Gene sequences

How To ▶︎

JA

EN

TOP > About the Species(Zea mays ) > genome data >Gene sequences

Search

By Traits

Let’s Analyze!!

SNP Detection
(lang=JA only)

Other Tools

Data List

All

Trait-Related Loci

Zea mays

CDS Sequence

CDS ID	Zm00001d012770_T006
CDS Infomation	cds chromosome:B73_RefGen_v4:8:180488754:180493769:-1 gene:Zm00001d012770 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding description:Putative translation elongation factor family protein
Sequence	ATGTATTATTGTTTTTTTGCAGGCAAGTCTACACTTACAGATTCCCTTGTGGCAGCTGCT GGGATTATTGCCCAGGAAGTTGCTGGTGATGTTCGCATGACTGATACTCGTGCAGATGAA GCCGAGCGTGGCATCACAATCAAATCTACTGGTATCTCTCTTTATTATGAGATGACTGAT GAGTCACTGAAGAACTACAAGGGTGAGAGGGATGGTAACCAATACTTGATCAACCTTATT GACTCACCCGGGCACGTCGATTTTTCTTCGGAAGTCACAGCTGCTCTTCGCATCACCGAT GGTGCTCTGGTTGTGGTTGATTGTATTGAAGGTGTCTGTGTGCAAACTGAAACTGTGCTT CGCCAAGCCCTTGGTGAGAGGATTAGGCCAGTTCTTACCGTGAACAAGATGGACAGGTGC TTCCTTGAGCTTCAGGTTGAGGGTGAGGAAGCTTATCAGACTTTCTCCCGTGTTATTGAG AATGCCAATGTCATCATGGCAACATATGAAGATAAGCTCCTTGGTGATGTCCAAGTATAC CCAGAGAAGGGGACAGTTGCCTTTTCTGCTGGTCTGCATGGATGGGCCTTTACACTCACT AACTTTGCGAAGATGTATGCATCTAAGTTTGGAGTTGATGAATCTAAGATGATGGAGAGG CTATGGGGTGAGAATTTCTTTGACCCTGCCACAAAGAAATGGACCACCAAGAACACAGGT TCTCCTACCTGCAAGAGAGGATTTGTTCAGTTCTGCTACGAGCCAATCAAGCAAATCATC AAAACCTGCATGAATGACCAAAAGGAGAAATTGTGGCCCATGTTGCAAAAGCTTAATGTT ACCATGAAGGCTGATGAGAAGGAGTTGATTGGCAAAGCTTTGATGAAGCGTGTTATGCAA ACGTGGCTTCCAGCCAGCACTGCACTTCTTGAGATGATGATATTCCACCTTCCTTCCCCG GCAAAGGCTCAAAAGTATCGTGTGGAGAACTTGTATGAGGGACCCCTTGATGATGTTTAT GCAACTGCTATCAGAAACTGTGATCCGGAGGGTCCTCTTATGCTGTATGTTTCAAAGATG ATTCCAGCATCTGACAAGGGCAGGTTCTTTGCCTTTGGTCGTGTCTTCTCAGGGAAGGTT GCTACTGGTATGAAAGTTCGGATCATGGGTCCCAACTATGTCCCTGGCCAGAAGAAGGAC CTGTATGTCAAGAGTGTTCAGCGTACTGTTATCTGGATGGGAAAGAAACAAGAGTCAGTT GAGGATGTTCCTTGTGGTAACACTGTTGCTATGGTTGGTCTGGATCAGTTCATCACGAAG AACGCTACACTCACTAATGAGAAGGAGGTTGATGCATGCCCAATCAGAGCAATGAAGTTC TCTGTCTCCCCTGTTGTGCGTGTTGCTGTTCAGTGCAAGGTTGCTTCCGACCTTCCCAAG CTAGTAGAAGGTTTGAAGCGTCTGGCGAAGTCCGATCCTATGGTTCTGTGTACAATGGAA GAATCTGGTGAGCATATCATTGCTGGAGCTGGTGAGCTTCATCTTGAGATTTGCCTGAAG GATCTGCAAGAGGACTTCATGGGAGGTGCTGAAATTATTGTTTCTCCTCCTGTTGTGTCC TTCCGTGAAACCGTTCTTGAGAAGTCCTGCCGCACTGTCATGAGCAAGTCACCTAACAAG CACAACCGTCTGTACATGGAAGCGCGCCCCCTGGAGGAGGGTCTTGCTGAGGCAATTGAT GATGGCCGCATTGGCCCACGTGATGATCCTAAGGTGCGCTCCCAGATCCTCTCTCAAGAG TTTGGGTGGGACAAGGATCTTGCCAAGAAGATTTGGTGCTTCGGACCTGAGACCACCGGC CCAAACATGGTTGTTGATATGTGCAAGGGAGTGCAGTATCTCAATGAAATCAAGGATTCT GTTGTGGCTGGTTTCCAGTGGGCATCGAAGGAGGGTGCACTGGCTGAAGAGAACATGCGC GGGATTTGCTTCGAGGTCTGTGATGTCGTTCTTCATGCCGATGCTATCCACAGGGGTGGT GGCCAGGTCATTCCAACTGCCAGGAGGGTCATTTATGCTTCTCAGCTCACAGCCAAGCCG AGGCTGCTGGAACCAGTTTACCTGGTGGAGATCCAGGCCCCAGAAAATGCACTTGGTGGC ATATACGGTGTTCTGAACCAGAAGAGAGGACATGTATTCGAGGAGATGCAAAGGCCTGGT ACCCCGCTCTACAACATCAAGGCTTTCCTCCCTGTCATCGAGTCCTTTGGGTTCTCAAGC CAGCTGAGGGCTGCAACCTCTGGTCAGGCGTTCCCCCAGTGTGTGTTTGACCACTGGGAC ATGATGGGCTCGGATCCTTTGGAGGCTGGCTCCCAGGCTGCCCAGCTGGTGCTGGATATC CGCAAGAGGAAGGGTCTGAAAGAACAGATGACTCCTCTTTCTGAGTTTGAGGACAAGCTC TAA

Peptide Sequence

PEP ID	Zm00001d012770_P006
PEP Infomation	pep chromosome:B73_RefGen_v4:8:180488754:180493769:-1 gene:Zm00001d012770 transcript:Zm00001d012770_T006 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding description:Putative translation elongation factor family protein
Sequence	MYYCFFAGKSTLTDSLVAAAGIIAQEVAGDVRMTDTRADEAERGITIKSTGISLYYEMTD ESLKNYKGERDGNQYLINLIDSPGHVDFSSEVTAALRITDGALVVVDCIEGVCVQTETVL RQALGERIRPVLTVNKMDRCFLELQVEGEEAYQTFSRVIENANVIMATYEDKLLGDVQVY PEKGTVAFSAGLHGWAFTLTNFAKMYASKFGVDESKMMERLWGENFFDPATKKWTTKNTG SPTCKRGFVQFCYEPIKQIIKTCMNDQKEKLWPMLQKLNVTMKADEKELIGKALMKRVMQ TWLPASTALLEMMIFHLPSPAKAQKYRVENLYEGPLDDVYATAIRNCDPEGPLMLYVSKM IPASDKGRFFAFGRVFSGKVATGMKVRIMGPNYVPGQKKDLYVKSVQRTVIWMGKKQESV EDVPCGNTVAMVGLDQFITKNATLTNEKEVDACPIRAMKFSVSPVVRVAVQCKVASDLPK LVEGLKRLAKSDPMVLCTMEESGEHIIAGAGELHLEICLKDLQEDFMGGAEIIVSPPVVS FRETVLEKSCRTVMSKSPNKHNRLYMEARPLEEGLAEAIDDGRIGPRDDPKVRSQILSQE FGWDKDLAKKIWCFGPETTGPNMVVDMCKGVQYLNEIKDSVVAGFQWASKEGALAEENMR GICFEVCDVVLHADAIHRGGGQVIPTARRVIYASQLTAKPRLLEPVYLVEIQAPENALGG IYGVLNQKRGHVFEEMQRPGTPLYNIKAFLPVIESFGFSSQLRAATSGQAFPQCVFDHWD MMGSDPLEAGSQAAQLVLDIRKRKGLKEQMTPLSEFEDKL

Transcript Sequence

Transcript ID	Zm00001d012770_T006
Transcript Infomation	cdna chromosome:B73_RefGen_v4:8:180488754:180493769:-1 gene:Zm00001d012770 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding description:Putative translation elongation factor family protein
Sequence	ATAGATATATCTTTACAGGCTGCCACTAGGGTTTTAGTGCTTCTCTCCCGGCGGCGCCTC CACATCTCGTCTCTCAGATCGGGAGGCGAAACCAAGGTTACTGGCTCTCTCTCCCCTCTT CTCTGGTTGCTAGAGCTAGAGCTAGCTGATCGGTATTTCTAGTTGGCTTCAAGGCGTTTT GGTTCCATCTCACGGTGTCTTGTGTTGATTGGATTGAATCAGAGGTTTTCAATTGCTTGT GGTTCGAATCTGATGTTTGTGTGGGTACTCGAGGTAATTTAGGTGGATTTGGGTTTACTG GCTTCCGACTGTTCTCTCTGTGATTGGTCTGTCCGATCTGTAGAGATAAGATAAGTTGCA GTCCTGGTTCAATCCAGATGTCTTAGATTTCTCGATTCTTCAATTTTTTTTGCGTGTACC AGTTAGTTTGCACCTTATGTTTAAGATGAATCAGGTCTGCTGTGATCCTTGGGTGACACC AATTTGTTAACTCAGATCTGCTGTTTTGCCATGCCTAATTGTAGCTGGTATAGTCTGATT TAGTTCGAACGATTTGTTTTTCTGTTGGTAGGTCTCAGATCCATGTTATGTTTATGATCC GTTTTAGGTGGTAATTGTTATTTTTTTACGGTCCATTTTTTATGCTCAGGACATTAGCAT TCATTGATATTTGCTAGTCCAAGTCTACATGAATTTGTTGAGTAATCTATGCTTTCCTTT TTGGAATCTTTGATTTTCATGAAGGCTAGGATCTTCTGCCAGCTGAAATGTTTGTCTAAA ATATTTTCTGGTGTTTCCATGTAATTTGATATGCCATTAATGTGATAATCTGTCTGTACA AGTCTATAAGATTGTTTTTGGTTCACAATTGTAATACATATGGTACACCCATCAGTTGTG CCTTAACCAGTTAACATCTACTGTTTCTTGTTCCACTTATCAGTATTAATTCATTCATTA TTTTAGAGATTGATCATCGCTTTGATGCTTTCTTAAACAAGTTGTGTAGTTTGATGAGGT TCTACCCTCTGTTCAAAACTAAGATACCTCTTTGCTTCAGTGTGCTTACAATATCTTGTC GAGTGAAATTTAGAATAATTAACCTTGATAAAGTTTCCAATGACTTCCTGAAAGGGTTAA TATCTTGTTTCAAACATTAGACAGTTAAATAAATATTTGCTTCTCTTTTGATCCTGACAA ATATAGTCCTTGTTGTTCTTTAGTGCAGATGTTAGACTCAAAGTTTGCTGTATTCATGTT CTTTAATTCTTAGCCTTGAATAGGAGTGCATTGAAAACAGCTATCCACATGACTGAACCT TGACTTGTGGCTTCTGTTGGGTTTCAACTCTAACCTACCTCAACTTGCTTGGGACTAAAA GGCATTGCTGTTTTTTTTTTAATTCTGACAAGCATTTTGTAACTTCAACTGCAGGCATAC ATATACATATTTGTAGTGGTACCATCATAACAAGTAAAGATGGTGAAGTTCACGGCTGAA GAGCTCCGTGCCATCATGGACAAAAAGAACAACATTCGTAATATGTCTGTTATTGCTCAT GTGGACCATGGTATGTTCAAAACACTACTTTGTTAGATGTTATATAGTCCTTAATATTTT TGAGCCTCTTTGTTTTTAAAATTTATTTCGTTTTCAATGTTTAAGAGCTAATGCTTTTAC TGATGCTGTATTATCTGGTTTGTGCCAAGTTACTTATGGTCACTTGTTCATTCATGGATA AAAAGGCTTACTGTTTTTTCATCTTGTGATGAATGTATTGCTTTTCTAGGTATTATCATC GGTAATATTATCTGTTAGTAGCGAGGGATTTGCAATTTTGCCACTTAGAGCTTTGTTCTC TTTGGTATTATGCCACTGCGTCTATGGTTTCTGGGTTCATCTATGTCTACGGTTTGTGGA CCCGATGGGAAATTAACTAAGCCCAACATTCTAAGTGGCAAATTTGCAAATCCCTTTGTA TTTTTGGGACTTCAAACAATGTGCTTCAGACTTTTGCCATTCGTAACATTGAAACCTAGT GTGACATGTAAGGTCTTATTTTTGTGAAGTCTATTATGTATTGGCAAAAGTGTGGAACAC ATTGTTTGGAGTCCCTATATGTTTAGATTGTAATGTATATTGATTTATTTGTATACTTTT GATTTTGATTGGTCATCTGTTTCTAATGTGCTCCTCTATGATGCATGTCCACTTGGATGT TGAAGTTTTGCATCATTCATTATGTATTATTGTTTTTTTGCAGGCAAGTCTACACTTACA GATTCCCTTGTGGCAGCTGCTGGGATTATTGCCCAGGAAGTTGCTGGTGATGTTCGCATG ACTGATACTCGTGCAGATGAAGCCGAGCGTGGCATCACAATCAAATCTACTGGTATCTCT CTTTATTATGAGATGACTGATGAGTCACTGAAGAACTACAAGGGTGAGAGGGATGGTAAC CAATACTTGATCAACCTTATTGACTCACCCGGGCACGTCGATTTTTCTTCGGAAGTCACA GCTGCTCTTCGCATCACCGATGGTGCTCTGGTTGTGGTTGATTGTATTGAAGGTGTCTGT GTGCAAACTGAAACTGTGCTTCGCCAAGCCCTTGGTGAGAGGATTAGGCCAGTTCTTACC GTGAACAAGATGGACAGGTGCTTCCTTGAGCTTCAGGTTGAGGGTGAGGAAGCTTATCAG ACTTTCTCCCGTGTTATTGAGAATGCCAATGTCATCATGGCAACATATGAAGATAAGCTC CTTGGTGATGTCCAAGTATACCCAGAGAAGGGGACAGTTGCCTTTTCTGCTGGTCTGCAT GGATGGGCCTTTACACTCACTAACTTTGCGAAGATGTATGCATCTAAGTTTGGAGTTGAT GAATCTAAGATGATGGAGAGGCTATGGGGTGAGAATTTCTTTGACCCTGCCACAAAGAAA TGGACCACCAAGAACACAGGTTCTCCTACCTGCAAGAGAGGATTTGTTCAGTTCTGCTAC GAGCCAATCAAGCAAATCATCAAAACCTGCATGAATGACCAAAAGGAGAAATTGTGGCCC ATGTTGCAAAAGCTTAATGTTACCATGAAGGCTGATGAGAAGGAGTTGATTGGCAAAGCT TTGATGAAGCGTGTTATGCAAACGTGGCTTCCAGCCAGCACTGCACTTCTTGAGATGATG ATATTCCACCTTCCTTCCCCGGCAAAGGCTCAAAAGTATCGTGTGGAGAACTTGTATGAG GGACCCCTTGATGATGTTTATGCAACTGCTATCAGAAACTGTGATCCGGAGGGTCCTCTT ATGCTGTATGTTTCAAAGATGATTCCAGCATCTGACAAGGGCAGGTTCTTTGCCTTTGGT CGTGTCTTCTCAGGGAAGGTTGCTACTGGTATGAAAGTTCGGATCATGGGTCCCAACTAT GTCCCTGGCCAGAAGAAGGACCTGTATGTCAAGAGTGTTCAGCGTACTGTTATCTGGATG GGAAAGAAACAAGAGTCAGTTGAGGATGTTCCTTGTGGTAACACTGTTGCTATGGTTGGT CTGGATCAGTTCATCACGAAGAACGCTACACTCACTAATGAGAAGGAGGTTGATGCATGC CCAATCAGAGCAATGAAGTTCTCTGTCTCCCCTGTTGTGCGTGTTGCTGTTCAGTGCAAG GTTGCTTCCGACCTTCCCAAGCTAGTAGAAGGTTTGAAGCGTCTGGCGAAGTCCGATCCT ATGGTTCTGTGTACAATGGAAGAATCTGGTGAGCATATCATTGCTGGAGCTGGTGAGCTT CATCTTGAGATTTGCCTGAAGGATCTGCAAGAGGACTTCATGGGAGGTGCTGAAATTATT GTTTCTCCTCCTGTTGTGTCCTTCCGTGAAACCGTTCTTGAGAAGTCCTGCCGCACTGTC ATGAGCAAGTCACCTAACAAGCACAACCGTCTGTACATGGAAGCGCGCCCCCTGGAGGAG GGTCTTGCTGAGGCAATTGATGATGGCCGCATTGGCCCACGTGATGATCCTAAGGTGCGC TCCCAGATCCTCTCTCAAGAGTTTGGGTGGGACAAGGATCTTGCCAAGAAGATTTGGTGC TTCGGACCTGAGACCACCGGCCCAAACATGGTTGTTGATATGTGCAAGGGAGTGCAGTAT CTCAATGAAATCAAGGATTCTGTTGTGGCTGGTTTCCAGTGGGCATCGAAGGAGGGTGCA CTGGCTGAAGAGAACATGCGCGGGATTTGCTTCGAGGTCTGTGATGTCGTTCTTCATGCC GATGCTATCCACAGGGGTGGTGGCCAGGTCATTCCAACTGCCAGGAGGGTCATTTATGCT TCTCAGCTCACAGCCAAGCCGAGGCTGCTGGAACCAGTTTACCTGGTGGAGATCCAGGCC CCAGAAAATGCACTTGGTGGCATATACGGTGTTCTGAACCAGAAGAGAGGACATGTATTC GAGGAGATGCAAAGGCCTGGTACCCCGCTCTACAACATCAAGGCTTTCCTCCCTGTCATC GAGTCCTTTGGGTTCTCAAGCCAGCTGAGGGCTGCAACCTCTGGTCAGGCGTTCCCCCAG TGTGTGTTTGACCACTGGGACATGATGGGCTCGGATCCTTTGGAGGCTGGCTCCCAGGCT GCCCAGCTGGTGCTGGATATCCGCAAGAGGAAGGGTCTGAAAGAACAGATGACTCCTCTT TCTGAGTTTGAGGACAAGCTCTAATCTTTTCGTTTTTGCTACTGTTACTGGTTTTAATTG TCACTCGGAGTCTGGGAACTATTTATATCTTGTTTCCTTTTAGTTGTCAAGTGCATGTTT CTGAACATCATTGGTCATACTGTACTATCCAAGTGCTGTTGAGACACTTTTTTCTATCAA TCGTGATGTAACAGTTGGT