Gene sequences

How To ▶︎

JA

EN

TOP > About the Species(Sorghum bicolor ) > genome data >Gene sequences

Search

By Traits

Let’s Analyze!!

SNP Detection
(lang=JA only)

Other Tools

Data List

All

Trait-Related Loci

Sorghum bicolor

CDS Sequence

CDS ID	EES05409
CDS Infomation	cds chromosome:Sorghum_bicolor_NCBIv3:4:56152325:56153873:1 gene:SORBI_3004G211900 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding description:hypothetical protein
Sequence	ATGGCTGTCCTGCAAGTTGCTGCTGCTGCCCCTCCCCCTGTCTCAGCGATTGGGTTTGAG GGATATGAGAAGCGCCTTGAGATCAGCTTCTCTGAGGCACCTGTCTTCGCTGATCCCAAT GGAAGGGGATTGCGTGCGCTCTCACGTGACCAGATTGAGACTGTTCTTGACCTTGCACGG TGCACCATTGTGTCTGAGCTCTCAAATGAGGACTTTGACTCTTATGTCTTATCCGAGTCA AGCCTGTTTGTCTACCCATATAAAATGGTGATCAAGACCTGTGGGACTACAAAGCTTCTG CTCGCTATTCCGAGGATCCTTGAGCTTGCTAAAGAGCTCTCGTTGCCACTTTCTGCAGTT AAATACTCCCGTGGGACATTCATATTCCCTGATGCACAGCCTTCCCCACACAAGAACTTT GCTGATGAGGTTGCCTTCCTGAATCGCTTCTTTGGTGGCCTCAAGTCTGGCGGTAATGCT TATGTTATTGGTGATTCTGCAAAGCCTGGGCAGAAGTGGCACGTCTACTATGCCTCTGAG CACCCTGAGGAGCCTGTTGTTACTCTCGAGATGTGCATGACTGGGCTGGACAAGAAGAAA GCTTCTGTCTTCTTCAAGACATCTGCTGATGGTTACACATCGTGTGCTAAGGAGATGACC AAGCTCTCTGGTATCTCGGACATTATTCCAGAGATGGAGATCTGTGACTTTGATTTCGAG CCCTGTGGCTACTCCATGAATGCTGTTCATGGCCCTGCTTTCTCGACCATTCATGTGACC CCAGAGGATGGCTTCAGCTATGCAAGCTACGAGGTCATGGGCTTCAACCCAGGCTCTTCT TCTTATGGTGACCTGGTTAAGAGGGTGCTGAGGTGCTTTGGCCCAGTTGAGTTCTCTGTT GCCGTGACTATCTTCGGTGAGCGGGACAATGCAAAGACCTGGGGGAAGAAACTGGAAGCT GAGGCCTATGCCTGCAGCAACATGGTTGAGCAGGTGCTGCCGTCTGGTGGCTTGCTCATA TATCAGAGCTTCACTGCTACGGGTGCAGCCACCCCTGGGTCGCCGAGGTCAGTCCTGCAT GACTTCGCTGGTGACATTGTCAAGCCTGGCGATAGTGGTGAGGCCGATGGCCCCTGCTGG GAAGCTGATGCTGTGGATGAGAGCGAGGAAAGAGAGGTAAAGAAGATGAAATGCTGA

Peptide Sequence

PEP ID	EES05409
PEP Infomation	pep chromosome:Sorghum_bicolor_NCBIv3:4:56152325:56153873:1 gene:SORBI_3004G211900 transcript:EES05409 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding description:hypothetical protein
Sequence	MAVLQVAAAAPPPVSAIGFEGYEKRLEISFSEAPVFADPNGRGLRALSRDQIETVLDLAR CTIVSELSNEDFDSYVLSESSLFVYPYKMVIKTCGTTKLLLAIPRILELAKELSLPLSAV KYSRGTFIFPDAQPSPHKNFADEVAFLNRFFGGLKSGGNAYVIGDSAKPGQKWHVYYASE HPEEPVVTLEMCMTGLDKKKASVFFKTSADGYTSCAKEMTKLSGISDIIPEMEICDFDFE PCGYSMNAVHGPAFSTIHVTPEDGFSYASYEVMGFNPGSSSYGDLVKRVLRCFGPVEFSV AVTIFGERDNAKTWGKKLEAEAYACSNMVEQVLPSGGLLIYQSFTATGAATPGSPRSVLH DFAGDIVKPGDSGEADGPCWEADAVDESEEREVKKMKC

Transcript Sequence

Transcript ID	EES05409
Transcript Infomation	cdna chromosome:Sorghum_bicolor_NCBIv3:4:56152325:56153873:1 gene:SORBI_3004G211900 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding description:hypothetical protein
Sequence	GTTGCTTTCCAGTGACCAAAAGATTTCAAGAAACCACTCCCTGTCTTCCTCCCCCGGCTG TCTGTCATCTTGCTCTGAAACAATGGCTGTCCTGCAAGTTGCTGCTGCTGCCCCTCCCCC TGTCTCAGCGATTGGGTTTGAGGGATATGAGAAGCGCCTTGAGATCAGCTTCTCTGAGGC ACCTGTCTTCGCTGATCCCAATGGAAGGGGATTGCGTGCGCTCTCACGTGACCAGATTGA GACTGTTCTTGACCTTGCACGGTGCACCATTGTGTCTGAGCTCTCAAATGAGGACTTTGA CTCTTATGTCTTATCCGAGTCAAGCCTGTTTGTCTACCCATATAAAATGGTGATCAAGAC CTGTGGGACTACAAAGCTTCTGCTCGCTATTCCGAGGATCCTTGAGCTTGCTAAAGAGCT CTCGTTGCCACTTTCTGCAGTTAAATACTCCCGTGGGACATTCATATTCCCTGATGCACA GCCTTCCCCACACAAGAACTTTGCTGATGAGGTTGCCTTCCTGAATCGCTTCTTTGGTGG CCTCAAGTCTGGCGGTAATGCTTATGTTATTGGTGATTCTGCAAAGCCTGGGCAGAAGTG GCACGTCTACTATGCCTCTGAGCACCCTGAGGAGCCTGTTGTTACTCTCGAGATGTGCAT GACTGGGCTGGACAAGAAGAAAGCTTCTGTCTTCTTCAAGACATCTGCTGATGGTTACAC ATCGTGTGCTAAGGAGATGACCAAGCTCTCTGGTATCTCGGACATTATTCCAGAGATGGA GATCTGTGACTTTGATTTCGAGCCCTGTGGCTACTCCATGAATGCTGTTCATGGCCCTGC TTTCTCGACCATTCATGTGACCCCAGAGGATGGCTTCAGCTATGCAAGCTACGAGGTCAT GGGCTTCAACCCAGGCTCTTCTTCTTATGGTGACCTGGTTAAGAGGGTGCTGAGGTGCTT TGGCCCAGTTGAGTTCTCTGTTGCCGTGACTATCTTCGGTGAGCGGGACAATGCAAAGAC CTGGGGGAAGAAACTGGAAGCTGAGGCCTATGCCTGCAGCAACATGGTTGAGCAGGTGCT GCCGTCTGGTGGCTTGCTCATATATCAGAGCTTCACTGCTACGGGTGCAGCCACCCCTGG GTCGCCGAGGTCAGTCCTGCATGACTTCGCTGGTGACATTGTCAAGCCTGGCGATAGTGG TGAGGCCGATGGCCCCTGCTGGGAAGCTGATGCTGTGGATGAGAGCGAGGAAAGAGAGGT AAAGAAGATGAAATGCTGATGCTGTGATGAGCTATGCTGAAGGTTGACAAATCAGATTTA GAGTTGCTGCCCTTGGTCATCTTGTGTAGCAGCCAAGCCAGATTATTTATGCTGCATAAC CTGTGCTATTGTGGTGTGGCACATGCTTATATTTGCAATAAAGAGCTCTAGGTGGTTAGC CTTGTCTGCCACAGTGAGTAGTGTACCCATATTGCGTTTCTGAACTGTATGAATCTAAAT AAAGTCTTGTGTTTGATACAATTTGAATTTGAATGATGTCTTTTCATGT