Gene sequences

How To ▶︎

JA

EN

TOP > About the Species(Sorghum bicolor ) > genome data >Gene sequences

Search

By Traits

Let’s Analyze!!

SNP Detection
(lang=JA only)

Other Tools

Data List

All

Trait-Related Loci

Sorghum bicolor

CDS Sequence

CDS ID	EES02568
CDS Infomation	cds chromosome:Sorghum_bicolor_NCBIv3:3:7746012:7753329:-1 gene:SORBI_3003G089000 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding description:hypothetical protein
Sequence	ATGGAAAATCGACCAAATGGTTCAGTAAATAATGCTGAGCATAATAATCAGGAAAATGAG AAGTCCATGGATGCTAGTGAGCCTGAAGAAGCACGAGATGTTTTTGTTTACAGAGAAGAT GTTGTGAGTTTGAAGTCCAAGGAGGATGTCCGTGGATTAGTTTTGGAGGTAGCTGGGGAG TATGATTCTGAAGGTAGCATCACTGATGATGATATTGATACTGATGAACATAAAGATAAT AAATCTGCTCATGGAGCTGAAAATGGTGGTGCTGATGGTGATAATGCTAGTAATGGAGCT GAAGTTGAAAGCCAGAGTTCTTTGCCTGATGACAAAGTTCGAGTGTTATGGATAGATGGT AGTGAGAAGACAGAAGACATTGATGAGGTAGTTGTTGTTGATAGAAGTTTCCTTCATGGA GATTTAGTTGCCTCTGCCTCAGACCCAACTGGTCAGATGGGGCTTGTTTTGGATGTCAAT CTTGTGGTTGATTTGCAAGGTGCCAATGGCGATACGATAAAGGGTGTATCTTCCAAGGAT TTGAGACGAATCAGGGAATTCAATGTGGGTGATTATGTCGTCTCTGGGCTATGGCTTGGT CGAGTTGATGAAGTGCTAGATAATGTTAATGTGTTGTTTGATGATGGCTCTGTATGTAAA GTTAATAGGGCAGATCCTATGCGCTTAAAGCCAGCATTTGGCCCAATTCATCCAGATACA GCTTGTCCTTTTTATCCAGGACAGCGTGTGAAGGCAGTGTCATCATCTGTTTTCAAAACA TCCAGGTGGCTTAATGGATTGTGGAGAGCATGTCGTCTTGAAGGTACTGTCACAAAAGTG GAAAGTGCTGCTGTTATAGTCTATTGGATGGCATCAGCACACTTTGCTACAGATCAGCAA CCTGTTCCTCCAGAGGAGCAGAACCCAAAGGACCTTACTCTTTTGTCTTGTTTCTCATAT GCAAACTGGCAATTAACTGACTGGTGTCTTCCTCACCGATACACTTCATGTACTAATGAT ACCATGGTTAATTCTGATAAACATACAAGGCAGATATGTACATGCTCACAAAGCTCAGCT CCACTGTCTGATATTCCAGAATCTCAAGTTGATGTTCAGGCTGAACAAGATCAAATGACT GATACAGATGCAGGTCACAAGCAGACAGATGTTGATTCTACTGCAGATGGATTGAGTATG TCGGATGGAGATAATTCATGCATAGCCAAAGAATCAGAAACAGGAACTAGTGTATCAAGC ATCCCAAAGTTGGGTCCACAGGACAATGCAACATCCAGAAAAAAGTTTAGGAAAGTGTTT CTAAAAAAGGACAAAAGAACAAAAAAAAGAGACGACAGCTTTGAGCGAGCTCTACTCATC GCAAATACCTGTACCAAAGTTGATGTAGTCTGGCAGGACGGGACAAAGGAATGTGGAGTA GCTGCAACATCGTTGATCCCTATCCACAGTCCAAATGACCATGATTTCTTCCCGGAGCAG TATGTTGTGGACAAGGTCACAAATGATGATGATTCTTCTGAACCAAGGCGTGTGGGTCTT GTTAGAAGCGTTAATGCTAAGGACCGAACAGTAACTGTATCATGGTTTAAGCCTTCACTA CGTCTAGAGGAGCCAATGGAGATCGGGTGTAATGAAGTTGTGAGTGCATATGAACTGGAT GGCCATCCGGATTATGATTATTGCTATGGAGATATTGTCGTCCGCTTGCCGCCTGTTTCA CCTGTAATTGAATCAACCAATAACAAGGACCAAATGGAACTGGATAAGACGGTAGATTCC TCGGAAGGATTTGCTACTTCGAATGATGCACCCCCTGATACTAGTGCAGACGAACAGCTT TCACAGAAGGAATACTGCTCGCAGTTTACAAGCCTCTCATGGGCTGGAAATATAGTTGGC TTTCAAGATGGTGAGATTGAAATCATTTGGGGTGATGGCTCGATTTCAAAGGTTGGGCCT CATGAAATATATGTTGTTGGTCGTGAAGATGATGGAGCCTCACTAGATGATGGAACAGCC TCTGATGGTGCTAGCTGGGAGACTCTTGATGACAACGAAATGGATGTACTTGATGATTCT GCAAAGGATGATTCGCAAAATGTACCTGAGAATAGCATTGAAAGGGAAAATGGTTCATTT AGCTCCCAGGATGGAAGTTCTATTGCAACTGGTCCCCTTTCAGTTGCTTTTGGGTTTGTG ACCCGACTGGCGAGTGATCTCTTTGCTCGAGGTAGAAGGCATTTAGATGGATCATCAAAC TCAGATGCTATGGATGAAGTTGAGTCTCACCGGTCTAATGAGGCTTCAGAAACTGGTGAT GACATTGATAAAATTAATGAGAATCATGTGGAATCGCCAGAGCATGCTGCAGTCACAGAA AACGATTCTTCTGTCGAGAAGTCTGTAGACGTGGTCTTGGCTGATAATCCTGAAGATCCA GAATGTTTCAAACACTTTGATGTTCTGCAGTGTCCTCCAGATCACCACTACCTTGAAAAC ACAGCCCAGGGTACAGGTGGAAGAAAGTGGGTCAAAAAGGTACAGCAGGAATGGAGCATA CTTGAGAAGAACCTACCAGACTATATTTATGTCAGGGTATTTGAGGATCGCATGGATCTC TTGAGAGCTGTGATTGTTGGAGCAAGCGGAACACCCTACCAAGATGGCCTGTTCTTCTTT GATTTCCACCTTCCACCTGAGTACCCAGAAGTCCCTCCGTCAGCATACTATCATTCTGGT GGTTTGCGTGTAAATCCAAACCTGTATGTGGACGGGAAGGTTTGTTTAAGTCTCTTAAAT ACTTGGACTGGCAGAGGGAATGAAGTGTGGGATAAATCATCATCAAGTATTCTCCAAGTG CTAGTTTCACTTCAGGGATTGGTTCTCAATGAAAAACCCTATTTTAATGAGGCTGGGTAT GAGAAGCAAGTTGGTACTGTTGAAGGGGAGAAGAATGCAGTGCCGTATAATGAGAATACA TACCTGCTGAGCGTGAAATCTATGCTGTATATATTGAGACGGCCTCCTTTGCATTTTGAG GATTTTGTGAAGAGCCATTTCCGCAAGCGTGGCCACTACATCCTTAAAGCTTGTGAGGCC TATTTGCAAGGAAATGTTGTGGGCACTCTCACTGACGACGCATGCCCCACCGAGAGAAGC AAGGAGCACTCGAGCTCTGTTGGCTTCAAGCTTGCACTAGCAAAGATTCTACCTCGGCTG ATTACAGCCCTGAAGGACACTGGAGCCGACTGCGACCAATACGAGCACCTTGGGAAAACA GAAACAGTTAGAGAAAGCTGA

Peptide Sequence

PEP ID	EES02568
PEP Infomation	pep chromosome:Sorghum_bicolor_NCBIv3:3:7746012:7753329:-1 gene:SORBI_3003G089000 transcript:EES02568 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding description:hypothetical protein
Sequence	MENRPNGSVNNAEHNNQENEKSMDASEPEEARDVFVYREDVVSLKSKEDVRGLVLEVAGE YDSEGSITDDDIDTDEHKDNKSAHGAENGGADGDNASNGAEVESQSSLPDDKVRVLWIDG SEKTEDIDEVVVVDRSFLHGDLVASASDPTGQMGLVLDVNLVVDLQGANGDTIKGVSSKD LRRIREFNVGDYVVSGLWLGRVDEVLDNVNVLFDDGSVCKVNRADPMRLKPAFGPIHPDT ACPFYPGQRVKAVSSSVFKTSRWLNGLWRACRLEGTVTKVESAAVIVYWMASAHFATDQQ PVPPEEQNPKDLTLLSCFSYANWQLTDWCLPHRYTSCTNDTMVNSDKHTRQICTCSQSSA PLSDIPESQVDVQAEQDQMTDTDAGHKQTDVDSTADGLSMSDGDNSCIAKESETGTSVSS IPKLGPQDNATSRKKFRKVFLKKDKRTKKRDDSFERALLIANTCTKVDVVWQDGTKECGV AATSLIPIHSPNDHDFFPEQYVVDKVTNDDDSSEPRRVGLVRSVNAKDRTVTVSWFKPSL RLEEPMEIGCNEVVSAYELDGHPDYDYCYGDIVVRLPPVSPVIESTNNKDQMELDKTVDS SEGFATSNDAPPDTSADEQLSQKEYCSQFTSLSWAGNIVGFQDGEIEIIWGDGSISKVGP HEIYVVGREDDGASLDDGTASDGASWETLDDNEMDVLDDSAKDDSQNVPENSIERENGSF SSQDGSSIATGPLSVAFGFVTRLASDLFARGRRHLDGSSNSDAMDEVESHRSNEASETGD DIDKINENHVESPEHAAVTENDSSVEKSVDVVLADNPEDPECFKHFDVLQCPPDHHYLEN TAQGTGGRKWVKKVQQEWSILEKNLPDYIYVRVFEDRMDLLRAVIVGASGTPYQDGLFFF DFHLPPEYPEVPPSAYYHSGGLRVNPNLYVDGKVCLSLLNTWTGRGNEVWDKSSSSILQV LVSLQGLVLNEKPYFNEAGYEKQVGTVEGEKNAVPYNENTYLLSVKSMLYILRRPPLHFE DFVKSHFRKRGHYILKACEAYLQGNVVGTLTDDACPTERSKEHSSSVGFKLALAKILPRL ITALKDTGADCDQYEHLGKTETVRES

Transcript Sequence

Transcript ID	EES02568
Transcript Infomation	cdna chromosome:Sorghum_bicolor_NCBIv3:3:7746012:7753329:-1 gene:SORBI_3003G089000 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding description:hypothetical protein
Sequence	CGTCTCCTTCGCTGCTCGCCTCCGCCTCCTCTTTTGTCCCCCGCCCGCGCCTCGTCTCAT CTACCCTCACCTAGGGCACGCGCGCCGACCTCGCCGCCTCGTCGCCGCCGCCAACCTCGC AGCCGTCGATCCCCGGCGCTCCGATAGCCAGAGGTCAGTCCGCCAGCACCACCAGATGAC TTCCGACTCATATCCCGTCGCTATCGATCGCTTTCGACTTGCGTGGTTTCTCCGGCGCTC CCACGGCCGCGCCGCCCCCTGATCTTGGCGCGATAGTCCGTGGATTGGCAATCGTAGGGT ATCCGCTGGCAGATGAGGCTTTTGCCCGTGTCTCGATTCGGTTCCGGCGAGGTGCGGCCG GCGGTTGCCGCGGCTGGATGGCCCGATGCAGGGTGGGCAATGGGACTGTGGGGGCGGCTG TTGGTTTAGCTTGGTTGGATTGGTTTCGATTGGGGTTTCGTCGAGAACTAGATGGGTGGT TGCTTGCGGACTCTTTAGTCTGGCATATTCGGTTGCTTGCAAAGTCTGCTACTGATAGTA CATAGAACAAGGTCACTGGCACTCTTTCGGGAATCGTTTGTTTGATTTGGATTTGGATTG GCGAGAACAATAGCCATGTTAGATTAGAAAAATAGTATGGGCACCATGCTCACTTCAGCC TGTTAGGTTGCTTGTCGCAGTTCTTGCTTTTATTGCCTATTCTTCAAATTATCAGCATCA TGTGTGGTTCTCCCCCCCTCAAAACTTTATAGAAGTTTTCAACTCATATCCGTTTCTTGT AATTGTTTTCTTGTTTATTTTCCATAAGTGGTTGCTACAATGCTCACTAACATGTCACCT CTTGTTTATGATCAGACAAGTTATTTGCATGATTAATACATTGAAATTCAATTTTTGAAT CAAGAGTGGCCTACCATTCTAATTCCATTCCATAACTGTTACTGCAATTTTGTCTTCATG AATTAAGTTACTCCCATGTTAACATTTTCATCATTATTTCCTGATGAAACTATCACGAGG CACACATAGACGTTCTAGGGTTCTTGAGCTCCCTGTAGTTTTTAGGCATATAAAATAAAA AGATTGTGCAAAATATGTGTTCACAAAGTAAAATGCAATATTTATATAGATAACTGCATT ATAGTTTCCTGTGGCTTCTTGATGATTATGGATTTAGGATTATTTAATATTCAAGTAAAG CAACATATCGTTCTACTTTTCAGCAAGTATTTACTGCACTTGCATGAATGCATGATACTT TAATGGAAATGCATTGCTGGAGCTAGGACCCTGCATTGCATCTACATTCTACTTGTCATG CTTATTCCTTGTGTTAAGGAAAAATATATCGTTTGTTAGGAAACTACTAGGTACGAGTCA TTGGCGTACTTTAAAAATTCTAGCAGTAAAACAAGTGGTGATCTGCATGCTTTGTGGAAT TCAATAGCAGTAATCATGGGGAAATGTTTACATATGTTAAGATTTTTAAATTTGTTTTTC TCTCAAGTTTCATGCTTAGCCTCATGTATCTTATCTTAAACATGTCGTATGTGTTTCAGT TGAATAGAGGGCTACTTGATTGTTTGGAATCTACTTTTATAGTTGATTCCAAGCATGGAA AATCGACCAAATGGTTCAGTAAATAATGCTGAGCATAATAATCAGGAAAATGAGAAGTCC ATGGATGCTAGTGAGCCTGAAGAAGCACGAGATGTTTTTGTTTACAGAGAAGATGTTGTG AGTTTGAAGTCCAAGGAGGATGTCCGTGGATTAGTTTTGGAGGTAGCTGGGGAGTATGAT TCTGAAGGTAGCATCACTGATGATGATATTGATACTGATGAACATAAAGATAATAAATCT GCTCATGGAGCTGAAAATGGTGGTGCTGATGGTGATAATGCTAGTAATGGAGCTGAAGTT GAAAGCCAGAGTTCTTTGCCTGATGACAAAGTTCGAGTGTTATGGATAGATGGTAGTGAG AAGACAGAAGACATTGATGAGGTAGTTGTTGTTGATAGAAGTTTCCTTCATGGAGATTTA GTTGCCTCTGCCTCAGACCCAACTGGTCAGATGGGGCTTGTTTTGGATGTCAATCTTGTG GTTGATTTGCAAGGTGCCAATGGCGATACGATAAAGGGTGTATCTTCCAAGGATTTGAGA CGAATCAGGGAATTCAATGTGGGTGATTATGTCGTCTCTGGGCTATGGCTTGGTCGAGTT GATGAAGTGCTAGATAATGTTAATGTGTTGTTTGATGATGGCTCTGTATGTAAAGTTAAT AGGGCAGATCCTATGCGCTTAAAGCCAGCATTTGGCCCAATTCATCCAGATACAGCTTGT CCTTTTTATCCAGGACAGCGTGTGAAGGCAGTGTCATCATCTGTTTTCAAAACATCCAGG TGGCTTAATGGATTGTGGAGAGCATGTCGTCTTGAAGGTACTGTCACAAAAGTGGAAAGT GCTGCTGTTATAGTCTATTGGATGGCATCAGCACACTTTGCTACAGATCAGCAACCTGTT CCTCCAGAGGAGCAGAACCCAAAGGACCTTACTCTTTTGTCTTGTTTCTCATATGCAAAC TGGCAATTAACTGACTGGTGTCTTCCTCACCGATACACTTCATGTACTAATGATACCATG GTTAATTCTGATAAACATACAAGGCAGATATGTACATGCTCACAAAGCTCAGCTCCACTG TCTGATATTCCAGAATCTCAAGTTGATGTTCAGGCTGAACAAGATCAAATGACTGATACA GATGCAGGTCACAAGCAGACAGATGTTGATTCTACTGCAGATGGATTGAGTATGTCGGAT GGAGATAATTCATGCATAGCCAAAGAATCAGAAACAGGAACTAGTGTATCAAGCATCCCA AAGTTGGGTCCACAGGACAATGCAACATCCAGAAAAAAGTTTAGGAAAGTGTTTCTAAAA AAGGACAAAAGAACAAAAAAAAGAGACGACAGCTTTGAGCGAGCTCTACTCATCGCAAAT ACCTGTACCAAAGTTGATGTAGTCTGGCAGGACGGGACAAAGGAATGTGGAGTAGCTGCA ACATCGTTGATCCCTATCCACAGTCCAAATGACCATGATTTCTTCCCGGAGCAGTATGTT GTGGACAAGGTCACAAATGATGATGATTCTTCTGAACCAAGGCGTGTGGGTCTTGTTAGA AGCGTTAATGCTAAGGACCGAACAGTAACTGTATCATGGTTTAAGCCTTCACTACGTCTA GAGGAGCCAATGGAGATCGGGTGTAATGAAGTTGTGAGTGCATATGAACTGGATGGCCAT CCGGATTATGATTATTGCTATGGAGATATTGTCGTCCGCTTGCCGCCTGTTTCACCTGTA ATTGAATCAACCAATAACAAGGACCAAATGGAACTGGATAAGACGGTAGATTCCTCGGAA GGATTTGCTACTTCGAATGATGCACCCCCTGATACTAGTGCAGACGAACAGCTTTCACAG AAGGAATACTGCTCGCAGTTTACAAGCCTCTCATGGGCTGGAAATATAGTTGGCTTTCAA GATGGTGAGATTGAAATCATTTGGGGTGATGGCTCGATTTCAAAGGTTGGGCCTCATGAA ATATATGTTGTTGGTCGTGAAGATGATGGAGCCTCACTAGATGATGGAACAGCCTCTGAT GGTGCTAGCTGGGAGACTCTTGATGACAACGAAATGGATGTACTTGATGATTCTGCAAAG GATGATTCGCAAAATGTACCTGAGAATAGCATTGAAAGGGAAAATGGTTCATTTAGCTCC CAGGATGGAAGTTCTATTGCAACTGGTCCCCTTTCAGTTGCTTTTGGGTTTGTGACCCGA CTGGCGAGTGATCTCTTTGCTCGAGGTAGAAGGCATTTAGATGGATCATCAAACTCAGAT GCTATGGATGAAGTTGAGTCTCACCGGTCTAATGAGGCTTCAGAAACTGGTGATGACATT GATAAAATTAATGAGAATCATGTGGAATCGCCAGAGCATGCTGCAGTCACAGAAAACGAT TCTTCTGTCGAGAAGTCTGTAGACGTGGTCTTGGCTGATAATCCTGAAGATCCAGAATGT TTCAAACACTTTGATGTTCTGCAGTGTCCTCCAGATCACCACTACCTTGAAAACACAGCC CAGGGTACAGGTGGAAGAAAGTGGGTCAAAAAGGTACAGCAGGAATGGAGCATACTTGAG AAGAACCTACCAGACTATATTTATGTCAGGGTATTTGAGGATCGCATGGATCTCTTGAGA GCTGTGATTGTTGGAGCAAGCGGAACACCCTACCAAGATGGCCTGTTCTTCTTTGATTTC CACCTTCCACCTGAGTACCCAGAAGTCCCTCCGTCAGCATACTATCATTCTGGTGGTTTG CGTGTAAATCCAAACCTGTATGTGGACGGGAAGGTTTGTTTAAGTCTCTTAAATACTTGG ACTGGCAGAGGGAATGAAGTGTGGGATAAATCATCATCAAGTATTCTCCAAGTGCTAGTT TCACTTCAGGGATTGGTTCTCAATGAAAAACCCTATTTTAATGAGGCTGGGTATGAGAAG CAAGTTGGTACTGTTGAAGGGGAGAAGAATGCAGTGCCGTATAATGAGAATACATACCTG CTGAGCGTGAAATCTATGCTGTATATATTGAGACGGCCTCCTTTGCATTTTGAGGATTTT GTGAAGAGCCATTTCCGCAAGCGTGGCCACTACATCCTTAAAGCTTGTGAGGCCTATTTG CAAGGAAATGTTGTGGGCACTCTCACTGACGACGCATGCCCCACCGAGAGAAGCAAGGAG CACTCGAGCTCTGTTGGCTTCAAGCTTGCACTAGCAAAGATTCTACCTCGGCTGATTACA GCCCTGAAGGACACTGGAGCCGACTGCGACCAATACGAGCACCTTGGGAAAACAGAAACA GTTAGAGAAAGCTGATCATTGAGTGATTTGTACTTGGATCTACTGTTTTTTTGGTTCAGA AAGATGGTGACTCCATCAGGCTGTTTTCCTACAAATGTACATTCAAAGTTTGTTGTTTCA GTCAAACATTTGGAAAATATGGCTCCAAATGATTTATTTGATATACATGGAACTGAGCTA CCCTGTACAGTTGATGTTTTTGTTAAACTTGCAGGGTCTTTAAACTTTATAAATGCCAGG GAATCGTTGGCAATATTGGAACCAGGCCTAGAAAAACCTGGAGTAGAGGTGT