Plant GARDEN How To ▶︎

JA

EN

Zea mays

CDS Sequence

CDS ID

Zm00001d012219_T001

CDS Infomation

cds chromosome:B73_RefGen_v4:8:170356402:170357442:-1 gene:Zm00001d012219 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding

Sequence

ATGGCCTCCGCCGACGCCGGCACTTGCCCGTGGGATGCCCTCCCGTTGCACCTCCAGGAG
CGAATCCTCTCCCTCCTCCCCATCACCGAACTACTTCCCGTTGCCGCCGTGTCCCGCGCC
TTCCACCGCCTTCTGCGCTCCCCGACCTTCCATGCCCTCCTCTCCCCGCATCGCCTCGAC
GCCTTCTTCCTCCTTTCCCCACGGCTCGCCGTCCACCCGCTGTCCCGCCGCGTCCGCACT
ATGCCCGCGTTCGCCGCGCTCTCTCCTCCTTCCTACCCGCTCGTCTCCTCCCCGTCCCCA
TCACTCCTTATCACCTGCGCCTCACTCCAGTTCCTCCCGCCGATCCCCGACGGAGCCTAC
CTCCTATCCGCTATCGTCCCATCGCGCGGCTCCTCCACCTCCTGCACCCTTGTCGCCGTC
ATCACCGGCGCAGCCGCGCGTTCTTACACCCTGGACACCGGCGATCCCTCCCCGCAGTGG
GCGTCTAGAGGCGATCTCCCGCTGTCTCTCACGCTCCTGGAAAACGCCGCGGTCTCCGGT
GACCGCAGCAAACTCTTCGTCCTCGGCCGTGGCCCCGAGGCGCTCTTGGTTTTTCATCTC
GTGACGGGGACATGGGAGGTGCTGCATGTTGTGATGCCACAAGGTCTCACTACGGCGCAC
CTGTTTCTTTTTGATGGGAGCCTATTCTTAGTAGGTGGTATTGAGAGCTTTGGAGTAGTG
GATCGGGTGGTGGTCTGGCGGTTGGACGACGATAAGGTGGAGGAGGTGTGGTGGAGGGAG
GTGAGCGTGATGCCGACGGAGGTTTTCGATGAGTTGCTAGCTGGTAGGTTTGGCAGATTC
TGGCATTTTCAGGCTGCAGACAGATTGGGGATTGTTTGCTTGTACAATGCTGTGGATCGG
AGGCTGGTCATGTTTGATGCGGCTGATGGCATGTGGACAGTGCTGCCACGATTGTCCGCG
TTGGATGCATGCGAGAGCTTCAGGTGGTTTGGACATGTCTTGGAGCCAGGAGTTGAAATC
TTGATGGGACTACGTTGGTGA

Peptide Sequence

PEP ID

Zm00001d012219_P001

PEP Infomation

pep chromosome:B73_RefGen_v4:8:170356402:170357442:-1 gene:Zm00001d012219 transcript:Zm00001d012219_T001 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding

Sequence

MASADAGTCPWDALPLHLQERILSLLPITELLPVAAVSRAFHRLLRSPTFHALLSPHRLD
AFFLLSPRLAVHPLSRRVRTMPAFAALSPPSYPLVSSPSPSLLITCASLQFLPPIPDGAY
LLSAIVPSRGSSTSCTLVAVITGAAARSYTLDTGDPSPQWASRGDLPLSLTLLENAAVSG
DRSKLFVLGRGPEALLVFHLVTGTWEVLHVVMPQGLTTAHLFLFDGSLFLVGGIESFGVV
DRVVVWRLDDDKVEEVWWREVSVMPTEVFDELLAGRFGRFWHFQAADRLGIVCLYNAVDR
RLVMFDAADGMWTVLPRLSALDACESFRWFGHVLEPGVEILMGLRW

Transcript Sequence

Transcript ID

Zm00001d012219_T001

Transcript Infomation

cdna chromosome:B73_RefGen_v4:8:170356402:170357442:-1 gene:Zm00001d012219 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding

Sequence

ATGGCCTCCGCCGACGCCGGCACTTGCCCGTGGGATGCCCTCCCGTTGCACCTCCAGGAG
CGAATCCTCTCCCTCCTCCCCATCACCGAACTACTTCCCGTTGCCGCCGTGTCCCGCGCC
TTCCACCGCCTTCTGCGCTCCCCGACCTTCCATGCCCTCCTCTCCCCGCATCGCCTCGAC
GCCTTCTTCCTCCTTTCCCCACGGCTCGCCGTCCACCCGCTGTCCCGCCGCGTCCGCACT
ATGCCCGCGTTCGCCGCGCTCTCTCCTCCTTCCTACCCGCTCGTCTCCTCCCCGTCCCCA
TCACTCCTTATCACCTGCGCCTCACTCCAGTTCCTCCCGCCGATCCCCGACGGAGCCTAC
CTCCTATCCGCTATCGTCCCATCGCGCGGCTCCTCCACCTCCTGCACCCTTGTCGCCGTC
ATCACCGGCGCAGCCGCGCGTTCTTACACCCTGGACACCGGCGATCCCTCCCCGCAGTGG
GCGTCTAGAGGCGATCTCCCGCTGTCTCTCACGCTCCTGGAAAACGCCGCGGTCTCCGGT
GACCGCAGCAAACTCTTCGTCCTCGGCCGTGGCCCCGAGGCGCTCTTGGTTTTTCATCTC
GTGACGGGGACATGGGAGGTGCTGCATGTTGTGATGCCACAAGGTCTCACTACGGCGCAC
CTGTTTCTTTTTGATGGGAGCCTATTCTTAGTAGGTGGTATTGAGAGCTTTGGAGTAGTG
GATCGGGTGGTGGTCTGGCGGTTGGACGACGATAAGGTGGAGGAGGTGTGGTGGAGGGAG
GTGAGCGTGATGCCGACGGAGGTTTTCGATGAGTTGCTAGCTGGTAGGTTTGGCAGATTC
TGGCATTTTCAGGCTGCAGACAGATTGGGGATTGTTTGCTTGTACAATGCTGTGGATCGG
AGGCTGGTCATGTTTGATGCGGCTGATGGCATGTGGACAGTGCTGCCACGATTGTCCGCG
TTGGATGCATGCGAGAGCTTCAGGTGGTTTGGACATGTCTTGGAGCCAGGAGTTGAAATC
TTGATGGGACTACGTTGGTGA