Gene sequences

How To ▶︎

JA

EN

TOP > About the Species(Zea mays ) > genome data >Gene sequences

Search

By Traits

Let’s Analyze!!

SNP Detection
(lang=JA only)

Other Tools

Data List

All

Trait-Related Loci

Zea mays

CDS Sequence

CDS ID	Zm00001d016181_T001
CDS Infomation	cds chromosome:B73_RefGen_v4:5:148921887:148924910:1 gene:Zm00001d016181 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding
Sequence	ATGCCCGACTCCGCTGATCCCCTCCCCACGCAACCCTCGCCGGATCCCGACATGCCGCCG CGGAAGCCTCTCGCTGGCGGCAAGCTCAAGAAGCCGCTCACTGACAAGCAGCGCGCTGCC GCGGAGCAGCGCCTGTCCCACCTCCGCGCCCACCTCATCCTGCGCTCCCTCGACTCCCCC GCTGGCGGGGCCCGTGCCCTACCGCCGCCGCAGGAGGCGGCGCTCGATGCCCTCGGCCTG CTCAATTTCTTCCGCCTCGACCTGCAATCTGACACCCCGCGCCCCGACCTCATCGCTCCG CTCGTCGCCTACTACGACCCGGTCTGCAAGCGCAGCTTCGTCCGCGGCGTCCGTGTCAGC GTCTCGCGCCACCACATCACCCGCGCGCTCTGCCTACCCTCGAAGCCCGCCTCCGCAGCG CCGGCCCCAGCAGACGTCGATCCCGCAGCGGTGGTCCCTGCCGTTATGCAGCTCCTGCAG GATTACGTCCTGCTCCCGTTTCAGGGGGGCGACATGTGCATACTGCCGCAGGAGGTGGCC GCCGCAGAGCAGATGGTCAGGGAGGGGGCGGCGCATAGGGTTGATTGGGGAGGGCTGATC TGGGGCCTCGTCGAGAAGGAGATGCTCGAGCTGCCCAAGAGGGAAGACGGGGTGTGCTAC TATGGGCCGCACCTGCAGAGGCTCATTTATTCCGAAAAGCCACATCTGTTGGAGCTGGTG GAGGAAGGGCCTGTTCCGGAGGCGTCCGCTGATGTGGAGATGGAGGATGAGGATGGTGAT GTGGATTTGAAAAGCAAGAACTTGGTGGAACTGGAGCCGGGGGATGGGGATGGAGAAGCG GGTAACGATGTCAGAAGCGAGAGCTTGAAGGATTCAGAATTGGGGAATGCTGGTGCAAGG AATGATGGTTTGGACAAGTTGGAGTTGGGGGATGCTGTTACAAGGAACAAGGTCATGGAG GAGTTGGGTTTAAGGGATGTAGATGCTAGGAACAACAGTATAGAGGAACTAGAGGTGGTC GAGGAAGATGCAAGGAGCAAGAGCTTGAATGAATGTGAGGCTGTGGATGTGGATCTGGAT GCTATGGACATCAATATAAATGACAGAGAGACGATCAATGGAGATACAAGGAGCAAGAGT TTGAACGAATCTGAGGCTGTGGATCTGGATCCAGATGCCATGGAAAACAATATAGATGAA ATGGAGACGGTCAATGAAGATGCAAGGACTAAGAGCTTGGATGAATTTGAGGCTGTGGAT GTGGCTCCAGATGCCATGGACAACAATATAGATGAAATGGGTGTGGTCAATGAAGACGCA AGGAGCAAGGGCTTGAATGAATCTGAGGCTGTGGATGCCATAAACAACAATATAGTTGAA TTGGATGCGGTCAATGAAGATGCGAGGTGCAAAAGCTTGAATGATGAATCAGAGCTGGTT GAAGAGGAATTTAAGAGCCCAAGCTTTGATGACATGAACACCGTGGATGAGCACGTCAAT GGCACAGACACGGATGGATTATGTTTGGGATTTGTGGAAGTTGAAGCGGTGCCTGCTGTA CATGAGGCAATGCCTGATAATAATGAAGAAACGACAGAGGAAGCACCAGCAGGGGGTGCT GATGTGGCAGGCAGTGATAATGTGGCAGTGCCTACAGATGTGGATTGTGAAGAACACTAT GTTGAGGCAGTAGTTGTAACACAAGAGGTAGTGGCTGTTGCAGAGGAGTTGGGGGATGAG GAGGCCAAGAGGGATGAAGAGAAGGATGTGATGGGATTGAGCTTGGGTTTTAATTCTACC AATGGTTATGGTGCTATGGATGTGGAAAAGGAAACCAATGTTGAAAGTTTGGATGAGGAC GAGAGTGACAGTGGCAATGAAGAGGCAGAAGAGTCAGAGGATGGTGCATTTGACGTTAAT GATGGAGAGGACATGAATTGGAGAATTGGGGATGTCAACGGGGGTGAGGGAATGACACAT TCCTTACAACGCTGTAACACATTTGGGGGCATGGAGTTTGAGAACCTGAATAAAGGAGAG GATGAGATGAGGGATGAGTTAAGATTTGACGATTTTCCTGCAAGGGCATCTTTGGAAAGG ATGACATCATCAAACCTCCTCCAAGCCATGAACTCAATTCCCTCATCATACAATGTATCA GAGAATGTGCATGATCTGCCCTCTGGGGATTTCTTGGCTATGGGGGCTGATGCACATAAG AGTGGAGTGGACCTGGGACCAGGGAGCTCATATTTATTTGGGAATAATGGTAAGAGGAAT ATTGATGATATTGATGGGTACAATGGCAATATGCAGGTGCAAGAGGGGTTTCCTCGGTCT AATCAGCAGAAGAGGATGCGGCATAGTAACAGTAGCAACATATCACCTGGATCAGGCTTT TTCAATGCAAGCTTTTCGGTGCCTATACAGAACTTGATGGTTGAGGCAAGCAGGCTCTAT GAGCAGAATGAGCAAAAACTTCAGAGTTTGCAATTTGAGAAGCAACATTGGTCTGACATG CTGCAGCAGAAGGAAGCCATTATCCAATCCCTAAACTCAGCTCGTTTTGAGCAACATAAT AAGTATCAAGCGGAGCTTAGACGCTTCGAGCATGATCTGAATGTTATGGCTCAGTTGGTC ACTACATACAAAAAAGCTTTAAAACAGACCCGGGCTTCTTTTGATGAGTACAGGAAGAAG TTCCCTTGCAATGTTCCTCTTTATGGTGATGTTGCTTGTGGCGGTGGTCTTGTTCTTAGT GTGAGGGAGTTGGAGAAAAGGCGGTGTGAGGAGCAGCAGCAAAATATTGCCATGGTAAAT GGTATGATTGAAAGATTCCAGTACAAATGGCTCTCAAAGTTTGAAGAGTGGGGACTTTCT GTCAATTCACTGTGGAGCAGAATGGAAGGACTCTATAAGGAGATTGAGCTTCTCAAGGAA AACAGAAGAGCAAGATTTGCTACCCCAGCTACAGAGGAATCTACCCTAGCTACAGAAGGA TCTACTCCAGCTACAGAGGAATGA

Peptide Sequence

PEP ID	Zm00001d016181_P001
PEP Infomation	pep chromosome:B73_RefGen_v4:5:148921887:148924910:1 gene:Zm00001d016181 transcript:Zm00001d016181_T001 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding
Sequence	MPDSADPLPTQPSPDPDMPPRKPLAGGKLKKPLTDKQRAAAEQRLSHLRAHLILRSLDSP AGGARALPPPQEAALDALGLLNFFRLDLQSDTPRPDLIAPLVAYYDPVCKRSFVRGVRVS VSRHHITRALCLPSKPASAAPAPADVDPAAVVPAVMQLLQDYVLLPFQGGDMCILPQEVA AAEQMVREGAAHRVDWGGLIWGLVEKEMLELPKREDGVCYYGPHLQRLIYSEKPHLLELV EEGPVPEASADVEMEDEDGDVDLKSKNLVELEPGDGDGEAGNDVRSESLKDSELGNAGAR NDGLDKLELGDAVTRNKVMEELGLRDVDARNNSIEELEVVEEDARSKSLNECEAVDVDLD AMDININDRETINGDTRSKSLNESEAVDLDPDAMENNIDEMETVNEDARTKSLDEFEAVD VAPDAMDNNIDEMGVVNEDARSKGLNESEAVDAINNNIVELDAVNEDARCKSLNDESELV EEEFKSPSFDDMNTVDEHVNGTDTDGLCLGFVEVEAVPAVHEAMPDNNEETTEEAPAGGA DVAGSDNVAVPTDVDCEEHYVEAVVVTQEVVAVAEELGDEEAKRDEEKDVMGLSLGFNST NGYGAMDVEKETNVESLDEDESDSGNEEAEESEDGAFDVNDGEDMNWRIGDVNGGEGMTH SLQRCNTFGGMEFENLNKGEDEMRDELRFDDFPARASLERMTSSNLLQAMNSIPSSYNVS ENVHDLPSGDFLAMGADAHKSGVDLGPGSSYLFGNNGKRNIDDIDGYNGNMQVQEGFPRS NQQKRMRHSNSSNISPGSGFFNASFSVPIQNLMVEASRLYEQNEQKLQSLQFEKQHWSDM LQQKEAIIQSLNSARFEQHNKYQAELRRFEHDLNVMAQLVTTYKKALKQTRASFDEYRKK FPCNVPLYGDVACGGGLVLSVRELEKRRCEEQQQNIAMVNGMIERFQYKWLSKFEEWGLS VNSLWSRMEGLYKEIELLKENRRARFATPATEESTLATEGSTPATEE

Transcript Sequence

Transcript ID	Zm00001d016181_T001
Transcript Infomation	cdna chromosome:B73_RefGen_v4:5:148921887:148924910:1 gene:Zm00001d016181 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding
Sequence	ATGCCCGACTCCGCTGATCCCCTCCCCACGCAACCCTCGCCGGATCCCGACATGCCGCCG CGGAAGCCTCTCGCTGGCGGCAAGCTCAAGAAGCCGCTCACTGACAAGCAGCGCGCTGCC GCGGAGCAGCGCCTGTCCCACCTCCGCGCCCACCTCATCCTGCGCTCCCTCGACTCCCCC GCTGGCGGGGCCCGTGCCCTACCGCCGCCGCAGGAGGCGGCGCTCGATGCCCTCGGCCTG CTCAATTTCTTCCGCCTCGACCTGCAATCTGACACCCCGCGCCCCGACCTCATCGCTCCG CTCGTCGCCTACTACGACCCGGTCTGCAAGCGCAGCTTCGTCCGCGGCGTCCGTGTCAGC GTCTCGCGCCACCACATCACCCGCGCGCTCTGCCTACCCTCGAAGCCCGCCTCCGCAGCG CCGGCCCCAGCAGACGTCGATCCCGCAGCGGTGGTCCCTGCCGTTATGCAGCTCCTGCAG GATTACGTCCTGCTCCCGTTTCAGGGGGGCGACATGTGCATACTGCCGCAGGAGGTGGCC GCCGCAGAGCAGATGGTCAGGGAGGGGGCGGCGCATAGGGTTGATTGGGGAGGGCTGATC TGGGGCCTCGTCGAGAAGGAGATGCTCGAGCTGCCCAAGAGGGAAGACGGGGTGTGCTAC TATGGGCCGCACCTGCAGAGGCTCATTTATTCCGAAAAGCCACATCTGTTGGAGCTGGTG GAGGAAGGGCCTGTTCCGGAGGCGTCCGCTGATGTGGAGATGGAGGATGAGGATGGTGAT GTGGATTTGAAAAGCAAGAACTTGGTGGAACTGGAGCCGGGGGATGGGGATGGAGAAGCG GGTAACGATGTCAGAAGCGAGAGCTTGAAGGATTCAGAATTGGGGAATGCTGGTGCAAGG AATGATGGTTTGGACAAGTTGGAGTTGGGGGATGCTGTTACAAGGAACAAGGTCATGGAG GAGTTGGGTTTAAGGGATGTAGATGCTAGGAACAACAGTATAGAGGAACTAGAGGTGGTC GAGGAAGATGCAAGGAGCAAGAGCTTGAATGAATGTGAGGCTGTGGATGTGGATCTGGAT GCTATGGACATCAATATAAATGACAGAGAGACGATCAATGGAGATACAAGGAGCAAGAGT TTGAACGAATCTGAGGCTGTGGATCTGGATCCAGATGCCATGGAAAACAATATAGATGAA ATGGAGACGGTCAATGAAGATGCAAGGACTAAGAGCTTGGATGAATTTGAGGCTGTGGAT GTGGCTCCAGATGCCATGGACAACAATATAGATGAAATGGGTGTGGTCAATGAAGACGCA AGGAGCAAGGGCTTGAATGAATCTGAGGCTGTGGATGCCATAAACAACAATATAGTTGAA TTGGATGCGGTCAATGAAGATGCGAGGTGCAAAAGCTTGAATGATGAATCAGAGCTGGTT GAAGAGGAATTTAAGAGCCCAAGCTTTGATGACATGAACACCGTGGATGAGCACGTCAAT GGCACAGACACGGATGGATTATGTTTGGGATTTGTGGAAGTTGAAGCGGTGCCTGCTGTA CATGAGGCAATGCCTGATAATAATGAAGAAACGACAGAGGAAGCACCAGCAGGGGGTGCT GATGTGGCAGGCAGTGATAATGTGGCAGTGCCTACAGATGTGGATTGTGAAGAACACTAT GTTGAGGCAGTAGTTGTAACACAAGAGGTAGTGGCTGTTGCAGAGGAGTTGGGGGATGAG GAGGCCAAGAGGGATGAAGAGAAGGATGTGATGGGATTGAGCTTGGGTTTTAATTCTACC AATGGTTATGGTGCTATGGATGTGGAAAAGGAAACCAATGTTGAAAGTTTGGATGAGGAC GAGAGTGACAGTGGCAATGAAGAGGCAGAAGAGTCAGAGGATGGTGCATTTGACGTTAAT GATGGAGAGGACATGAATTGGAGAATTGGGGATGTCAACGGGGGTGAGGGAATGACACAT TCCTTACAACGCTGTAACACATTTGGGGGCATGGAGTTTGAGAACCTGAATAAAGGAGAG GATGAGATGAGGGATGAGTTAAGATTTGACGATTTTCCTGCAAGGGCATCTTTGGAAAGG ATGACATCATCAAACCTCCTCCAAGCCATGAACTCAATTCCCTCATCATACAATGTATCA GAGAATGTGCATGATCTGCCCTCTGGGGATTTCTTGGCTATGGGGGCTGATGCACATAAG AGTGGAGTGGACCTGGGACCAGGGAGCTCATATTTATTTGGGAATAATGGTAAGAGGAAT ATTGATGATATTGATGGGTACAATGGCAATATGCAGGTGCAAGAGGGGTTTCCTCGGTCT AATCAGCAGAAGAGGATGCGGCATAGTAACAGTAGCAACATATCACCTGGATCAGGCTTT TTCAATGCAAGCTTTTCGGTGCCTATACAGAACTTGATGGTTGAGGCAAGCAGGCTCTAT GAGCAGAATGAGCAAAAACTTCAGAGTTTGCAATTTGAGAAGCAACATTGGTCTGACATG CTGCAGCAGAAGGAAGCCATTATCCAATCCCTAAACTCAGCTCGTTTTGAGCAACATAAT AAGTATCAAGCGGAGCTTAGACGCTTCGAGCATGATCTGAATGTTATGGCTCAGTTGGTC ACTACATACAAAAAAGCTTTAAAACAGACCCGGGCTTCTTTTGATGAGTACAGGAAGAAG TTCCCTTGCAATGTTCCTCTTTATGGTGATGTTGCTTGTGGCGGTGGTCTTGTTCTTAGT GTGAGGGAGTTGGAGAAAAGGCGGTGTGAGGAGCAGCAGCAAAATATTGCCATGGTAAAT GGTATGATTGAAAGATTCCAGTACAAATGGCTCTCAAAGTTTGAAGAGTGGGGACTTTCT GTCAATTCACTGTGGAGCAGAATGGAAGGACTCTATAAGGAGATTGAGCTTCTCAAGGAA AACAGAAGAGCAAGATTTGCTACCCCAGCTACAGAGGAATCTACCCTAGCTACAGAAGGA TCTACTCCAGCTACAGAGGAATGA