Gene sequences

How To ▶︎

JA

EN

TOP > About the Species(Sorghum bicolor ) > genome data >Gene sequences

Search

By Traits

Let’s Analyze!!

SNP Detection
(lang=JA only)

Other Tools

Data List

All

Trait-Related Loci

Sorghum bicolor

CDS Sequence

CDS ID	KXG27611
CDS Infomation	cds chromosome:Sorghum_bicolor_NCBIv3:5:1159342:1167251:-1 gene:SORBI_3005G012800 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding description:hypothetical protein
Sequence	ATGGCCATGGCTGGAGTGTTACATCTCTGGAATGAATGGGAGATCCAAATCCTGGTCCTT GTCAGCTTCGCGTTGCAGGTTTTCCTGCTCAGCTTCGCGTGGATGCGTCGGCACAGCATC TCTCGTGCTCTGAGGATCCTCCTTTGGCTCATGTACCTGCTGGCTGAATACACTGCGACA TACACCATAGGTTATCTGTCCATCACTAGTTGCAAGCCAGCAGGCAAGCTGCAGCAGCAG CTCATGGCATTCTGGGCACCGTTCCTTCTTGTGCATCTCGGCGGCCAGGACACCATCACG GCCTACGCCATGGAGGACAACCAGCTCTGGCTGCGCTACCTGCTCACTTTTGCCGTGCAG GCCCTTGGAGCAGCTTATGTCCTCTATAAGAACATGGGCAGCCATGGGCCACTGGTTGTG CCTGCTGTCCTGATATTTCTCGTGGGTGTACTCAAGAATGCAGAGAGAGTATGGACACTC AGTTTCTCCAGGCTGGAGATCATAAGAAGGTACCTGGACGGTGTTTCGATCAAGGAAAAC GACAGGGATTACTCTGCTACAGGAGCAGGAGCAGAAGCACAGTTGGACAAATTGCATGAC GATGAATCGGTTCTGCAGGGTGCTCATGACCTGCTCTACATCTGCTTGGGTCAGTTTGTG GATGACAAGATCTGGCCGTCCATGTTTCAGAACAATGTGATGAAGCATTTTCATGGGAAT AGCAAAACATTCGAGCTAGTCGAGATGCAGCTCTCCTTGATGTATGACATCTTTTACACC AAGGCAGCAGTGATCCACACATGGTATGGTCGTTGTGTCCGTGTCATGTCGTTGCTTGCG ACAGGCATGGCATTCTATTTGTTCAAGTTCAGTACTGATGGCAAAGACTACGGCTACAGC TACAGCACAGTGGATGCTGCTGTCACCTACATACTGGCAGCTGGGGCTCTCATTCTGGAG ATAGCATCAGTGTTGAGGGCAATGGGGTCAACATGGACATGTGCCATGCTGAAAGCGACC AAGTGGGACTGGCTGCACAACCTGCACGTATCTCTTCGGCGGTGTGTCAGGATAGTACAA GCAAGAAGATGGTCTTATTCCATCGGACAGCTTAACTTGCTGGATTCCTACTGCTACAAA GGTGATGAAACAAGTCTAGGATCTGTTGGGGAGAGAGACAAAACAAGTCTTGGAATGGAA GACAGCAGTTTTGCTCCGAAAAAAGATAAAAGGGGATTCACCATACAAATAAAAGATAAG GCAGCAAATCTAGGCAGCAAAATGGTTTCCTTTTACAGAGATGGCAGCAGCAGGATTTAT TTGACGGCCGTCAAGGAGCTGGTGCTGGAAGAGATACAGAGAGTGGTGGAAGCATGTGAA GGCAATGAGGGCGTGATGAGAAGCTACCGTGGTCAGTGCGTGCTGGAGCAACGATGGCCT GAATGTGATGATGGTAGTGGTGGATTCTTGAAGGATCTCACCTGGAGCACGAACATGGAT TTTGATCAAAGCATCCTTGCATGGCATCTTGCCACCGACAAGTTCCTCCGGCACTCAATG TCATCTACAAGAAATGAAGGGCCGTCTCGTTCCCTTGTGGAGGCAACCAAGGCAGTCTCC AACTACATGATGTTCCTCCTTGTGGAACGTCCCTACATGCTGCCATCCCCTGTTCGACCC ACATTGCATCTCCAAGCCAAGAAAGCGTTGCGGCAATGGCATTATTCGCAGTTCATGGAG CGAGACAGCCACAACAAAGGTACTATTGATGAGGAAGCGCAAGTCCTTAATGCTGGAGCT AAACTCGCTGACCAACTACTATGCATGGAGGAATTGGAGAAGCCAGGGCCCAACAAGCTG CTGCGGGTGGTTTTTGGGGTGTGGGTGGAGATGCTATGCTACGCGGCACATCACTGCAGC AGGGAGTCCCATGCTAAGCAGCTCAGCAGTGGCGGAGAGTTGATAACCATCTCGTGGCTT CTGACCACGGCAGAGTATAATCGCGTCTACTACAGCCAAACAAACTTTAAGGAGAGAAAG CATGGTTCTATCTGGAATTTCATGAATTTCGTGGATTTCAAGGATTTTGCGTCGAACATT CTTTTTTCCCATTCTGGATGGATGCCCATGTGTAGAGGTCCGAGTGGACTCTTTCGAAGA GTTGTCTAG

Peptide Sequence

PEP ID	KXG27611
PEP Infomation	pep chromosome:Sorghum_bicolor_NCBIv3:5:1159342:1167251:-1 gene:SORBI_3005G012800 transcript:KXG27611 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding description:hypothetical protein
Sequence	MAMAGVLHLWNEWEIQILVLVSFALQVFLLSFAWMRRHSISRALRILLWLMYLLAEYTAT YTIGYLSITSCKPAGKLQQQLMAFWAPFLLVHLGGQDTITAYAMEDNQLWLRYLLTFAVQ ALGAAYVLYKNMGSHGPLVVPAVLIFLVGVLKNAERVWTLSFSRLEIIRRYLDGVSIKEN DRDYSATGAGAEAQLDKLHDDESVLQGAHDLLYICLGQFVDDKIWPSMFQNNVMKHFHGN SKTFELVEMQLSLMYDIFYTKAAVIHTWYGRCVRVMSLLATGMAFYLFKFSTDGKDYGYS YSTVDAAVTYILAAGALILEIASVLRAMGSTWTCAMLKATKWDWLHNLHVSLRRCVRIVQ ARRWSYSIGQLNLLDSYCYKGDETSLGSVGERDKTSLGMEDSSFAPKKDKRGFTIQIKDK AANLGSKMVSFYRDGSSRIYLTAVKELVLEEIQRVVEACEGNEGVMRSYRGQCVLEQRWP ECDDGSGGFLKDLTWSTNMDFDQSILAWHLATDKFLRHSMSSTRNEGPSRSLVEATKAVS NYMMFLLVERPYMLPSPVRPTLHLQAKKALRQWHYSQFMERDSHNKGTIDEEAQVLNAGA KLADQLLCMEELEKPGPNKLLRVVFGVWVEMLCYAAHHCSRESHAKQLSSGGELITISWL LTTAEYNRVYYSQTNFKERKHGSIWNFMNFVDFKDFASNILFSHSGWMPMCRGPSGLFRR VV

Transcript Sequence

Transcript ID	KXG27611
Transcript Infomation	cdna chromosome:Sorghum_bicolor_NCBIv3:5:1159342:1167251:-1 gene:SORBI_3005G012800 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding description:hypothetical protein
Sequence	GGCATACAGCATTACCGACTACTTAGGACGACTAAGTAAGATCTGGGCAAGGAATCTGAT TCCTAAAAGAAAAACGGGTGTCTTGATTACTATGGAGCGATCATCATAGCCAAAGAATAA ATCAAGCAACCAAAAGTCCAAAACATGCAACCAACAAAAGAATGAAGCTGCTAGTTATGG GAACTTGAGTGGACATAGCTCGCCTCTTCTTCTGCCATGCATTGTGGTGAGCTGCCGGCC CTTTCTTACAAATGTCCTGCTCTGCTGTGCTTCATCGGCCTTACACAGGCTCTTCATTGT CAGCGGAGGCAAGTGACAGAGGCTATCTCGATCAGTCCTTGACAGATCAACCCAAACATC CGAGTCTTTACGTGCTGTGTTCCGCTGTTGTCAAGGCCACAAGCTAGGGTAGCTCACTCA CTTCGATCTCATCACCTGGTTTTCAGGTATGTAAGCTCTTTTCTTGCTTGCTCCGCTGCT TCTATGATCTTTGTCTAGAGCTCGTTTTTTTAACTACATCTCAACATTAATGCTGACATA AGTACAACACTAGTACAAGATTGTTTATTATTTTAAGTATTTGTGTCATGTAATAATTTT AATTTGTTGGGATTCCCACACTTGTGGGAACGAACCCGATATTCTCCCATTATATAGAAA ACAATCGATATGTATTTTAAGAGAAGTCAAGGGGTTAACTACGTGTGTGTGTGTGTATGT GTATTAGGTATGTTTAGATCCATTAGCACTAATATTAGAAGGTAAAATTAGTACTAGTGG ATCCAAACAGGCCTTATTAGCTAATGGTGGAAGTGATAGTTTAATTTGCTAATTTGGAGT TGCTAATAGGTGCTAATATTTATCTTCAACTTACTATCAACCACATGTTAGCAGGTGGAT CTAAATGGCCTCTTGCTAACGACTAAAAGTTATTACCGATTAGCTAGCTAATTTTTGATG CTAATGGATCAAACATGACCTTAACAGAGAAGGCAAAAACAACTTTTATCGAAAGAGAAT AATAAAATGAGAGGGTTCAGTTAGGTAAATTAGTTAATAGTTGAGACTGTTGTAATTCAA ATATGACAAATTAGCTAGTCGTTGAAACACTATAGCAGCTCCTCTCCACCGGAAGCTGCA GGTTGTTTTGTTAGCTTTTGATTGGGATGTGATTCCTTAGTAGTACGTCGCTTGAATGCG AGGCAATATGTGTAAATTAAAATAAGTCTGTATTGTACATTGCCTTTCATGTCGGCTGAG CTTGAAGGATGCAAACAGCTTTTAACTGCTGCTTTCGGTTATGTTTGCATAGCTAAGTTT TGAGCATCTCTAAAAGTCTCTCTACATCCTTTCTAAATATTAGAAATAAAGATTTTGATA AAAAAACTATCCTACAACAACTTCTCTAAATGGTATCTAAATAAGTCATCTTCTATTCTA GAATTTTCTCTAGCCAGAAATAGATGACTAGAATGACTCTCTAGAGTGTGTATAAGATAT AGAAAAATTATTGGAGAGTGAAAAGATATATAGAGAGCGAATTTTATGCAAATAACTCTC CAAATTATTCTTTAGATAGGCTTTTGGAGATGCTCTTATGACAATGCGGTGATGACTTTC TTCCCCTCACATATTTCGCGACGCTTCTAAGACCTGTAACCGCTGCAAATGCCTTTTCTG TGTGGATGGTCCTAAAAAAACATGTGCTTAATAATTTTTTAAAAAATATGTTTGGAAATA CAAAAACCTAACATTTCCTGAAAAAACTACAATAACTTCCATTAGATGTGGATATGTGAT TCTACGTTATTGCAAGTCTTGCACAACTTCCTTCAGATTTTACAATTATACATGACAATC AAGGACAAGAATATTTCAAGAATGTAAAGTGTAATAAGGTCTTTCCATAAAAGCTCCACA CCATCAGTGGGTCTTCTTTGCCTTTCTTCAATTCAATGTTCAGTGCTCAATTAGAAGCTA CAAAATTAGTTCAATAGCACCAAAATAATACTATTTTCAAAAAATGCGTGTAACAACACT GAAAAAGTGTGTTGTATTGCCTTGTAGTAACACCCCATTGCCGGGCGGTGGCATCTGCAA CCACAGACATGTGCACTTACGCTGGCCTAGGAACAAAAAAGCTATCTACTTCACACCGCC AACTGTTTTTAACCGGTTCCACAAAACTTTCTAATCCTGCTGTGAGATCAAACGCTCAGT ACCCTCTACCTGCTCAGTCTCTTTCTACCTCTCGTCATTTATGGCATCTCAGTGAAACGC TTTCACCCCGCTCATCTACCTTGTCTCTAACAACTCCTTGCTACCAGATCCACCTCCATC CCCACCTCCACGCTAGCTCGTCTTCGGTAGCACATCACCATGACATCCCCGCGTACCTTG TTCAACTGCCTTTCTTCGCTACCCGACTTGGCGGCGCCACCATCGGTCCACAAGGGCGCC TAGATCTTCTTTCCTTCTAAGCCCTCTAGCAAATAATGATAGATGAACCCTAACCCACTG AAGAAAGATCAGACAGGAGATGGTAAACGCATAACATATCATGCAACCATGAATTAGCAT GTCGACTAGCTACCTCCATAACCGCTGAGTGTTTAGTTTGCTCGAATTTGTATAACGTTG AATTGCTTTAGTGTAGAATTGGTTAGTCACATTAGTATAGCGCGCATTGCATTACTGTAA CATTAGTTACCCGTATTAGTATAGCATTTTTTTAAAGTAATAATAGTATGAGCTTTGCCT TTAATTAAGAATAATAGATTTGGTCTAGTTCATATTATTATAGCGTGGATTTAGTTTTTC TATCTAAGTGGTTAGACTGATAATGCAAGTTGCTATTGTTTGATTTGCCTAGATAGAAAG TGTTATGCGTGGAATTGGTTTCCTGCCTAAGTGGTTACACCATGTCTTGGGATATATGGA GTGTAGTAAGTGGTTACACCATGCGTGGAATTGGTTTCCTGCCTAAGCGTTATGCGAGTG CAGTATAAAGAATGTATAACCAGATACATAGAATTTAACTGAATTATGAGATGTAGGCAG GACATGTTTAGATATAGATGAGTTGCATTAGCAGGGCGTTTGAAAGAGAAATAGTGGATG AACGACTAAGATTAAATAAGCTGTAAAGAATAGATGGCTAGGATATAATATTACCCTTTG GAGTGTGAGATATCTCTATCCCTATCTCTTTCTATCTTAGACCTTGTTTAGTTCTCTATG TGAATTTTTTTTTGTGAGTGTAGCACTCTCATTTGTATTTGACAATTATTGTCCAACCAT GACCTAACTAGATTCAAAAGATTCGTCTCATAAATTAAAGACGGACTATGTAATTAGAGG GTGTTAAAGTTTAACAGTCGTCTCTCTAGTTGTGTTTTTAGTTTCATAAATAATTTATAT TTAGTACTCCATGCATGTCCAAATATTCGATGTGACGGGAGTTAAAGTTTACCGCGATGA AACAAACGGAGCCTTAGTTATTTTTAGTTATTTTTTATATCTATATTTAATACTCAATTC GTCGTGACGGTGGAAGGAGTGAAGCGGTTGATGCGGAAAAACACTACTGAGGTGGTCGTA AAATTCTGCCCAGTAAATTCAAGCGAACAGCCAATCTAGCACTCTTTTTTTTTATCCTCA ATCTAGCATACTCGGCCAGTATAGCATTTCCAAAAAAAAAAAGACAAATACTATATTCCG AGCACCGCGCGACCTCCCTCCCCGTCGAGCTCGAGCCCACACCACACCCAATGACCCAAG AGGTCAACACTAGATGACCTCGCCGCCGCGTCACCCCGTCCCCGTCCCGGAGCAGCAGCA CAAGGTCAGCTGGGCTATGCCAGCGCGAGGAGCCGAGGACATGGCGGGACGGGCTGGAAG CCGTCCCTTGAGCTGCACTGCAGCTTCTCTTCCTCCGCGACTACACGGAGCAGCAGCCGG ACCGGAAGCCGTGCCGTCCCTATGTCAGCGCCCAGCCGCTCACGCCTAAGGTGCGGCGGC CGTCCCTCAAGAAACGGTCGCCGTCCACCTCGTCGCGTATCGCTTCGGAGATGCCGTCGT CGCATCGGCTGTTGCCTGGTCGGCCAAGAGGTCGCCCAGCGCTCACCGCCCGGGCAGGTT CTGCTTCCTCAACCTCGCCCACGATATGCTCGATGAAATGCGCCAGGACAGAGAGCGTCG CGCGCGCGCGCGCGCGCGCCAGTCAGGGTCCTTTCCCTCGAGGTTGAAGCTCTGCTGCTC CTTCATTCTCTGCGGCGCTGCCTCCTACGGCAGCAGCGTGGCGCATGTCTCCATGGTGGG GCTGTTGGTGTAGCAGTGGCATCCGTCCGCCCAGGGAGTGTGCGCACTGGGGCTGACGTT CAGGTGCAAGAGCCTGAGCATGGTGGTACGGCACCAGGTGCGTGGGCAAACACCCGATAA CTGCCTACTAGAGAAGTGAGTTCTCACTAGCTTGTTGGCCTGGACGAAGGGGATTCACGG CATCATGTGCCACCGGGACAGAATGCTATTCCAAGGTAACCGTCCATTTTTTTTCCCGGT GGTATTTCACATGATAGAGATCTTTTAGTGGTACTTCCCAAACTTTGAATGCTACAGAAC TAATTTACCCCAGACGAAAGGGCCCGGGAGGGTTTTGTATTTTGGAATTGCTTTCTGTTC TTAGAGAAGAGGTTTAAATTTGAGTGAAATTCAAATTTACAGAAGGGCGCATGAGGCCAA ATTAAACCCCAACAAATCCAATTTTCAAAGTTCAAAGTTTTTTGAGTGAAATTGGTGATC TTACCTATTTACATTACATGTACAATGGAAAAATGCACAAAATTTGCAAAAGATCTTAAT TTTACTGAATGCCAAGAATATATGATATTAATAAAAAAAACACATGGTATTACTAAGATC TAGTTGCAGACCATGACATTTATGCAAGGAATAACGGTAGATGACAAGAGATATTTATAA AAAAAATTGATCCCTTGTGAGTTTCGACAATGGCTCTGGTCCTGTGTTGCTGCTGTTGTC ATATAGTTGCAGAATTGCAAAAGCTATGAGCCATGCAGTTACACCACGACTGTGTGATGT GAAAACTTCATGCAACATGGAATACACAAGTGCCTTGCTGATGACCCCTATCCCTGTTAA GGCAACTGTCCAAGTCCCATTACTTGGCCCAAAATATCTTTTCACACGTTTTGTTCAAAC ATCACTATCTAAGTGATGTTGTAAACTTTTTGTATTTGATACCCATCGAAAGGCCCATTT TGGGCCATTATAAATGAAATCAGGTGGGGAACCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCGTTG ACCTTAAAAAAATCTTTTCAAACAAAAACTTGGTCCACTTGTGCACCTAATCTGCAATGC ACTGCCATTGGTTGGAGTATTTTATTTCTGTTGTTGTGTGCGTAGTATAATTGATCAATT GCTCGTGATGGTCCTTATGACCTTATCTGTGTTTCACTGACTGATTGATTGTGTAATTCA TCACTACAGAGCTTCCAAGCAAGCGATGGCCATGGCTGGAGTGTTACATCTCTGGAATGA ATGGGAGATCCAAATCCTGGTCCTTGTCAGCTTCGCGTTGCAGGTTTTCCTGCTCAGCTT CGCGTGGATGCGTCGGCACAGCATCTCTCGTGCTCTGAGGATCCTCCTTTGGCTCATGTA CCTGCTGGCTGAATACACTGCGACATACACCATAGGTTATCTGTCCATCACTAGTTGCAA GCCAGCAGGCAAGCTGCAGCAGCAGCTCATGGCATTCTGGGCACCGTTCCTTCTTGTGCA TCTCGGCGGCCAGGACACCATCACGGCCTACGCCATGGAGGACAACCAGCTCTGGCTGCG CTACCTGCTCACTTTTGCCGTGCAGGCCCTTGGAGCAGCTTATGTCCTCTATAAGAACAT GGGCAGCCATGGGCCACTGGTTGTGCCTGCTGTCCTGATATTTCTCGTGGGTGTACTCAA GAATGCAGAGAGAGTATGGACACTCAGTTTCTCCAGGCTGGAGATCATAAGAAGGTACCT GGACGGTGTTTCGATCAAGGAAAACGACAGGGATTACTCTGCTACAGGAGCAGGAGCAGA AGCACAGTTGGACAAATTGCATGACGATGAATCGGTTCTGCAGGGTGCTCATGACCTGCT CTACATCTGCTTGGGTCAGTTTGTGGATGACAAGATCTGGCCGTCCATGTTTCAGAACAA TGTGATGAAGCATTTTCATGGGAATAGCAAAACATTCGAGCTAGTCGAGATGCAGCTCTC CTTGATGTATGACATCTTTTACACCAAGGCAGCAGTGATCCACACATGGTATGGTCGTTG TGTCCGTGTCATGTCGTTGCTTGCGACAGGCATGGCATTCTATTTGTTCAAGTTCAGTAC TGATGGCAAAGACTACGGCTACAGCTACAGCACAGTGGATGCTGCTGTCACCTACATACT GGCAGCTGGGGCTCTCATTCTGGAGATAGCATCAGTGTTGAGGGCAATGGGGTCAACATG GACATGTGCCATGCTGAAAGCGACCAAGTGGGACTGGCTGCACAACCTGCACGTATCTCT TCGGCGGTGTGTCAGGATAGTACAAGCAAGAAGATGGTCTTATTCCATCGGACAGCTTAA CTTGCTGGATTCCTACTGCTACAAAGGTGATGAAACAAGTCTAGGATCTGTTGGGGAGAG AGACAAAACAAGTCTTGGAATGGAAGACAGCAGTTTTGCTCCGAAAAAAGATAAAAGGGG ATTCACCATACAAATAAAAGATAAGGCAGCAAATCTAGGCAGCAAAATGGTTTCCTTTTA CAGAGATGGCAGCAGCAGGATTTATTTGACGGCCGTCAAGGAGCTGGTGCTGGAAGAGAT ACAGAGAGTGGTGGAAGCATGTGAAGGCAATGAGGGCGTGATGAGAAGCTACCGTGGTCA GTGCGTGCTGGAGCAACGATGGCCTGAATGTGATGATGGTAGTGGTGGATTCTTGAAGGA TCTCACCTGGAGCACGAACATGGATTTTGATCAAAGCATCCTTGCATGGCATCTTGCCAC CGACAAGTTCCTCCGGCACTCAATGTCATCTACAAGAAATGAAGGGCCGTCTCGTTCCCT TGTGGAGGCAACCAAGGCAGTCTCCAACTACATGATGTTCCTCCTTGTGGAACGTCCCTA CATGCTGCCATCCCCTGTTCGACCCACATTGCATCTCCAAGCCAAGAAAGCGTTGCGGCA ATGGCATTATTCGCAGTTCATGGAGCGAGACAGCCACAACAAAGGTACTATTGATGAGGA AGCGCAAGTCCTTAATGCTGGAGCTAAACTCGCTGACCAACTACTATGCATGGAGGAATT GGAGAAGCCAGGGCCCAACAAGCTGCTGCGGGTGGTTTTTGGGGTGTGGGTGGAGATGCT ATGCTACGCGGCACATCACTGCAGCAGGGAGTCCCATGCTAAGCAGCTCAGCAGTGGCGG AGAGTTGATAACCATCTCGTGGCTTCTGACCACGGCAGAGTATAATCGCGTCTACTACAG CCAAACAAACTTTAAGGAGAGAAAGCATGGTTCTATCTGGAATTTCATGAATTTCGTGGA TTTCAAGGATTTTGCGTCGAACATTCTTTTTTCCCATTCTGGATGGATGCCCATGTGTAG AGGTCCGAGTGGACTCTTTCGAAGAGTTGTCTAGCCAACAACTCGGTGTTTTGGAAGCTC CTGAGTCCTGACGCATGATTTTTTCCCATAAATTTACGCTGTCTTATAGATATATTTACA CTGGTTTATTACTATATTTATAATGGTTTCTTCCATATAATTTATTGTACAGAGTGATGT AATTTGGAAGATTGCAGATTTTACTGTTGAATGGTTAACATATTTGACTG