Gene sequences

How To ▶︎

JA

EN

TOP > About the Species(Sorghum bicolor ) > genome data >Gene sequences

Search

By Traits

Let’s Analyze!!

SNP Detection
(lang=JA only)

Other Tools

Data List

All

Trait-Related Loci

Sorghum bicolor

CDS Sequence

CDS ID	OQU78106
CDS Infomation	cds chromosome:Sorghum_bicolor_NCBIv3:9:51247542:51250178:-1 gene:SORBI_3009G155400 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding description:hypothetical protein
Sequence	ATGTTGGCCCTAGGAGTGAGAACTCACCAGCGCCGGCACTGGTGCCTCGCACAGCTCCGT GGCAAGAACGCTGGGGCCTTGGCACCGGAACTGGCCCCGAAGTCACAGTCCACGCTCGCC TGCTCCGTCCCATTGGAGAATCAAACTAACCTCAATGACGCTACCGGTGCCCGCCAAGCG TTCGACGAAATTCCCCACAGGAACACCCTGGACCATGCCCTTTTCGACCACGCGCGGCGG GGTTCAGTCCACCAGGCGCTAGACCACTTCTTGGATGTGCACCGCTGCCATGGTGGGCGT GTTGGTGGTGGGGCACTGGTGGGGGTCCTCAAAGTCTGTGGGTCAGTTCCAGACAGAGTA CTGGGGAAGCAGCTGCATGGCCTGTGCATCAGGTGTGGGCATGATCGTGGCGACGTCGGC GTGGGCACGTCTCTTGTTGACATGTACATGAAGTGGCACAGTGTTGTGGACGGCAGGAAG GTGTTTGAGGCAATGCCCAAGAGGAATGTTGTCACCTGGACGTCATTGCTCACTGGGTAT ATCCAGGATGGAGCATTATCGGATGTTATGGAGCTCTTCTTCAGGATGCGTGCTGAAGGG GTCTGGCCCAATTCTGTCACATTTGCGAGTGTTCTCTCAGTGGTGGCAAGCCAGGGTATG GTTGATCTTGGACGGCGCGTGCATGCTCAATCAGTTAAGTTTGGTTGCTGCTCCACTGTG TTTGTGTGCAATTCTCTGATGAACATGTATGCAAAGTGTGGACTGGTTGAAGAAGCCAGG GTCGTGTTTTGTGGGATGGAGACCAGGGACATGGTGTCATGGAATACATTGATGGCAGGC CTTGTGTTGAACGGGCATGATCTTGAAGCCCTGCAGCTGTTCCATGATTCACGATCCAGT ATTACCATGCTTACACAGTCGACATACGCAACAGTGATCAAATTATGTGCAAATATCAAA CAGCTTGGCCTGGCCCGTCAACTTCACAGCAGTGTTCTTAAACGTGGGTTTCATTCATAT GGCAATGTAATGACAGCCCTCATGGATGCCTACAGCAAAGCAGGTCAACTGGGTAATGCT CTGGATATATTTTTGTTGATGTCAGGATCTCAGAATGTTGTTTCATGGACTGCTATGATT AATGGGTGCATTCAGAATGGTGATGTACCTCTTGCTGCTGCTCTTTTTAGCAGAATGAGA GAAGATGGTGTTGCTCCGAATGATTTCACCTACTCAACAATTCTGACAGCGTCAGTGGCC AGCTTGCCTCCCCAAATTCATGCCCAGGTGATCAAGACAAACTATGAGTGTACATCAATT GTTGGAACTGCACTTCTCGCCTCTTACTCTAAGCTTTGCAACACTGAAGAAGCTCTTTCT ATATTTAAAATGATTGACCAGAAGGATGTTGTTTCATGGTCTGCAATGTTGACTTGCTAT GCCCAAGCTGGTGATTCCGATGGTGCCACAAATATATTCATCAAGATGACCATGCATGGC TTGAAGCCAAATGAGTTTACAATCTCTAGTGTTATTGATGCTTGTGCTAGTCCGACAGCT GGAGTTGACCTGGGTAGGCAGTTCCATGCTATTTCTATCAAGCACAGATGCCATGATGCA CTCTGTGTGAGCAGTGCACTTGTTAGTATGTATGCAAGAAAAGGGAGCATCGAGAGTGCT CAGTGTATCTTTGAGAGGCAAACAGATAGAGATTTGGTGTCATGGAACTCAATGCTATCA GGGTATGCACAGCATGGTTACAGCCAAAAGGCCCTTGATGTATTTCGACAGATGGAAGCT GAGGGCATTGAGATGGATGGCGTCACATTCCTTTCTGTGATCATGGGATGTGCTCATGCT GGTCTTGTTGAAGAAGGTCAGCGATACTTTGATTCGATGGCCAGAGACTATGGGATCACT CCAACCATGGAGCATTATGCGTGCATGGTTGATCTCTATAGCCGCGCAGGCAAGCTGGAT GAAGCAATGAGCCTTATAGAAGGCATGTCATTCCCAGCAGGTCCAATGGTATGGCGCACA TTGCTAGGAGCTTGTAAAGTTCACAAGAATGTTGAGCTTGGAAAGTTGGCTGCGGAGAAG CTGCTGTCACTTGAACCTTTTGACTCGGCTACATACGTGCTACTCTCCAACATTTATTCG GCTGCAGGGAAGTGGAAAGAGAAGGATGAAGTGAGGAAGCTCATGGACACTAAAAAGGTT AAGAAAGAAGCTGGATGCAGCTGGATTCAGATCAAGAATAAAGTCCATTCCTTTATAGCT TCAGACAAGTCGCATCCTTTATCAGAACAGATATATGCAAAGCTCAGGGCAATGACAACT AAGTTAAAGCAAGAAGGTTATTGTCCTGATACAAGCTTTGCGCTTCATGAAGTGGCAGAA GAGCAGAAAGAAGCTATGCTGGCAATGCACAGTGAGCGCCTAGCCCTCGCATTTGGTTTG ATAGCTACACCACCAGGGGCACCCCTTCACATTTTTAAGAACCTGCGGGTGTGTGGGGAC TGCCACACTGTGATCAAAATGGTCTCTAAAATTGAGGATAGGGAGATTGTAATGCGAGAT TGCAGCAGGTTCCACCACTTCAATTCAGGGGTCTGCTCTTGTGGCGATTTTTGGTGA

Peptide Sequence

PEP ID	OQU78106
PEP Infomation	pep chromosome:Sorghum_bicolor_NCBIv3:9:51247542:51250178:-1 gene:SORBI_3009G155400 transcript:OQU78106 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding description:hypothetical protein
Sequence	MLALGVRTHQRRHWCLAQLRGKNAGALAPELAPKSQSTLACSVPLENQTNLNDATGARQA FDEIPHRNTLDHALFDHARRGSVHQALDHFLDVHRCHGGRVGGGALVGVLKVCGSVPDRV LGKQLHGLCIRCGHDRGDVGVGTSLVDMYMKWHSVVDGRKVFEAMPKRNVVTWTSLLTGY IQDGALSDVMELFFRMRAEGVWPNSVTFASVLSVVASQGMVDLGRRVHAQSVKFGCCSTV FVCNSLMNMYAKCGLVEEARVVFCGMETRDMVSWNTLMAGLVLNGHDLEALQLFHDSRSS ITMLTQSTYATVIKLCANIKQLGLARQLHSSVLKRGFHSYGNVMTALMDAYSKAGQLGNA LDIFLLMSGSQNVVSWTAMINGCIQNGDVPLAAALFSRMREDGVAPNDFTYSTILTASVA SLPPQIHAQVIKTNYECTSIVGTALLASYSKLCNTEEALSIFKMIDQKDVVSWSAMLTCY AQAGDSDGATNIFIKMTMHGLKPNEFTISSVIDACASPTAGVDLGRQFHAISIKHRCHDA LCVSSALVSMYARKGSIESAQCIFERQTDRDLVSWNSMLSGYAQHGYSQKALDVFRQMEA EGIEMDGVTFLSVIMGCAHAGLVEEGQRYFDSMARDYGITPTMEHYACMVDLYSRAGKLD EAMSLIEGMSFPAGPMVWRTLLGACKVHKNVELGKLAAEKLLSLEPFDSATYVLLSNIYS AAGKWKEKDEVRKLMDTKKVKKEAGCSWIQIKNKVHSFIASDKSHPLSEQIYAKLRAMTT KLKQEGYCPDTSFALHEVAEEQKEAMLAMHSERLALAFGLIATPPGAPLHIFKNLRVCGD CHTVIKMVSKIEDREIVMRDCSRFHHFNSGVCSCGDFW

Transcript Sequence

Transcript ID	OQU78106
Transcript Infomation	cdna chromosome:Sorghum_bicolor_NCBIv3:9:51247542:51250178:-1 gene:SORBI_3009G155400 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding description:hypothetical protein
Sequence	ATGTTGGCCCTAGGAGTGAGAACTCACCAGCGCCGGCACTGGTGCCTCGCACAGCTCCGT GGCAAGAACGCTGGGGCCTTGGCACCGGAACTGGCCCCGAAGTCACAGTCCACGCTCGCC TGCTCCGTCCCATTGGAGAATCAAACTAACCTCAATGACGCTACCGGTGCCCGCCAAGCG TTCGACGAAATTCCCCACAGGAACACCCTGGACCATGCCCTTTTCGACCACGCGCGGCGG GGTTCAGTCCACCAGGCGCTAGACCACTTCTTGGATGTGCACCGCTGCCATGGTGGGCGT GTTGGTGGTGGGGCACTGGTGGGGGTCCTCAAAGTCTGTGGGTCAGTTCCAGACAGAGTA CTGGGGAAGCAGCTGCATGGCCTGTGCATCAGGTGTGGGCATGATCGTGGCGACGTCGGC GTGGGCACGTCTCTTGTTGACATGTACATGAAGTGGCACAGTGTTGTGGACGGCAGGAAG GTGTTTGAGGCAATGCCCAAGAGGAATGTTGTCACCTGGACGTCATTGCTCACTGGGTAT ATCCAGGATGGAGCATTATCGGATGTTATGGAGCTCTTCTTCAGGATGCGTGCTGAAGGG GTCTGGCCCAATTCTGTCACATTTGCGAGTGTTCTCTCAGTGGTGGCAAGCCAGGGTATG GTTGATCTTGGACGGCGCGTGCATGCTCAATCAGTTAAGTTTGGTTGCTGCTCCACTGTG TTTGTGTGCAATTCTCTGATGAACATGTATGCAAAGTGTGGACTGGTTGAAGAAGCCAGG GTCGTGTTTTGTGGGATGGAGACCAGGGACATGGTGTCATGGAATACATTGATGGCAGGC CTTGTGTTGAACGGGCATGATCTTGAAGCCCTGCAGCTGTTCCATGATTCACGATCCAGT ATTACCATGCTTACACAGTCGACATACGCAACAGTGATCAAATTATGTGCAAATATCAAA CAGCTTGGCCTGGCCCGTCAACTTCACAGCAGTGTTCTTAAACGTGGGTTTCATTCATAT GGCAATGTAATGACAGCCCTCATGGATGCCTACAGCAAAGCAGGTCAACTGGGTAATGCT CTGGATATATTTTTGTTGATGTCAGGATCTCAGAATGTTGTTTCATGGACTGCTATGATT AATGGGTGCATTCAGAATGGTGATGTACCTCTTGCTGCTGCTCTTTTTAGCAGAATGAGA GAAGATGGTGTTGCTCCGAATGATTTCACCTACTCAACAATTCTGACAGCGTCAGTGGCC AGCTTGCCTCCCCAAATTCATGCCCAGGTGATCAAGACAAACTATGAGTGTACATCAATT GTTGGAACTGCACTTCTCGCCTCTTACTCTAAGCTTTGCAACACTGAAGAAGCTCTTTCT ATATTTAAAATGATTGACCAGAAGGATGTTGTTTCATGGTCTGCAATGTTGACTTGCTAT GCCCAAGCTGGTGATTCCGATGGTGCCACAAATATATTCATCAAGATGACCATGCATGGC TTGAAGCCAAATGAGTTTACAATCTCTAGTGTTATTGATGCTTGTGCTAGTCCGACAGCT GGAGTTGACCTGGGTAGGCAGTTCCATGCTATTTCTATCAAGCACAGATGCCATGATGCA CTCTGTGTGAGCAGTGCACTTGTTAGTATGTATGCAAGAAAAGGGAGCATCGAGAGTGCT CAGTGTATCTTTGAGAGGCAAACAGATAGAGATTTGGTGTCATGGAACTCAATGCTATCA GGGTATGCACAGCATGGTTACAGCCAAAAGGCCCTTGATGTATTTCGACAGATGGAAGCT GAGGGCATTGAGATGGATGGCGTCACATTCCTTTCTGTGATCATGGGATGTGCTCATGCT GGTCTTGTTGAAGAAGGTCAGCGATACTTTGATTCGATGGCCAGAGACTATGGGATCACT CCAACCATGGAGCATTATGCGTGCATGGTTGATCTCTATAGCCGCGCAGGCAAGCTGGAT GAAGCAATGAGCCTTATAGAAGGCATGTCATTCCCAGCAGGTCCAATGGTATGGCGCACA TTGCTAGGAGCTTGTAAAGTTCACAAGAATGTTGAGCTTGGAAAGTTGGCTGCGGAGAAG CTGCTGTCACTTGAACCTTTTGACTCGGCTACATACGTGCTACTCTCCAACATTTATTCG GCTGCAGGGAAGTGGAAAGAGAAGGATGAAGTGAGGAAGCTCATGGACACTAAAAAGGTT AAGAAAGAAGCTGGATGCAGCTGGATTCAGATCAAGAATAAAGTCCATTCCTTTATAGCT TCAGACAAGTCGCATCCTTTATCAGAACAGATATATGCAAAGCTCAGGGCAATGACAACT AAGTTAAAGCAAGAAGGTTATTGTCCTGATACAAGCTTTGCGCTTCATGAAGTGGCAGAA GAGCAGAAAGAAGCTATGCTGGCAATGCACAGTGAGCGCCTAGCCCTCGCATTTGGTTTG ATAGCTACACCACCAGGGGCACCCCTTCACATTTTTAAGAACCTGCGGGTGTGTGGGGAC TGCCACACTGTGATCAAAATGGTCTCTAAAATTGAGGATAGGGAGATTGTAATGCGAGAT TGCAGCAGGTTCCACCACTTCAATTCAGGGGTCTGCTCTTGTGGCGATTTTTGGTGA