Plant GARDEN
How To ▶︎

JA

EN

TOP > About the Species(Sorghum bicolor ) > genome data >Gene sequences

Search

By Species By Keywords Genes By Markers By Traits

Let’s Analyze!!

SNP Detection
(lang=JA only) Sequences Other Tools

Data List

All Markers Trait-Related Loci
Sorghum bicolor

CDS Sequence

CDS ID

OQU77877
CDS Infomation

cds chromosome:Sorghum_bicolor_NCBIv3:9:45894868:45896427:-1 gene:SORBI_3009G116400 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding description:hypothetical protein
Sequence

ATGCACGGGGAAGGGCTCCTCCGTCCTGACGCCACGGGCGTCTCGTGCGCTCTCTCCGCC
GTTGGGGACGTCGGTTTGGTTTCGGTAGGCGAACAGCTGCACGGGTACGCAGTGAAGGCA
GGCTGCAGGCTGGATGCCTGTGTGGTCACCGCCCTCATCGATATGTATGGGAAGTGCGGG
CGGGCTGCGGAGATTGTTCAGGTGTTTGATGAGTCAAGCCACATGGATGTTGCTTCTTGC
AATGCCCTCATCGCGGGGCTATCTCGGAACACGCAAGTCTCTGAGGCACTAAGGTTGTTC
AGGGAGTTTGTTGGCCGGGGACTCGAGCTGAATGTCGTGTCCTGGACCTCGATTGTTGCT
TGTTGTGTCCAGAATGGTAAGGATTTGGAAGCTGTGGAACTTTTCAGGGAGATGCAGGCA
CAAGGGATCGAACCAAACTCTGTCACGATCCCTTGTGTGCTGCCAGCGTTTGCCAATGTT
GCAGCTCTGACGCATGGGAGGTCAGCGCACAGTTTTGCTCTCAGGAAAGGTTTTCTCCAT
GATGTTTATGTGAGCAGTGCGTTGGTGGACATGTATGCAAAGTGCGGCAGGGTTAAGGAT
GCGAGAACAATATTTGACGCAATGCCATCTCGGAATGTGGTGTCATGGAATGCGATGATC
GGTGGCTATGCTATGCATGGAGAGGCCGTGAATGCAGTTCGGTTGTTTCACTCAATGCTG
CTGTGCAAACAGAAGCCTGACATGGTCACCTTCACCTGCGTGCTTGCTGCTTGCACCCAA
GCTGGACTGACAGAGGAAGGGCGTCACTATTTCAAAAAAATGCATGCTGAATATGGTGTT
TCTCCGAGGATGGAACATTATGCATGTATGGTTACTCTTGTAGGACGTGCTGGCAAGCTT
GATGAGGCATATGATCTCATAAGTGATATGCCATTTGAGCCAGATGGCTGTATTTGGGGT
TCGTTATTAGGCTCTTGCCGGGTTCATGGCAATGTGGATCTGGCTGAGGTTGCAGCAGAA
AAGCTCTTTCATCTAGAGCCAGAAAATGCTGGTAATTATGTCCTGCTTTCTAACATTTAT
GCTTCTAAGAAAATGTGGGATGGAGTTAATAGGGTCAGAGAGATGATGAAGGATGTAGGC
TTGAAGAAGGAAAAGGGCTGTAGCTGGATCGAGATCAAGAACAAGGTCCATATGTTGTTG
GCTGGTGATGATTCACACCCTATGATGACTGCGATAATTGAGAAACTAAAGCAGCTTAAT
ATTCAGATGAGGAAGCTGGGCTTTGTACCAAGCACAGATTTTGTGCTACATGATGTGGAG
GAACAAGAGAAAGATGATATCCTTGCTGTTCACAGTGAGAAGCTAGCTGTCGCTTTGGGA
CTCATAAGCACTAGCCCAGGAACAACCCTTCGGGTGATAAAGAACCTCCGAATTTGTGGA
GACTGCCATGAGGCAATGAAATTTATATCATCCTTTGAGGGGAGGGAGATATCTGTTAGA
GATACCAACAGGTTCCATCACTTTAGGGGTGGAAAATGTTCCTGTGGGGATTATTGGTGA

Peptide Sequence

PEP ID

OQU77877
PEP Infomation

pep chromosome:Sorghum_bicolor_NCBIv3:9:45894868:45896427:-1 gene:SORBI_3009G116400 transcript:OQU77877 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding description:hypothetical protein
Sequence

MHGEGLLRPDATGVSCALSAVGDVGLVSVGEQLHGYAVKAGCRLDACVVTALIDMYGKCG
RAAEIVQVFDESSHMDVASCNALIAGLSRNTQVSEALRLFREFVGRGLELNVVSWTSIVA
CCVQNGKDLEAVELFREMQAQGIEPNSVTIPCVLPAFANVAALTHGRSAHSFALRKGFLH
DVYVSSALVDMYAKCGRVKDARTIFDAMPSRNVVSWNAMIGGYAMHGEAVNAVRLFHSML
LCKQKPDMVTFTCVLAACTQAGLTEEGRHYFKKMHAEYGVSPRMEHYACMVTLVGRAGKL
DEAYDLISDMPFEPDGCIWGSLLGSCRVHGNVDLAEVAAEKLFHLEPENAGNYVLLSNIY
ASKKMWDGVNRVREMMKDVGLKKEKGCSWIEIKNKVHMLLAGDDSHPMMTAIIEKLKQLN
IQMRKLGFVPSTDFVLHDVEEQEKDDILAVHSEKLAVALGLISTSPGTTLRVIKNLRICG
DCHEAMKFISSFEGREISVRDTNRFHHFRGGKCSCGDYW

Transcript Sequence

Transcript ID

OQU77877
Transcript Infomation

cdna chromosome:Sorghum_bicolor_NCBIv3:9:45894868:45896427:-1 gene:SORBI_3009G116400 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding description:hypothetical protein
Sequence

ATGCACGGGGAAGGGCTCCTCCGTCCTGACGCCACGGGCGTCTCGTGCGCTCTCTCCGCC
GTTGGGGACGTCGGTTTGGTTTCGGTAGGCGAACAGCTGCACGGGTACGCAGTGAAGGCA
GGCTGCAGGCTGGATGCCTGTGTGGTCACCGCCCTCATCGATATGTATGGGAAGTGCGGG
CGGGCTGCGGAGATTGTTCAGGTGTTTGATGAGTCAAGCCACATGGATGTTGCTTCTTGC
AATGCCCTCATCGCGGGGCTATCTCGGAACACGCAAGTCTCTGAGGCACTAAGGTTGTTC
AGGGAGTTTGTTGGCCGGGGACTCGAGCTGAATGTCGTGTCCTGGACCTCGATTGTTGCT
TGTTGTGTCCAGAATGGTAAGGATTTGGAAGCTGTGGAACTTTTCAGGGAGATGCAGGCA
CAAGGGATCGAACCAAACTCTGTCACGATCCCTTGTGTGCTGCCAGCGTTTGCCAATGTT
GCAGCTCTGACGCATGGGAGGTCAGCGCACAGTTTTGCTCTCAGGAAAGGTTTTCTCCAT
GATGTTTATGTGAGCAGTGCGTTGGTGGACATGTATGCAAAGTGCGGCAGGGTTAAGGAT
GCGAGAACAATATTTGACGCAATGCCATCTCGGAATGTGGTGTCATGGAATGCGATGATC
GGTGGCTATGCTATGCATGGAGAGGCCGTGAATGCAGTTCGGTTGTTTCACTCAATGCTG
CTGTGCAAACAGAAGCCTGACATGGTCACCTTCACCTGCGTGCTTGCTGCTTGCACCCAA
GCTGGACTGACAGAGGAAGGGCGTCACTATTTCAAAAAAATGCATGCTGAATATGGTGTT
TCTCCGAGGATGGAACATTATGCATGTATGGTTACTCTTGTAGGACGTGCTGGCAAGCTT
GATGAGGCATATGATCTCATAAGTGATATGCCATTTGAGCCAGATGGCTGTATTTGGGGT
TCGTTATTAGGCTCTTGCCGGGTTCATGGCAATGTGGATCTGGCTGAGGTTGCAGCAGAA
AAGCTCTTTCATCTAGAGCCAGAAAATGCTGGTAATTATGTCCTGCTTTCTAACATTTAT
GCTTCTAAGAAAATGTGGGATGGAGTTAATAGGGTCAGAGAGATGATGAAGGATGTAGGC
TTGAAGAAGGAAAAGGGCTGTAGCTGGATCGAGATCAAGAACAAGGTCCATATGTTGTTG
GCTGGTGATGATTCACACCCTATGATGACTGCGATAATTGAGAAACTAAAGCAGCTTAAT
ATTCAGATGAGGAAGCTGGGCTTTGTACCAAGCACAGATTTTGTGCTACATGATGTGGAG
GAACAAGAGAAAGATGATATCCTTGCTGTTCACAGTGAGAAGCTAGCTGTCGCTTTGGGA
CTCATAAGCACTAGCCCAGGAACAACCCTTCGGGTGATAAAGAACCTCCGAATTTGTGGA
GACTGCCATGAGGCAATGAAATTTATATCATCCTTTGAGGGGAGGGAGATATCTGTTAGA
GATACCAACAGGTTCCATCACTTTAGGGGTGGAAAATGTTCCTGTGGGGATTATTGGTGA