Gene sequences

How To ▶︎

JA

EN

TOP > About the Species(Zea mays ) > genome data >Gene sequences

Search

By Traits

Let’s Analyze!!

SNP Detection
(lang=JA only)

Other Tools

Data List

All

Trait-Related Loci

Zea mays

CDS Sequence

CDS ID	Zm00001d015248_T031
CDS Infomation	cds chromosome:B73_RefGen_v4:5:81114776:81118143:1 gene:Zm00001d015248 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding description:Splicing factor 3B subunit 1
Sequence	ATGAAGCCCGAGGATTACCAGTACTTTGGAACTTTGCTGAACGAGGAAGAGGAGGAGCAG CTATCGCCAGAGGAGCAGAAGGAGAGGAAAATCATGAAACTGTTACTCAAAGTGAAGAAT GGCACACCCCCACAGCGTAAAACAGCACTTCGGCAACTGACAGACAAAGCCCGTGAATTT GGTGCAGGACCGTTGTTCAACAAAATACTGCCCTTACTCATGCAGCCAACACTGGAGGAC CAGGAGAGGCATCTTTTGGTGAAGGTCATTGACAGAGTACTTTATAAGCTCGATGAGCTG GTCCGTCCTTTTGTGCACAAGATTCTTGTGGTTATTGAACCACTGTTGATTGATGAGGAC TATTATGCTCGTGTTGAAGGCAGGGAGATCATCTCAAACCTTAGCAAAGCAGCTGGGCTT GCTACTATGATTGCTGCTATGCGACCCGACATCGATAACATTGATGAGTATGTGAGAAAC ACCACTGCTAGGGCGTTCAGTGTGGTGGCTTCTGCTTTGGGTATCCCTGCCCTTTTACCA TTCTTGAAGGCTGTCTGTCAGAGTAAGAAGTCTTGGCAGGCTAGGCACACTGGTATCAAA ATCGTCCAACAGATTGCTATTCTCATGGGCTGTGCTGTTTTGCCACACCTCAAGTCACTA GTTGAGATCATTGAGCATGGGCTGAGCGATGAAAACCAGAAAGTTCGTACAATTACTGCC CTTTCTCTTGCTGCACTTGCTGAGGCTGCTGCACCATATGGTATAGAAAGTTTTGATACT GTATTGAAACCTCTGTGGAAGGGTATCAGATCTCACCGTGGGAAGGTCCTTGCTGCCTTC CTAAAGGCCATTGGTTTCATCATCCCTCTTATGGATGCTCTGTATGCTAGCTACTACACA AAGGAGGTGATGCAGGTCCTCATTAGGGAGTTCCAGTCTCCAGATGAAGAAATGAAGAAA ATTGTTCTCAAGGTGGTGAAACAGTGTGTCAGTACAGAGGGTGTGGAGGCTGATTATATC CGGAATGACATCCTTCCAGATTTCTTCAAGCACTTCTGGGTGAGGAGAATGGCTCTAGAT CGCAGGAACTATAAGCAGCTTGTGGAAACTACAGTTGAGATGGCAAACAAGGTTGGAGTT GCTGATATTGTTGGGAGGGTTGTTGAGGATCTGAAAGATGAAAGTGAGCCCTACAGAAGA ATGGTGATGGAAACAATCGAGAAGGTGGTAGCCAACTTGGGTGCATCAGATATTGATGCT CGTCTGGAGGAGCTGCTTATTGATGGTATCTTGTATGCTTTCCAAGAGCAGACTAGTGAT GACGCAAATGTTATGCTAAATGGTTTTGGAGCTGTGGTTAATGCACTTGGACAGAGAGTT AAGCCCTACCTTCCTCAGATTTGTGGTACTATCAAGTGGCGATTGAACAACAAGAGTGCA AAAGTTAGGCAGCAAGCTGCTGATCTGATCTCCAGGATAGCCATAGTAATGAAGCAGTGC CAGGAGGAGCAGCTTATGGGTCACTTGGGTGTTGTGCTGTATGAGTACTTAGGAGAGGAG TATCCTGAGGTGCTTGGTTCAATTCTTGGAGCCTTGAAGGCTATCGTCAATGTCATTGGT ATGACTAAAATGACTCCACCAATCAAGGATCTTCTTCCTCGTCTGACCCCCATTCTTAAG AACAGGCATGAGAAGGTCCAAGAGAACTGCATTGATCTTGTTGGTAGGATTGCTGATCGT GGAGCAGAATTTGTGCCAGCAAGGGAATGGATGAGGATTTGTTTTGAGCTGCTCGAAATG TTGAAGGCTCATAAGAAGGGTATTAGGAGAGCAACTGTGAACACATTTGGTTATATCGCA AAGGCTATAGGGCCACAGGATGTGTTGGCCACCCTGTTGAATAACTTGAAGGTGCAAGAA CGACAGAACCGGGTCTGTACAACTGTAGCTATTGCTATAGTTGCTGAAACTTGCTCACCT TTCACAGTTTTACCTGCCCTTATGAATGAGTACCGGGTCCCAGAGCTCAATGTCCAAAAT GGTGTTCTGAAGTCACTCTCTTTCCTCTTTGAGTATATTGGTGAGATGGGCAAAGATTAC ATATATGCCGTCACCCCCTTACTTGAAGATGCTTTAATGGATAGAGATCTGGTTCACCGG CAGACTGCTGCATCTGCTGTTAAGCACATGGCTCTAGGTGTTGCTGGCTTGGGTTGTGAG GATGCTCTTGTTCATCTGCTTAACTATGTTTGGCCCAACATATTTGAGACATCTCCCCAC GTTATAAATGCTGTCATGGAGGCAATTGAGGGGATGAGGGTCGCACTAGGTGCGGCTGTG ATTTTAAATTATTGCCTGCAAGGTCTCTTCCATCCAGCAAGGAAAGTACGAGAAGTGTAT TGGAAGATATACAACTCTTTGTACATCGGCGCGCAGGATGCACTTGTTGCTTCTTATCCT GCCCTGGAAGACGATGGGGATAACATCTTTAGTCGTCCAGAGTTGGCAATGTTTGTCTGA

Peptide Sequence

PEP ID	Zm00001d015248_P031
PEP Infomation	pep chromosome:B73_RefGen_v4:5:81114776:81118143:1 gene:Zm00001d015248 transcript:Zm00001d015248_T031 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding description:Splicing factor 3B subunit 1
Sequence	MKPEDYQYFGTLLNEEEEEQLSPEEQKERKIMKLLLKVKNGTPPQRKTALRQLTDKAREF GAGPLFNKILPLLMQPTLEDQERHLLVKVIDRVLYKLDELVRPFVHKILVVIEPLLIDED YYARVEGREIISNLSKAAGLATMIAAMRPDIDNIDEYVRNTTARAFSVVASALGIPALLP FLKAVCQSKKSWQARHTGIKIVQQIAILMGCAVLPHLKSLVEIIEHGLSDENQKVRTITA LSLAALAEAAAPYGIESFDTVLKPLWKGIRSHRGKVLAAFLKAIGFIIPLMDALYASYYT KEVMQVLIREFQSPDEEMKKIVLKVVKQCVSTEGVEADYIRNDILPDFFKHFWVRRMALD RRNYKQLVETTVEMANKVGVADIVGRVVEDLKDESEPYRRMVMETIEKVVANLGASDIDA RLEELLIDGILYAFQEQTSDDANVMLNGFGAVVNALGQRVKPYLPQICGTIKWRLNNKSA KVRQQAADLISRIAIVMKQCQEEQLMGHLGVVLYEYLGEEYPEVLGSILGALKAIVNVIG MTKMTPPIKDLLPRLTPILKNRHEKVQENCIDLVGRIADRGAEFVPAREWMRICFELLEM LKAHKKGIRRATVNTFGYIAKAIGPQDVLATLLNNLKVQERQNRVCTTVAIAIVAETCSP FTVLPALMNEYRVPELNVQNGVLKSLSFLFEYIGEMGKDYIYAVTPLLEDALMDRDLVHR QTAASAVKHMALGVAGLGCEDALVHLLNYVWPNIFETSPHVINAVMEAIEGMRVALGAAV ILNYCLQGLFHPARKVREVYWKIYNSLYIGAQDALVASYPALEDDGDNIFSRPELAMFV

Transcript Sequence

Transcript ID	Zm00001d015248_T031
Transcript Infomation	cdna chromosome:B73_RefGen_v4:5:81114776:81118143:1 gene:Zm00001d015248 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding description:Splicing factor 3B subunit 1
Sequence	CCACTTTATGCTATTCCAGAGGAGAATCGTGGGCAGCATTTTGATGTGCCCAAGGAGCTG CCTGGTGGGTTGCCACTCATGAAGCCCGAGGATTACCAGTACTTTGGAACTTTGCTGAAC GAGGAAGAGGAGGAGCAGCTATCGCCAGAGGAGCAGAAGGAGAGGAAAATCATGAAACTG TTACTCAAAGTGAAGAATGGCACACCCCCACAGCGTAAAACAGCACTTCGGCAACTGACA GACAAAGCCCGTGAATTTGGTGCAGGACCGTTGTTCAACAAAATACTGCCCTTACTCATG CAGCCAACACTGGAGGACCAGGAGAGGCATCTTTTGGTGAAGGTCATTGACAGAGTACTT TATAAGCTCGATGAGCTGGTCCGTCCTTTTGTGCACAAGATTCTTGTGGTTATTGAACCA CTGTTGATTGATGAGGACTATTATGCTCGTGTTGAAGGCAGGGAGATCATCTCAAACCTT AGCAAAGCAGCTGGGCTTGCTACTATGATTGCTGCTATGCGACCCGACATCGATAACATT GATGAGTATGTGAGAAACACCACTGCTAGGGCGTTCAGTGTGGTGGCTTCTGCTTTGGGT ATCCCTGCCCTTTTACCATTCTTGAAGGCTGTCTGTCAGAGTAAGAAGTCTTGGCAGGCT AGGCACACTGGTATCAAAATCGTCCAACAGATTGCTATTCTCATGGGCTGTGCTGTTTTG CCACACCTCAAGTCACTAGTTGAGATCATTGAGCATGGGCTGAGCGATGAAAACCAGAAA GTTCGTACAATTACTGCCCTTTCTCTTGCTGCACTTGCTGAGGCTGCTGCACCATATGGT ATAGAAAGTTTTGATACTGTATTGAAACCTCTGTGGAAGGGTATCAGATCTCACCGTGGG AAGGTCCTTGCTGCCTTCCTAAAGGCCATTGGTTTCATCATCCCTCTTATGGATGCTCTG TATGCTAGCTACTACACAAAGGAGGTGATGCAGGTCCTCATTAGGGAGTTCCAGTCTCCA GATGAAGAAATGAAGAAAATTGTTCTCAAGGTGGTGAAACAGTGTGTCAGTACAGAGGGT GTGGAGGCTGATTATATCCGGAATGACATCCTTCCAGATTTCTTCAAGCACTTCTGGGTG AGGAGAATGGCTCTAGATCGCAGGAACTATAAGCAGCTTGTGGAAACTACAGTTGAGATG GCAAACAAGGTTGGAGTTGCTGATATTGTTGGGAGGGTTGTTGAGGATCTGAAAGATGAA AGTGAGCCCTACAGAAGAATGGTGATGGAAACAATCGAGAAGGTGGTAGCCAACTTGGGT GCATCAGATATTGATGCTCGTCTGGAGGAGCTGCTTATTGATGGTATCTTGTATGCTTTC CAAGAGCAGACTAGTGATGACGCAAATGTTATGCTAAATGGTTTTGGAGCTGTGGTTAAT GCACTTGGACAGAGAGTTAAGCCCTACCTTCCTCAGATTTGTGGTACTATCAAGTGGCGA TTGAACAACAAGAGTGCAAAAGTTAGGCAGCAAGCTGCTGATCTGATCTCCAGGATAGCC ATAGTAATGAAGCAGTGCCAGGAGGAGCAGCTTATGGGTCACTTGGGTGTTGTGCTGTAT GAGTACTTAGGAGAGGAGTATCCTGAGGTGCTTGGTTCAATTCTTGGAGCCTTGAAGGCT ATCGTCAATGTCATTGGTATGACTAAAATGACTCCACCAATCAAGGATCTTCTTCCTCGT CTGACCCCCATTCTTAAGAACAGGCATGAGAAGGTCCAAGAGAACTGCATTGATCTTGTT GGTAGGATTGCTGATCGTGGAGCAGAATTTGTGCCAGCAAGGGAATGGATGAGGATTTGT TTTGAGCTGCTCGAAATGTTGAAGGCTCATAAGAAGGGTATTAGGAGAGCAACTGTGAAC ACATTTGGTTATATCGCAAAGGCTATAGGGCCACAGGATGTGTTGGCCACCCTGTTGAAT AACTTGAAGGTGCAAGAACGACAGAACCGGGTCTGTACAACTGTAGCTATTGCTATAGTT GCTGAAACTTGCTCACCTTTCACAGTTTTACCTGCCCTTATGAATGAGTACCGGGTCCCA GAGCTCAATGTCCAAAATGGTGTTCTGAAGTCACTCTCTTTCCTCTTTGAGTATATTGGT GAGATGGGCAAAGATTACATATATGCCGTCACCCCCTTACTTGAAGATGCTTTAATGGAT AGAGATCTGGTTCACCGGCAGACTGCTGCATCTGCTGTTAAGCACATGGCTCTAGGTGTT GCTGGCTTGGGTTGTGAGGATGCTCTTGTTCATCTGCTTAACTATGTTTGGCCCAACATA TTTGAGACATCTCCCCACGTTATAAATGCTGTCATGGAGGCAATTGAGGGGATGAGGGTC GCACTAGGTGCGGCTGTGATTTTAAATTATTGCCTGCAAGGTCTCTTCCATCCAGCAAGG AAAGTACGAGAAGTGTATTGGAAGATATACAACTCTTTGTACATCGGCGCGCAGGATGCA CTTGTTGCTTCTTATCCTGCCCTGGAAGACGATGGGGATAACATCTTTAGTCGTCCAGAG TTGGCAATGTTTGTCTGATTAACGGTACCTCATGTTGCAGCTGCTGAAGCGTTACACTGG ATTTAGGACCAATCCTAAGGCTGCAGCATGCCAATTAATCCATCAAGATCCTATATTGTG AAGGACAAATGACAATCCTAGCGCGCTGTCATCTTTTTATGAATATTAGGCGTTGGGCAT TTACCGTGTTTTAAAACTTTGTATTACACATGGATGTTGTATTATGTGGTGTGGACAATG GAACGTTGCAAGCTGACC