Gene sequences

How To ▶︎

JA

EN

TOP > About the Species(Zea mays ) > genome data >Gene sequences

Search

By Traits

Let’s Analyze!!

SNP Detection
(lang=JA only)

Other Tools

Data List

All

Trait-Related Loci

Zea mays

CDS Sequence

CDS ID	Zm00001d030026_T050
CDS Infomation	cds chromosome:B73_RefGen_v4:1:100634812:100642315:1 gene:Zm00001d030026 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding description:DnaJ homolog subfamily C GRV2
Sequence	ATGGTGTCTGATTCTGACACACCAGAAATTATATGGACCCACAAGATGCGAGCAGAAAAC CTTATTCGTCAGGTCCTGCAGCATCTCGGTGACTTTCCTCAGAAATTAGCACAGCATTGC CATTCGTTGTATGATTATGCTCCTATGCCACCCGTGACTTATCCGAATCTGAAAGATGAG ATGTGGTGCCATCGTTACTACCTCCGTAACCTATGTGATGAAATTAGGTTTCCTAACTGG CCCATTGTAGAACACGTGGAGTTTTTGCAGTCATTGTTGGTAATGTGGCGTGAAGAGTTA ACTCGTCGTCCAATGGATTTATCTGAAGAAGAAGCCTGTAAGATACTGGAGATTTCACTT GATGATCTCGTGCTTGTTGAGAACGGTAGCAGCAAGCGGCCATCTGACTTAAGTTCGGCT AATTCCGGAAACAAAACTGAAAACATTGATGAAGAGAAGCTTAAGCGCCAATACCGAAAG CTAGCAATAAAATATCATCCAGACAAGAACCCTGAAGGAAGGGAGAAGTTTGTTGCTGTG CAAAAGGCCTATGAGCGATTGCAGGCTAGTATGCAGGGATTGCAGGGACCACAAGTCTGG AGGCTGCTACTCTTGCTGAAGGCACAATGCATCTTGTACAAGAGATATGGGGATGTCTTG GAACCATTCAAATATGCTGGTTATCCTATGTTGCTAAATGCAGTTACTGTAGATAAGGAT GACAGCAATTTTCTTTCATCTGATAGGGCCCCTCTTCTTATAGCTGCTTCAGAGCTGATT TGGCTGACATGTGCATCATCTTCATTAAATGGAGAAGAACTTATAAGGGATGGTGGTATC CCCTTGTTGGCAACACTTCTTTCTCGCTGTATGTGCATTGTTCAGCCCACAACACCGGCA AATGAACCAGCTGCAAGAATAGTCACCAACATAATGCATACTTTCTCTGTCCTCAGTCAG TTTGAGTCAGGAAGAGTTGAGGTTCTTAAGTTTGGTGGCCTTGTTGAGGACATTGTGCAT TGTACAGAACTTGAATTTGTTCCTTCAGCTGTGGATGCTGCACTGCTGACAGCTGCAAAT GTTTCGGTGTCATCTGAGTTGCAAAATGCTTTGCTCAGGGCTGGATTTTTATGGTATGTG CTACCCCTGCTGCTTCAGTATGATTCGACAGCAGAAGAGAATGAGATATGTGAGGCACAT GGTGTTGGGGCAAGGGTGCAGATTGCTAAAAATCTGCATGCTGTTCATGCAACTCAGGCT TTGTCTAAGCTTTCTGGTCTCAGCAGCGATGATATACTGTACCCAGATAACAAACCTGCA TACAATGCGCTAAAGGCTCTTCTTACTCCAAAGCTTGCTGACATGCTGAGAAACCACCCA CCTAAAGAGTTATTATCAAATCTGAATTCAAATTTGGAATCACCAGAGATCATATGGAAT TCGTCCACCAGAGGGGAGCTTCTCAAATTTGTAGACCAGCAGCGTGCTAGTCAAGGCCCT GATGGTTCATATGATTTGACAGAATCACAGTCTTTCACCTATGAAGCTTTATCCAAAGAA TTGATCGTTGGTAATGTATACTTGAGAGTTTACAACAATCAACCGGATTTTGAAATAAGT GACCAGGAGGAATTTTGCATTGCCCTGCTCAAGTTTATAGCAGAGTTAGTACAACAGTGG AATTCCGTTAACTTGGAGGAGACGATTCATCAACATGGTTCAGTTATTGAAGCATCTATT TCTGAAAATGATCAAGTCAGTGATTCAACTATTGAAGGAAAAATGGACAATTCATCAGGA AAACAAAGTACAGATGGAGATTCTGAAGTTATTATAAACCTCCAATGTGGGCTAACATCA CTTCAGAATCTTCTTACAAGTAATCCAGGCTTAGCTGCTGTTTTTGCTACCAAGGAGCGT CTGGTTCCTCTTTTTGAATGCCTTGCACTCCATGTTTCTCCTGAAAGCAGCATCCCACAA ATCTGTTTAAGTATTCTTTCTCTGTTGACTAAGCATGCTCCTTGTTTGGAGGCTATGGTT GCAGAAAGGATGAGCCTCATTTTGCTATTTCAGATACTCCACTGCAATCCTCCTTGCAGG GATGGAGCTCTTGCTGTACTATATTCTTTAGCCAGCACACCAGAGCTTGCCTGGGCTGCT GCCAAGCATGGTGGTGTTGTTTACATTCTTGAACTTATGTTGCCACTTCAAGAGGAAATC TCTATGCAGCAAAGAGCTGCTGCTGCATCTTTATTGGGCAAACTTGTTGGACAACCAATG CATGGCCCCAGGGTGGCAATCACCCTTGCCAGGTTCCTGCCTGATGGTTTGGTTTCTGCC ATTAAAGATGGACCTGGTGAAGCTGTTGTTTCTTCTCTTGAACAGACAACGGAAACTCCT GAACTAGTATGGACACCCGCAATGGCAGCTTCTCTTTCTGCACAGTTAGCAACAATGGCA TCAGACCTCTACCAAGAGCAGATGAAAGGACGTGTTGTTGATTGGGATGTACCTGAACAA GCATCTGGGCAACATGTAATGAAGGACGAACCACAGGTTGGTGGAATTTATGTTAGACTT TTTCTTAAGGACCCCAAATTTCCACTGAGAAACCCTAAAAGATTCCTTGAAGGGCTCCTA GATCAATATGTCTCCTCTGTTGCTGCTACGCATTATGAAGCAATTGCTACAGACCCAGAG CTTCCTTTACTACTGTCTGCGGCATTGGTTTCCTTACTACGAGTTCATCCAGCACTTGCT GACCATGTTGGCTACCTCGGTTATGTTCCAAAGCTTGTTGCGGCTATGGCTTATGAGGGA AGAAGGGAGACTATGGCATCTGGGCAGGCTACCAGTGCATCGAAGGCAGAACCTAGCGAA CATGACAACTCAGCTCACTCCGAGGCCACTGTACAGACTCCACAAGAACGTGTTCGCCTT AGTTGTTTGCGTGTTCTGCATCAGCTTGCGTCTAGTACAACTTGTGCAGAAGCTATGGCA GCAACAAGTGCAGGAACTCCTCAGGTTGTACCACTGCTTATGAAAGCAATTGGATGGCAA GGTGGAAGTATACTGGCATTGGAGACATTAAAGCGTGTAGTTGGTGCTGGTAATCGGGCT CGTGATGCTCTTGTTGCACAGGGGCTTAAGGTTGGTCTTGTTGAAGTACTCCTTGGTATT CTTGATTGGCGTGTTGGTGGAAGACAGGGGCTCTGTAATCAAATGAAGTGGAATGAATCA GAGGCTTCAATTGGACGTGTTTTGGCTGTGGAGCCTTATCGTCCCTCGACTCTTATCTAC AAGTGA

Peptide Sequence

PEP ID	Zm00001d030026_P050
PEP Infomation	pep chromosome:B73_RefGen_v4:1:100634812:100642315:1 gene:Zm00001d030026 transcript:Zm00001d030026_T050 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding description:DnaJ homolog subfamily C GRV2
Sequence	MVSDSDTPEIIWTHKMRAENLIRQVLQHLGDFPQKLAQHCHSLYDYAPMPPVTYPNLKDE MWCHRYYLRNLCDEIRFPNWPIVEHVEFLQSLLVMWREELTRRPMDLSEEEACKILEISL DDLVLVENGSSKRPSDLSSANSGNKTENIDEEKLKRQYRKLAIKYHPDKNPEGREKFVAV QKAYERLQASMQGLQGPQVWRLLLLLKAQCILYKRYGDVLEPFKYAGYPMLLNAVTVDKD DSNFLSSDRAPLLIAASELIWLTCASSSLNGEELIRDGGIPLLATLLSRCMCIVQPTTPA NEPAARIVTNIMHTFSVLSQFESGRVEVLKFGGLVEDIVHCTELEFVPSAVDAALLTAAN VSVSSELQNALLRAGFLWYVLPLLLQYDSTAEENEICEAHGVGARVQIAKNLHAVHATQA LSKLSGLSSDDILYPDNKPAYNALKALLTPKLADMLRNHPPKELLSNLNSNLESPEIIWN SSTRGELLKFVDQQRASQGPDGSYDLTESQSFTYEALSKELIVGNVYLRVYNNQPDFEIS DQEEFCIALLKFIAELVQQWNSVNLEETIHQHGSVIEASISENDQVSDSTIEGKMDNSSG KQSTDGDSEVIINLQCGLTSLQNLLTSNPGLAAVFATKERLVPLFECLALHVSPESSIPQ ICLSILSLLTKHAPCLEAMVAERMSLILLFQILHCNPPCRDGALAVLYSLASTPELAWAA AKHGGVVYILELMLPLQEEISMQQRAAAASLLGKLVGQPMHGPRVAITLARFLPDGLVSA IKDGPGEAVVSSLEQTTETPELVWTPAMAASLSAQLATMASDLYQEQMKGRVVDWDVPEQ ASGQHVMKDEPQVGGIYVRLFLKDPKFPLRNPKRFLEGLLDQYVSSVAATHYEAIATDPE LPLLLSAALVSLLRVHPALADHVGYLGYVPKLVAAMAYEGRRETMASGQATSASKAEPSE HDNSAHSEATVQTPQERVRLSCLRVLHQLASSTTCAEAMAATSAGTPQVVPLLMKAIGWQ GGSILALETLKRVVGAGNRARDALVAQGLKVGLVEVLLGILDWRVGGRQGLCNQMKWNES EASIGRVLAVEPYRPSTLIYK

Transcript Sequence

Transcript ID	Zm00001d030026_T050
Transcript Infomation	cdna chromosome:B73_RefGen_v4:1:100634812:100642315:1 gene:Zm00001d030026 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding description:DnaJ homolog subfamily C GRV2
Sequence	GGCAAAGCGTAGTGTACTGGGTGGACTACTCCCAGAATCTTTGCTGTATGTCTTGGAGCG CAGTGGCCCTTCTGCTTTTGCGGGTGCAATGGTGTCTGATTCTGACACACCAGAAATTAT ATGGACCCACAAGATGCGAGCAGAAAACCTTATTCGTCAGGTCCTGCAGCATCTCGGTGA CTTTCCTCAGAAATTAGCACAGCATTGCCATTCGTTGTATGATTATGCTCCTATGCCACC CGTGACTTATCCGAATCTGAAAGATGAGATGTGGTGCCATCGTTACTACCTCCGTAACCT ATGTGATGAAATTAGGTTTCCTAACTGGCCCATTGTAGAACACGTGGAGTTTTTGCAGTC ATTGTTGGTAATGTGGCGTGAAGAGTTAACTCGTCGTCCAATGGATTTATCTGAAGAAGA AGCCTGTAAGATACTGGAGATTTCACTTGATGATCTCGTGCTTGTTGAGAACGGTAGCAG CAAGCGGCCATCTGACTTAAGTTCGGCTAATTCCGGAAACAAAACTGAAAACATTGATGA AGAGAAGCTTAAGCGCCAATACCGAAAGCTAGCAATAAAATATCATCCAGACAAGAACCC TGAAGGAAGGGAGAAGTTTGTTGCTGTGCAAAAGGCCTATGAGCGATTGCAGGCTAGTAT GCAGGGATTGCAGGGACCACAAGTCTGGAGGCTGCTACTCTTGCTGAAGGCACAATGCAT CTTGTACAAGAGATATGGGGATGTCTTGGAACCATTCAAATATGCTGGTTATCCTATGTT GCTAAATGCAGTTACTGTAGATAAGGATGACAGCAATTTTCTTTCATCTGATAGGGCCCC TCTTCTTATAGCTGCTTCAGAGCTGATTTGGCTGACATGTGCATCATCTTCATTAAATGG AGAAGAACTTATAAGGGATGGTGGTATCCCCTTGTTGGCAACACTTCTTTCTCGCTGTAT GTGCATTGTTCAGCCCACAACACCGGCAAATGAACCAGCTGCAAGAATAGTCACCAACAT AATGCATACTTTCTCTGTCCTCAGTCAGTTTGAGTCAGGAAGAGTTGAGGTTCTTAAGTT TGGTGGCCTTGTTGAGGACATTGTGCATTGTACAGAACTTGAATTTGTTCCTTCAGCTGT GGATGCTGCACTGCTGACAGCTGCAAATGTTTCGGTGTCATCTGAGTTGCAAAATGCTTT GCTCAGGGCTGGATTTTTATGGTATGTGCTACCCCTGCTGCTTCAGTATGATTCGACAGC AGAAGAGAATGAGATATGTGAGGCACATGGTGTTGGGGCAAGGGTGCAGATTGCTAAAAA TCTGCATGCTGTTCATGCAACTCAGGCTTTGTCTAAGCTTTCTGGTCTCAGCAGCGATGA TATACTGTACCCAGATAACAAACCTGCATACAATGCGCTAAAGGCTCTTCTTACTCCAAA GCTTGCTGACATGCTGAGAAACCACCCACCTAAAGAGTTATTATCAAATCTGAATTCAAA TTTGGAATCACCAGAGATCATATGGAATTCGTCCACCAGAGGGGAGCTTCTCAAATTTGT AGACCAGCAGCGTGCTAGTCAAGGCCCTGATGGTTCATATGATTTGACAGAATCACAGTC TTTCACCTATGAAGCTTTATCCAAAGAATTGATCGTTGGTAATGTATACTTGAGAGTTTA CAACAATCAACCGGATTTTGAAATAAGTGACCAGGAGGAATTTTGCATTGCCCTGCTCAA GTTTATAGCAGAGTTAGTACAACAGTGGAATTCCGTTAACTTGGAGGAGACGATTCATCA ACATGGTTCAGTTATTGAAGCATCTATTTCTGAAAATGATCAAGTCAGTGATTCAACTAT TGAAGGAAAAATGGACAATTCATCAGGAAAACAAAGTACAGATGGAGATTCTGAAGTTAT TATAAACCTCCAATGTGGGCTAACATCACTTCAGAATCTTCTTACAAGTAATCCAGGCTT AGCTGCTGTTTTTGCTACCAAGGAGCGTCTGGTTCCTCTTTTTGAATGCCTTGCACTCCA TGTTTCTCCTGAAAGCAGCATCCCACAAATCTGTTTAAGTATTCTTTCTCTGTTGACTAA GCATGCTCCTTGTTTGGAGGCTATGGTTGCAGAAAGGATGAGCCTCATTTTGCTATTTCA GATACTCCACTGCAATCCTCCTTGCAGGGATGGAGCTCTTGCTGTACTATATTCTTTAGC CAGCACACCAGAGCTTGCCTGGGCTGCTGCCAAGCATGGTGGTGTTGTTTACATTCTTGA ACTTATGTTGCCACTTCAAGAGGAAATCTCTATGCAGCAAAGAGCTGCTGCTGCATCTTT ATTGGGCAAACTTGTTGGACAACCAATGCATGGCCCCAGGGTGGCAATCACCCTTGCCAG GTTCCTGCCTGATGGTTTGGTTTCTGCCATTAAAGATGGACCTGGTGAAGCTGTTGTTTC TTCTCTTGAACAGACAACGGAAACTCCTGAACTAGTATGGACACCCGCAATGGCAGCTTC TCTTTCTGCACAGTTAGCAACAATGGCATCAGACCTCTACCAAGAGCAGATGAAAGGACG TGTTGTTGATTGGGATGTACCTGAACAAGCATCTGGGCAACATGTAATGAAGGACGAACC ACAGGTTGGTGGAATTTATGTTAGACTTTTTCTTAAGGACCCCAAATTTCCACTGAGAAA CCCTAAAAGATTCCTTGAAGGGCTCCTAGATCAATATGTCTCCTCTGTTGCTGCTACGCA TTATGAAGCAATTGCTACAGACCCAGAGCTTCCTTTACTACTGTCTGCGGCATTGGTTTC CTTACTACGAGTTCATCCAGCACTTGCTGACCATGTTGGCTACCTCGGTTATGTTCCAAA GCTTGTTGCGGCTATGGCTTATGAGGGAAGAAGGGAGACTATGGCATCTGGGCAGGCTAC CAGTGCATCGAAGGCAGAACCTAGCGAACATGACAACTCAGCTCACTCCGAGGCCACTGT ACAGACTCCACAAGAACGTGTTCGCCTTAGTTGTTTGCGTGTTCTGCATCAGCTTGCGTC TAGTACAACTTGTGCAGAAGCTATGGCAGCAACAAGTGCAGGAACTCCTCAGGTTGTACC ACTGCTTATGAAAGCAATTGGATGGCAAGGTGGAAGTATACTGGCATTGGAGACATTAAA GCGTGTAGTTGGTGCTGGTAATCGGGCTCGTGATGCTCTTGTTGCACAGGGGCTTAAGGT TGGTCTTGTTGAAGTACTCCTTGGTATTCTTGATTGGCGTGTTGGTGGAAGACAGGGGCT CTGTAATCAAATGAAGTGGAATGAATCAGAGGCTTCAATTGGACGTGTTTTGGCTGTGGA GCCTTATCGTCCCTCGACTCTTATCTACAAGTGAAGGGCTTATTTTGACATCGCATGAGG ATAAGGCTGATGAGTTGTTCCATTTCTATGATGCCTTGCTCGGGACTACTTTGGGGAGAG AAAATTCTCTTAATCTTGATGCCCTGGAGATGCCTTCTTTCAATCTCAATGAGCTAGATG TGCCTTTCTCAGAGGAAGAAGTTTGGGGTACTGTAAAATCTATGCCGTCGGATAAAGCTC CGGGCCCGG