Gene sequences

How To ▶︎

JA

EN

TOP > About the Species(Sorghum bicolor ) > genome data >Gene sequences

Search

By Traits

Let’s Analyze!!

SNP Detection
(lang=JA only)

Other Tools

Data List

All

Trait-Related Loci

Sorghum bicolor

CDS Sequence

CDS ID	EES17868
CDS Infomation	cds chromosome:Sorghum_bicolor_NCBIv3:9:9886462:9899365:1 gene:SORBI_3009G075800 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding description:hypothetical protein
Sequence	ATGGATGCTACTGCAACAGATCTGCAAAGGGCTGAGGAATTTAAACTTAAGGCGAATGAT GCCTTCAAGGCAAACAAGTTCTCTCAGGCTATAGAGCTTTACAGTCAAGCCATTGAGCTG AATAGTTCGAATGCAGTTTACTGGGCAAACCGTGCATTTGCACACACAAAATTAGAGGAA TACGGAAGTGCTGTGCAGGATGCTACGAAAGCCATCGAAATTGATCCTAGATATTCAAAA GGTTATTATAGACGTGGCGCAGCGTATCTTGCCATGGGAAAGTTCAAGGAAGCCCTAAAG GATTTTCAGCAGGTTAAAAAAATCTGTCCGAATGATCCAGACGCTACAAGAAAGTTGAAA GAGTGTGAGAAAGCTGTCCAAAAAATCCGTTTTGAAGAAGCAATTTCTGTTGGAGATGCT GAGAGGGGCTCCGTGGCAGACTCCATCGACTACCATATCATAGAAGTAGAGCCACACTAC GCGGGACCAAGAATTGATGGCGAAGAAATAACGATAGATTTTGTCAAAGCAATGTTGGAT GAATTTAAGAAGCAGAAATGCATACATAAAAGATATGCTTATCAGATTGTTCTAAAAACC TTGGATTTGCTACGTTCGATGCCTTCCCTTGTTGATGTGAATGTTCCAAACGGTGGGCAT TTTACAGTTTGCGGTGATGTGCATGGTCAGTACTTTGATTTGCTCAACATATTTGACCTC AATGGGCTTCCCTCAGAAGAAAATCCTTACCTCTTCAATGGTGATTTTGTGGACAGAGGA TCTTTCTCTGTTGAAGTCATACTCACGCTTTTTGCTTTCAAGTGCCTCTATCCAAAAGCT ATGTACCTTGCAAGAGGAAATCATGAAAGCAAGAGCATGAACAAAATATATGGCTTTGAG GGGGAAGTGAGGTCAAAACTGGGCGAAAAGTTTGTTGAACTTTTTGCTGAAGTCTTTTGT TGGTTACCTCTTGCGCATGTCATCAACAACAAGGTCTTTGTGGTTCATGGAGGGCTATTT AGTGTTGATGGGGTGAAACTTTCAGACATCAGGTCCATTGATCGTTTCTGTGAACCACCT GAAGAAGGTCTAATGTGTGAACTACTATGGAGTGACCCTCAGCCTCAGCTTGGAAGAGGT CCAAGCAAACGTGGTGTTGCTCTTTCCTTTGGCGCAGATGTGACTAAGAAGTTTCTACAG GAAAATAACCTGGATCTTATTGTCCGGTCCCATGAAGTAAAGGATGAAGGCCATGAAATT GAACATGATGGGAAGCTTATAACAGTCTTCTCTGCGCCTAATTACTGTGACCAGATGGGC AACAAGGGTGCATTTATTCGCTTCACAGCTCCAGAAATGAAACCAGATATTGTTACTTTC TCAGCTGTGCCACACCCTGATGTGAGGCCGATGGCGTATGCAAATAACTTCCTCAGGATG TTTCAATGA

Peptide Sequence

PEP ID	EES17868
PEP Infomation	pep chromosome:Sorghum_bicolor_NCBIv3:9:9886462:9899365:1 gene:SORBI_3009G075800 transcript:EES17868 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding description:hypothetical protein
Sequence	MDATATDLQRAEEFKLKANDAFKANKFSQAIELYSQAIELNSSNAVYWANRAFAHTKLEE YGSAVQDATKAIEIDPRYSKGYYRRGAAYLAMGKFKEALKDFQQVKKICPNDPDATRKLK ECEKAVQKIRFEEAISVGDAERGSVADSIDYHIIEVEPHYAGPRIDGEEITIDFVKAMLD EFKKQKCIHKRYAYQIVLKTLDLLRSMPSLVDVNVPNGGHFTVCGDVHGQYFDLLNIFDL NGLPSEENPYLFNGDFVDRGSFSVEVILTLFAFKCLYPKAMYLARGNHESKSMNKIYGFE GEVRSKLGEKFVELFAEVFCWLPLAHVINNKVFVVHGGLFSVDGVKLSDIRSIDRFCEPP EEGLMCELLWSDPQPQLGRGPSKRGVALSFGADVTKKFLQENNLDLIVRSHEVKDEGHEI EHDGKLITVFSAPNYCDQMGNKGAFIRFTAPEMKPDIVTFSAVPHPDVRPMAYANNFLRM FQ

Transcript Sequence

Transcript ID	EES17868
Transcript Infomation	cdna chromosome:Sorghum_bicolor_NCBIv3:9:9886462:9899365:1 gene:SORBI_3009G075800 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding description:hypothetical protein
Sequence	GTACGCTGCAAGCAAAACCCTACCCTGCCTTTTGTTTTCCTCCATCACCCCCAGCGTGGT AGCGTGCGCTTAACACCCCGCCTTCGACGACTGCGCCGCCCGTCGCTGCCGCAGCCGTCC TACTTCGGCCCCTTACTTCGCCCCCTTCGTCGGCGACGAGCAACACCAGGTACGCCCTCC GCGTGGTCTTCCCTTCCTGCTGTCGGAAGCCGTGCGCCCAAACCCTAACTTACTATTCGT AGGTACGCCGCCCCTTGGTCTCCGCTTACTGCTGTGCGAAGCCGTGCGCCCAAACCCTAA CATACTATTCGTATTCAGATCTGAATCTAATTACAAGTGCATATGCTTGTATTATGCCTG CTAACTGCGATTGCTTAGCAAAAAATTATCGGGTGTACATGTGGACGCCCATGTTCTTAA CTGGGTCAGCCCCTGTCTTGTGTTAAGATATCCCTTTTTGCTGTGCGAACCATGCTGCTG CGAAAGATACTTGAAAACCTGCGTTTTGTGCTCCCAATGGATGTGCTGTTCAACAGTGAT GCCCCCTAGGACTGTCATTATGTTTAATTGCGTTGTAGTTTCTTGCTGGGGTCATTTGGT AGAACTAAAGTGATCAGCACCTACCAAAAATATTGTTTAGTTGTTCCACAGTTTTATAGA GGCATACTTGTTTGTTTTCCTTTTGTCTTTAATGTTATACTTTGGCCATTGGTTCCTCAC AAAATATATCATTTGCGACTAGGAAACTGATGTAGTTTGGAAGCATTTTGAAATATCAAT CTAGCTGTATAATTTCTATGCACTGAACATACTTATAATTTATACTCCCCTGTCCACAAA TGTATGTGTTTGTAAGATGTTTAAGACAGATTAAGGAGAAAGGGAGATGACTATGATGCC CCTCAATCAATCACTTAGGCTAGTCTCAATTTCATGAGAGTATCATGCACATTAAATAGG GTGCCACATAAGCAAAATTGCTGACTTGGCAGGGGCAATAAATGAAGGAGTTTCATCAGA TGAGAGAGGAGTTTCATCCCCATGAAACTCATGTGGCCCGGTTACCTAGTTTATAGTCTT GGTAACTGTGCCATGAAACTATGCATTGAGACTGACCTTACAGAGATGCAATTAATGCCT TTCTTTTCTATTGATACTATAAATGTCATGCGCTAATTAAATTTTTAGACACCAAGTTAG AGCATCTCCAGCAATCGCTCTATGGAGTGTTTGGTTGGTGGATAGAGGTTGCATTGCATA TCCTGGTTGGGTGGATGCAGGCTGAGTGGAACTATATTTCATAAAAACAAGATATGGTGA GGTTGCATGAGCGGATGCCAAGAAAGGGAGATGCTGTTTGGTTGCTTGCATGAGCAGATG CAGTCTACCAAACCTGAGAGGATGACATGTGGGGCCACATTAAGAACACTGCTTCCACCC AGCTAGGATGGCCAGTGAAGTTCATTTTGAGCGTATCCACTGGGCCGCAACCAAACAAGC TTCTTTTTCATATTATATGGATCCACACAGCCAGGATGAAGGAGATGCAGGCAACCAAAC ACACCCCTAAGACCCACTCGGTAAGGGCACGTACAACGCAGCACTCTTAGCAGACACCTA AGGACAGTTATTAAATTCCCATGCCATGTTAAGCTACCTTGAAGCATCATGGGCGCTTGC ATGCTGAATCGACGCTCGCATAGGCTTCTTGTGCTTCAATCTTCTACAGTAGCCTCACAC TTGTCTCCAAGTAAGAAATAACTACATTATGATGTAAATGCATTGGGCGGCCAAGTGCTT AAACAAGCTCCTAAATTTACCAATTTAAACATGTGTGAAATAATTGTTTCCATTTTAGAT TGGCTCTTGTGGAAAAGCTTACTGATGTAGTGTTTGTTCTCTCTCTTTAAGTGTCTATAT AAGCATCTTTGCGTTTTTCACACCCTAAATCCTCATTTGGAGAGCTGTTCCAAAAAAATC CAGTCTAGTCACATAAAACAGGGTCGAAGGCATTGACACCTGACCCAGGAACATTGTCCC CAACCTGGCTACATGGGACCATTTTTGACCCCGCCATATAAAAACCTGTCGCAAGTAACG TACCATGTTCTACGACCCAATCCACCTGGGATCTCTGTGACTTTGCTCTATATACGTGCA CTAAATCATGCTCCCATATATGGGTCAATCGATGTTACGGCTGATGATCCTCCTGACATT GTAAAGATTGTAGTTGCTCGCAATTGTGCTGAGCTATCGATAAGTAATATAAGGCCCTAG AGCCAAGCTTGAATTGAAAAAAAATTCATGCTCCCATATATTCTATTGGGCTAGAATGTA CCTTTGCACCTAGGCTGGAGTGGCCCAGACAGCCCATATATGCACCTAAAATATAATTTC GTTTCTTTTTGCTATCCAATCAGAATGTTCCTTTCTGGCCACAGAAGCCATTGCCTTGCC CTGTGCCCCTGTTTTCTGTCATCTGCATAAGCAAAAGCAAGCACATATTCACATGCCACA AACAACGGAGGCTGGCTCACCTGCGGAGGCTATCCGTGCTGCTTGCCTGGCGTGGCAGGG ACCATATCTGGGAAGGGGACACGCTAGGGCAGCCAACCTCAGGTGGATCTGGTGTCGTTG CTGAAGTGGCAGTGGTCGGCCTGCACTTAGAGATGTGAACTCAATTGGTAGTCACATACA TCCAGTGAATAGCGACGGGTTTGCTTGTGTGCAACTGAATCAGAGCCAGCATCAGTAGGT TGGCATGTGGAGCAGTCGGCGATGGTACCATATGGGTATGGGAAGAGGAAGGAATGACTT GAGATATCTGCAAGAAGCGGCGGTGTAACACTTTGGAGAACCAGCGGGCTTCTCACCAAG TGGAGATCAAGAATTATGGTTTTGGCGCGATGGAAAAGTTGTTGGAGCCATAGTTTTTGT GTATGTTATCTGAAACATATGATGTAGCTCTGAATAGAGCTTCTCTTGGAGATGCTTTTA TGTTGGCGGATAAAATTAATGATGAGGGAGGGGTGGGGTAAATTATGCTAAAAATGCTTA CATTTTTGGACAAACTTTGAATGCTAAAAATGCTTATTTGTGGACGGTGGGAGTGAATTT TGATTTCCCAAAATAAAATAAGCTCTGCATATTTGGATGGAGGGAGTACATGATTAGGAG CTGTAATAACTTCATGAAACATGATGTGCCTTAGAGTCTGTAGGGAAGTGCTTACCAAGT AAAGTTAACATCATGAAAAATACCAAATATGTTGTATAAAAGGAAAGTAGAACAGAGGTC CTTGCTTGGAGAATAGCTGGTCCTTCCTTGTTTGGAACTCCAATTGTATATATAAGAGTA ACTGAGAGATGGGGCTGTTCTTTTGAAATTTTAGAGTTAAATGCATGAGCGGCCCCTGAA CTTGTCAAGAGGTATCACTTAGGTCCACAAACTCTAAAAGTGCATTTCTGGGTCCCTGTT CTTGTTATATGGTAAACCATAGGTCCATGCCAGCCACATGGATATTTGTTGCTGATATGG CATGACAGCATGGTGTATATTTTTATGTTGAGGTCCTTTTCCTTGGAAAATACACCCTGC TTTTCGCGTCCACAAAAAGTAGCCGCACACCACGGCGGATGCCAAGCAGCAGCAACAGCC AACAGCACACTGCGCATGAGAAGCAACAGCTGACCATAGCTCACTCCGCTGTCGGCTGAC GCGGGGGTGGTCGGGTGGGTCCTGGGTTGCTGTGGCCGTGTGCCATCCACGAGACCACGA CGCAACGGTGAGCACTGGCTTCACAGGCACGTGTGTGGTGGCCTCCAGCCGACAGTACCG TGGTCTCCCGTCCACCTCCGCTGGTGCGGACACGCAGGAGCTGCTGGACACGGAAGATGC TGATGCACGTTGTGCTGTTGCTGCTGCTTCGCGACCGTCATGGTGTCTGGCTGCTTTGCT TGGGCACGAGAAGGCAGGGCCTATGGTCTATTTTCCAAGTAAAAAGGGTCTAAATATAAA ATGCATGCTACCACATAAGCAACAAATGATCGTGTGGCTAATATGGACCTGCGGTGCACG ATATAACAAGAATAGGGACCCAGAAATGCATTTTCTGAGTTCGTAGATCTAAGTGACACC TCTTGACAAGTTCAGGGGCTACTCATGCAATTTAACTCAATCTTTTATGTCTTGATTCTA TCTGATTGTTGTGACATGAGATTAGGTTTGGGCATATAATGTGTTCATAAATGGGGGAGG ATATTGGGCTGGAGCTTGGGTCATTCCCAAAAAGCCCAACTTTAGTGTTTAGGTTTAGGG GTGAAAAAGAGGAAGCTAAGTTTCAGGGGAGGAAGCCAAGTTTCAGGGTCGAGTAAAAGG CATGCAAAATGGTTTCTGTAGAAAAGTGGAACCTTTAATGAGAAGGTATCTGGTGGACCC GATGTCAAAATCATATCCTTGGAGTTGTGGGTGATACTGAGAGATGGGCTTGTGATGTGG ACTAGTACCTGGAGTAACCGGTAAGGGTTGTGATGATATTGCTCTAGGAGATGGATGGTT CTGTTAGGACTGCACAGCGAGGTTTGTGCTGCAGAATTTTGCGAGGTTGGCTTCATGCTC CTTTGCTACTGGTTTATCATGAAAGGACTACTGACTGCTACTGGTTTATCATGATACGAC TACTGACTACCCTCCTATATTCTACACTCTAAGTGAATAATTAAGTAGGAAGCTGAGCTA GCAGTCGGTCAAGGGTGTGGATGTATGGCCAGACCACACAAGTTCAAGTCCTCGCCAAGG CGAATTCATGTGCCTATTTTCTTCTTAATAAAATGCCACCTAGTTCTTCTACGTTGGTCT ATTTTTTAAAGTGAATAATTAGCAGCTATAGTTCTACTTCTCTAGAAACATTGTGATCTC ATTAAGTTGTTAATTTCCACTTTTAGTATGTGTGTGTTATAGTGAGGGCCTGAGTGCATT AGAACTTGGGGGTGCATATTTTCAAATGCTGTCTTTGTGTGATGTTCTACTGTCGTGAAA CTATGGATCGTAAGTTTCTAGAAAAGGTGCTAAAGCATCTATCTTTCAGTTATGCTTGTG TGTGATACTCTTGTACTTCCTTTGTTCTTTCACTAACTCATTTACTTTTTGCACACGCAG TTTGTGGATAAAGGGTCTTTAAGTCTTCATATGAAATTATCCTTTTGGTAGGCAGCTGAA GGATAATAACTATCATGGATGCTACTGCAACAGATCTGCAAAGGGCTGAGGAATTTAAAC TTAAGGCGAATGATGCCTTCAAGGCAAACAAGTTCTCTCAGGCTATAGAGCTTTACAGTC AAGCCATTGAGCTGAATAGTTCGAATGCAGTTTACTGGGCAAACCGTGCATTTGCACACA CAAAATTAGAGGAATACGGAAGTGCTGTGCAGGATGCTACGAAAGCCATCGAAATTGATC CTAGATATTCAAAAGGTTATTATAGACGTGGCGCAGCGTATCTTGCCATGGGAAAGTTCA AGGAAGCCCTAAAGGATTTTCAGCAGGTTAAAAAAATCTGTCCGAATGATCCAGACGCTA CAAGAAAGTTGAAAGAGTGTGAGAAAGCTGTCCAAAAAATCCGTTTTGAAGAAGCAATTT CTGTTGGAGATGCTGAGAGGGGCTCCGTGGCAGACTCCATCGACTACCATATCATAGAAG TAGAGCCACACTACGCGGGACCAAGAATTGATGGCGAAGAAATAACGATAGATTTTGTCA AAGCAATGTTGGATGAATTTAAGAAGCAGAAATGCATACATAAAAGATATGCTTATCAGA TTGTTCTAAAAACCTTGGATTTGCTACGTTCGATGCCTTCCCTTGTTGATGTGAATGTTC CAAACGGTGGGCATTTTACAGTTTGCGGTGATGTGCATGGTCAGTACTTTGATTTGCTCA ACATATTTGACCTCAATGGGCTTCCCTCAGAAGAAAATCCTTACCTCTTCAATGGTGATT TTGTGGACAGAGGATCTTTCTCTGTTGAAGTCATACTCACGCTTTTTGCTTTCAAGTGCC TCTATCCAAAAGCTATGTACCTTGCAAGAGGAAATCATGAAAGCAAGAGCATGAACAAAA TATATGGCTTTGAGGGGGAAGTGAGGTCAAAACTGGGCGAAAAGTTTGTTGAACTTTTTG CTGAAGTCTTTTGTTGGTTACCTCTTGCGCATGTCATCAACAACAAGGTCTTTGTGGTTC ATGGAGGGCTATTTAGTGTTGATGGGGTGAAACTTTCAGACATCAGGTCCATTGATCGTT TCTGTGAACCACCTGAAGAAGGTCTAATGTGTGAACTACTATGGAGTGACCCTCAGCCTC AGCTTGGAAGAGGTCCAAGCAAACGTGGTGTTGCTCTTTCCTTTGGCGCAGATGTGACTA AGAAGTTTCTACAGGAAAATAACCTGGATCTTATTGTCCGGTCCCATGAAGTAAAGGATG AAGGCCATGAAATTGAACATGATGGGAAGCTTATAACAGTCTTCTCTGCGCCTAATTACT GTGACCAGATGGGCAACAAGGGTGCATTTATTCGCTTCACAGCTCCAGAAATGAAACCAG ATATTGTTACTTTCTCAGCTGTGCCACACCCTGATGTGAGGCCGATGGCGTATGCAAATA ACTTCCTCAGGATGTTTCAATGACAGAATATAGCAACCTTGTCTAGCAATTTTTATCAGA TGAGTCTATTGTTTGTCAGCTCCCAACACATTTCTTGCTAGGTTCAAGTGTATGCTCTGT ACAACAAATCAAGTGATGTAAGGGATTCAATTGTCGATTTACTGGGACGTTGCATCAATT TTTGTGCTCGAGTTGTCATTCTTGTAACCATCAGTAAACAGCCTTAGATCATTAGATTCT AGTTTACTTGTAAAATTGCTAAATCGTCATTTCCTTTATTTATTTATCAGCTAAGTTATA CACATGTTTAGTGCTTCTATCAAATTATTATGTGTGTGCCTCAGTAGTATTATCTGAGTA ATCCTTACATTT