGGAGCGTCCTTGGGAAG AGGTTAGTGCTGGCGTACCTGAAATGCGGCGACCTGGGCGAGGCAAGGACGGTGTTCGAT GGAATGCCTCCTCAAGCTGCTGATGTCCGTGTCTGGACTTCGCTGATGAGCGCGTACGCC AAGGCGGGTGATTTCCAGGAAGCTGTCTCCCTGTTTAGGCAGATGCAGTGCTGCGGGGTC AGTCCGGATGCACATGCTGTTTCCTGTGTCCTCAAGTGCGTTTCCAGTTTGGGCAGCCTT ACGGAAGGCGAGGTGATTCATGGATTACTTGAGAAGTTGGGTCTCGGTCAAGCATGCGCG GTTGCAAATGCTCTGATTGCCGTGTACTCGAGGTGTGGACGGATGGAGGATGCGGCACGG GTATTTGACAGTATGCATCCCCGGGATGCCATCTCTTGGAATTCTATGATTGGTGGATGC TTTTCAAACGGATGGCATGGTACAGCTGTTGATCTTTTCAGCAAAATGTGGTCTCAAGGT ACGGAGATCAGTTCAGTGACAGTGCTCAGTGTTCTGCCTGCTTGTGCGGGATTAGGTTAT GGCCTTATTGGAAAAGCGGTGCATGGATACTCCGTGAAATCCGGATTGCTTTGGGGCCTT GATTCTGTACAAAGTGGGATAGATGATGCTGCTCTTGGATCCAAACTGGTATTCATGTAT GTGAAATGTGGGGACATGGCCTCTGCAAGAAGGGTGTTTGATGCGATGTCATCGAAAGGT AATGTGCACGTATGGAATCTGATAATGGGTGGGTACGCAAAGGTTGGTGAATTTGAAGAA AGTCTCTCGCTTTTTGTGCAAATGCATGAGCTTGGAATTGCCCCGGATGAACATGCCATT TCTTGCCTTCTGAAGTGCATCACTTGTTTGTCTTGTGCCAGGGATGGCTTGGTGGCTCAT GGATATATAGTAAAATTGGGTTTCGGGGCACAGTGTGCAGTTTGCAATGCACTGATATCA TTCTATGCAAAGTCCAACATGATTGGCGATGCAGTCTTGGTGTTCAATAGAATGCCTCGT CAAGATACCATTTCTTGGAATTCTGTGATTAGTGGATGCTCTTCCAATGGACTAAACAGT GAAGCTATTGAGTTGTTCATAAGAATGTGGACACAAGGACAGGAGCTGGACTCAGTTACG TTGCTAAGTGTTTTGCCAGCTTGTGCACAGTCACGCTATTGGTTTGCAGGAAGGGTGGTT CATGGTTACTCGGTTAAAACTGGATTGATTGGGGAAACATCTCTTGCAAATGCTCTTCTT GATATGTACTCAAATTGCTCAGATTGGCAGAGCACTAATCAGATATTCAGAAGCATGGGT CAAAAAAATGTGGTGTCCTGGACAGCAATGATCACGAGTTATATGAGGGCAGGACTGTTT GACAAAGTGGCTGGGTTACTTCAAGAGATGGTACTAGATGGTATCAGACCTGATGTCTTT GCAGTCACAAGTGCCCTTCACGCTTTTGCTGGTGACGAATCTCTGAAACAAGGCAAATCT GTCCATGGTTACACCATCAGAAATGGAATGGAGAAGCTTCTTCCTGTTGCCAATGCACTT ATGGAAATGTATGTGAAATGCAGGAATGTGGAAGAAGCACGGTTGATTTTTGACCGTGTG ACGAATAAGGATGTAATCTCATGGAATACACTGATAGGAGGTTACTCCAGAAATAATTTT CCCAATGAATCCTTCAGTTTGTTCAGTGACATGTTGCTCCAATTCAGACCCAATGCAGTG ACCATGACTTGCATCCTTCCTGCTGCTGCAAGCATTTCATCCTTGGAGCGAGGAAGGGAG ATACATGCTTATGCACTTCGAAGAGGATTTCTGGAAGATAGTTATGCATCCAATGCGCTT GTGGACATGTATGTTAAATGTGGTGCGTTACTGGTAGCTCGAGTTTTGTTTGACCGGTTG ACTAAGAAGAACCTCATATCATGGACCATTATGATTGCTGGATATGGCATGCATGGTTTT GGGAAACATGCCATCGCCCTCTTTGAGCAAATGAGAGGCAGTGGTATTGAGCCAGATGCG GCCTCTTTCAGTGCCATATTGTATGCTTGCTGCCATTCTGGTCTTGCTGCTGAGGGACGG AGATTCTTCAAGGCTATGCAAAAGGAATACAAAATAGAGCCCAAGTTGAAGCACTACACC TGCATTGTTGACCTGCTTAGCCGTACCGGCGACCTGAAGGAGGCTCTTGAGTTCATCGAG TCAATGCCGATTGAACCTGATTCAAGCATTTGGGTATCATTGCTTCACGGATGTAGAATT CACAAGAACGTCAAGCTTGCGGAGAAGGTAGCAGACAAGGTCTTTAAGCTGGAACCTGAG AACACAGGGTACTATGTTCTTCTTGCCAACATCTATGCTGAGGCTGAGAGATGGGAGGCT GTCAAGAAGCTCAAGAACAAGATTGGTGGTCGAGGGCTCCGTGAGAACACTGGCTACAGT TGGATCGAGGTCAGAAGCAAGGTTCATGTCTTTATTGCAGATAACCGGAATCACCCAGAC TGGAACAGGATTGCAGAGTTTCTGGATGATGTTGCCAGAAGGATGCGGCAAGAAGGCCAT GATCCTAAGAAAAAGTATGCTCTGATGGGTGCCGATGATGCAGTGCATGACGAGGCACTA TGTGGGCACAGCTCAAAGCTCGCCGTCGCATTCGGTGTGCTGAATTTACCGGAGGGACGG CCAATTCGTGTGACAAAAAACTCAAAAGTCTGCAGCCACTGCCATGAGGCTGCCAAGTTC ATATCGAAGATGTGCAACAGAGAGATCATTCTGAGAGATTCAAGCAGATTCCATCGTTTT GAAGGAGGCAGGTGTTCTTGCAGAGGGTACCTCTGA

Peptide Sequence

PEP ID	Zm00001d031535_P001
PEP Infomation	pep chromosome:B73_RefGen_v4:1:193452711:193455986:1 gene:Zm00001d031535 transcript:Zm00001d031535_T001 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding description:Tetratricopeptide repeat (TPR)-like superfamily protein
Sequence	MATPPLYSVSTHHRAPPPWPPPKAATSPRITFRCSVLAAPAGRVLEAPTAAPSSWSTKNP PSRALSSDVNLRIQRLCQAGDLAGALRLLGSDGGVDVRSYCMVVQLCGEERSLEAAKRAH ALIRASSAAATGGKGSVLGKRLVLAYLKCGDLGEARTVFDGMPPQAADVRVWTSLMSAYA KAGDFQEAVSLFRQMQCCGVSPDAHAVSCVLKCVSSLGSLTEGEVIHGLLEKLGLGQACA VANALIAVYSRCGRMEDAARVFDSMHPRDAISWNSMIGGCFSNGWHGTAVDLFSKMWSQG TEISSVTVLSVLPACAGLGYGLIGKAVHGYSVKSGLLWGLDSVQSGIDDAALGSKLVFMY VKCGDMASARRVFDAMSSKGNVHVWNLIMGGYAKVGEFEESLSLFVQMHELGIAPDEHAI SCLLKCITCLSCARDGLVAHGYIVKLGFGAQCAVCNALISFYAKSNMIGDAVLVFNRMPR QDTISWNSVISGCSSNGLNSEAIELFIRMWTQGQELDSVTLLSVLPACAQSRYWFAGRVV HGYSVKTGLIGETSLANALLDMYSNCSDWQSTNQIFRSMGQKNVVSWTAMITSYMRAGLF DKVAGLLQEMVLDGIRPDVFAVTSALHAFAGDESLKQGKSVHGYTIRNGMEKLLPVANAL MEMYVKCRNVEEARLIFDRVTNKDVISWNTLIGGYSRNNFPNESFSLFSDMLLQFRPNAV TMTCILPAAASISSLERGREIHAYALRRGFLEDSYASNALVDMYVKCGALLVARVLFDRL TKKNLISWTIMIAGYGMHGFGKHAIALFEQMRGSGIEPDAASFSAILYACCHSGLAAEGR RFFKAMQKEYKIEPKLKHYTCIVDLLSRTGDLKEALEFIESMPIEPDSSIWVSLLHGCRI HKNVKLAEKVADKVFKLEPENTGYYVLLANIYAEAERWEAVKKLKNKIGGRGLRENTGYS WIEVRSKVHVFIADNRNHPDWNRIAEFLDDVARRMRQEGHDPKKKYALMGADDAVHDEAL CGHSSKLAVAFGVLNLPEGRPIRVTKNSKVCSHCHEAAKFISKMCNREIILRDSSRFHRF EGGRCSCRGYL

Transcript Sequence

Transcript ID	Zm00001d031535_T001
Transcript Infomation	cdna chromosome:B73_RefGen_v4:1:193452711:193455986:1 gene:Zm00001d031535 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding description:Tetratricopeptide repeat (TPR)-like superfamily protein
Sequence	ATGGCGACGCCTCCGCTCTACTCCGTTTCCACTCACCACCGCGCCCCACCACCATGGCCG CCTCCCAAGGCTGCCACTAGTCCGCGAATAACCTTTCGGTGTAGCGTGCTGGCGGCACCG GCTGGCCGAGTCCTGGAGGCGCCCACCGCTGCTCCAAGCTCATGGAGCACCAAGAATCCG CCAAGTCGGGCCCTGAGTTCCGACGTGAACCTGCGAATCCAGCGCCTCTGTCAGGCGGGT GACCTCGCGGGCGCTCTGAGGCTGCTGGGCTCTGACGGCGGCGTCGACGTGCGGAGCTAC TGCATGGTCGTTCAGCTCTGCGGGGAGGAGCGGTCGTTGGAGGCTGCCAAGAGAGCGCAT GCCTTAATTCGCGCGTCCAGTGCCGCTGCAACGGGTGGAAAAGGGAGCGTCCTTGGGAAG AGGTTAGTGCTGGCGTACCTGAAATGCGGCGACCTGGGCGAGGCAAGGACGGTGTTCGAT GGAATGCCTCCTCAAGCTGCTGATGTCCGTGTCTGGACTTCGCTGATGAGCGCGTACGCC AAGGCGGGTGATTTCCAGGAAGCTGTCTCCCTGTTTAGGCAGATGCAGTGCTGCGGGGTC AGTCCGGATGCACATGCTGTTTCCTGTGTCCTCAAGTGCGTTTCCAGTTTGGGCAGCCTT ACGGAAGGCGAGGTGATTCATGGATTACTTGAGAAGTTGGGTCTCGGTCAAGCATGCGCG GTTGCAAATGCTCTGATTGCCGTGTACTCGAGGTGTGGACGGATGGAGGATGCGGCACGG GTATTTGACAGTATGCATCCCCGGGATGCCATCTCTTGGAATTCTATGATTGGTGGATGC TTTTCAAACGGATGGCATGGTACAGCTGTTGATCTTTTCAGCAAAATGTGGTCTCAAGGT ACGGAGATCAGTTCAGTGACAGTGCTCAGTGTTCTGCCTGCTTGTGCGGGATTAGGTTAT GGCCTTATTGGAAAAGCGGTGCATGGATACTCCGTGAAATCCGGATTGCTTTGGGGCCTT GATTCTGTACAAAGTGGGATAGATGATGCTGCTCTTGGATCCAAACTGGTATTCATGTAT GTGAAATGTGGGGACATGGCCTCTGCAAGAAGGGTGTTTGATGCGATGTCATCGAAAGGT AATGTGCACGTATGGAATCTGATAATGGGTGGGTACGCAAAGGTTGGTGAATTTGAAGAA AGTCTCTCGCTTTTTGTGCAAATGCATGAGCTTGGAATTGCCCCGGATGAACATGCCATT TCTTGCCTTCTGAAGTGCATCACTTGTTTGTCTTGTGCCAGGGATGGCTTGGTGGCTCAT GGATATATAGTAAAATTGGGTTTCGGGGCACAGTGTGCAGTTTGCAATGCACTGATATCA TTCTATGCAAAGTCCAACATGATTGGCGATGCAGTCTTGGTGTTCAATAGAATGCCTCGT CAAGATACCATTTCTTGGAATTCTGTGATTAGTGGATGCTCTTCCAATGGACTAAACAGT GAAGCTATTGAGTTGTTCATAAGAATGTGGACACAAGGACAGGAGCTGGACTCAGTTACG TTGCTAAGTGTTTTGCCAGCTTGTGCACAGTCACGCTATTGGTTTGCAGGAAGGGTGGTT CATGGTTACTCGGTTAAAACTGGATTGATTGGGGAAACATCTCTTGCAAATGCTCTTCTT GATATGTACTCAAATTGCTCAGATTGGCAGAGCACTAATCAGATATTCAGAAGCATGGGT CAAAAAAATGTGGTGTCCTGGACAGCAATGATCACGAGTTATATGAGGGCAGGACTGTTT GACAAAGTGGCTGGGTTACTTCAAGAGATGGTACTAGATGGTATCAGACCTGATGTCTTT GCAGTCACAAGTGCCCTTCACGCTTTTGCTGGTGACGAATCTCTGAAACAAGGCAAATCT GTCCATGGTTACACCATCAGAAATGGAATGGAGAAGCTTCTTCCTGTTGCCAATGCACTT ATGGAAATGTATGTGAAATGCAGGAATGTGGAAGAAGCACGGTTGATTTTTGACCGTGTG ACGAATAAGGATGTAATCTCATGGAATACACTGATAGGAGGTTACTCCAGAAATAATTTT CCCAATGAATCCTTCAGTTTGTTCAGTGACATGTTGCTCCAATTCAGACCCAATGCAGTG ACCATGACTTGCATCCTTCCTGCTGCTGCAAGCATTTCATCCTTGGAGCGAGGAAGGGAG ATACATGCTTATGCACTTCGAAGAGGATTTCTGGAAGATAGTTATGCATCCAATGCGCTT GTGGACATGTATGTTAAATGTGGTGCGTTACTGGTAGCTCGAGTTTTGTTTGACCGGTTG ACTAAGAAGAACCTCATATCATGGACCATTATGATTGCTGGATATGGCATGCATGGTTTT GGGAAACATGCCATCGCCCTCTTTGAGCAAATGAGAGGCAGTGGTATTGAGCCAGATGCG GCCTCTTTCAGTGCCATATTGTATGCTTGCTGCCATTCTGGTCTTGCTGCTGAGGGACGG AGATTCTTCAAGGCTATGCAAAAGGAATACAAAATAGAGCCCAAGTTGAAGCACTACACC TGCATTGTTGACCTGCTTAGCCGTACCGGCGACCTGAAGGAGGCTCTTGAGTTCATCGAG TCAATGCCGATTGAACCTGATTCAAGCATTTGGGTATCATTGCTTCACGGATGTAGAATT CACAAGAACGTCAAGCTTGCGGAGAAGGTAGCAGACAAGGTCTTTAAGCTGGAACCTGAG AACACAGGGTACTATGTTCTTCTTGCCAACATCTATGCTGAGGCTGAGAGATGGGAGGCT GTCAAGAAGCTCAAGAACAAGATTGGTGGTCGAGGGCTCCGTGAGAACACTGGCTACAGT TGGATCGAGGTCAGAAGCAAGGTTCATGTCTTTATTGCAGATAACCGGAATCACCCAGAC TGGAACAGGATTGCAGAGTTTCTGGATGATGTTGCCAGAAGGATGCGGCAAGAAGGCCAT GATCCTAAGAAAAAGTATGCTCTGATGGGTGCCGATGATGCAGTGCATGACGAGGCACTA TGTGGGCACAGCTCAAAGCTCGCCGTCGCATTCGGTGTGCTGAATTTACCGGAGGGACGG CCAATTCGTGTGACAAAAAACTCAAAAGTCTGCAGCCACTGCCATGAGGCTGCCAAGTTC ATATCGAAGATGTGCAACAGAGAGATCATTCTGAGAGATTCAAGCAGATTCCATCGTTTT GAAGGAGGCAGGTGTTCTTGCAGAGGGTACCTCTGA