Gene sequences

How To ▶︎

JA

EN

TOP > About the Species(Zea mays ) > genome data >Gene sequences

Search

By Traits

Let’s Analyze!!

SNP Detection
(lang=JA only)

Other Tools

Data List

All

Trait-Related Loci

Zea mays

CDS Sequence

CDS ID	Zm00001d025981_T018
CDS Infomation	cds chromosome:B73_RefGen_v4:10:135280790:135284272:1 gene:Zm00001d025981 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding description:RNA-binding (RRM/RBD/RNP motifs) family protein
Sequence	ATGGTTAAAGAGCACCGCAAGCGGAAAGAGTTTGAAGTTTTTGTTGGTGGTCTGGATAAA GATGCAACAGAAAATGACCTTAAGAAGGTTTTTGGTGAAGTTGGTGAGATCACTGAAGTT CGTCTGATGATGAACCCTGCCACAAAGAAGAATAAAGGCTTTGCCTTCCTGCGATATGCA ACTGTAGAGCAAGCAAGGCGTGCTGTTTCAGAGCTAAAGAATCCACTGGTGCGGGGTAAA CAATGTGGTGTTGCTCCAAGTCATGACAATGATACACTCTTTGTCGGCAATATCTGCAAA ACATGGACAAAAGAACATTTGAAGGATAAACTGAAGAGTTATGGAGTTGAAAGTTTTGAC GACTTACTACTGGTTGAGGATACAAACAATCCTGGGATGAATCGTGGCTATGCCTTGCTT GAGTTTTCTACTCGACCTGAGGCAATGGATGCTTTCAGGATATTGCAGAAGAGGGATGTA GTCTTTGGAGTTGATCGTAGTGCAAAGGTTTCCTTTGCTGATTCCTACCCTCAAGTTGAT GACGAAATAATGGCACAGGTCAGAACAGTATTTCTTGATGGCCTTCCTCCCTCATGGGAT GAAGACCGTGTTAAGAAATATCTCAAAAAGTATGGAGCTATTGAGAAACTTGAACTTGCT CGAAACATGCCAGCTGCCAAGAGAAAGGATTTTGGGTTTGTTACATTTGATACGCATGAT AATGCTGTTGCATGTGCTGAAGGGATAAGTAACTCTGAAATTGGTGAAGGTGATCACAAG GCAAAAGTAAGGGCTAGACTGTCGCGACCACTACAGAGACCACCTAGAATGAAGCATGGA TTGAGAGGAAATTTTAGAGTCGGGCATGGTGCCCCACGGGGTGGCCGTTTACAGTACGCT CGTGCTCCTCCACCTCGCAGGCCTCCACCACGCCTTGTTCGGCCTGCTGGTAGTCGCTTA CCACCAATCAGGAGCCATCCATTGAAACGACCCATATACATCAGAGATAGACGTCCTGCT ATGCCAATGCTAGATAGAGCTAGGCGTTTACCTCCTTCAGGGAGATCTTATGACAGGAGG CCCCCAGCTCCAGTTTACCTGAAGAAAAGTCCAAGGAGAGAATACGGGAGGCGTGATGAA CTTCCTCCTCCAAGGAGCAGAGCTATGATTGATTACAGTCCTAGAGTTCCAGTTGATAGA CGTCCCTCTTTGAGGGATGATTATTTACCCCGGGGATCAGGTTATTCAGACCTAGGTCCT CATAGTGCTCCCCATCTTTCTGATAGGCGAGCTTATGCTGATGATAGTTATGGGGGGAAG TTCGACCGGCCTTTACCGGTCTATAGGGAGGGTCGTGGCCATGATTATGACACCGTTTCT GGATCAAAGCGTCCATATGCAGATATGGATGATGCGCCTCGGTATCAAGAAATTGGTGTT CGTCAGTCCAAGGCACGCTTGGACTATGACATTGGTGGCAGCAGTGCTCGCTATGGAGAT ACATACAACGAGAGGCCTGGACGACCACATGCGGGATATAGCAGTAGTCGGTCTATCCCT GGTCATGATTCAGCATATGGTAGCAGCCGTAATGGCATGAGTTATGGAGGTTCTGCTAGC AGTGCTGATGCTGGTGGTATGTACCCACCGAGTTACAGTGGTAGCTATGGGTCTCGTGGA TCTGATGTTGGTGGGAGTTCATATTCTTCGCTTTACTCAGGCCGCAATTTGGGTAGCAGC AGTGGTGGCTACTATGGAGGTAGCGGTTCCGGTTCATATTACTAA

Peptide Sequence

PEP ID	Zm00001d025981_P018
PEP Infomation	pep chromosome:B73_RefGen_v4:10:135280790:135284272:1 gene:Zm00001d025981 transcript:Zm00001d025981_T018 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding description:RNA-binding (RRM/RBD/RNP motifs) family protein
Sequence	MVKEHRKRKEFEVFVGGLDKDATENDLKKVFGEVGEITEVRLMMNPATKKNKGFAFLRYA TVEQARRAVSELKNPLVRGKQCGVAPSHDNDTLFVGNICKTWTKEHLKDKLKSYGVESFD DLLLVEDTNNPGMNRGYALLEFSTRPEAMDAFRILQKRDVVFGVDRSAKVSFADSYPQVD DEIMAQVRTVFLDGLPPSWDEDRVKKYLKKYGAIEKLELARNMPAAKRKDFGFVTFDTHD NAVACAEGISNSEIGEGDHKAKVRARLSRPLQRPPRMKHGLRGNFRVGHGAPRGGRLQYA RAPPPRRPPPRLVRPAGSRLPPIRSHPLKRPIYIRDRRPAMPMLDRARRLPPSGRSYDRR PPAPVYLKKSPRREYGRRDELPPPRSRAMIDYSPRVPVDRRPSLRDDYLPRGSGYSDLGP HSAPHLSDRRAYADDSYGGKFDRPLPVYREGRGHDYDTVSGSKRPYADMDDAPRYQEIGV RQSKARLDYDIGGSSARYGDTYNERPGRPHAGYSSSRSIPGHDSAYGSSRNGMSYGGSAS SADAGGMYPPSYSGSYGSRGSDVGGSSYSSLYSGRNLGSSSGGYYGGSGSGSYY

Transcript Sequence

Transcript ID	Zm00001d025981_T018
Transcript Infomation	cdna chromosome:B73_RefGen_v4:10:135280790:135284272:1 gene:Zm00001d025981 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding description:RNA-binding (RRM/RBD/RNP motifs) family protein
Sequence	GATGATGGAGTTGCAAAAGAAATATATGAAGAAGAGGACAAAGGTGAACGGCTTGAGTTT GAGGATGAACCAGAATATGAAGAGGAGGCTGCTGTAGACTATGATGAGAAAGATTTGGAG CAGTATGAAGAACAATACGAGGATGGTGATGAAGAGGTGGAGTATACTGAAGATGTGGTT GAAGTGGAGACTGATATTGTGGGTGAGGAACTTGATGAAGGTGGTGTTGATGGGGAGGGG GAGGGATACGAAAATGATGATGAAGAACATCATGTGGATGTGGATGATGCAGAGCAGGAT GAAATGGTTAAAGAGCACCGCAAGCGGAAAGAGTTTGAAGTTTTTGTTGGTGGTCTGGAT AAAGATGCAACAGAAAATGACCTTAAGAAGGTTTTTGGTGAAGTTGGTGAGATCACTGAA GTTCGTCTGATGATGAACCCTGCCACAAAGAAGAATAAAGGCTTTGCCTTCCTGCGATAT GCAACTGTAGAGCAAGCAAGGCGTGCTGTTTCAGAGCTAAAGAATCCACTGGTGCGGGGT AAACAATGTGGTGTTGCTCCAAGTCATGACAATGATACACTCTTTGTCGGCAATATCTGC AAAACATGGACAAAAGAACATTTGAAGGATAAACTGAAGAGTTATGGAGTTGAAAGTTTT GACGACTTACTACTGGTTGAGGATACAAACAATCCTGGGATGAATCGTGGCTATGCCTTG CTTGAGTTTTCTACTCGACCTGAGGCAATGGATGCTTTCAGGATATTGCAGAAGAGGGAT GTAGTCTTTGGAGTTGATCGTAGTGCAAAGGTTTCCTTTGCTGATTCCTACCCTCAAGTT GATGACGAAATAATGGCACAGGTCAGAACAGTATTTCTTGATGGCCTTCCTCCCTCATGG GATGAAGACCGTGTTAAGAAATATCTCAAAAAGTATGGAGCTATTGAGAAACTTGAACTT GCTCGAAACATGCCAGCTGCCAAGAGAAAGGATTTTGGGTTTGTTACATTTGATACGCAT GATAATGCTGTTGCATGTGCTGAAGGGATAAGTAACTCTGAAATTGGTGAAGGTGATCAC AAGGCAAAAGTAAGGGCTAGACTGTCGCGACCACTACAGAGACCACCTAGAATGAAGCAT GGATTGAGAGGAAATTTTAGAGTCGGGCATGGTGCCCCACGGGGTGGCCGTTTACAGTAC GCTCGTGCTCCTCCACCTCGCAGGCCTCCACCACGCCTTGTTCGGCCTGCTGGTAGTCGC TTACCACCAATCAGGAGCCATCCATTGAAACGACCCATATACATCAGAGATAGACGTCCT GCTATGCCAATGCTAGATAGAGCTAGGCGTTTACCTCCTTCAGGGAGATCTTATGACAGG AGGCCCCCAGCTCCAGTTTACCTGAAGAAAAGTCCAAGGAGAGAATACGGGAGGCGTGAT GAACTTCCTCCTCCAAGGAGCAGAGCTATGATTGATTACAGTCCTAGAGTTCCAGTTGAT AGACGTCCCTCTTTGAGGGATGATTATTTACCCCGGGGATCAGGTTATTCAGACCTAGGT CCTCATAGTGCTCCCCATCTTTCTGATAGGCGAGCTTATGCTGATGATAGTTATGGGGGG AAGTTCGACCGGCCTTTACCGGTCTATAGGGAGGGTCGTGGCCATGATTATGACACCGTT TCTGGATCAAAGCGTCCATATGCAGATATGGATGATGCGCCTCGGTATCAAGAAATTGGT GTTCGTCAGTCCAAGGCACGCTTGGACTATGACATTGGTGGCAGCAGTGCTCGCTATGGA GATACATACAACGAGAGGCCTGGACGACCACATGCGGGATATAGCAGTAGTCGGTCTATC CCTGGTCATGATTCAGCATATGGTAGCAGCCGTAATGGCATGAGTTATGGAGGTTCTGCT AGCAGTGCTGATGCTGGTGGTATGTACCCACCGAGTTACAGTGGTAGCTATGGGTCTCGT GGATCTGATGTTGGTGGGAGTTCATATTCTTCGCTTTACTCAGGCCGCAATTTGGGTAGC AGCAGTGGTGGCTACTATGGAGGTAGCGGTTCCGGTTCATATTACTAAGATTTGGCATTA TAGGACGTTGGTGTAGGCCCTGCATTTTGTGGAGCTCCTTGATTTAAGCCCTACAGATCT GGAAAAGAAATCCCAAGCACCCAAGTGAGGCAATGATTTCAAATAAGACATTTCAACGAA GCCAGATCATTAAGTTGGTTGAAGCAGTAGTCCCGAGGATGTTCTGGCTTGCTTATGTAA TGTAAGGATTTGCTTTATCTGATCAAGAGTTATGAACATAAGAGCCAGATATGGTGTTTT AAGTGTTTCGACATGTTTACTTCCAGTGTTTCTATAACGTTATTGAGACAGAATGGAGTG TACTTTGAGGTAGTTTCTGCAATTCAAG