Gene sequences

How To ▶︎

JA

EN

TOP > About the Species(Sorghum bicolor ) > genome data >Gene sequences

Search

By Traits

Let’s Analyze!!

SNP Detection
(lang=JA only)

Other Tools

Data List

All

Trait-Related Loci

Sorghum bicolor

CDS Sequence

CDS ID	EES07720
CDS Infomation	cds chromosome:Sorghum_bicolor_NCBIv3:4:66958550:66963612:-1 gene:SORBI_3004G337900 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding description:hypothetical protein
Sequence	ATGAAGAAAGTGTTCGATCAGACGGTCCGGGACCTAAAAAGAGAGGTGAACAAGAAGGTC CTCAAGGTGCCTGGAATAGAACAAAAGATCCTTGATGCCACAAGCAACGAACCGTGGGGC CCACATGGATCTCTCCTGGCAGACATTGCTCAAGCAACGCACAACCATCACGAGTACCAG ATGATCATGAACATTGTGTGGAAGAGGGTCAGTGACACTGGTAAAAATTGGCGTCATGTT TACAAGGGATTGATTGTCTTGGATTACCTGGTGGCGCATGGTACTGAACGAGTTATTGAT GACATAAGAGAACATGCTTATCAGATATCAGCACTAGCTGACTTCCAGTACATTGATTCT TCTGGGAGAGATCAAGGTAGCAATGTGCGAAGGAAATCCCAGAGCCTTGTCAGTTTAGTT AATGATAAAGAAAGGATACAGGAAGTTAGACAGAAAGCACTCGCTACCAGGGACAAGTAC AGGAGTGCATTTGCCCCCAGTGGCAGGAGCCCAGGTGGATATGGTGGTGGTTATGATAAT GACCGCTATGAAGGGAGCTATGGCAGTAGATATGACAACAGAAATGGAAATGGGAGGGAA AGAGACTATGGATACAGGGACGATGACAGATATGGTGGACCTGGAGATACACCCAATAGG GAAGGAGATCGTTATTCCAGAGATTCTAATGAACGCTACGGCAGAGATTATAGAGAAGAT GAATACAAAGGAAGTCATAGCAACCACGAGTATTCTGAAGGAGCAGGTCGCAGGAGCTAT GGCCGGGAAAGGGATTCATATGGGGATGATGAAGCTTATTCATCTCGTGGCCGTGGCAGC AATGCTGATGCGCCTACTCAGGATGATAGGCCTATAGAGCGAAAGCTTTCTAACCAGCAA ATTGCTTCACCACCACCGAACTATGAAGATGTTACAAGAGATAGCCAGGACAATCTTCAG GATGACAGAAATGGAGGAAGTGTTCCTGCTGCTGTACCAAGGGTGTCCTCTCCTTCAGTT CCTGCAACAACTGTTCCTGCAGGACAGGTGAATGGGGTTCAGGACACTACTGTTGAAGAT GTACCTGCACCACCAACTGTTCATGCTGAGCCTAATGGATTTGATGAGTTTGATCCACGT GGATCTGTGCCAGATTCTTCCCCTCCTGTAAACCCTGCACCAGTAGCGGATAGCTTGGAG ATGGATTTGTTTGGATCAGATCCTATTAGTTCATTGGCTTTGGTGTCTGTGCCTCAACCA ACGACCACATCAAATGTTGAAGCACCGGCAAATTCAGGTTTTGAGACAAATAGTTTCGTG GGCATGCCTCCTGCTTCCACTGGATTTGGCGAGATTGATGCCTCAAATCCTTTTGGGGAT CCTACACCTTTCAAGGCAGTTCTTGATGAAAGTCCAGCACTACCTCAGACACATGCTGCA CCAGCTGGTTCTTTCCAGTCCAGTGGACCTGGTGCGGATGTGAACCCTTTCCAGCCCGCT TCAGCCGCAAGCTTTGGTTTTGGAGACACTCTTGGTGATCTCACTTTTGCATCAAACGCT GCACCTGAGCAGCAAGATATTTTTGCAAACACAGCCTCCTTCCCTTCAGAGTTAGCACCA GCAAACCCGTCTGTGGTTCTGCAGCAGCCAGTTCCTACAAATTTCCCCTCTCAGCCACCT CAGCCAGTTGCTGGCCCATTGCATGCTGCTCCCACAGCATTTGCTCCTTCTCAGGCCGCT CCCACATCATTCGCTCCTTCTCAGGCTGCTCCCACATCATTTGCTCCTCCTCAGGCACCT CAGGCTGCCCCTGTGTTTGCTTATTCACAAGCGCCGCCTCATCCTGGTGCTGCCAACCAT TCTCAATTTCCCCAGACTGCTGCCCCGTCTTTTCCTCCTTCGCAGGTGCCTCAATCTGTA GCACCCAGTCTGCCATCAGGCCAATCAGATTTCTTTATGCAACCAGCATCAGGGTCTGGT ATTGACAGCTTGTCTGGGGTTCCTACACAGAATGGGGCACCGTCCTACATTCCTTCACAG ACCTCTCAGTTCACTGCTCCGGCAAATCAACAACCATCTCAGCCAAGCTTCCTCCCACAA ACTAGCACGCCAGCACTCCAGCCTGCCTTGATCTCTCGTGGGGCATCCCAGCCCCTTAGT GTGCCAAATTCAGTGCCTACTGGTGGCAGCTTCCCATTGCAGTCAAGTTCATCAGCTCCC TCAGAAACTATCATTTCTGCTTTGCAAGTTAATCAGACTGAGCCAGTGAAGAAGTTTGAG CCCAAATCTAAACTGTGGTCTGACACTTTGAGCCGAGGTCTTGTCAATCTGGACATTTCT GGACCAAAAGCGAATCCTCATGCTGATATTGGAGTTGACTTTGATTCAATTAATCGCAAG GAGAAAAGGCAGGAAAAGAAAATCAACCAAGCACCTGTTGTGTCTACAGTCACCATGGGC AAAGCCATGGGAGCTGGTTCCGGCATTGGTCGGGCTGGTGCAGGTGCAATGGCACCTCCT CCCAACCCAATGGGTGCTGGCAGGGGCATGGGTATGGGTCCTGGTGCTGGTGCCGGTGCT GGTTATGGTGGTGGAATGGGAATGAACCGGCCAATGGGCATGGGGATGGGAATGGGAATG GGAATGAATCAACAACAGATGCGGATGGGGATGAACCAACAGCCGATGGGAATGGGGATG GGGATGGGGATGGGGATGAACCAGCAACCGATGGGAATGGGGATGGGGATGAACCAACAA CAGATGGGAGGAATGAATATGGGGATGGGGATGAACCAGGGGATGCCGATGCGTCCTATG GGGATGGGTCCTGGTGGAATGCCCGGTGCTGGCTACAATCAGATGGGTGCAGCATACGGT GGTCAGCAGCCATATGGAGGATACAGGTGA

Peptide Sequence

PEP ID	EES07720
PEP Infomation	pep chromosome:Sorghum_bicolor_NCBIv3:4:66958550:66963612:-1 gene:SORBI_3004G337900 transcript:EES07720 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding description:hypothetical protein
Sequence	MKKVFDQTVRDLKREVNKKVLKVPGIEQKILDATSNEPWGPHGSLLADIAQATHNHHEYQ MIMNIVWKRVSDTGKNWRHVYKGLIVLDYLVAHGTERVIDDIREHAYQISALADFQYIDS SGRDQGSNVRRKSQSLVSLVNDKERIQEVRQKALATRDKYRSAFAPSGRSPGGYGGGYDN DRYEGSYGSRYDNRNGNGRERDYGYRDDDRYGGPGDTPNREGDRYSRDSNERYGRDYRED EYKGSHSNHEYSEGAGRRSYGRERDSYGDDEAYSSRGRGSNADAPTQDDRPIERKLSNQQ IASPPPNYEDVTRDSQDNLQDDRNGGSVPAAVPRVSSPSVPATTVPAGQVNGVQDTTVED VPAPPTVHAEPNGFDEFDPRGSVPDSSPPVNPAPVADSLEMDLFGSDPISSLALVSVPQP TTTSNVEAPANSGFETNSFVGMPPASTGFGEIDASNPFGDPTPFKAVLDESPALPQTHAA PAGSFQSSGPGADVNPFQPASAASFGFGDTLGDLTFASNAAPEQQDIFANTASFPSELAP ANPSVVLQQPVPTNFPSQPPQPVAGPLHAAPTAFAPSQAAPTSFAPSQAAPTSFAPPQAP QAAPVFAYSQAPPHPGAANHSQFPQTAAPSFPPSQVPQSVAPSLPSGQSDFFMQPASGSG IDSLSGVPTQNGAPSYIPSQTSQFTAPANQQPSQPSFLPQTSTPALQPALISRGASQPLS VPNSVPTGGSFPLQSSSSAPSETIISALQVNQTEPVKKFEPKSKLWSDTLSRGLVNLDIS GPKANPHADIGVDFDSINRKEKRQEKKINQAPVVSTVTMGKAMGAGSGIGRAGAGAMAPP PNPMGAGRGMGMGPGAGAGAGYGGGMGMNRPMGMGMGMGMGMNQQQMRMGMNQQPMGMGM GMGMGMNQQPMGMGMGMNQQQMGGMNMGMGMNQGMPMRPMGMGPGGMPGAGYNQMGAAYG GQQPYGGYR

Transcript Sequence

Transcript ID	EES07720
Transcript Infomation	cdna chromosome:Sorghum_bicolor_NCBIv3:4:66958550:66963612:-1 gene:SORBI_3004G337900 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding description:hypothetical protein
Sequence	GGTGTCCAACCGAGGAGGACATAGAGCTGGGCGTATAATAACGAGCTAGATTTCAAAAAG GGAGCTATGAAGAAAGTGTTCGATCAGACGGTCCGGGACCTAAAAAGAGAGGTGAACAAG AAGGTCCTCAAGGTGCCTGGAATAGAACAAAAGATCCTTGATGCCACAAGCAACGAACCG TGGGGCCCACATGGATCTCTCCTGGCAGACATTGCTCAAGCAACGCACAACCATCACGAG TACCAGATGATCATGAACATTGTGTGGAAGAGGGTCAGTGACACTGGTAAAAATTGGCGT CATGTTTACAAGGGATTGATTGTCTTGGATTACCTGGTGGCGCATGGTACTGAACGAGTT ATTGATGACATAAGAGAACATGCTTATCAGATATCAGCACTAGCTGACTTCCAGTACATT GATTCTTCTGGGAGAGATCAAGGTAGCAATGTGCGAAGGAAATCCCAGAGCCTTGTCAGT TTAGTTAATGATAAAGAAAGGATACAGGAAGTTAGACAGAAAGCACTCGCTACCAGGGAC AAGTACAGGAGTGCATTTGCCCCCAGTGGCAGGAGCCCAGGTGGATATGGTGGTGGTTAT GATAATGACCGCTATGAAGGGAGCTATGGCAGTAGATATGACAACAGAAATGGAAATGGG AGGGAAAGAGACTATGGATACAGGGACGATGACAGATATGGTGGACCTGGAGATACACCC AATAGGGAAGGAGATCGTTATTCCAGAGATTCTAATGAACGCTACGGCAGAGATTATAGA GAAGATGAATACAAAGGAAGTCATAGCAACCACGAGTATTCTGAAGGAGCAGGTCGCAGG AGCTATGGCCGGGAAAGGGATTCATATGGGGATGATGAAGCTTATTCATCTCGTGGCCGT GGCAGCAATGCTGATGCGCCTACTCAGGATGATAGGCCTATAGAGCGAAAGCTTTCTAAC CAGCAAATTGCTTCACCACCACCGAACTATGAAGATGTTACAAGAGATAGCCAGGACAAT CTTCAGGATGACAGAAATGGAGGAAGTGTTCCTGCTGCTGTACCAAGGGTGTCCTCTCCT TCAGTTCCTGCAACAACTGTTCCTGCAGGACAGGTGAATGGGGTTCAGGACACTACTGTT GAAGATGTACCTGCACCACCAACTGTTCATGCTGAGCCTAATGGATTTGATGAGTTTGAT CCACGTGGATCTGTGCCAGATTCTTCCCCTCCTGTAAACCCTGCACCAGTAGCGGATAGC TTGGAGATGGATTTGTTTGGATCAGATCCTATTAGTTCATTGGCTTTGGTGTCTGTGCCT CAACCAACGACCACATCAAATGTTGAAGCACCGGCAAATTCAGGTTTTGAGACAAATAGT TTCGTGGGCATGCCTCCTGCTTCCACTGGATTTGGCGAGATTGATGCCTCAAATCCTTTT GGGGATCCTACACCTTTCAAGGCAGTTCTTGATGAAAGTCCAGCACTACCTCAGACACAT GCTGCACCAGCTGGTTCTTTCCAGTCCAGTGGACCTGGTGCGGATGTGAACCCTTTCCAG CCCGCTTCAGCCGCAAGCTTTGGTTTTGGAGACACTCTTGGTGATCTCACTTTTGCATCA AACGCTGCACCTGAGCAGCAAGATATTTTTGCAAACACAGCCTCCTTCCCTTCAGAGTTA GCACCAGCAAACCCGTCTGTGGTTCTGCAGCAGCCAGTTCCTACAAATTTCCCCTCTCAG CCACCTCAGCCAGTTGCTGGCCCATTGCATGCTGCTCCCACAGCATTTGCTCCTTCTCAG GCCGCTCCCACATCATTCGCTCCTTCTCAGGCTGCTCCCACATCATTTGCTCCTCCTCAG GCACCTCAGGCTGCCCCTGTGTTTGCTTATTCACAAGCGCCGCCTCATCCTGGTGCTGCC AACCATTCTCAATTTCCCCAGACTGCTGCCCCGTCTTTTCCTCCTTCGCAGGTGCCTCAA TCTGTAGCACCCAGTCTGCCATCAGGCCAATCAGATTTCTTTATGCAACCAGCATCAGGG TCTGGTATTGACAGCTTGTCTGGGGTTCCTACACAGAATGGGGCACCGTCCTACATTCCT TCACAGACCTCTCAGTTCACTGCTCCGGCAAATCAACAACCATCTCAGCCAAGCTTCCTC CCACAAACTAGCACGCCAGCACTCCAGCCTGCCTTGATCTCTCGTGGGGCATCCCAGCCC CTTAGTGTGCCAAATTCAGTGCCTACTGGTGGCAGCTTCCCATTGCAGTCAAGTTCATCA GCTCCCTCAGAAACTATCATTTCTGCTTTGCAAGTTAATCAGACTGAGCCAGTGAAGAAG TTTGAGCCCAAATCTAAACTGTGGTCTGACACTTTGAGCCGAGGTCTTGTCAATCTGGAC ATTTCTGGACCAAAAGCGAATCCTCATGCTGATATTGGAGTTGACTTTGATTCAATTAAT CGCAAGGAGAAAAGGCAGGAAAAGAAAATCAACCAAGCACCTGTTGTGTCTACAGTCACC ATGGGCAAAGCCATGGGAGCTGGTTCCGGCATTGGTCGGGCTGGTGCAGGTGCAATGGCA CCTCCTCCCAACCCAATGGGTGCTGGCAGGGGCATGGGTATGGGTCCTGGTGCTGGTGCC GGTGCTGGTTATGGTGGTGGAATGGGAATGAACCGGCCAATGGGCATGGGGATGGGAATG GGAATGGGAATGAATCAACAACAGATGCGGATGGGGATGAACCAACAGCCGATGGGAATG GGGATGGGGATGGGGATGGGGATGAACCAGCAACCGATGGGAATGGGGATGGGGATGAAC CAACAACAGATGGGAGGAATGAATATGGGGATGGGGATGAACCAGGGGATGCCGATGCGT CCTATGGGGATGGGTCCTGGTGGAATGCCCGGTGCTGGCTACAATCAGATGGGTGCAGCA TACGGTGGTCAGCAGCCATATGGAGGATACAGGTGAGGAGGGGCTATGCAGTCTCCCACA CCACAGATTATGGGGGCGAGGTGTTGAGAAACAGTTTAGGAGGCATCTGTATTTTGCTCA CCTGGTTTTGCTTTGTGTATGATTTCTTGTTTCTTTTGGGGGCGGGTGAGAAGGGTATAA TTTTCGTCACTATTCTTTTACAGTCCATGTTGGATACTGTACCTACTAAATAGCAAATAG CAAACATGTGAACAAGGGCGGTGCTACAACTACTGTGTTGTGTTGGATGCAAAGCCTTGA TATATTACAGAGCTCCCATGTAGTTGTATACTTTGCTATAGGCTGCTTCTTTTTAGTAAA CATATTATTTGTTTCAGCATTCTTGCTGGATGGATAATAAATGGCTGTACCATTTGAT