Gene sequences

How To ▶︎

JA

EN

TOP > About the Species(Sorghum bicolor ) > genome data >Gene sequences

Search

By Traits

Let’s Analyze!!

SNP Detection
(lang=JA only)

Other Tools

Data List

All

Trait-Related Loci

Sorghum bicolor

CDS Sequence

CDS ID	EES00043
CDS Infomation	cds chromosome:Sorghum_bicolor_NCBIv3:3:1318586:1321538:1 gene:SORBI_3003G014700 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding description:hypothetical protein
Sequence	ATGGCTGGTGCGGCGCCACCCGCCCTGCGCATGTCGCACGCGCAATTCATCGAGCACCTT CGCTGTGCGGCCTCGTCAGTCCGCACCCGTCGCGCCGGCGACGCTCTCCACGGCTGGGCG CTCAAGTCCGGCGCAGCCTCCCACACGCCTGTCTCCAACTCTCTCATCACCTTCTACTGC TCCCCCCCGCGGCCCCTACTCGGCGCAGCCTTTGCCGTCTTCGCCGACATCCCCGCCGGC TTGCGCGACGTCGCCTCGTGGAACTCCCTCCTCAACCCGCTCTCCCGCCACCAGCCCCTC GCCGCTCTCTCCCATTTCCGCTCCATGATGTCCTCCACCGACGCCGTCCTCCCCACGCCG CACTCCTTCGCCGCCGTGTTCACTGCCGCCGCCCGCGTGCCCTCCGCGTCCGCTGGCGCC GTCGCACACGCGTTCGCGTGCAAGCTGCCGTCCTCCTCTGGCTCCAATAACGTCTTCGTC TCGACCGCCCTTCTCAACATGTACTGCAAGCTGGGAGCTATTTCTGATGCCCGGAGGGTG TTTGATCAAATGCCACATCGGAATGCGGTGTCCTGGGCTGCCATGGTGTCAGGGTATGCC ACAGGGAAGTGTTCTGAGGAGGCTTTTGAGCTCTTCCGGCTGATGCTTCAGGAGTGCCCA TTGGAGAAAAATGAGTTCGTCGCCACAGCTGTTCTTAGCGCAGTTAGCGTGCCACTGGGT TTGCTTATTGGGGTGCAGTTGCATGGGCTGGTATTGAAGGATGGCTTGGTGGGATTTGTG TCCGTGGAGAATTCACTTGTCACAATGTATGCCAAGGCTGAGTGTATGGATGCAGCAATG GCGGTGTTTGGCTCATCTAAGGAGAGGAACTCCATCACATGGTCAGCAATGATCACGGGG TATGCTCAGAATGGGGAAGCAGATTGTGCAGCTACGATGTTCCTACAGATGCATTCGGCA GGTTTCTCACCAACTGAATTCACCTTTGTTGGGATACTGAACGCATCCAGTGATATGGGC GCATTGGTGGTTGGGAAGCAGGCACATGGTTTGATGGTGAAGCTTGGGTTTGAGAGGCAG GTTTATGTGAAGAGTGCACTGGTGGACATGTATGCCAAGTGTGGCTGTACTGGTGATGCG AAAGATGGGTTTCACCAATTGTATGATGTCGATGATGTTGTCATTTGGACAGCGATGATT ACTGGGCATGTGCAGAATGGGGAGCATGAGGAAGCGCTGATGTTGTATTCCAGGATGGAC AAAGAGGGTGTTATGCCCAGTTATTTAACTGTAACTAGTGTACTCAGAGCATGTGCGTGC CTTGCAGCACTGGAGCCTGGGAAGCAATTGCATGCACAAATCTTGAAGTGTGGATTTGGT TTGGGGGGCTCTGTTGGAACAGCTTTGTCTACTATGTATTCAAAGTGTGGAAACCTTGAA GATAGCATGGTTGTGTTCCGAAGGATGCCTGATAGGGATATTATTTCATGGAACTCAATT ATTTCTGGTTTTTCACAACATGGGCGTGGAAGGGACGCACTTGACCTGTTCGAGGAGATG AAGCTAGAGGGAATTGCACCAGATCATATAACATTCATTAATGTCTTATGTGCTTGTAGC CACATGGGCTTAGTTGACAGAGGCTGGTTTTATTTTAGGGCAATGAGCAAAGACTATGGT TTAATTCCTAAGCTTGATCACTATGCTTGCATAGTTGATATTCTTAGCCGAGCAGGCCAG TTAAAAGAAGCAAAGGACTTCATAGAATCAATAACTATTGACCATGGAACATGCCTATGG CGTATAGTCCTAGGGGCATGTCGCAGTCTACGAGATTTTGATGTTGGAGCATATGCAGGT GAACAACTGATGGAATTAGGTACTGAGGACTCATCTGCTTATATATTGTTATCAAACATT TATGCTGCCCAGAGGAAGTGGAATGATGTTGAGCGGGTGAGACATTTGATGAGACTCCGA GGTGTTAGCAAAGATCCAGGGTGTAGCTGGGTTGAGCTTAACAACCAAGTTAATGTGTTT GTTGTTGGGGAACAGCAACACCCTGAAGCGGAAAAAATAAATGTAGAGTTGATTAGGCTA GCGAAACACATGAAGGATGAAGGGTATCGTCAAACATATAAATTCCTGTTTGACGATGAA CTGGATGCACTAAGAGAACGTCATGAAGAACAACAATTGGAGTTGATATCAACAGCGTTT AGCTGA

Peptide Sequence

PEP ID	EES00043
PEP Infomation	pep chromosome:Sorghum_bicolor_NCBIv3:3:1318586:1321538:1 gene:SORBI_3003G014700 transcript:EES00043 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding description:hypothetical protein
Sequence	MAGAAPPALRMSHAQFIEHLRCAASSVRTRRAGDALHGWALKSGAASHTPVSNSLITFYC SPPRPLLGAAFAVFADIPAGLRDVASWNSLLNPLSRHQPLAALSHFRSMMSSTDAVLPTP HSFAAVFTAAARVPSASAGAVAHAFACKLPSSSGSNNVFVSTALLNMYCKLGAISDARRV FDQMPHRNAVSWAAMVSGYATGKCSEEAFELFRLMLQECPLEKNEFVATAVLSAVSVPLG LLIGVQLHGLVLKDGLVGFVSVENSLVTMYAKAECMDAAMAVFGSSKERNSITWSAMITG YAQNGEADCAATMFLQMHSAGFSPTEFTFVGILNASSDMGALVVGKQAHGLMVKLGFERQ VYVKSALVDMYAKCGCTGDAKDGFHQLYDVDDVVIWTAMITGHVQNGEHEEALMLYSRMD KEGVMPSYLTVTSVLRACACLAALEPGKQLHAQILKCGFGLGGSVGTALSTMYSKCGNLE DSMVVFRRMPDRDIISWNSIISGFSQHGRGRDALDLFEEMKLEGIAPDHITFINVLCACS HMGLVDRGWFYFRAMSKDYGLIPKLDHYACIVDILSRAGQLKEAKDFIESITIDHGTCLW RIVLGACRSLRDFDVGAYAGEQLMELGTEDSSAYILLSNIYAAQRKWNDVERVRHLMRLR GVSKDPGCSWVELNNQVNVFVVGEQQHPEAEKINVELIRLAKHMKDEGYRQTYKFLFDDE LDALRERHEEQQLELISTAFS

Transcript Sequence

Transcript ID	EES00043
Transcript Infomation	cdna chromosome:Sorghum_bicolor_NCBIv3:3:1318586:1321538:1 gene:SORBI_3003G014700 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding description:hypothetical protein
Sequence	ATGGCTGGTGCGGCGCCACCCGCCCTGCGCATGTCGCACGCGCAATTCATCGAGCACCTT CGCTGTGCGGCCTCGTCAGTCCGCACCCGTCGCGCCGGCGACGCTCTCCACGGCTGGGCG CTCAAGTCCGGCGCAGCCTCCCACACGCCTGTCTCCAACTCTCTCATCACCTTCTACTGC TCCCCCCCGCGGCCCCTACTCGGCGCAGCCTTTGCCGTCTTCGCCGACATCCCCGCCGGC TTGCGCGACGTCGCCTCGTGGAACTCCCTCCTCAACCCGCTCTCCCGCCACCAGCCCCTC GCCGCTCTCTCCCATTTCCGCTCCATGATGTCCTCCACCGACGCCGTCCTCCCCACGCCG CACTCCTTCGCCGCCGTGTTCACTGCCGCCGCCCGCGTGCCCTCCGCGTCCGCTGGCGCC GTCGCACACGCGTTCGCGTGCAAGCTGCCGTCCTCCTCTGGCTCCAATAACGTCTTCGTC TCGACCGCCCTTCTCAACATGTACTGCAAGCTGGGAGCTATTTCTGATGCCCGGAGGGTG TTTGATCAAATGCCACATCGGAATGCGGTGTCCTGGGCTGCCATGGTGTCAGGGTATGCC ACAGGGAAGTGTTCTGAGGAGGCTTTTGAGCTCTTCCGGCTGATGCTTCAGGAGTGCCCA TTGGAGAAAAATGAGTTCGTCGCCACAGCTGTTCTTAGCGCAGTTAGCGTGCCACTGGGT TTGCTTATTGGGGTGCAGTTGCATGGGCTGGTATTGAAGGATGGCTTGGTGGGATTTGTG TCCGTGGAGAATTCACTTGTCACAATGTATGCCAAGGCTGAGTGTATGGATGCAGCAATG GCGGTGTTTGGCTCATCTAAGGAGAGGAACTCCATCACATGGTCAGCAATGATCACGGGG TATGCTCAGAATGGGGAAGCAGATTGTGCAGCTACGATGTTCCTACAGATGCATTCGGCA GGTTTCTCACCAACTGAATTCACCTTTGTTGGGATACTGAACGCATCCAGTGATATGGGC GCATTGGTGGTTGGGAAGCAGGCACATGGTTTGATGGTGAAGCTTGGGTTTGAGAGGCAG GTTTATGTGAAGAGTGCACTGGTGGACATGTATGCCAAGTGTGGCTGTACTGGTGATGCG AAAGATGGGTTTCACCAATTGTATGATGTCGATGATGTTGTCATTTGGACAGCGATGATT ACTGGGCATGTGCAGAATGGGGAGCATGAGGAAGCGCTGATGTTGTATTCCAGGATGGAC AAAGAGGGTGTTATGCCCAGTTATTTAACTGTAACTAGTGTACTCAGAGCATGTGCGTGC CTTGCAGCACTGGAGCCTGGGAAGCAATTGCATGCACAAATCTTGAAGTGTGGATTTGGT TTGGGGGGCTCTGTTGGAACAGCTTTGTCTACTATGTATTCAAAGTGTGGAAACCTTGAA GATAGCATGGTTGTGTTCCGAAGGATGCCTGATAGGGATATTATTTCATGGAACTCAATT ATTTCTGGTTTTTCACAACATGGGCGTGGAAGGGACGCACTTGACCTGTTCGAGGAGATG AAGCTAGAGGGAATTGCACCAGATCATATAACATTCATTAATGTCTTATGTGCTTGTAGC CACATGGGCTTAGTTGACAGAGGCTGGTTTTATTTTAGGGCAATGAGCAAAGACTATGGT TTAATTCCTAAGCTTGATCACTATGCTTGCATAGTTGATATTCTTAGCCGAGCAGGCCAG TTAAAAGAAGCAAAGGACTTCATAGAATCAATAACTATTGACCATGGAACATGCCTATGG CGTATAGTCCTAGGGGCATGTCGCAGTCTACGAGATTTTGATGTTGGAGCATATGCAGGT GAACAACTGATGGAATTAGGTACTGAGGACTCATCTGCTTATATATTGTTATCAAACATT TATGCTGCCCAGAGGAAGTGGAATGATGTTGAGCGGGTGAGACATTTGATGAGACTCCGA GGTGTTAGCAAAGATCCAGGGTGTAGCTGGGTTGAGCTTAACAACCAAGTTAATGTGTTT GTTGTTGGGGAACAGCAACACCCTGAAGCGGAAAAAATAAATGTAGAGTTGATTAGGCTA GCGAAACACATGAAGGATGAAGGGTATCGTCAAACATATAAATTCCTGTTTGACGATGAA CTGGATGCACTAAGAGAACGTCATGAAGAACAACAATTGGAGTTGATATCAACAGCGTTT AGCTGAGTTCCCAAGTGGTAAGAAAGGTTACTACTGTGATTATTTCAACCAAAAGGAGGA ATTAAAAGGAAAGCTAAAAAAAATTGTAACAAAAAAAAGAATTAAAAGGAAAACTAGAAA AAAATTTAATGAAAAAAAATATTGCTCTAATGCTTGCTATGCTTGTTATTTGAGAAGCAG ATTGGATTCCTACATTTATGATTACCTGTTGAAGAGGAACCTGCAGAACACGGCGAAGGC ATTCCAAGCCGAAAGCAATGTGCCTCCGCTCCTGTTTGTGAGTGCTGTGATCAGATTATA AAACTATCTAGTTGTGCTGCTCTTTTAGTTTCGAAGCTTCTATCTTTTGGCATAAAGGGC CAAACTTTGATTCCTTGAAGCATTAGTTTGAAGCGAAGCACTGAAGTATTGGTCCATATT TATGTTTTGACTAACAGCAACAATAAAGCTTAGTCCCAAACAAAATTGGGGTAGGCGTTT GTATTTTGACTGACACCAAAGTAGGAGTTTTTTTTGGTCGGTTTGTGTCATTGTGTGTGT GTGTGGTGGTGGTGGTGTCATTATGAAAAATGTAATATAATTCCTTGTAATTGATAGTAT TGCCTCTTTTTACATTGCAACAGCGATCGATGCACCAGGGGGGTTTCTCTTTGAATGGTG GTCGGTTTTCTGGGACATCTTCATTGCAGGGACGAACAAGAAGCATTCTGATTCTGCCAC TTCTTACCTTCAG