Gene sequences

How To ▶︎

JA

EN

TOP > About the Species(Zea mays ) > genome data >Gene sequences

Search

By Traits

Let’s Analyze!!

SNP Detection
(lang=JA only)

Other Tools

Data List

All

Trait-Related Loci

Zea mays

CDS Sequence

CDS ID	Zm00001d026350_T001
CDS Infomation	cds chromosome:B73_RefGen_v4:10:144091288:144093948:1 gene:Zm00001d026350 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding description:Pentatricopeptide repeat-containing protein
Sequence	ATGCTCTTCAACTCGCCAAAATCAGCAAAACGAATAGGAGTACAGTTCCTATCAGTTGCA AGTGCAGACTGCTTTGGTCGAGATGTCTCTCCGACGCACTTTGCATCCCTGTTAAAGGAA TGCAGGTCTGTGAATACAGTTCGTCAAATTCATCAGAAGATAATTGCTTGCGGCCTTCTT TCGTATCCATCATCTTTGTTGTCTGTGCCACTCGCACCACTTCCATCACATTCATATGTA TCACCAAAATCTTTGGGCACCGGTGTTGTAGCTTCCTATCTTGCTTGTGGTGCTACGAAG GATGCTCTCTCAGTGTTGGAGCGTGTCACACCATCACCAGCCGTGTGGTGGAATCTACTC GTAAGAGAACACATCAAGGAAGGCCACCTTGATAGAGCAATTGGTGTATCTTGTCGCATG CTGCGTGCTGGAACTAAGCCAGACCATTTTACTCTGCCGTATGCGCTGAAAGCATGTGGA GAGCTACCTTCATACTGTTGTGGAAGAGCATTACATGGACTCATATGTTGCAATGGATTT GAGTCAAATGTCTTTGTCTGCAATGCATTGGTGGCAATGTATTCCCGCTGTGGTTCTTTG GAGGATGCCAGTCTGGTGTTTGATGAAATAACACGGAAGGGAATTGATGATGTTATCTCA TGGAATTCAATTGTTGCTGCCCATGTTAAGGGTAGTAATCCGCGGACTGCATTAGAGCTG TTTTCAGAGATGTCAATGATTGTTCACGAAAAAGCTACAAATGAAAGGTCAGATATCATT AGCATTGTCAACATTCTTCCTGCATGTGCTTCTCTAAAGGCATTGCCTCAAATTAAGGAA ATCCACAGCTATGCCATTCGGAATGGCACATTTGCAGATGCTTTTGTGTGCAATGCTCTG ATTGATACCTATGCAAAGTGTGGGTCAATGAACGATGCGGTAAAGGTTTTCAATGTAATG GAATTCAAGGATGTCGTTTCTTGGAATGCAATGGTTACTGGATACACCCAAAGTGGGAAC TTTGGGGCAGCCTTCGAGCTTTTCGAGAATATGCGCAAGGAAAATATCCCACTAGATGTC ATAACGTGGAGTGCTGTAATTGCAGGGTATGCTCAGAGGGGGTGTAGCCAAGAGGCCCTT GATGCATTCCAGCAAATGATTCTTGATGGTTCAGAGCCAAATTCTGTCACTATCATCTCT CTATTGTCTGCTTGCGCTTCCTTGGGAGCATTGTCTCAGGGCATGGAAATTCATGCATAC TCTCTGAAGAAGTGTCTTTTATCCTTGGATAATGATTTTGGTGGTGACGGTGACGGTGAG GATCTAATGGTGTACAATGCATTAATAGATATGTACTCAAAGTGCAGAAGTTTCAAAGCT GCACGCTCCATATTTGATTCCATACCTCGAAGAGAACGTAATGTGGTGACTTGGACCGTC ATGATTGGTGGATATGCACAATATGGAGACTCAAATGATGCCCTCAAGATTTTCTCAGAG ATGATTTCAAAACCATACGCAGTTGCCCCAAATGCTTATACAATTTCCTGCATTTTGATG GCCTGTGCACATCTGGCAGCTCTTCGTATGGGTAAGCAGATTCACGCTTATGTCACCCGT CACCATGAATATGAACCATCTGTGTACTTTGTGGCAAATTGCCTTATTGATATGTACTCA AAGTGTGGTGATGTTGATACTGCTAGAAATGTATTTGATAGCATGCCTAAAAGGAATGAA GTATCTTGGACTTCAATGATGTCAGGGTATGGAATGCATGGTCGTGGTAAGGAGGCTTTA GACATATTTGACAAGATGCAGAAGGCAGGCTTTGTTCCTGATGATATTTCCTTCCTGGTT CTTCTTTATGCTTGTAGCCATTCTGGCATGGTGGATCAAGGTCTGAATTACTTTGATATC ATGCGCAGGGATTATGATGTAGTTGCCAGTGCAGAGCATTATGCTTGTGTTATTGACTTA CTGGCTCGCTGTGGGCGATTAGATAAGGCATGGAAAACAATTCAGGAAATGCCAATGGAG CCTAGTGCAGTTATCTGGGTTGCATTACTTAGTGCCTGTAGAGTTCATTCGAATGTGGAA CTTGCTGAATATGCTCTGAACAAACTGGTCAATATGAAAGCAGAGAATGATGGATCCTAC ACACTTATCTCCAACATATATGCTAATGCAAGGCGGTGGAAAGATGTAGCAAGAATCAGA CAATTAATGAAGAAATCAGGGATTAAGAAGAGGCCAGGATGCAGCTGGGTCCAAGGTAAG AAGGGTACTGCATCATTCTTTGTTGGAGATCGATCACACCCTCTATCTCCAGAGATATAT TCTCTTTTAGAGAGATTAATTGGCCGCATCAAGGTTATGGGTTATGTCCCCGAGACAAAC TTTGCACTGCATGATGTTGATGACGAGGAGAAAAATAATCTTCTCAGTGAACACAGCGAG AAGCTTGCTCTCGCATATGGGCTCCTCACGACTTCCCCTGGTTGTCCCATACGGATCACA AAGAACCTTCGTGTTTGCGGTGATTGTCATAGTGCATTCACCTACATCTCCAAGATTGTT GACCATGAGATCATTGTACGAGATTCCAGTCGCTTCCATCATTTCAAGAATGGCTCTTGT TCCTGTGGTGGCTATTGGTGA

Peptide Sequence

PEP ID	Zm00001d026350_P001
PEP Infomation	pep chromosome:B73_RefGen_v4:10:144091288:144093948:1 gene:Zm00001d026350 transcript:Zm00001d026350_T001 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding description:Pentatricopeptide repeat-containing protein
Sequence	MLFNSPKSAKRIGVQFLSVASADCFGRDVSPTHFASLLKECRSVNTVRQIHQKIIACGLL SYPSSLLSVPLAPLPSHSYVSPKSLGTGVVASYLACGATKDALSVLERVTPSPAVWWNLL VREHIKEGHLDRAIGVSCRMLRAGTKPDHFTLPYALKACGELPSYCCGRALHGLICCNGF ESNVFVCNALVAMYSRCGSLEDASLVFDEITRKGIDDVISWNSIVAAHVKGSNPRTALEL FSEMSMIVHEKATNERSDIISIVNILPACASLKALPQIKEIHSYAIRNGTFADAFVCNAL IDTYAKCGSMNDAVKVFNVMEFKDVVSWNAMVTGYTQSGNFGAAFELFENMRKENIPLDV ITWSAVIAGYAQRGCSQEALDAFQQMILDGSEPNSVTIISLLSACASLGALSQGMEIHAY SLKKCLLSLDNDFGGDGDGEDLMVYNALIDMYSKCRSFKAARSIFDSIPRRERNVVTWTV MIGGYAQYGDSNDALKIFSEMISKPYAVAPNAYTISCILMACAHLAALRMGKQIHAYVTR HHEYEPSVYFVANCLIDMYSKCGDVDTARNVFDSMPKRNEVSWTSMMSGYGMHGRGKEAL DIFDKMQKAGFVPDDISFLVLLYACSHSGMVDQGLNYFDIMRRDYDVVASAEHYACVIDL LARCGRLDKAWKTIQEMPMEPSAVIWVALLSACRVHSNVELAEYALNKLVNMKAENDGSY TLISNIYANARRWKDVARIRQLMKKSGIKKRPGCSWVQGKKGTASFFVGDRSHPLSPEIY SLLERLIGRIKVMGYVPETNFALHDVDDEEKNNLLSEHSEKLALAYGLLTTSPGCPIRIT KNLRVCGDCHSAFTYISKIVDHEIIVRDSSRFHHFKNGSCSCGGYW

Transcript Sequence

Transcript ID	Zm00001d026350_T001
Transcript Infomation	cdna chromosome:B73_RefGen_v4:10:144091288:144093948:1 gene:Zm00001d026350 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding description:Pentatricopeptide repeat-containing protein
Sequence	ATGCTCTTCAACTCGCCAAAATCAGCAAAACGAATAGGAGTACAGTTCCTATCAGTTGCA AGTGCAGACTGCTTTGGTCGAGATGTCTCTCCGACGCACTTTGCATCCCTGTTAAAGGAA TGCAGGTCTGTGAATACAGTTCGTCAAATTCATCAGAAGATAATTGCTTGCGGCCTTCTT TCGTATCCATCATCTTTGTTGTCTGTGCCACTCGCACCACTTCCATCACATTCATATGTA TCACCAAAATCTTTGGGCACCGGTGTTGTAGCTTCCTATCTTGCTTGTGGTGCTACGAAG GATGCTCTCTCAGTGTTGGAGCGTGTCACACCATCACCAGCCGTGTGGTGGAATCTACTC GTAAGAGAACACATCAAGGAAGGCCACCTTGATAGAGCAATTGGTGTATCTTGTCGCATG CTGCGTGCTGGAACTAAGCCAGACCATTTTACTCTGCCGTATGCGCTGAAAGCATGTGGA GAGCTACCTTCATACTGTTGTGGAAGAGCATTACATGGACTCATATGTTGCAATGGATTT GAGTCAAATGTCTTTGTCTGCAATGCATTGGTGGCAATGTATTCCCGCTGTGGTTCTTTG GAGGATGCCAGTCTGGTGTTTGATGAAATAACACGGAAGGGAATTGATGATGTTATCTCA TGGAATTCAATTGTTGCTGCCCATGTTAAGGGTAGTAATCCGCGGACTGCATTAGAGCTG TTTTCAGAGATGTCAATGATTGTTCACGAAAAAGCTACAAATGAAAGGTCAGATATCATT AGCATTGTCAACATTCTTCCTGCATGTGCTTCTCTAAAGGCATTGCCTCAAATTAAGGAA ATCCACAGCTATGCCATTCGGAATGGCACATTTGCAGATGCTTTTGTGTGCAATGCTCTG ATTGATACCTATGCAAAGTGTGGGTCAATGAACGATGCGGTAAAGGTTTTCAATGTAATG GAATTCAAGGATGTCGTTTCTTGGAATGCAATGGTTACTGGATACACCCAAAGTGGGAAC TTTGGGGCAGCCTTCGAGCTTTTCGAGAATATGCGCAAGGAAAATATCCCACTAGATGTC ATAACGTGGAGTGCTGTAATTGCAGGGTATGCTCAGAGGGGGTGTAGCCAAGAGGCCCTT GATGCATTCCAGCAAATGATTCTTGATGGTTCAGAGCCAAATTCTGTCACTATCATCTCT CTATTGTCTGCTTGCGCTTCCTTGGGAGCATTGTCTCAGGGCATGGAAATTCATGCATAC TCTCTGAAGAAGTGTCTTTTATCCTTGGATAATGATTTTGGTGGTGACGGTGACGGTGAG GATCTAATGGTGTACAATGCATTAATAGATATGTACTCAAAGTGCAGAAGTTTCAAAGCT GCACGCTCCATATTTGATTCCATACCTCGAAGAGAACGTAATGTGGTGACTTGGACCGTC ATGATTGGTGGATATGCACAATATGGAGACTCAAATGATGCCCTCAAGATTTTCTCAGAG ATGATTTCAAAACCATACGCAGTTGCCCCAAATGCTTATACAATTTCCTGCATTTTGATG GCCTGTGCACATCTGGCAGCTCTTCGTATGGGTAAGCAGATTCACGCTTATGTCACCCGT CACCATGAATATGAACCATCTGTGTACTTTGTGGCAAATTGCCTTATTGATATGTACTCA AAGTGTGGTGATGTTGATACTGCTAGAAATGTATTTGATAGCATGCCTAAAAGGAATGAA GTATCTTGGACTTCAATGATGTCAGGGTATGGAATGCATGGTCGTGGTAAGGAGGCTTTA GACATATTTGACAAGATGCAGAAGGCAGGCTTTGTTCCTGATGATATTTCCTTCCTGGTT CTTCTTTATGCTTGTAGCCATTCTGGCATGGTGGATCAAGGTCTGAATTACTTTGATATC ATGCGCAGGGATTATGATGTAGTTGCCAGTGCAGAGCATTATGCTTGTGTTATTGACTTA CTGGCTCGCTGTGGGCGATTAGATAAGGCATGGAAAACAATTCAGGAAATGCCAATGGAG CCTAGTGCAGTTATCTGGGTTGCATTACTTAGTGCCTGTAGAGTTCATTCGAATGTGGAA CTTGCTGAATATGCTCTGAACAAACTGGTCAATATGAAAGCAGAGAATGATGGATCCTAC ACACTTATCTCCAACATATATGCTAATGCAAGGCGGTGGAAAGATGTAGCAAGAATCAGA CAATTAATGAAGAAATCAGGGATTAAGAAGAGGCCAGGATGCAGCTGGGTCCAAGGTAAG AAGGGTACTGCATCATTCTTTGTTGGAGATCGATCACACCCTCTATCTCCAGAGATATAT TCTCTTTTAGAGAGATTAATTGGCCGCATCAAGGTTATGGGTTATGTCCCCGAGACAAAC TTTGCACTGCATGATGTTGATGACGAGGAGAAAAATAATCTTCTCAGTGAACACAGCGAG AAGCTTGCTCTCGCATATGGGCTCCTCACGACTTCCCCTGGTTGTCCCATACGGATCACA AAGAACCTTCGTGTTTGCGGTGATTGTCATAGTGCATTCACCTACATCTCCAAGATTGTT GACCATGAGATCATTGTACGAGATTCCAGTCGCTTCCATCATTTCAAGAATGGCTCTTGT TCCTGTGGTGGCTATTGGTGA