Plant GARDEN
How To ▶︎

JA

EN

TOP > About the Species(Sorghum bicolor ) > genome data >Gene sequences

Search

By Species By Keywords Genes By Markers By Traits

Let’s Analyze!!

SNP Detection
(lang=JA only) Sequences Other Tools

Data List

All Markers Trait-Related Loci
Sorghum bicolor

CDS Sequence

CDS ID

EES01688
CDS Infomation

cds chromosome:Sorghum_bicolor_NCBIv3:3:66431058:66433614:1 gene:SORBI_3003G341800 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding description:hypothetical protein
Sequence

ATGGAGGAAACTCTGCAAGCGCTCGATGATCTGATTTCCCAGTTTCTGAGCTTGGATCGG
TCTCTCTGGTCCAGTTCTGATGATGCTGACTCCTTTTTAGAAGCTGTGGATGAACTAACT
TCCACCATCCATGGCCTTGAGAACACCTCTGCAGATCATGTGCTCCTTGAGAGCTTTGAC
CTCCTTCTAGAGCGATGTTCCACGAGGCTTAAGGATGAGTTCCAGCAACTGGTGGGTACA
TCTGGCTTCAGTGATGACTGTGGTGGTGACCACAATTTCAAGAGAAGCCAAAATGAAGAT
GACAACCACACCTTTGTAGCCCAACCAGTAAGAAACTTTGACATCATTGTTGATGCCTTA
CCAGAGGGTGTAGTCACTGAGGCAAATCGAATCGCAAGAAGGATGATCGCTGCTGGTTTT
GGTGATACATGTGCGGAGACCTATGCTTCTGCACGCCGCAACTTCATTGATGAGAGTATT
GCTCGACTTGGGGTTAATGCTCATTTCGAAGAATTGTGCAAGTCAACATCATGGGAGGAG
CTTGAGACTCAGATCATGCGATGGATACCTGCAATACGAGTTGTGTTCCACATCTTAATC
CCAAGTGAGCGTCACCTATGCAATTGCATTTTTGAAGAATTTACATCCTACACTAAACTT
GCCTTTGCCACCGCATGCAAACCATTTCTTCAACTCCTGTCCTTTGGCAAAGTTATTGCT
GCTGCTGGACATAACCCAGAGAGTCTCTTCCGCATAGTTGACATGTATGATGCTTTAACT
GATATTCTTCCTGTCCTTGATGAAGCCTTTGATCATGAGGTAGCTGCTCTTCGTGAATGC
CTTGGATTGTCAATTAAGGGCATATTTGTGGCTCTAGAAAAACTGATACGCTGTGATCCA
TGCAATTCTTCACCACCAGATGGTGGATTGCATCCAATAACAAGGTATGTGATGAACTAT
CTTATGGCAGCTTGCGTGTCTCGCCATACTCTGGAAGAAGTGATGCTTGTGGAGTTTGGT
TGTGTTGAAACATGTCCAATCGATCCTGACCGTTCCACATCATCACTGGCAATCCGCTTT
GCTTGGATTGTGGATGTGCTGATAGGGAATCTTGAGTCCAAATCCAGGATTTATGGTCAT
GCTCCTCTTGGCTGTGTCTTCCTGATCAACAATGGGATCTATATAATCAAGAAAGTCAAT
GGTTGCGAGCTTAAGATCTTGCTGGGTGAGGATTGGACCAGGGTAATATCTGCAAAGGTT
CACCAATGGGTGTTGGAATACCGCCGGGCTACCTGGGGGAGGGCCATAGCAATACTTGAG
ACTGGCAGAAGATCTGACAGTAGTTTGAGTATTATGTTAGAGAAACTGAACCGCTTCCAT
AGCTTTGTGGAAGCAATTTGCCAGGTGCAGTCACGGTGGGTACTGGTGGATAAGCAGCAA
GCAGTGAATTTGAGTATTATGGTTGAGGAGCTGGTTATTCCAGTGTACAGGGATACAATT
GAGATGTTAAAGGCAACAGAGGCTGTAGGGGTTTCATATGTGCGACCTGAGGACGTGAAG
TCACGGATTCAGCGGTTGTTCAAAGCAATGGCCAAGTCATAG

Peptide Sequence

PEP ID

EES01688
PEP Infomation

pep chromosome:Sorghum_bicolor_NCBIv3:3:66431058:66433614:1 gene:SORBI_3003G341800 transcript:EES01688 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding description:hypothetical protein
Sequence

MEETLQALDDLISQFLSLDRSLWSSSDDADSFLEAVDELTSTIHGLENTSADHVLLESFD
LLLERCSTRLKDEFQQLVGTSGFSDDCGGDHNFKRSQNEDDNHTFVAQPVRNFDIIVDAL
PEGVVTEANRIARRMIAAGFGDTCAETYASARRNFIDESIARLGVNAHFEELCKSTSWEE
LETQIMRWIPAIRVVFHILIPSERHLCNCIFEEFTSYTKLAFATACKPFLQLLSFGKVIA
AAGHNPESLFRIVDMYDALTDILPVLDEAFDHEVAALRECLGLSIKGIFVALEKLIRCDP
CNSSPPDGGLHPITRYVMNYLMAACVSRHTLEEVMLVEFGCVETCPIDPDRSTSSLAIRF
AWIVDVLIGNLESKSRIYGHAPLGCVFLINNGIYIIKKVNGCELKILLGEDWTRVISAKV
HQWVLEYRRATWGRAIAILETGRRSDSSLSIMLEKLNRFHSFVEAICQVQSRWVLVDKQQ
AVNLSIMVEELVIPVYRDTIEMLKATEAVGVSYVRPEDVKSRIQRLFKAMAKS

Transcript Sequence

Transcript ID

EES01688
Transcript Infomation

cdna chromosome:Sorghum_bicolor_NCBIv3:3:66431058:66433614:1 gene:SORBI_3003G341800 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding description:hypothetical protein
Sequence

TAATGCAAGTTTAAAAAAAATATTTATACAGTGGGGCCATCCTGCACATCCTTTACCTCC
TGGAAGCTCAATTACAGAGCAGCCGGACTCCAAGCCCATAGACTGTTGCTGCAAAGAAAC
CCACTTTTTTACTTCTTGTAGAATGTAGACTCTCTTGCGGTCTTGCCTCTCTCCAGTGCC
CTTCTCAGGCTAGCTAGACCTTGCTGTTTTCTTTGTACAGTTTTTAGTTTCCTGTTCTTT
CCTTTTTTTTTTCAATACAAATTTTACAGTGGGGGCCTCCCCTGCTGTTTCCCTGGTTCG
AAAAAAAGAAGATTGAGGACAAACCCAGATGGACTTCTTGTTTACAATCGGAGGAAGTAT
TTTTTTCCACGCAAACCTTTGTGTTGTTTCTCAAAGCTTGCCGTTTAGATTTCAACGACT
TGATGTATTGGTTGGTTGAAAGAAAAGTCAAAAGAGTACAATTGCCACGAAGTGATGCCT
GGTGGCTGTGTGGTTGGATGTTGCTATCCTGAGGTAAGCTCGTTGTGACCCCCCAACAGC
ATAGATGGATGTAATGCTCTGGTTTTGTCTGTATCCACCATCCATTGCACCTCGTACATA
AATGGTGGTCTGTTGTGATTTTGCATCATTCGGAACATCAGTAAACTCATCTGTATGGAG
GTCAAGTTGGATGTATCTAGGTGCTACTAGGAGGAAAGTTTTGCACCTTAATTTCAGATT
CACTTTCTGTGAGGTACGTTTCACACTCTTAGTTCTTCTATGATATGCATATGAATATGA
AATGTTTGAACTGGTCCATTTTGCCAGCTAGAGACTGGAGATTGCGTTGCACCAGCCTCT
TCTATGACTTGCCCTGAAGACATAGGAGGCTCACAAATTTGAAATTAGACTTAAGGAGTG
TTTGCTTTGTAGCATTGGTGATTGGCATGGAGGAAACTCTGCAAGCGCTCGATGATCTGA
TTTCCCAGTTTCTGAGCTTGGATCGGTCTCTCTGGTCCAGTTCTGATGATGCTGACTCCT
TTTTAGAAGCTGTGGATGAACTAACTTCCACCATCCATGGCCTTGAGAACACCTCTGCAG
ATCATGTGCTCCTTGAGAGCTTTGACCTCCTTCTAGAGCGATGTTCCACGAGGCTTAAGG
ATGAGTTCCAGCAACTGGTGGGTACATCTGGCTTCAGTGATGACTGTGGTGGTGACCACA
ATTTCAAGAGAAGCCAAAATGAAGATGACAACCACACCTTTGTAGCCCAACCAGTAAGAA
ACTTTGACATCATTGTTGATGCCTTACCAGAGGGTGTAGTCACTGAGGCAAATCGAATCG
CAAGAAGGATGATCGCTGCTGGTTTTGGTGATACATGTGCGGAGACCTATGCTTCTGCAC
GCCGCAACTTCATTGATGAGAGTATTGCTCGACTTGGGGTTAATGCTCATTTCGAAGAAT
TGTGCAAGTCAACATCATGGGAGGAGCTTGAGACTCAGATCATGCGATGGATACCTGCAA
TACGAGTTGTGTTCCACATCTTAATCCCAAGTGAGCGTCACCTATGCAATTGCATTTTTG
AAGAATTTACATCCTACACTAAACTTGCCTTTGCCACCGCATGCAAACCATTTCTTCAAC
TCCTGTCCTTTGGCAAAGTTATTGCTGCTGCTGGACATAACCCAGAGAGTCTCTTCCGCA
TAGTTGACATGTATGATGCTTTAACTGATATTCTTCCTGTCCTTGATGAAGCCTTTGATC
ATGAGGTAGCTGCTCTTCGTGAATGCCTTGGATTGTCAATTAAGGGCATATTTGTGGCTC
TAGAAAAACTGATACGCTGTGATCCATGCAATTCTTCACCACCAGATGGTGGATTGCATC
CAATAACAAGGTATGTGATGAACTATCTTATGGCAGCTTGCGTGTCTCGCCATACTCTGG
AAGAAGTGATGCTTGTGGAGTTTGGTTGTGTTGAAACATGTCCAATCGATCCTGACCGTT
CCACATCATCACTGGCAATCCGCTTTGCTTGGATTGTGGATGTGCTGATAGGGAATCTTG
AGTCCAAATCCAGGATTTATGGTCATGCTCCTCTTGGCTGTGTCTTCCTGATCAACAATG
GGATCTATATAATCAAGAAAGTCAATGGTTGCGAGCTTAAGATCTTGCTGGGTGAGGATT
GGACCAGGGTAATATCTGCAAAGGTTCACCAATGGGTGTTGGAATACCGCCGGGCTACCT
GGGGGAGGGCCATAGCAATACTTGAGACTGGCAGAAGATCTGACAGTAGTTTGAGTATTA
TGTTAGAGAAACTGAACCGCTTCCATAGCTTTGTGGAAGCAATTTGCCAGGTGCAGTCAC
GGTGGGTACTGGTGGATAAGCAGCAAGCAGTGAATTTGAGTATTATGGTTGAGGAGCTGG
TTATTCCAGTGTACAGGGATACAATTGAGATGTTAAAGGCAACAGAGGCTGTAGGGGTTT
CATATGTGCGACCTGAGGACGTGAAGTCACGGATTCAGCGGTTGTTCAAAGCAATGGCCA
AGTCATAGAGTGGCTTTTCTGGCTGTGGCTTTCTGAG