Plant GARDEN
How To ▶︎

JA

EN

TOP > About the Species(Sorghum bicolor ) > genome data >Gene sequences

Search

By Species By Keywords Genes By Markers By Traits

Let’s Analyze!!

SNP Detection
(lang=JA only) Sequences Other Tools

Data List

All Markers Trait-Related Loci
Sorghum bicolor

CDS Sequence

CDS ID

EES13584
CDS Infomation

cds chromosome:Sorghum_bicolor_NCBIv3:7:11768032:11771979:1 gene:SORBI_3007G087100 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding description:hypothetical protein
Sequence

ATGGCTTCGCTGAGGATTAAAAGCCCAGCCGGTCCTCCGGAACTCAGAAGGCGCAATCTT
GCTAGAAACCCAGTCCATGTGGGGGATTTGGTTGGGTTTAGTTCCAAGATGTTGCCAATG
GGGGACCACAGGTGTGCAGGCAGCGCAGTCATCACAAGCCATGGTGTTGGATATGTTGGT
GCTGGGAGGAAGAGCTGTCCAGGGGCATTCTTGAAGAATGGTGTGGTCTGCTCTCTCGAC
GATAGTGGTGTCAGGGTGTCTACGCTGTGTTCATCTCTTCCATCTGAAGCTCTAAGTTTT
GGCAGCAAAATGTCATTAGTTAATTCAATGGGCTTTGCACAGAAGAAGAAAGGGTGTAAG
TTGTGGCGGAGATTACAGGGTGGTAAGAAATTGGTAAAGCATAGAGCTCCGAAGCATGGC
CTGGGAAAGGACAGGCATGGTCACAAATCTGCGGTTAAGGATGATGGTGTTGATGCGCTT
TTGTCCGGTATAAGCAAGGAGTCCAGCATTGAAGAGTGCAATTCTGCTCTGATCCGTCTT
GAGAAGCTCAGCGATGAGAAGGCTCTTAACTTCTTTGACTGGATGAAGGTTAACGGGAAG
CTAAAGGGGAATCCTCATGCATATCACCTAGCTCTTCAAGCCATTGCCTGGAAGGAGGAC
TGGAAGATGGCTGAACTGTTGCTTTGTGAAATGGTTGCTGATTCAGGTTGCACACTGGAT
GCTCGAGCATTTAATGGACTGATATATGTTTGTGCTAAAAGGAGGCTTGATGCTTGGGCA
ACAAAGTGGTTTCACATGATGCTTGAGAGAGAAGTGCAGCCGAACTTGTCTACCTTTGGT
ATGCTTATGGTCCTTTACCAGAAGACTGGGAAACTATCTGAGGCTGAATTCACTTTCCAA
AAAATGAGGAATTGCAATATCAAATGTGTCAATGCTTACTCAGCCATGATTACTTTGTAT
ACACGTTTAGGCCTCTTTGCCAAGTCCGAGGATACTATTAATCTAATGAACAATGATGGG
TTAGTTCCAAACATGGAAAATTGGTTGGTGCGGTTGAATGTGTACTGCCAACAGGGTAAA
ATGGAGGAGGCTGAATTGGTCTTGCAGTCCATGGTTGACGAAGGATTCACCCTGAATATT
GTAGCATACAACACTTTAATTACAGGATATGGAAAAAGTTCTGATGTGCAGAAGGCAAAC
AGAGTGTTTGATAGCCTTGGTAGTGCAGGTTTAGCTCCTGATGAAACCACCTATAGATCG
ATGGTAGAAGGTTTTGGTAGAGCAAATATATATGAAGAGGCAATTTTGTACTACAGGAAG
CTCAAGGGTGCTGGTTTCCGACCAAATGCATCCAACTTTTACACTATGATCAACCTACTA
GCAAGACGTGATGACAATGAAACTGCAGCTGAAATTATGGAGGACATGAGGGCAGCAGGC
TGTCAGTGTTCATCAATTGTTACTGTTCTTGTTCGGGCTTATGGAGCAGTAGGAAGAATG
CATAAGGTTCTTCCTATTCTACAAGCTTGTTTCAACAAGAAGATTTTGTTTGATGCTACC
TCATGCTCTATTTTGGTAACATCATTTGTTCAAAAGTCTTTACTGGAAGAAGCTTTGTAC
ATTCTGCGTGAAAAGAAATGGAAAGATTCTGCTTTTGAAGATAACTTATATCATATGTTG
ATATGTTCTTGCAAAGAGGGTGGCAGTTACAATGATGCTGTTAGGATATACAATCAGATG
CCTAAGTCTGAAACACATCCTAATCCCCGTATTTCTTGCACCATGATTGATGTCTTCAGC
ATGATGAAGAGGTTTGCCGATGCTGAAGCTATTTACCTTGAACTGAAGGCTTCAGCTTCT
GTACTTGATATGATTGCTTATAGTGTCATTGTGAGAATGTATATTAAAGCACAACGACTA
GAGGATGCTTGTTCAATTTTGGCAGAAATGGAGAAACAAAAAGAAATAATTCCTGATAAG
TATCTTTTTCTCGACATGCTTCGGACTTACCAAAAATGTGGTCTGCTCGAGAAGTTGGCT
GATACATATTACTGGATACGTAAGAGTCAAGTTGAATGTGATGAAGCCATGTATAACTGC
ATTATTAATTGCTGTGGGCGGGCCATACCTGTTGATGAGCTGTCCAGAATTTTTGATGAA
ATGATTCAACAGGGACACTTAGCAAACACTGTTACCCTCAATGTATTGCTAGATATATAT
GGAAAAGCTGGGCTTTTTAACAGGGCTGAAAAGGTCTTTATCATGGCTCGCAAGCAGGGC
CTGGCGGATATCATATCATACAATACCATTATTGCCGCATATGCAAAAAGTGGCAATTTT
CATAGTATGAATTATTTTGTCCAAATGATGCAGGATGCAGGGTTTCCTGTTTCTCCTGAG
GCATACAATTGTATGCTGGATGCTTATGGAAAAGCAGGGCAACTGGAAGAGTTTGCTTCT
GTTTTGCAGAAGATGAAGAGAGCAAAATGCAAGTTTGATCACTACACCTACAATATAATG
ATCAATATTTATGGGAGAAGGGGTTGGATAGAAGATGTTTCGAATGTTCTTGCAGAGCTA
AAGGACCGAGGTGTTGTGCCAGATCTGTACAGTTACAATACCTTGATAAAAGCATATGGG
ATAGCAAGAATGCCCGAAGATGCTGTCAAACTGATGCAAGAGATGAGGATTAAAGGCATC
AGCCCTGATCGGGTGACATATGCTAACCTCATTGCTGCCCTACAAAGGAATGAAAATTTC
CTAGAAGCTGTTAAATGGTCACTCTGGATGAGGCAAACAGGAGTTGTAGGGTGTGGAGCT
CGAGCATAA

Peptide Sequence

PEP ID

EES13584
PEP Infomation

pep chromosome:Sorghum_bicolor_NCBIv3:7:11768032:11771979:1 gene:SORBI_3007G087100 transcript:EES13584 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding description:hypothetical protein
Sequence

MASLRIKSPAGPPELRRRNLARNPVHVGDLVGFSSKMLPMGDHRCAGSAVITSHGVGYVG
AGRKSCPGAFLKNGVVCSLDDSGVRVSTLCSSLPSEALSFGSKMSLVNSMGFAQKKKGCK
LWRRLQGGKKLVKHRAPKHGLGKDRHGHKSAVKDDGVDALLSGISKESSIEECNSALIRL
EKLSDEKALNFFDWMKVNGKLKGNPHAYHLALQAIAWKEDWKMAELLLCEMVADSGCTLD
ARAFNGLIYVCAKRRLDAWATKWFHMMLEREVQPNLSTFGMLMVLYQKTGKLSEAEFTFQ
KMRNCNIKCVNAYSAMITLYTRLGLFAKSEDTINLMNNDGLVPNMENWLVRLNVYCQQGK
MEEAELVLQSMVDEGFTLNIVAYNTLITGYGKSSDVQKANRVFDSLGSAGLAPDETTYRS
MVEGFGRANIYEEAILYYRKLKGAGFRPNASNFYTMINLLARRDDNETAAEIMEDMRAAG
CQCSSIVTVLVRAYGAVGRMHKVLPILQACFNKKILFDATSCSILVTSFVQKSLLEEALY
ILREKKWKDSAFEDNLYHMLICSCKEGGSYNDAVRIYNQMPKSETHPNPRISCTMIDVFS
MMKRFADAEAIYLELKASASVLDMIAYSVIVRMYIKAQRLEDACSILAEMEKQKEIIPDK
YLFLDMLRTYQKCGLLEKLADTYYWIRKSQVECDEAMYNCIINCCGRAIPVDELSRIFDE
MIQQGHLANTVTLNVLLDIYGKAGLFNRAEKVFIMARKQGLADIISYNTIIAAYAKSGNF
HSMNYFVQMMQDAGFPVSPEAYNCMLDAYGKAGQLEEFASVLQKMKRAKCKFDHYTYNIM
INIYGRRGWIEDVSNVLAELKDRGVVPDLYSYNTLIKAYGIARMPEDAVKLMQEMRIKGI
SPDRVTYANLIAALQRNENFLEAVKWSLWMRQTGVVGCGARA

Transcript Sequence

Transcript ID

EES13584
Transcript Infomation

cdna chromosome:Sorghum_bicolor_NCBIv3:7:11768032:11771979:1 gene:SORBI_3007G087100 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding description:hypothetical protein
Sequence

TCACAGTCCATCTCCGACGTCACATTCACGACTCACGCGGCGGCCGCGTCGCCAAACCTC
GCCGCTCACCCGCTCTCACGGCCGATTCATCTCGCCGAAGCCACGACCGGAGTTGCGTTA
GCCCCCCTCCCGCACCCGCACCCTCCCCCCCAGCGGCGAGACCTCCTCTCTCACCTCCGC
CACTGGCGTGGCCGCTGCTGGTGGTGCGCTACGTCGCTAGCTCGGGGGCTCAGCGCACCT
TGTCATGAAGGGAAGGCGGCAGTCAGTGGCCCGGCGTATGCACTAGGCGCTCCTGCTCCT
CATCGTTGACCTTGTCCTCTAATCCGCCGCAGGTGAGCACGGTTTCCGTCCCCTCTTGCT
GTGTCCCCTCTGCCGTTCTGCATATCTCCCAAGCGAATTTCAAAATAGGCACTGCCGGTT
TAATCTTTGTTTTGCTCTAATGTGCAGGACTGCTTGGTTGAAACCCATGCCCGAATGGCT
TCGCTGAGGATTAAAAGCCCAGCCGGTCCTCCGGAACTCAGAAGGCGCAATCTTGCTAGA
AACCCAGTCCATGTGGGGGATTTGGTTGGGTTTAGTTCCAAGATGTTGCCAATGGGGGAC
CACAGGTGTGCAGGCAGCGCAGTCATCACAAGCCATGGTGTTGGATATGTTGGTGCTGGG
AGGAAGAGCTGTCCAGGGGCATTCTTGAAGAATGGTGTGGTCTGCTCTCTCGACGATAGT
GGTGTCAGGGTGTCTACGCTGTGTTCATCTCTTCCATCTGAAGCTCTAAGTTTTGGCAGC
AAAATGTCATTAGTTAATTCAATGGGCTTTGCACAGAAGAAGAAAGGGTGTAAGTTGTGG
CGGAGATTACAGGGTGGTAAGAAATTGGTAAAGCATAGAGCTCCGAAGCATGGCCTGGGA
AAGGACAGGCATGGTCACAAATCTGCGGTTAAGGATGATGGTGTTGATGCGCTTTTGTCC
GGTATAAGCAAGGAGTCCAGCATTGAAGAGTGCAATTCTGCTCTGATCCGTCTTGAGAAG
CTCAGCGATGAGAAGGCTCTTAACTTCTTTGACTGGATGAAGGTTAACGGGAAGCTAAAG
GGGAATCCTCATGCATATCACCTAGCTCTTCAAGCCATTGCCTGGAAGGAGGACTGGAAG
ATGGCTGAACTGTTGCTTTGTGAAATGGTTGCTGATTCAGGTTGCACACTGGATGCTCGA
GCATTTAATGGACTGATATATGTTTGTGCTAAAAGGAGGCTTGATGCTTGGGCAACAAAG
TGGTTTCACATGATGCTTGAGAGAGAAGTGCAGCCGAACTTGTCTACCTTTGGTATGCTT
ATGGTCCTTTACCAGAAGACTGGGAAACTATCTGAGGCTGAATTCACTTTCCAAAAAATG
AGGAATTGCAATATCAAATGTGTCAATGCTTACTCAGCCATGATTACTTTGTATACACGT
TTAGGCCTCTTTGCCAAGTCCGAGGATACTATTAATCTAATGAACAATGATGGGTTAGTT
CCAAACATGGAAAATTGGTTGGTGCGGTTGAATGTGTACTGCCAACAGGGTAAAATGGAG
GAGGCTGAATTGGTCTTGCAGTCCATGGTTGACGAAGGATTCACCCTGAATATTGTAGCA
TACAACACTTTAATTACAGGATATGGAAAAAGTTCTGATGTGCAGAAGGCAAACAGAGTG
TTTGATAGCCTTGGTAGTGCAGGTTTAGCTCCTGATGAAACCACCTATAGATCGATGGTA
GAAGGTTTTGGTAGAGCAAATATATATGAAGAGGCAATTTTGTACTACAGGAAGCTCAAG
GGTGCTGGTTTCCGACCAAATGCATCCAACTTTTACACTATGATCAACCTACTAGCAAGA
CGTGATGACAATGAAACTGCAGCTGAAATTATGGAGGACATGAGGGCAGCAGGCTGTCAG
TGTTCATCAATTGTTACTGTTCTTGTTCGGGCTTATGGAGCAGTAGGAAGAATGCATAAG
GTTCTTCCTATTCTACAAGCTTGTTTCAACAAGAAGATTTTGTTTGATGCTACCTCATGC
TCTATTTTGGTAACATCATTTGTTCAAAAGTCTTTACTGGAAGAAGCTTTGTACATTCTG
CGTGAAAAGAAATGGAAAGATTCTGCTTTTGAAGATAACTTATATCATATGTTGATATGT
TCTTGCAAAGAGGGTGGCAGTTACAATGATGCTGTTAGGATATACAATCAGATGCCTAAG
TCTGAAACACATCCTAATCCCCGTATTTCTTGCACCATGATTGATGTCTTCAGCATGATG
AAGAGGTTTGCCGATGCTGAAGCTATTTACCTTGAACTGAAGGCTTCAGCTTCTGTACTT
GATATGATTGCTTATAGTGTCATTGTGAGAATGTATATTAAAGCACAACGACTAGAGGAT
GCTTGTTCAATTTTGGCAGAAATGGAGAAACAAAAAGAAATAATTCCTGATAAGTATCTT
TTTCTCGACATGCTTCGGACTTACCAAAAATGTGGTCTGCTCGAGAAGTTGGCTGATACA
TATTACTGGATACGTAAGAGTCAAGTTGAATGTGATGAAGCCATGTATAACTGCATTATT
AATTGCTGTGGGCGGGCCATACCTGTTGATGAGCTGTCCAGAATTTTTGATGAAATGATT
CAACAGGGACACTTAGCAAACACTGTTACCCTCAATGTATTGCTAGATATATATGGAAAA
GCTGGGCTTTTTAACAGGGCTGAAAAGGTCTTTATCATGGCTCGCAAGCAGGGCCTGGCG
GATATCATATCATACAATACCATTATTGCCGCATATGCAAAAAGTGGCAATTTTCATAGT
ATGAATTATTTTGTCCAAATGATGCAGGATGCAGGGTTTCCTGTTTCTCCTGAGGCATAC
AATTGTATGCTGGATGCTTATGGAAAAGCAGGGCAACTGGAAGAGTTTGCTTCTGTTTTG
CAGAAGATGAAGAGAGCAAAATGCAAGTTTGATCACTACACCTACAATATAATGATCAAT
ATTTATGGGAGAAGGGGTTGGATAGAAGATGTTTCGAATGTTCTTGCAGAGCTAAAGGAC
CGAGGTGTTGTGCCAGATCTGTACAGTTACAATACCTTGATAAAAGCATATGGGATAGCA
AGAATGCCCGAAGATGCTGTCAAACTGATGCAAGAGATGAGGATTAAAGGCATCAGCCCT
GATCGGGTGACATATGCTAACCTCATTGCTGCCCTACAAAGGAATGAAAATTTCCTAGAA
GCTGTTAAATGGTCACTCTGGATGAGGCAAACAGGAGTTGTAGGGTGTGGAGCTCGAGCA
TAATATACCTGAAGTATTGGGTTTTGTTTTGAAATTGTCCAACTCAGAATTGTTGTCTTC
ATGTTGCAGTTGAGTACATACTTTCTATTGTACAGAAGAGTGTAGCTGATTGTTCTGCAA
GTGCTACAGACATTCAGAAACTTGTTCTCATACAGGATGAAATTCAGTCATGCAGGTAGG
AAGTTTTTATCATACCTATCATACTGTTGTAAATTTACATTAACAGTGGTTTGACCATCT
ATAGTCAAACAATGAAACAAGGAATACAGTTTGGAATTCACTTGTTCTTCAGTCTCTCAT
TGGGTGAGTACAATGTTGTCATTTCCTTCGTCTTCTCTGGAAAACTTTTGGCTTTGATTT
CTTTTTCACTACTAACATCATGCTAATACAATCTTTCACTTTCATTTGGATGCTTGTTCG
AGCCCTCTACACTTATTATGAATGGTTTGGTAGATGCAGCTGTGCACATTTGTGACCACC
CTATAAATACATTTGAGCTGCCTGAGATAGTGTAGCTTGTCCAGTCATAATATAGTTAAA
TGGTGGTCCTATATGTTGAATCCATGGAAGTGCTCGAGAGGATGATATTTAGTATCACCA
GGTGATCTGTATGACGCATATATTGACATATTCCCCATCTTCATTTGC