Gene sequences

How To ▶︎

JA

EN

TOP > About the Species(Zea mays ) > genome data >Gene sequences

Search

By Traits

Let’s Analyze!!

SNP Detection
(lang=JA only)

Other Tools

Data List

All

Trait-Related Loci

Zea mays

CDS Sequence

CDS ID	Zm00001d015082_T027
CDS Infomation	cds chromosome:B73_RefGen_v4:5:74806736:74820070:1 gene:Zm00001d015082 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding description:transducin family protein / WD-40 repeat family protein
Sequence	ATGCAACTAGAGGGAATCGGAAAGGGCCCACCAGCTATCGGTTACATGCAAATTGAGATG GACAATCCAGTAACCCGTGTCATGTCCTCACCGTCATTTAGGTCAGACCATGGCTCTCCC CAGGTGCTGGCTGTTCATAGGAGCTATATAGCAATGGGCACATCTAAAGGTGCTGTCATC GTCATTCCAAGCAAATACTCCATTCATCAAGCTGATGATACAGATGCAAAGATGCTGTTC TTTTGGAACCAAGGCGAGAAGACTCAATCACCAGTGACTGCCATGTGCTTTAACCAGCAA GGGGACCTTCTGCTAGTAGGATATGGTGATGGTCATATGACAATTTGGGATGTACAGAAA TCTGCAGCAGCAAAAGTTATATATGGCGAGCATACAGCACCAGTAGTGCATGCTTGTTTT ATCCGCCAATCTAAAGCCATCACTGGGGATTCAAAAGGGGTAGTTCTATTGCACACATTT TCCATTATCCCCGTAATTAATCGTTTAACTGTCAAGGGAACTCAGCGTCTTTTTGATGGG AATACTGGAATTGTGCTCTCAGCCTGTCCTCTTGTAATGGATGAATCTTTTGGTTTTAGT AATTCATCTGCCCAGGGAAATCAGACAACTTCCTCCAGTGGTGGTCTTGGCAGCATGATG GGTGGTGTTGTTGGAGGCGTGGTTGGAGTAGATTCTGGATGGAAGTTTTTCAACGAAGGC TCTTCTCCAATGGAGGATGGTGTTGTAGTCATGTTTATTATGCATCAACATGCTCTTGTG GTTAGACTCCGTACCAATATTGACCATGTTGACCATATTGAGACCTTCTCTAGACCAGAT GGAGCACGTGAGGGCTCCATCGCGTATGCTGCGTGGAAATATACATCATATTTGAATGAA TCGTCATCAGTAGATGAAGAACGAGTGTCATGGCTAGCACTTGCATGGGACCGTCAAGTG CAAGTTGCAAAGTTTGTTAAATCAAAGATATTTAAACACAAAGAGTGGAAGCTTGATAGT TCAGCTGTTGGTGTTGCCTGGTTAGACGACCAGATGTTAGTTGTCCTTAATTTGAGAGGG CAACTCTGTTTATTCTCTAAAGATGGCAGTGAGCTTCGCAGAACTACCTTTGTTCCTGAT GGCCTTCTTTTTGATGACACCATATTGCACCATGCACATTTTTTTAACAGGTTTGGTAAC CCAGAGAGGCATTTTAACAGTTCAGTAGCGGTAAGAGGTGCTACAGTGTATATTCTTGGG CCATCTTTTCTCACGGTTTCCCGACTTCTTCCATGGAAAGAGCGAATTGAAGCACTAAAG AGGGCTGGCGATTGGATGGGTGCACTAGACATGGCAATGAGGCTTTATGATGGTCAGACA CAGGGTGTTGTTGATCTCCCAAGAACGGTTGATTCTATTAGAGATGCCATAATGCCTTAC TTAGTAGAGTTGCTGCTATCATATATAAGTTATGTTTTTGAATATATTTCAATTGCGCTG CCAAATCATACTGGAAAAGGGGGAGAATCAGGTGTTCTAATAGAGGCAGATCGATCCCTG CTTACACAAAGAGATGAGCAGTACGCTCGTGTAGGAGGGGTTGCAGTTGAGTATTGTGTC CACATTGGACGGAATGATATCCTTTTCGATACAGTCTTCTCTAAGTTTGCTGCTGCAGAA AGTGGAGGTATGTTTCTGGAGGTGCTAGAGCCTTATATATTGAAGGATATGCTTGGTTCT CTGCCCCCTGAGATTATGCAAGCACTAGTGGAGCATTATAGTGGCAAAGGGTGGTTGCAA CGAGTTGAACAATGCATCCTTCACATGGATATTTCTTCATTGGACTTTAATCAGGTAGTC AGACTTTGTCGTGAACATGGGCTATATGGTGCACTAATTTATTTATTTAACCAAGGCCTG AATGATTTCCGTACACCACTAGAGGAACTTCTATCAGTCGTTCAGAACACCAACAGTAAA GATGATGCTTCTAGTGGATACAGGATGCTTGTTTATCTGAAATATTGCTTTCAGGGTTTG GCATTTCCTCCAGGGCATGGAATAATTCCCCAATCCCGGCTTCATTCAGTGAGGGAAGAA CTCCTTCAATTTCTGCTTGAAGAATCTAAGCCACTCACTTCTGAAGTATTTAAGGGTTTC AATGCTTCTTGTGGAAAGTGCCTAAACATATGCTATCTGCTATGGTTGGATACTGAAGCT ACTTTGGAAGTCATCAAATGTGCTTTTGTACAGGATAACTTTGAGTCTAGAGATGAACTT CCGAGTACTGTCAATACATCTGCTTCAGATAATGAAGATGGTATTGATGCTGGAAGACCA GAGGGCCAAAATGCTATGGTACAAAATGTGGTTGATGCCATCATTGACATAGTTGGTTTG GAAAATGATGTGATTCGGTCTGTTATGGGTAGAACTGAATCAGAATTATGGCCTTCGGAG AAGGATTTTGGCTATTTAATGGAGTTTGTGTCCTTTTTTGTTTCTCACAAAAGGGCTAAT GCATCTAAGAGGGTTGTTATGCACATTCTTACTTATCTCATTTCGTCATATGATGACACA AGAACAAGGATTCAGAAAGAAAAAGAAGTTCTTCAACTCTTCAATGCGGTTCCCCGAAAC GATTGGAATTCGGATTTTGTCTTGAACCTTTGTTCAGATGCTCATTTTTATCAGGCCTGT GGTTTGATATTTACAGCCAGGAATCAGAATTTGGCTGCTTTAGATAGTTACATGAAGGAT AAAGAGGAACCTTTCCATGCTTTTATCTTCATTGATAAGAAGTTACTAGAATTGGTTGAC GATGAAGCTTTGTCGTTTCATACCACAGTAATATCTCGCTTTCCTGAGCTAGTCAAGCTA AGCAGGGAATGTGCATTTGTCTTGGCGATTGATCATTTCTGTGATAAGATACAGCAAATA TTAGCAGAGCTTCGTTCTGACCGACACAGCCTCTTTCTTTTCTTGAAAACTGCTATTGAA GTACACTTGTCTGGAAAACTTGACTTCAGTAAGCTTGAATTAAGAAACAAACAAACTGTT GAACTCCAGTACTCTTCTACTGAAGTTGAAGCTTATCAGCAGAGGCTATCAAATCTCTCC AAGTTATGCCACAATCCTGTTTACATCGACGACGAGTTAGTTGAGCTTTATCTGGAGCTT TTATGTCAGTATGAGCGAAGGTCAGTTCTGAAGTTTCTGGAGACTTTTGACAGTTACAGA TTGGAACGGTGCTTGCATCTTTGCCTAGATTATGGAGTTACAGATGCTGCTGCTTTCTTG CAAGAGAGGGTTGGTGATGTTGGGAGTGCCCTTGACCTTATTCTGGCTGGACTTGATGAG AAAATTAGCTTATTTATCTCTTCTGTGGAAAGTACTTTCTCTGGCGTCGCATCAAAAAGT ATCGCTGAAATTAAGCAACCAGACATCGTTCTAGAAATGAGTGAGGCTCATCCAGTGCTT GATGCATTGCATGCCTCCATTGGATTGTGCCAAAGGAATTCACAGCGCTTGGACCCAGAG GAATCTCAGTCCCTTTGGTTCCAACTCCTTGACTCGAAATTATTCAATAGCGCATCTAGA AAGACAATGCGAGCCTATTGCTGTAAGCCTGTGATAATTTGGGGGAAGTTTTTTCCAAAC TGTTCTCAATTTTTGTCATGCTCATAG

Peptide Sequence

PEP ID	Zm00001d015082_P027
PEP Infomation	pep chromosome:B73_RefGen_v4:5:74806736:74820070:1 gene:Zm00001d015082 transcript:Zm00001d015082_T027 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding description:transducin family protein / WD-40 repeat family protein
Sequence	MQLEGIGKGPPAIGYMQIEMDNPVTRVMSSPSFRSDHGSPQVLAVHRSYIAMGTSKGAVI VIPSKYSIHQADDTDAKMLFFWNQGEKTQSPVTAMCFNQQGDLLLVGYGDGHMTIWDVQK SAAAKVIYGEHTAPVVHACFIRQSKAITGDSKGVVLLHTFSIIPVINRLTVKGTQRLFDG NTGIVLSACPLVMDESFGFSNSSAQGNQTTSSSGGLGSMMGGVVGGVVGVDSGWKFFNEG SSPMEDGVVVMFIMHQHALVVRLRTNIDHVDHIETFSRPDGAREGSIAYAAWKYTSYLNE SSSVDEERVSWLALAWDRQVQVAKFVKSKIFKHKEWKLDSSAVGVAWLDDQMLVVLNLRG QLCLFSKDGSELRRTTFVPDGLLFDDTILHHAHFFNRFGNPERHFNSSVAVRGATVYILG PSFLTVSRLLPWKERIEALKRAGDWMGALDMAMRLYDGQTQGVVDLPRTVDSIRDAIMPY LVELLLSYISYVFEYISIALPNHTGKGGESGVLIEADRSLLTQRDEQYARVGGVAVEYCV HIGRNDILFDTVFSKFAAAESGGMFLEVLEPYILKDMLGSLPPEIMQALVEHYSGKGWLQ RVEQCILHMDISSLDFNQVVRLCREHGLYGALIYLFNQGLNDFRTPLEELLSVVQNTNSK DDASSGYRMLVYLKYCFQGLAFPPGHGIIPQSRLHSVREELLQFLLEESKPLTSEVFKGF NASCGKCLNICYLLWLDTEATLEVIKCAFVQDNFESRDELPSTVNTSASDNEDGIDAGRP EGQNAMVQNVVDAIIDIVGLENDVIRSVMGRTESELWPSEKDFGYLMEFVSFFVSHKRAN ASKRVVMHILTYLISSYDDTRTRIQKEKEVLQLFNAVPRNDWNSDFVLNLCSDAHFYQAC GLIFTARNQNLAALDSYMKDKEEPFHAFIFIDKKLLELVDDEALSFHTTVISRFPELVKL SRECAFVLAIDHFCDKIQQILAELRSDRHSLFLFLKTAIEVHLSGKLDFSKLELRNKQTV ELQYSSTEVEAYQQRLSNLSKLCHNPVYIDDELVELYLELLCQYERRSVLKFLETFDSYR LERCLHLCLDYGVTDAAAFLQERVGDVGSALDLILAGLDEKISLFISSVESTFSGVASKS IAEIKQPDIVLEMSEAHPVLDALHASIGLCQRNSQRLDPEESQSLWFQLLDSKLFNSASR KTMRAYCCKPVIIWGKFFPNCSQFLSCS

Transcript Sequence

Transcript ID	Zm00001d015082_T027
Transcript Infomation	cdna chromosome:B73_RefGen_v4:5:74806736:74820070:1 gene:Zm00001d015082 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding description:transducin family protein / WD-40 repeat family protein
Sequence	CATGCAACTAGAGGGAATCGGAAAGGGCCCACCAGCTATCGGTTACATGCAAATTGAGAT GGACAATCCAGTAACCCGTGTCATGTCCTCACCGTCATTTAGGTCAGACCATGGCTCTCC CCAGGTGCTGGCTGTTCATAGGAGCTATATAGCAATGGGCACATCTAAAGGTGCTGTCAT CGTCATTCCAAGCAAATACTCCATTCATCAAGCTGATGATACAGATGCAAAGATGCTGTT CTTTTGGAACCAAGGCGAGAAGACTCAATCACCAGTGACTGCCATGTGCTTTAACCAGCA AGGGGACCTTCTGCTAGTAGGATATGGTGATGGTCATATGACAATTTGGGATGTACAGAA ATCTGCAGCAGCAAAAGTTATATATGGCGAGCATACAGCACCAGTAGTGCATGCTTGTTT TATCCGCCAATCTAAAGCCATCACTGGGGATTCAAAAGGGGTAGTTCTATTGCACACATT TTCCATTATCCCCGTAATTAATCGTTTAACTGTCAAGGGAACTCAGCGTCTTTTTGATGG GAATACTGGAATTGTGCTCTCAGCCTGTCCTCTTGTAATGGATGAATCTTTTGGTTTTAG TAATTCATCTGCCCAGGGAAATCAGACAACTTCCTCCAGTGGTGGTCTTGGCAGCATGAT GGGTGGTGTTGTTGGAGGCGTGGTTGGAGTAGATTCTGGATGGAAGTTTTTCAACGAAGG CTCTTCTCCAATGGAGGATGGTGTTGTAGTCATGTTTATTATGCATCAACATGCTCTTGT GGTTAGACTCCGTACCAATATTGACCATGTTGACCATATTGAGACCTTCTCTAGACCAGA TGGAGCACGTGAGGGCTCCATCGCGTATGCTGCGTGGAAATATACATCATATTTGAATGA ATCGTCATCAGTAGATGAAGAACGAGTGTCATGGCTAGCACTTGCATGGGACCGTCAAGT GCAAGTTGCAAAGTTTGTTAAATCAAAGATATTTAAACACAAAGAGTGGAAGCTTGATAG TTCAGCTGTTGGTGTTGCCTGGTTAGACGACCAGATGTTAGTTGTCCTTAATTTGAGAGG GCAACTCTGTTTATTCTCTAAAGATGGCAGTGAGCTTCGCAGAACTACCTTTGTTCCTGA TGGCCTTCTTTTTGATGACACCATATTGCACCATGCACATTTTTTTAACAGGTTTGGTAA CCCAGAGAGGCATTTTAACAGTTCAGTAGCGGTAAGAGGTGCTACAGTGTATATTCTTGG GCCATCTTTTCTCACGGTTTCCCGACTTCTTCCATGGAAAGAGCGAATTGAAGCACTAAA GAGGGCTGGCGATTGGATGGGTGCACTAGACATGGCAATGAGGCTTTATGATGGTCAGAC ACAGGGTGTTGTTGATCTCCCAAGAACGGTTGATTCTATTAGAGATGCCATAATGCCTTA CTTAGTAGAGTTGCTGCTATCATATATAAGTTATGTTTTTGAATATATTTCAATTGCGCT GCCAAATCATACTGGAAAAGGGGGAGAATCAGGTGTTCTAATAGAGGCAGATCGATCCCT GCTTACACAAAGAGATGAGCAGTACGCTCGTGTAGGAGGGGTTGCAGTTGAGTATTGTGT CCACATTGGACGGAATGATATCCTTTTCGATACAGTCTTCTCTAAGTTTGCTGCTGCAGA AAGTGGAGGTATGTTTCTGGAGGTGCTAGAGCCTTATATATTGAAGGATATGCTTGGTTC TCTGCCCCCTGAGATTATGCAAGCACTAGTGGAGCATTATAGTGGCAAAGGGTGGTTGCA ACGAGTTGAACAATGCATCCTTCACATGGATATTTCTTCATTGGACTTTAATCAGGTAGT CAGACTTTGTCGTGAACATGGGCTATATGGTGCACTAATTTATTTATTTAACCAAGGCCT GAATGATTTCCGTACACCACTAGAGGAACTTCTATCAGTCGTTCAGAACACCAACAGTAA AGATGATGCTTCTAGTGGATACAGGATGCTTGTTTATCTGAAATATTGCTTTCAGGGTTT GGCATTTCCTCCAGGGCATGGAATAATTCCCCAATCCCGGCTTCATTCAGTGAGGGAAGA ACTCCTTCAATTTCTGCTTGAAGAATCTAAGCCACTCACTTCTGAAGTATTTAAGGGTTT CAATGCTTCTTGTGGAAAGTGCCTAAACATATGCTATCTGCTATGGTTGGATACTGAAGC TACTTTGGAAGTCATCAAATGTGCTTTTGTACAGGATAACTTTGAGTCTAGAGATGAACT TCCGAGTACTGTCAATACATCTGCTTCAGATAATGAAGATGGTATTGATGCTGGAAGACC AGAGGGCCAAAATGCTATGGTACAAAATGTGGTTGATGCCATCATTGACATAGTTGGTTT GGAAAATGATGTGATTCGGTCTGTTATGGGTAGAACTGAATCAGAATTATGGCCTTCGGA GAAGGATTTTGGCTATTTAATGGAGTTTGTGTCCTTTTTTGTTTCTCACAAAAGGGCTAA TGCATCTAAGAGGGTTGTTATGCACATTCTTACTTATCTCATTTCGTCATATGATGACAC AAGAACAAGGATTCAGAAAGAAAAAGAAGTTCTTCAACTCTTCAATGCGGTTCCCCGAAA CGATTGGAATTCGGATTTTGTCTTGAACCTTTGTTCAGATGCTCATTTTTATCAGGCCTG TGGTTTGATATTTACAGCCAGGAATCAGAATTTGGCTGCTTTAGATAGTTACATGAAGGA TAAAGAGGAACCTTTCCATGCTTTTATCTTCATTGATAAGAAGTTACTAGAATTGGTTGA CGATGAAGCTTTGTCGTTTCATACCACAGTAATATCTCGCTTTCCTGAGCTAGTCAAGCT AAGCAGGGAATGTGCATTTGTCTTGGCGATTGATCATTTCTGTGATAAGATACAGCAAAT ATTAGCAGAGCTTCGTTCTGACCGACACAGCCTCTTTCTTTTCTTGAAAACTGCTATTGA AGTACACTTGTCTGGAAAACTTGACTTCAGTAAGCTTGAATTAAGAAACAAACAAACTGT TGAACTCCAGTACTCTTCTACTGAAGTTGAAGCTTATCAGCAGAGGCTATCAAATCTCTC CAAGTTATGCCACAATCCTGTTTACATCGACGACGAGTTAGTTGAGCTTTATCTGGAGCT TTTATGTCAGTATGAGCGAAGGTCAGTTCTGAAGTTTCTGGAGACTTTTGACAGTTACAG ATTGGAACGGTGCTTGCATCTTTGCCTAGATTATGGAGTTACAGATGCTGCTGCTTTCTT GCAAGAGAGGGTTGGTGATGTTGGGAGTGCCCTTGACCTTATTCTGGCTGGACTTGATGA GAAAATTAGCTTATTTATCTCTTCTGTGGAAAGTACTTTCTCTGGCGTCGCATCAAAAAG TATCGCTGAAATTAAGCAACCAGACATCGTTCTAGAAATGAGTGAGGCTCATCCAGTGCT TGATGCATTGCATGCCTCCATTGGATTGTGCCAAAGGAATTCACAGCGCTTGGACCCAGA GGAATCTCAGTCCCTTTGGTTCCAACTCCTTGACTCGAAATTATTCAATAGCGCATCTAG AAAGACAATGCGAGCCTATTGCTGTAAGCCTGTGATAATTTGGGGGAAGTTTTTTCCAAA CTGTTCTCAATTTTTGTCATGCTCATAGTTTGCTG