Gene sequences

How To ▶︎

JA

EN

TOP > About the Species(Zea mays ) > genome data >Gene sequences

Search

By Traits

Let’s Analyze!!

SNP Detection
(lang=JA only)

Other Tools

Data List

All

Trait-Related Loci

Zea mays

CDS Sequence

CDS ID	Zm00001d017700_T025
CDS Infomation	cds chromosome:B73_RefGen_v4:5:204557756:204561796:1 gene:Zm00001d017700 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding gene_symbol:JUMONJI-transcription factor 15 description:Lysine-specific demethylase REF6
Sequence	ATGATACTGCTTCTTGACATGTCTGTCATTCTTTCCAGTATTAACTATCACCACTGTGGA GCCCCCAAAACATGGTATGGTATTCCAGGAAGTGCTGCTTCTGATTTTGAGAAAGTGGTA CGTGAGCATGTATATGATCACGAAATTTTATCAGGTGAAGGGGAAAGTGCAGCATTTGAT GTTCTGTTGGGAAAGACTACAATCTTCCCACCTAATATTTTACTGGATCATCATGTTCCA GTCTATAGAGCCATACAGAAACCTGGAGAGTTTGTTGTAACGTTTCCCCGAGCTTATCAT TCTGGTTTCAGCCATGGTTTCAATTGTGGTGAGGCAGTAAATTTTGCTACGGGCGAATGG TTTCCTCTAGGAGCAGTTGCCAGTCAACATTATGCACTTCTTAAGAGGATACCAGTATTA CCTTATGAGGAGCTTCTTTGTAAAGAAGCAACATTTTGTGCTAATGAGTTTTCCTTGTTT GAACACGGAAATGTAACATTAACTGGAGGCACACATATACAGAGCTATATGAAGGGTCCC TTTGTGCAGTTGATGCGGTTCCAACACCGTGTTCGTTGGTTGCTTGTGAAAATGGGTGCC CGTACATGCTATAAAGCAGACATTGATGCCACAGTTCTCTGTGGGATATGCAAACGTGAC TGCTATGTAGCTCACATTATGTGTAACTGCAGAGCAGATGCAATTTGCCTTTGTCATGAG GAAGAGATTAGTAAGTGTTCTTGCAACTGCGACCGTGTTGTTTTTGTGAGGAAAGACATC TTTGAATTGGAGGAAATATCAAAGAAGTTTGAGGAAATTGGAATACTGGATGAAGTAGGA AAACAAATGTCTCAAAATGATGGCTATAACATGCATCCTTACTTGTCCAATGGCATTGAC CACAATGCTAAATACTTTCCATACTGCAAGATCCTAATTGATACATCCCCTGAACTTCGT ACCTTTTCAGAGGTAGATGTTCTTGGATATGATCTGAATAAGCCATATCCTACATTATCA ACAATAACTTCTGCACATGGACCCCATGAGTATTCTACACAAAGTGATGAGTGTACTAGT TCTAAGCAAAGAACATACTCTAGCTCATGTCCAGAGAATGGAACGCTTAGTGTTTATCCT TTATGTACATCTGATCAAGCATTCTCAACTGACAAATTGGCTGCTCAGGATACTGATGAT TCTGACTGTGAGGTATTTAGAGTTAAGAGACGATCTAGCATAGTTATGGAGAAAAGATGT TCAGAAGATCTAACAATAACTTTAACTGAGAATCAGGTACTGTTACTTTTGTGA

Peptide Sequence

PEP ID	Zm00001d017700_P025
PEP Infomation	pep chromosome:B73_RefGen_v4:5:204557756:204561796:1 gene:Zm00001d017700 transcript:Zm00001d017700_T025 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding gene_symbol:JUMONJI-transcription factor 15 description:Lysine-specific demethylase REF6
Sequence	MILLLDMSVILSSINYHHCGAPKTWYGIPGSAASDFEKVVREHVYDHEILSGEGESAAFD VLLGKTTIFPPNILLDHHVPVYRAIQKPGEFVVTFPRAYHSGFSHGFNCGEAVNFATGEW FPLGAVASQHYALLKRIPVLPYEELLCKEATFCANEFSLFEHGNVTLTGGTHIQSYMKGP FVQLMRFQHRVRWLLVKMGARTCYKADIDATVLCGICKRDCYVAHIMCNCRADAICLCHE EEISKCSCNCDRVVFVRKDIFELEEISKKFEEIGILDEVGKQMSQNDGYNMHPYLSNGID HNAKYFPYCKILIDTSPELRTFSEVDVLGYDLNKPYPTLSTITSAHGPHEYSTQSDECTS SKQRTYSSSCPENGTLSVYPLCTSDQAFSTDKLAAQDTDDSDCEVFRVKRRSSIVMEKRC SEDLTITLTENQVLLLL

Transcript Sequence

Transcript ID	Zm00001d017700_T025
Transcript Infomation	cdna chromosome:B73_RefGen_v4:5:204557756:204561796:1 gene:Zm00001d017700 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding gene_symbol:JUMONJI-transcription factor 15 description:Lysine-specific demethylase REF6
Sequence	CATATCAAGTGGCGGTATAAATGAAAATATTCCCACTATATTTTTGTCATTATTCTTTGC ATGATACTGCTTCTTGACATGTCTGTCATTCTTTCCAGTATTAACTATCACCACTGTGGA GCCCCCAAAACATGGTATGGTATTCCAGGAAGTGCTGCTTCTGATTTTGAGAAAGTGGTA CGTGAGCATGTATATGATCACGAAATTTTATCAGGTGAAGGGGAAAGTGCAGCATTTGAT GTTCTGTTGGGAAAGACTACAATCTTCCCACCTAATATTTTACTGGATCATCATGTTCCA GTCTATAGAGCCATACAGAAACCTGGAGAGTTTGTTGTAACGTTTCCCCGAGCTTATCAT TCTGGTTTCAGCCATGGTTTCAATTGTGGTGAGGCAGTAAATTTTGCTACGGGCGAATGG TTTCCTCTAGGAGCAGTTGCCAGTCAACATTATGCACTTCTTAAGAGGATACCAGTATTA CCTTATGAGGAGCTTCTTTGTAAAGAAGCAACATTTTGTGCTAATGAGTTTTCCTTGTTT GAACACGGAAATGTAACATTAACTGGAGGCACACATATACAGAGCTATATGAAGGGTCCC TTTGTGCAGTTGATGCGGTTCCAACACCGTGTTCGTTGGTTGCTTGTGAAAATGGGTGCC CGTACATGCTATAAAGCAGACATTGATGCCACAGTTCTCTGTGGGATATGCAAACGTGAC TGCTATGTAGCTCACATTATGTGTAACTGCAGAGCAGATGCAATTTGCCTTTGTCATGAG GAAGAGATTAGTAAGTGTTCTTGCAACTGCGACCGTGTTGTTTTTGTGAGGAAAGACATC TTTGAATTGGAGGAAATATCAAAGAAGTTTGAGGAAATTGGAATACTGGATGAAGTAGGA AAACAAATGTCTCAAAATGATGGCTATAACATGCATCCTTACTTGTCCAATGGCATTGAC CACAATGCTAAATACTTTCCATACTGCAAGATCCTAATTGATACATCCCCTGAACTTCGT ACCTTTTCAGAGGTAGATGTTCTTGGATATGATCTGAATAAGCCATATCCTACATTATCA ACAATAACTTCTGCACATGGACCCCATGAGTATTCTACACAAAGTGATGAGTGTACTAGT TCTAAGCAAAGAACATACTCTAGCTCATGTCCAGAGAATGGAACGCTTAGTGTTTATCCT TTATGTACATCTGATCAAGCATTCTCAACTGACAAATTGGCTGCTCAGGATACTGATGAT TCTGACTGTGAGGTATTTAGAGTTAAGAGACGATCTAGCATAGTTATGGAGAAAAGATGT TCAGAAGATCTAACAATAACTTTAACTGAGAATCAGGTACTGTTACTTTTGTGATTTTGA TTAGTTTAACTGCTCCATTTAAGAGTGGATGTCACGGCAGTATATTTGTAGCCAAGAATT TTTAAACTTCGACAAATAATGACTAGATTGGTCATGTGATGTTAAATGTCGTGCTAAGGG AGGCTCTAGCCGGACCCATGTTTTCCCTCCTTAATAAAATGACACGCAAATCTCCTGCGT AGTTCGAGAAAAAAAGGAAAGCATGGTTTGAGGGAGCATTGGAGTAGGAGGTCAGAACAA GAGTACGGCTGAGAGAATAATAGGGCTTAAGATATATAAGATGTTTGCTTGATTTCCAGG ATAAAATGTCCCTTCTTATTTTCAGGACTCACTCAACTAATACAACTCAACCTCTAATCT AACACATCCAAGAACTGGGTTTGTTGTAAGTGAACTGTATACAAGTACAATTCTGGTTCG TGGTATCTATCTCATGTGCACACAACCAAAGGAATCCGCGAGTGACCTTTTTTAACCTCA AACTAAAAATCACTCCCACTAGGATTCGAACTTTGAACCTGCGGCGTGCTACTCAGACCA TCTAACCAACTCTGCTAAGCGCGAAAGGGCCTCTAGCTGAGAGGTGGTCTGAGTAGCACT CCTCGGGTCCTGAGTTTTGTCTCACCGCAGGAGCGAATTTCAGGCTAGGATTGAAAAAAT TCCCTTTGGTTTGCCCCACGTCAAAGCACAGGTTTAAGGTTCGGTCCTGGTCGTGGTCAA TTTCACATGAGGTACGGTGCCACTGTGTATAAGCAGGGTAGAGATAGGGGGGTTTGAGAG TTTTCTCGACCTATGTAAGAAGGTCTTCTCTTAATACAATGTATGTGGGCTGTCTTACCC ATGCAGATCAAAGTTTTTTAAACATTGCTGTTAAACCTGTTGTGAAGGGTCCTCGTCCAC ATGGCCACAGTAGTAATAATCACGGGCAGGACATTTCTTAATACATAATTTACCTGTATC TGAATGAAGGTTATTTTAATTAATTAACTTATTGATACAGGACGTTGTATTGGACTTAAA CAGTCGACCTGGAACAGTTTCTGGGCCTGTTTGTTTTAGCTTTGATTCTTAAAATCTAGC TGCATATTGCAGATTATTAAAATCTTTATTCTTGGGTTCTAACAATCTACTTTTAAAACA CATCCTGTTTATTTTATCTTCAGCTTTTCGAACTAGAATCCAAAATTCAAAGCTAAATCA AACAGACCTTAGTTGTGCTAGTATTTTCGAAACCTTATTTCCTGAGTTGTATATAATTAT CTTTAAAATAAAAGAACCATCATCTTATACCAATCCTTTAATCTATTTAATGTACCCAAA GATCTTTTCCCTGTATGCACGATAAAGTTGTGGACAGCCTCAAACAGGTTTGACTGTAAC CTGCTATGGAGATTGGCTTATCAAATCTATGGTACTGCATGTACAACTCTCCTAGTTGCT AAGATCTATTTCAAAAACTATTTGTAAAATGATCACTAAACCTAAACGATGGATTAAGGA GGTTGAAACAATCAAACATGGAGAGACTTTAGACAAGGATAACTGCTCAGAAATAGCAAT TAAACCAAGTTACTTAACAAGAAATTTTTATTGAATGGTTGGACAACTGTGAAACCCTTT TTCAGAACTTTCAATATTTAGCTTCACTCATACTGCCTACTCTTTTACTAATGGCTTACT CATTGTTTGTGTTGCTAGGCTTTAAGACGGTTAAAGAAAGCCTGTTCAGATGACAGACAA GAGAACGCAACTGAATCACATTGCCTTGACTTCATTTCTGGAAATACAGATAATTTCATC AATCGAAGCAAACAAAAAATGAATGTAGATCAGCTAGATGCAAAAAATGTGGAAGATGAA GTTGCTTTCGGCCAGAAATCTATCGGTTGCAGTTACCTGTCTCCATCTGTAGATCTTGGG CCGAAACGCTTGAAAATTCGTGGCCCATCCTTCCCAAGCACTGTTTCTGAAGTGGAAATA TCTTATAGGTTCCAGGAGGACATTGACTTGGCTAGTCAGCATACTCAATGAAGTATGCTG CTCTTGGTGCTAACTGCTAACATCAATCGTAACTTCTGGAAGATGAAAGCTCTTTTTTCA TTGGATGGTTCAGAACTGATTCTATCTACAGGTCTCCAATGGAGGCACTGTTATGGCTGG ATTTTATGATTCTATTGCCAGGTCATAGGCGATTTTTCTGATGATCCGTAGCTGCACATC ACTTATTTCCTTTCTTTGTAGGTTTTCCACTGTGAATAGGTTAGTCTACTACTTTTAACA ATTTGGTTCATTCTTTTTCCACCACAGATACACCTGTACCTAGAATGCTTTAATAGATCC TCATACGAAATGGACATTGTACATTTTTTTTAACAAGTCAGTCTTTTG