Gene sequences

How To ▶︎

JA

EN

TOP > About the Species(Zea mays ) > genome data >Gene sequences

Search

By Traits

Let’s Analyze!!

SNP Detection
(lang=JA only)

Other Tools

Data List

All

Trait-Related Loci

Zea mays

CDS Sequence

CDS ID	Zm00001d003791_T001
CDS Infomation	cds chromosome:B73_RefGen_v4:2:59470932:59473694:-1 gene:Zm00001d003791 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding description:Pentatricopeptide repeat-containing protein
Sequence	ATGACATGCCGGGAAGTGGCAGCCTCGCTGCACCGATCGCTTGCCAAGTTTATCGTGCCT GACAACCCAGAGAAAATCCTGTCGCTTGTCGCTGCCAAGGCAAGCCATCATAGAGCTCTT GGCTCTGCGGACCTCACATGTGCCCTGCAGGCATGCAGGGGGCGAGGCAACCGATGGCCG CTTGTGCTGGAGATCCACGCGACATCAGTCGTGCGTGGGCTTGGGGCTGACCGCCTTATA GGCAACTTGCTGATCGATCTGTATGCAAAGAATGGGCTCGTGTGGCAGGCACGGCAGGTA TTCAAGGAGCTTTCTTCCAGGGACCATGTCTCATGGGTTGCCATGCTGTCAGGGTATGCA CAGCGTGGTCTTGGAAAGGAAGCTTTCAGGCTTTACAGCCAGATGCATTGGACTGCTGTT ATTCCTACGCCATATGTTCTGTCTAGTGTGCTGAGTGCTTGCACTAAAGGAAAACTTTTT GCTCAAGGTCGGATGATCCATGCCCAAGTTTACAAGCAAGCATTCTGTTCGGAGACCTTT GTGGGCAATGCACTTATTGCACTTTACTTAGGATTTGGATCCTTTAAGCTAGCAGAAAGG GTATTTTGTGACATGCTGTTCTGTGATCGAGTGACATTCAATACATTGATCTCAGGACAT GCTCAATGTGGACATGGTGAGTGTGCTTTGCAGATTTTTGATGAGATGCAGTTGTCAGGG CTCAGGCCTGATTGTGTGACAGTTGCCAGTCTGCTTGCAGCCTGTGCTTCTGTGGGAGAT CTTCAAAAGGGGAAGCAACTCCATTCATATTTACTAAAAGCAGGTATGTCTTTTGATTAC ATAACTGAAGGCTCACTACTCGATCTGTATGTGAAATGTGGTGACATTGAAACAGCACAT GATATCTTCAATCTGGGTGATAGGACAAACGTGGTACTGTGGAATTTAATGCTTGTGGCA TATGGGCAGATTAGTGATCTAGCAAAATCTTTTGAAATCTTTGGTCAGATGCAAGCTACA GGTATACACCCCAACAAATTCACCTACCCGTGCATTTTGAGGACTTGCACTTGCACTGGG CAAATTGAACTTGGAGAGCAGATTCATTCATTAAGCATAAAAAATGGATTCGAATCTGAT ATGTATGTTAGTGGTGTCTTGATAGATATGTATTCTAAATACAGATGTCTTGATAAAGCT CGAAAAATTCTGGAAATGCTTGAAAAAAGAGATGTGGTTTCTTGGACCTCAATGATTGCT GGATATGTGCAGCATGACTTTTGTGAAGAGGCTCTTGCAACATTCAAAGAAATGCAGGAC TGTGGAGTTTGGCCAGATAACATAGGACTGGCTAGTGCTGCAAGTGCTTGTGCTGGGATC AAAGCAATGCGCCAGGGCCTGCAGATTCATGCTCGGGTTTATGTCTCTGGTTATGCAGCT GATATTTCAATTTGGAACACGTTGGTAAACCTGTATGCAAGATGTGGAAGAAGTGAAGAA GCTTTCTCTTTGTTTCGGGAAATTGATCACAAGGATGAGATCACATGGAATGGATTGATA TCAGGTTTTGGACAAAGTCGTCTTTATGAACAAGCTCTCATGGTATTCATGAAGATGAGT CAAGCAGGTGCCAAGTACAATGTGTTCACATTTATTTCCGCTATTAGCGCTTTAGCTAAC CTTGCAGATATAAAACAAGGAAAACAAGTACATGGTAGAGCTGTTAAGACAGGGCACACC TCTGAAACTGAAGTTGCCAATGCTTTGATTTCACTATATGGAAAGTGTGGCAGTATTGAA GATGCCAAGATGATCTTTTCTGAAATGTCACTGAGGAATGAGGTTTCATGGAATACTATC ATAACAAGTTGTTCACAGCATGGACGTGGACTAGAAGCTTTGGATTTATTTGATCAGATG AAGCAAGAAGGTCTGAAACCAAATGATGTCACCTTCATAGGTGTTTTAGCTGCTTGCAGT CATGTGGGTTTGGTTGAGGAAGGCCTTAGTTACTTCAAATCCATGTCTAATGTGTATGGA CTTAATCCAATACCTGACCATTATGCCTGTGTTGTGGATATTCTTGGACGAGCAGGCCAA CTTGACCGTGCAAGGAGATTTGTTGATGAAATGCCTATCACTGCTAATGCAATGATTTGG CGAACACTTCTCAGTGCGTGTAAAGTACACAAGAACATCGAAATTGGGGAGCTTGCAGCC AAACATCTCCTGGAGTTAGAGCCCCATGATTCAGCATCATATGTCCTCCTATCAAATGCA TATGCTGTTACTGGGAAGTGGGCCAACAGGGATCAGGTCAGAAAGATGATGAAAGACAGA GGAATTAGAAAAGAACCAGGTCGAAGCTGGATTGAAGTAAAGAATGCAGTCCATGCATTC TTTGTTGGTGATCGGTTGCACCCCTTGTCCGATCAGATATACAAGTTTTTGTCTGAGCTA AATGATAGGTTATCCAAAATAGGATACAAGCAAGAGAACCCTAATTTGTTTCATGAAAAA GAGCAAGAGCAGAAAGACCCTACTGCTTTTGTCCATAGTGAGAAGTTAGCTGTTGCTTTT GGGTTAATGACTTTGCCTCCTTGTATTCCTCTTCGAGTGATTAAGAACCTTCGTGTATGT GATGACTGCCACAGTTGGATGAAATTTACCTCTGAAGTCACAAGAAGAGAAATTGTATTA CGAGATGTGTACAGATTTCACCATTTTAACAGTGGCAGCTGTTCATGTGGAGATTACTGG TGA

Peptide Sequence

PEP ID	Zm00001d003791_P001
PEP Infomation	pep chromosome:B73_RefGen_v4:2:59470932:59473694:-1 gene:Zm00001d003791 transcript:Zm00001d003791_T001 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding description:Pentatricopeptide repeat-containing protein
Sequence	MTCREVAASLHRSLAKFIVPDNPEKILSLVAAKASHHRALGSADLTCALQACRGRGNRWP LVLEIHATSVVRGLGADRLIGNLLIDLYAKNGLVWQARQVFKELSSRDHVSWVAMLSGYA QRGLGKEAFRLYSQMHWTAVIPTPYVLSSVLSACTKGKLFAQGRMIHAQVYKQAFCSETF VGNALIALYLGFGSFKLAERVFCDMLFCDRVTFNTLISGHAQCGHGECALQIFDEMQLSG LRPDCVTVASLLAACASVGDLQKGKQLHSYLLKAGMSFDYITEGSLLDLYVKCGDIETAH DIFNLGDRTNVVLWNLMLVAYGQISDLAKSFEIFGQMQATGIHPNKFTYPCILRTCTCTG QIELGEQIHSLSIKNGFESDMYVSGVLIDMYSKYRCLDKARKILEMLEKRDVVSWTSMIA GYVQHDFCEEALATFKEMQDCGVWPDNIGLASAASACAGIKAMRQGLQIHARVYVSGYAA DISIWNTLVNLYARCGRSEEAFSLFREIDHKDEITWNGLISGFGQSRLYEQALMVFMKMS QAGAKYNVFTFISAISALANLADIKQGKQVHGRAVKTGHTSETEVANALISLYGKCGSIE DAKMIFSEMSLRNEVSWNTIITSCSQHGRGLEALDLFDQMKQEGLKPNDVTFIGVLAACS HVGLVEEGLSYFKSMSNVYGLNPIPDHYACVVDILGRAGQLDRARRFVDEMPITANAMIW RTLLSACKVHKNIEIGELAAKHLLELEPHDSASYVLLSNAYAVTGKWANRDQVRKMMKDR GIRKEPGRSWIEVKNAVHAFFVGDRLHPLSDQIYKFLSELNDRLSKIGYKQENPNLFHEK EQEQKDPTAFVHSEKLAVAFGLMTLPPCIPLRVIKNLRVCDDCHSWMKFTSEVTRREIVL RDVYRFHHFNSGSCSCGDYW

Transcript Sequence

Transcript ID	Zm00001d003791_T001
Transcript Infomation	cdna chromosome:B73_RefGen_v4:2:59470932:59473694:-1 gene:Zm00001d003791 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding description:Pentatricopeptide repeat-containing protein
Sequence	ATGACATGCCGGGAAGTGGCAGCCTCGCTGCACCGATCGCTTGCCAAGTTTATCGTGCCT GACAACCCAGAGAAAATCCTGTCGCTTGTCGCTGCCAAGGCAAGCCATCATAGAGCTCTT GGCTCTGCGGACCTCACATGTGCCCTGCAGGCATGCAGGGGGCGAGGCAACCGATGGCCG CTTGTGCTGGAGATCCACGCGACATCAGTCGTGCGTGGGCTTGGGGCTGACCGCCTTATA GGCAACTTGCTGATCGATCTGTATGCAAAGAATGGGCTCGTGTGGCAGGCACGGCAGGTA TTCAAGGAGCTTTCTTCCAGGGACCATGTCTCATGGGTTGCCATGCTGTCAGGGTATGCA CAGCGTGGTCTTGGAAAGGAAGCTTTCAGGCTTTACAGCCAGATGCATTGGACTGCTGTT ATTCCTACGCCATATGTTCTGTCTAGTGTGCTGAGTGCTTGCACTAAAGGAAAACTTTTT GCTCAAGGTCGGATGATCCATGCCCAAGTTTACAAGCAAGCATTCTGTTCGGAGACCTTT GTGGGCAATGCACTTATTGCACTTTACTTAGGATTTGGATCCTTTAAGCTAGCAGAAAGG GTATTTTGTGACATGCTGTTCTGTGATCGAGTGACATTCAATACATTGATCTCAGGACAT GCTCAATGTGGACATGGTGAGTGTGCTTTGCAGATTTTTGATGAGATGCAGTTGTCAGGG CTCAGGCCTGATTGTGTGACAGTTGCCAGTCTGCTTGCAGCCTGTGCTTCTGTGGGAGAT CTTCAAAAGGGGAAGCAACTCCATTCATATTTACTAAAAGCAGGTATGTCTTTTGATTAC ATAACTGAAGGCTCACTACTCGATCTGTATGTGAAATGTGGTGACATTGAAACAGCACAT GATATCTTCAATCTGGGTGATAGGACAAACGTGGTACTGTGGAATTTAATGCTTGTGGCA TATGGGCAGATTAGTGATCTAGCAAAATCTTTTGAAATCTTTGGTCAGATGCAAGCTACA GGTATACACCCCAACAAATTCACCTACCCGTGCATTTTGAGGACTTGCACTTGCACTGGG CAAATTGAACTTGGAGAGCAGATTCATTCATTAAGCATAAAAAATGGATTCGAATCTGAT ATGTATGTTAGTGGTGTCTTGATAGATATGTATTCTAAATACAGATGTCTTGATAAAGCT CGAAAAATTCTGGAAATGCTTGAAAAAAGAGATGTGGTTTCTTGGACCTCAATGATTGCT GGATATGTGCAGCATGACTTTTGTGAAGAGGCTCTTGCAACATTCAAAGAAATGCAGGAC TGTGGAGTTTGGCCAGATAACATAGGACTGGCTAGTGCTGCAAGTGCTTGTGCTGGGATC AAAGCAATGCGCCAGGGCCTGCAGATTCATGCTCGGGTTTATGTCTCTGGTTATGCAGCT GATATTTCAATTTGGAACACGTTGGTAAACCTGTATGCAAGATGTGGAAGAAGTGAAGAA GCTTTCTCTTTGTTTCGGGAAATTGATCACAAGGATGAGATCACATGGAATGGATTGATA TCAGGTTTTGGACAAAGTCGTCTTTATGAACAAGCTCTCATGGTATTCATGAAGATGAGT CAAGCAGGTGCCAAGTACAATGTGTTCACATTTATTTCCGCTATTAGCGCTTTAGCTAAC CTTGCAGATATAAAACAAGGAAAACAAGTACATGGTAGAGCTGTTAAGACAGGGCACACC TCTGAAACTGAAGTTGCCAATGCTTTGATTTCACTATATGGAAAGTGTGGCAGTATTGAA GATGCCAAGATGATCTTTTCTGAAATGTCACTGAGGAATGAGGTTTCATGGAATACTATC ATAACAAGTTGTTCACAGCATGGACGTGGACTAGAAGCTTTGGATTTATTTGATCAGATG AAGCAAGAAGGTCTGAAACCAAATGATGTCACCTTCATAGGTGTTTTAGCTGCTTGCAGT CATGTGGGTTTGGTTGAGGAAGGCCTTAGTTACTTCAAATCCATGTCTAATGTGTATGGA CTTAATCCAATACCTGACCATTATGCCTGTGTTGTGGATATTCTTGGACGAGCAGGCCAA CTTGACCGTGCAAGGAGATTTGTTGATGAAATGCCTATCACTGCTAATGCAATGATTTGG CGAACACTTCTCAGTGCGTGTAAAGTACACAAGAACATCGAAATTGGGGAGCTTGCAGCC AAACATCTCCTGGAGTTAGAGCCCCATGATTCAGCATCATATGTCCTCCTATCAAATGCA TATGCTGTTACTGGGAAGTGGGCCAACAGGGATCAGGTCAGAAAGATGATGAAAGACAGA GGAATTAGAAAAGAACCAGGTCGAAGCTGGATTGAAGTAAAGAATGCAGTCCATGCATTC TTTGTTGGTGATCGGTTGCACCCCTTGTCCGATCAGATATACAAGTTTTTGTCTGAGCTA AATGATAGGTTATCCAAAATAGGATACAAGCAAGAGAACCCTAATTTGTTTCATGAAAAA GAGCAAGAGCAGAAAGACCCTACTGCTTTTGTCCATAGTGAGAAGTTAGCTGTTGCTTTT GGGTTAATGACTTTGCCTCCTTGTATTCCTCTTCGAGTGATTAAGAACCTTCGTGTATGT GATGACTGCCACAGTTGGATGAAATTTACCTCTGAAGTCACAAGAAGAGAAATTGTATTA CGAGATGTGTACAGATTTCACCATTTTAACAGTGGCAGCTGTTCATGTGGAGATTACTGG TGA