Gene sequences

How To ▶︎

JA

EN

TOP > About the Species(Sorghum bicolor ) > genome data >Gene sequences

Search

By Traits

Let’s Analyze!!

SNP Detection
(lang=JA only)

Other Tools

Data List

All

Trait-Related Loci

Sorghum bicolor

CDS Sequence

CDS ID	EES15346
CDS Infomation	cds chromosome:Sorghum_bicolor_NCBIv3:7:63226192:63230100:-1 gene:SORBI_3007G201400 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding description:hypothetical protein
Sequence	ATGGCGACGCCTCCGCTCTCCTCCGTTTCCACTCACCACCGTGCCCCACCACCATGGCCG CCTCCCAAGACTGCCACCAGTCCACGAACAAACTTCCGTTGTGGCGTGCTGGCGCCACCG GCCGGCCAAGTTATAGAGGCGGCCGCCGCTGCTCCAAGCCCAAGAAACCCGCCCAGTCGG GTCCTGAGCTCCGACGTGAACCTGCGAATCCAGCGCCTCTGTCAGGCGGGTGACCTCGCG GCCGCTCTGAGGTTGCTGGGCTCTGACGGCGGCGTCGGTGTGCGGAGCTACTGCGCGGTC GTTCAGCTCTGCGGGGAGGAGCGGTCGTTGGAGGCTGCGAGGAGAGCTCATGCCTTGGTT CGTGCTGGAACTGGTGGAATAATCGGGAGCGTCCTTGGGAAGAGGTTAGTGCTAGCGTAC CTGAAATGCGGCGACTTGGGCGGGGCAAGGATGGTGTTTGATGAAATGCCTCCTCGAGTC GCTGATGTCCGTGTCTGGACTTCGCTGATGAGCGCGTACGCGAAGGCTGGTGATTTCCAG GAAGGCGTTTCGCTGTTCAGGCAGATGCAGTGCTGCGGGGTTAGTCCGGACGCGCATGCT GTTTCCTGTGTCCTCAAGTGCATTGCCAGTTTGGGCAGCATTACAGAAGGCGAGGTGATT CATGGATTACTTGAGAAGTTGGGTCTTGGGGAAGCATGTGCGGTTGCTAATGCTCTGATT GCGTTGTACTCAAGGTGTGGTTGTATGGAGGATGCCATGCAGGTATTTGACAGTATGCAT GCCCGGGATGCCATCTCTTGGAATTCTACGATCAGTGGATATTTTTCAAACGGATGGCAT GATAGGGCTGTTGATCTTTTCAGCAAGATGTGGTCTGAAGGTACGGAGATTAGTTCAGTG ACAGTGCTCAGTGTTTTGCCTGCTTGTGCAGAATTAGGTTTTGAGCTTGTTGGAAAAGTG GTGCATGGTTATTCCATGAAATCTGGATTGCTTTGGGACCTTGAATCTGTACAAAGTGGG ATAGATGAGGCTCTTGGATCCAAATTGGTATTCATGTATGTGAAATGTGGTGACATGGGC TCTGCAAGAAGGGTGTTTGATGCAATGCCCTCAAAAGGTAATGTGCATGTATGGAATCTG ATAATGGGTGGGTATGCAAAGGCTGCTGAATTTGAAGAAAGTCTCTTGCTTTTTGAGCAA ATGCATGAACTTGGAATTACCCCAGATGAACATGCCCTTTCTTGCCTTCTGAAGTGTATC ACTTGTTTGTCATGTGCCAGGGATGGCTTGGTAGCTCATGGATATCTAGTAAAATTGGGT TTCGGGACACAGTGTGCAGTTTGCAATGCACTGATATCATTCTATGCAAAATCCAACATG ATTGACAATGCAGTCTTGGTGTTCGATAGAATGCCTCATCAAGATACCATTTCTTGGAAT TCTGTGATTAGTGGGTGCACTTCCAATGGATTAAACAGTGAAGCTATTGAGTTGTTCGTA AGAATGTGGATGCAAGGACACGAGCTGGACTCAACTACGTTGCTAAGTGTTTTGCCAGCT TGTGCGCGGTCACACTATTGGTTTGTAGGAAGGGTGGTTCATGGTTACTCGGTCAAAACT GGATTGATTGGGGAGACATCTCTTGCAAATGCTCTTCTTGATATGTACTCAAATTGCTCA GATTGGCATAGCACCAATCAGATATTCAGAAACATGGCTCAAAAAAACGTGGTGTCTTGG ACAGCAATGATCACAAGTTATACCAGGGCTGGGCTGTTTGACAAAGTGGCTGGGTTACTG CAAGAGATGGTATTAGATGGTATCAAACCTGATGTATTTGCAGTCACGAGTGTCCTTCAT GGTTTTGCTGGTGATGAATCTTTGAAACAAGGCAAATCTGTCCATGGGTACGCCATCAGA AATGGAATGGAGAAGCTTCTTCCTGTTGCAAATGCACTTATGGAAATGTATGTGAATTGC AGGAATATGGAAGAAGCACGGTTGGTTTTTGACCATGTGACAAATAAGGATATAATCTCA TGGAATACACTAATAGGAGGTTACTCCAGAAATAATTTTGCCAATGAATCCTTCAGTTTG TTCAGTGACATGTTGCTCCAATTCAAACCCAATACAGTGACCATGACCTGCATCCTTCCT GCTGTTGCAAGCATTTCATCTTTGGAGCGAGGCAGGGAGATACATGCTTATGCACTTCGA AGAGGATTCCTGGAAGATAGTTATACATCCAATGCGCTTGTGGACATGTATGTTAAATGT GGTGCGTTACTGGTAGCTCGAGTTTTGTTTGACCGGTTGACTAAGAAGAACCTCATATCA TGGACCATCATGATTGCTGGATATGGCATGCATGGTTGTGGAAAAGATGCTGTTGCCCTC TTTGAGCAGATGAGAGGCAGTGGTGTTGAACCAGACACGGCCTCTTTCAGTGCCATATTG TATGCTTGCTGCCATTCTGGTCTTACAGCTGAGGGGTGGAAATTCTTCAATGCTATGCGA AAGGAATACAAAATAGAGCCCAAACTGAAGCACTACACCTGTATTGTTGACCTGCTTAGC CATACCGGAAATCTGAAGGAGGCCTTTGAGTTCATCGAGTCAATGCCGATTGAACCTGAT TCAAGCATTTGGGTATCATTGCTGCACGGATGTAGAATTCACAGGGATGTCAAGCTTGCG GAGAAGGTAGCAGACAGGGTTTTCAAGCTGGAACCTGAGAACACAGGGTACTATGTTCTT CTTGCCAACATCTATGCTGAGGCTGAGAGATGGGAGGCTGTCAAGAAGCTCAAGAACAAG ATTGGTGGTCGAGGGCTCCGTGAGAACACTGGCTGCAGTTGGATTGAGGTCAGGGGCAAG GTTCATGTCTTTATCGCTGATAATCGGAATCACCCAGAATGGAACAGGATTGCAGAGTTT CTGGATCATGTTGCCAGAAGGATGCGGGAAGAAGGTCATGATCCTAAGAAAAAGTATTCT CTGATGGGTGCCAATGATGCAGTTCATGATGAGGCACTATGTGGACACAGCTCAAAGCTC GCTGTCACATTCGGTGTGCTGCATTTACCGGAAGGGCGGCCAATCCGTGTGACAAAGAAC TCAAAAGTCTGCAGTCACTGCCATGAGGCTGCCAAGTTCATATCCAAGATGTGCAACAGA GAGATCATTCTGAGAGATTCAAGCAGGTTCCATCATTTTGAAGGAGGCAGATGTTCTTGC AGGGGGCACTTCTGA

Peptide Sequence

PEP ID	EES15346
PEP Infomation	pep chromosome:Sorghum_bicolor_NCBIv3:7:63226192:63230100:-1 gene:SORBI_3007G201400 transcript:EES15346 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding description:hypothetical protein
Sequence	MATPPLSSVSTHHRAPPPWPPPKTATSPRTNFRCGVLAPPAGQVIEAAAAAPSPRNPPSR VLSSDVNLRIQRLCQAGDLAAALRLLGSDGGVGVRSYCAVVQLCGEERSLEAARRAHALV RAGTGGIIGSVLGKRLVLAYLKCGDLGGARMVFDEMPPRVADVRVWTSLMSAYAKAGDFQ EGVSLFRQMQCCGVSPDAHAVSCVLKCIASLGSITEGEVIHGLLEKLGLGEACAVANALI ALYSRCGCMEDAMQVFDSMHARDAISWNSTISGYFSNGWHDRAVDLFSKMWSEGTEISSV TVLSVLPACAELGFELVGKVVHGYSMKSGLLWDLESVQSGIDEALGSKLVFMYVKCGDMG SARRVFDAMPSKGNVHVWNLIMGGYAKAAEFEESLLLFEQMHELGITPDEHALSCLLKCI TCLSCARDGLVAHGYLVKLGFGTQCAVCNALISFYAKSNMIDNAVLVFDRMPHQDTISWN SVISGCTSNGLNSEAIELFVRMWMQGHELDSTTLLSVLPACARSHYWFVGRVVHGYSVKT GLIGETSLANALLDMYSNCSDWHSTNQIFRNMAQKNVVSWTAMITSYTRAGLFDKVAGLL QEMVLDGIKPDVFAVTSVLHGFAGDESLKQGKSVHGYAIRNGMEKLLPVANALMEMYVNC RNMEEARLVFDHVTNKDIISWNTLIGGYSRNNFANESFSLFSDMLLQFKPNTVTMTCILP AVASISSLERGREIHAYALRRGFLEDSYTSNALVDMYVKCGALLVARVLFDRLTKKNLIS WTIMIAGYGMHGCGKDAVALFEQMRGSGVEPDTASFSAILYACCHSGLTAEGWKFFNAMR KEYKIEPKLKHYTCIVDLLSHTGNLKEAFEFIESMPIEPDSSIWVSLLHGCRIHRDVKLA EKVADRVFKLEPENTGYYVLLANIYAEAERWEAVKKLKNKIGGRGLRENTGCSWIEVRGK VHVFIADNRNHPEWNRIAEFLDHVARRMREEGHDPKKKYSLMGANDAVHDEALCGHSSKL AVTFGVLHLPEGRPIRVTKNSKVCSHCHEAAKFISKMCNREIILRDSSRFHHFEGGRCSC RGHF

Transcript Sequence

Transcript ID	EES15346
Transcript Infomation	cdna chromosome:Sorghum_bicolor_NCBIv3:7:63226192:63230100:-1 gene:SORBI_3007G201400 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding description:hypothetical protein
Sequence	TTTCACCTTTGGCCTTTTCCCTCCTCTGTCCCATTCCTGCGCCGCGCTCTCGGCCTCTTG CCCGCCCGCCCGGCGCCCGCCCCCTGCCGCCGTCGCGCGCGCTACGCGCCGCCTGTCAGC GCGCCGGTCGTCCCGCCTCCGCCTCCAATCAAGCAAAGCCAACTAAACTGCGACACAGAA AATACCCACTGCATTTGGCGGCCGAATTCGAACTCTGCTCCTCCCAGCCTCCGTCCTCCA TGGCGACGCCTCCGCTCTCCTCCGTTTCCACTCACCACCGTGCCCCACCACCATGGCCGC CTCCCAAGACTGCCACCAGTCCACGAACAAACTTCCGTTGTGGCGTGCTGGCGCCACCGG CCGGCCAAGTTATAGAGGCGGCCGCCGCTGCTCCAAGCCCAAGAAACCCGCCCAGTCGGG TCCTGAGCTCCGACGTGAACCTGCGAATCCAGCGCCTCTGTCAGGCGGGTGACCTCGCGG CCGCTCTGAGGTTGCTGGGCTCTGACGGCGGCGTCGGTGTGCGGAGCTACTGCGCGGTCG TTCAGCTCTGCGGGGAGGAGCGGTCGTTGGAGGCTGCGAGGAGAGCTCATGCCTTGGTTC GTGCTGGAACTGGTGGAATAATCGGGAGCGTCCTTGGGAAGAGGTTAGTGCTAGCGTACC TGAAATGCGGCGACTTGGGCGGGGCAAGGATGGTGTTTGATGAAATGCCTCCTCGAGTCG CTGATGTCCGTGTCTGGACTTCGCTGATGAGCGCGTACGCGAAGGCTGGTGATTTCCAGG AAGGCGTTTCGCTGTTCAGGCAGATGCAGTGCTGCGGGGTTAGTCCGGACGCGCATGCTG TTTCCTGTGTCCTCAAGTGCATTGCCAGTTTGGGCAGCATTACAGAAGGCGAGGTGATTC ATGGATTACTTGAGAAGTTGGGTCTTGGGGAAGCATGTGCGGTTGCTAATGCTCTGATTG CGTTGTACTCAAGGTGTGGTTGTATGGAGGATGCCATGCAGGTATTTGACAGTATGCATG CCCGGGATGCCATCTCTTGGAATTCTACGATCAGTGGATATTTTTCAAACGGATGGCATG ATAGGGCTGTTGATCTTTTCAGCAAGATGTGGTCTGAAGGTACGGAGATTAGTTCAGTGA CAGTGCTCAGTGTTTTGCCTGCTTGTGCAGAATTAGGTTTTGAGCTTGTTGGAAAAGTGG TGCATGGTTATTCCATGAAATCTGGATTGCTTTGGGACCTTGAATCTGTACAAAGTGGGA TAGATGAGGCTCTTGGATCCAAATTGGTATTCATGTATGTGAAATGTGGTGACATGGGCT CTGCAAGAAGGGTGTTTGATGCAATGCCCTCAAAAGGTAATGTGCATGTATGGAATCTGA TAATGGGTGGGTATGCAAAGGCTGCTGAATTTGAAGAAAGTCTCTTGCTTTTTGAGCAAA TGCATGAACTTGGAATTACCCCAGATGAACATGCCCTTTCTTGCCTTCTGAAGTGTATCA CTTGTTTGTCATGTGCCAGGGATGGCTTGGTAGCTCATGGATATCTAGTAAAATTGGGTT TCGGGACACAGTGTGCAGTTTGCAATGCACTGATATCATTCTATGCAAAATCCAACATGA TTGACAATGCAGTCTTGGTGTTCGATAGAATGCCTCATCAAGATACCATTTCTTGGAATT CTGTGATTAGTGGGTGCACTTCCAATGGATTAAACAGTGAAGCTATTGAGTTGTTCGTAA GAATGTGGATGCAAGGACACGAGCTGGACTCAACTACGTTGCTAAGTGTTTTGCCAGCTT GTGCGCGGTCACACTATTGGTTTGTAGGAAGGGTGGTTCATGGTTACTCGGTCAAAACTG GATTGATTGGGGAGACATCTCTTGCAAATGCTCTTCTTGATATGTACTCAAATTGCTCAG ATTGGCATAGCACCAATCAGATATTCAGAAACATGGCTCAAAAAAACGTGGTGTCTTGGA CAGCAATGATCACAAGTTATACCAGGGCTGGGCTGTTTGACAAAGTGGCTGGGTTACTGC AAGAGATGGTATTAGATGGTATCAAACCTGATGTATTTGCAGTCACGAGTGTCCTTCATG GTTTTGCTGGTGATGAATCTTTGAAACAAGGCAAATCTGTCCATGGGTACGCCATCAGAA ATGGAATGGAGAAGCTTCTTCCTGTTGCAAATGCACTTATGGAAATGTATGTGAATTGCA GGAATATGGAAGAAGCACGGTTGGTTTTTGACCATGTGACAAATAAGGATATAATCTCAT GGAATACACTAATAGGAGGTTACTCCAGAAATAATTTTGCCAATGAATCCTTCAGTTTGT TCAGTGACATGTTGCTCCAATTCAAACCCAATACAGTGACCATGACCTGCATCCTTCCTG CTGTTGCAAGCATTTCATCTTTGGAGCGAGGCAGGGAGATACATGCTTATGCACTTCGAA GAGGATTCCTGGAAGATAGTTATACATCCAATGCGCTTGTGGACATGTATGTTAAATGTG GTGCGTTACTGGTAGCTCGAGTTTTGTTTGACCGGTTGACTAAGAAGAACCTCATATCAT GGACCATCATGATTGCTGGATATGGCATGCATGGTTGTGGAAAAGATGCTGTTGCCCTCT TTGAGCAGATGAGAGGCAGTGGTGTTGAACCAGACACGGCCTCTTTCAGTGCCATATTGT ATGCTTGCTGCCATTCTGGTCTTACAGCTGAGGGGTGGAAATTCTTCAATGCTATGCGAA AGGAATACAAAATAGAGCCCAAACTGAAGCACTACACCTGTATTGTTGACCTGCTTAGCC ATACCGGAAATCTGAAGGAGGCCTTTGAGTTCATCGAGTCAATGCCGATTGAACCTGATT CAAGCATTTGGGTATCATTGCTGCACGGATGTAGAATTCACAGGGATGTCAAGCTTGCGG AGAAGGTAGCAGACAGGGTTTTCAAGCTGGAACCTGAGAACACAGGGTACTATGTTCTTC TTGCCAACATCTATGCTGAGGCTGAGAGATGGGAGGCTGTCAAGAAGCTCAAGAACAAGA TTGGTGGTCGAGGGCTCCGTGAGAACACTGGCTGCAGTTGGATTGAGGTCAGGGGCAAGG TTCATGTCTTTATCGCTGATAATCGGAATCACCCAGAATGGAACAGGATTGCAGAGTTTC TGGATCATGTTGCCAGAAGGATGCGGGAAGAAGGTCATGATCCTAAGAAAAAGTATTCTC TGATGGGTGCCAATGATGCAGTTCATGATGAGGCACTATGTGGACACAGCTCAAAGCTCG CTGTCACATTCGGTGTGCTGCATTTACCGGAAGGGCGGCCAATCCGTGTGACAAAGAACT CAAAAGTCTGCAGTCACTGCCATGAGGCTGCCAAGTTCATATCCAAGATGTGCAACAGAG AGATCATTCTGAGAGATTCAAGCAGGTTCCATCATTTTGAAGGAGGCAGATGTTCTTGCA GGGGGCACTTCTGAAAGAAACACCAGTCATGTAACTGTGGTTTTGTTTGTTCATTAGCAG AGAGCACATTTATTGCTACTAGCAGTTCTAGCACCACCATATAGCCTGCATGTGTAATGA TTTTCCTTTATAAAGATGAAGAGATGACATTAGAACGATGAGGGAAGAGACCTTTAGAAG GTAACAATTTTGTGTGTTCAGGAAATAAAAGCTACTGTCCATAGAAATGTAAAGAAATTT AATATATATAAAAGCATTTTGGCATCTTTTACTGAAAATATTGTTACAAGCAATCTGCAT TTGCCATGGTAATTAAAAATCCTTCCTTTAACTGCTGTGTTGTAGTGACAACACAGCAGA TGTGGGAGTTTTGAAAGTTCTTGGATCTAGAGTGATTTAGAACTCTGAATATGTAGCGGA ATTGTGGCT