Plant GARDEN
How To ▶︎

JA

EN

TOP > About the Species(Sorghum bicolor ) > genome data >Gene sequences

Search

By Species By Keywords Genes By Markers By Traits

Let’s Analyze!!

SNP Detection
(lang=JA only) Sequences Other Tools

Data List

All Markers Trait-Related Loci
Sorghum bicolor

CDS Sequence

CDS ID

EER95837
CDS Infomation

cds chromosome:Sorghum_bicolor_NCBIv3:2:2367136:2369285:1 gene:SORBI_3002G025700 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding description:hypothetical protein
Sequence

ATGATGCAGCACACACTGTCCTTGTTGCTTATACCCTCGCTCTTTCTTGGCATCAATCAG
GCCACTTCGAGCATTGACAATGCCGGATTCATCTACAGTGGGTTCAATGGTGCTAACCTC
ACCCTTGATGGCATGGCGACCATCACATCCAGTGGCCTCCTCCAACTGAGTAGTGGCAAT
GGGGAACACAAAGGTCATGCGTTCCACCCTGAGCTGCTGAGGTTCCACAAGGCTCCCCGT
GGCAAGGTGCAGTCTTTCTCTGTTTCTTTTGTGTTTGCCATTCTCTCCATCGCTCCGAAC
TTAAGCTCCCATGGCATGGCCTTCCTCATTTCCCCAAGCACAAACCTCTCTTCCTCGGGT
ACAAGGGGATTCCTAGGGCTCTTCAATAGACAGAATAGTGGCAATGCAAGCAATCATATC
TTTGCTGTTGAGCTCGACACAATCCAGAATACTGAGTTCCAGGACATCAGTGATAATCAC
ATTGGTGTCGATGTTAATGACATCCGCTCGGTGCGATCCAACTACACCGGGTACTATGAT
GACAGCCAAGGCAGATATCAAAACCTGACACTCAATAGCCATGAGCCAATGCAAGTGTGG
GTAGACTATGATGAAGTGACTACTAAGATTAGTGTGACTATTGCTCCTCTCAAGATGTCC
AAACCCATGAGACCACTTATCTTAACAACCTACAACCTATCAACAGTGCTCACAGACCAA
GCATATGTTGGCTTCTCATCGACAACGGGGAGTATTGATTCACAGCACTATGTGCTCGGA
TGGAGCTTTGCTATGAATCAATCTGCTCCTGGTATTGATGTTGACAAGCTACCTAAGCTG
CCCCATGAAGGTTCAAAGAATTCTTCTAAGGTCATGGAAATCGTCATGCCAATAGCAACT
GCAATATTCATTCTTGTGGTAGCTGTTGTCATCTTCCAATTTATGTGGAGACGGTTAAAG
TATGCTGAGCTTCGAGAGGACTGGGAAGTCGAGTTTGGGCCGCATCGTCTCTCATACAAG
GACTTGTTCAGTGCAACACAAGGTTTCAAGAGCAAGCACCTGCTTGGTGTAGGGGGATTT
GGGAGTGTGTACAGAGGGGTTCTTCCAATGTCCAAACTAGAGGTCGCAGTTAAGAAGGTG
TCCCATGAGTCAAGACAAGGTATCAAGGAGTTTATAGCCGAGGTTGTGAGTATTGGCCGT
ATGAGGCATCGCAATCTAGTGCCGCTACTTGGCTATTGTCGAAGAAGAGGTGAACTCCTT
TTGGTTTATGAATTTATGCCAAATGGAAGCCTTGACAAGTATTTGTATGTTGAAGATGAC
AAGCCATCTTTAAATTGGGTGCAAAGGTTTCATATCATCAAAGGCATTGCTTCAGGATTG
CTTTACCTTCATGAGGAGTGGGACCAAGTTGTGATCCATCGAGATATTAAAGCAAGCAAT
GTCCTCCTTGATAATGAGATGAATGCACGACTTGGTGACTTTGGTCTAGCAAAGTTGTAT
GATCATGGTATCGATGCACAAACCACACATGTTGTTGGCACCATGGGCTACATAGCACCT
GAGTTGGCACGTACAGGAAAGGCATCCCCTATCACCGATGTGTTTGCATTTGGAGTGTTT
CTTCTTGAGGTCACTTGTGGGCGAAGACCTGTTGAACACAATAGAGAGAACAACACAGTA
TCGATGTTGGTCGATTGGGTACTAGAGAAATGGCACAAAGGACTGCTAACAAAAGTTGTA
GACCCAAGGATACAAGATGAGTTTGACATTAACCAGACTATCTTGGTGCTAAAGTTAGGG
TTGCTATGTTCCCATCCGGTTCCTGATTCTAGGCCTACCATGCGTCAAGTCATGCAATAC
CTTGATGGAGACATGATGTTGCCAGAGCAAATGCCAGAAAGCTTGACCCTCGGTATGCAA
TTCATGATGCAAAGTGAAGGGTTTGATTCATACATCATGTCACAAGCAACGACAATGGTT
AGTCATGGCACACTAACCGACATCTCGGGTGGGAGATGA

Peptide Sequence

PEP ID

EER95837
PEP Infomation

pep chromosome:Sorghum_bicolor_NCBIv3:2:2367136:2369285:1 gene:SORBI_3002G025700 transcript:EER95837 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding description:hypothetical protein
Sequence

MMQHTLSLLLIPSLFLGINQATSSIDNAGFIYSGFNGANLTLDGMATITSSGLLQLSSGN
GEHKGHAFHPELLRFHKAPRGKVQSFSVSFVFAILSIAPNLSSHGMAFLISPSTNLSSSG
TRGFLGLFNRQNSGNASNHIFAVELDTIQNTEFQDISDNHIGVDVNDIRSVRSNYTGYYD
DSQGRYQNLTLNSHEPMQVWVDYDEVTTKISVTIAPLKMSKPMRPLILTTYNLSTVLTDQ
AYVGFSSTTGSIDSQHYVLGWSFAMNQSAPGIDVDKLPKLPHEGSKNSSKVMEIVMPIAT
AIFILVVAVVIFQFMWRRLKYAELREDWEVEFGPHRLSYKDLFSATQGFKSKHLLGVGGF
GSVYRGVLPMSKLEVAVKKVSHESRQGIKEFIAEVVSIGRMRHRNLVPLLGYCRRRGELL
LVYEFMPNGSLDKYLYVEDDKPSLNWVQRFHIIKGIASGLLYLHEEWDQVVIHRDIKASN
VLLDNEMNARLGDFGLAKLYDHGIDAQTTHVVGTMGYIAPELARTGKASPITDVFAFGVF
LLEVTCGRRPVEHNRENNTVSMLVDWVLEKWHKGLLTKVVDPRIQDEFDINQTILVLKLG
LLCSHPVPDSRPTMRQVMQYLDGDMMLPEQMPESLTLGMQFMMQSEGFDSYIMSQATTMV
SHGTLTDISGGR

Transcript Sequence

Transcript ID

EER95837
Transcript Infomation

cdna chromosome:Sorghum_bicolor_NCBIv3:2:2367136:2369285:1 gene:SORBI_3002G025700 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding description:hypothetical protein
Sequence

GTTAAGCTCGTTGCACACTCCAGCCTATACACCATGATGCAGCACACACTGTCCTTGTTG
CTTATACCCTCGCTCTTTCTTGGCATCAATCAGGCCACTTCGAGCATTGACAATGCCGGA
TTCATCTACAGTGGGTTCAATGGTGCTAACCTCACCCTTGATGGCATGGCGACCATCACA
TCCAGTGGCCTCCTCCAACTGAGTAGTGGCAATGGGGAACACAAAGGTCATGCGTTCCAC
CCTGAGCTGCTGAGGTTCCACAAGGCTCCCCGTGGCAAGGTGCAGTCTTTCTCTGTTTCT
TTTGTGTTTGCCATTCTCTCCATCGCTCCGAACTTAAGCTCCCATGGCATGGCCTTCCTC
ATTTCCCCAAGCACAAACCTCTCTTCCTCGGGTACAAGGGGATTCCTAGGGCTCTTCAAT
AGACAGAATAGTGGCAATGCAAGCAATCATATCTTTGCTGTTGAGCTCGACACAATCCAG
AATACTGAGTTCCAGGACATCAGTGATAATCACATTGGTGTCGATGTTAATGACATCCGC
TCGGTGCGATCCAACTACACCGGGTACTATGATGACAGCCAAGGCAGATATCAAAACCTG
ACACTCAATAGCCATGAGCCAATGCAAGTGTGGGTAGACTATGATGAAGTGACTACTAAG
ATTAGTGTGACTATTGCTCCTCTCAAGATGTCCAAACCCATGAGACCACTTATCTTAACA
ACCTACAACCTATCAACAGTGCTCACAGACCAAGCATATGTTGGCTTCTCATCGACAACG
GGGAGTATTGATTCACAGCACTATGTGCTCGGATGGAGCTTTGCTATGAATCAATCTGCT
CCTGGTATTGATGTTGACAAGCTACCTAAGCTGCCCCATGAAGGTTCAAAGAATTCTTCT
AAGGTCATGGAAATCGTCATGCCAATAGCAACTGCAATATTCATTCTTGTGGTAGCTGTT
GTCATCTTCCAATTTATGTGGAGACGGTTAAAGTATGCTGAGCTTCGAGAGGACTGGGAA
GTCGAGTTTGGGCCGCATCGTCTCTCATACAAGGACTTGTTCAGTGCAACACAAGGTTTC
AAGAGCAAGCACCTGCTTGGTGTAGGGGGATTTGGGAGTGTGTACAGAGGGGTTCTTCCA
ATGTCCAAACTAGAGGTCGCAGTTAAGAAGGTGTCCCATGAGTCAAGACAAGGTATCAAG
GAGTTTATAGCCGAGGTTGTGAGTATTGGCCGTATGAGGCATCGCAATCTAGTGCCGCTA
CTTGGCTATTGTCGAAGAAGAGGTGAACTCCTTTTGGTTTATGAATTTATGCCAAATGGA
AGCCTTGACAAGTATTTGTATGTTGAAGATGACAAGCCATCTTTAAATTGGGTGCAAAGG
TTTCATATCATCAAAGGCATTGCTTCAGGATTGCTTTACCTTCATGAGGAGTGGGACCAA
GTTGTGATCCATCGAGATATTAAAGCAAGCAATGTCCTCCTTGATAATGAGATGAATGCA
CGACTTGGTGACTTTGGTCTAGCAAAGTTGTATGATCATGGTATCGATGCACAAACCACA
CATGTTGTTGGCACCATGGGCTACATAGCACCTGAGTTGGCACGTACAGGAAAGGCATCC
CCTATCACCGATGTGTTTGCATTTGGAGTGTTTCTTCTTGAGGTCACTTGTGGGCGAAGA
CCTGTTGAACACAATAGAGAGAACAACACAGTATCGATGTTGGTCGATTGGGTACTAGAG
AAATGGCACAAAGGACTGCTAACAAAAGTTGTAGACCCAAGGATACAAGATGAGTTTGAC
ATTAACCAGACTATCTTGGTGCTAAAGTTAGGGTTGCTATGTTCCCATCCGGTTCCTGAT
TCTAGGCCTACCATGCGTCAAGTCATGCAATACCTTGATGGAGACATGATGTTGCCAGAG
CAAATGCCAGAAAGCTTGACCCTCGGTATGCAATTCATGATGCAAAGTGAAGGGTTTGAT
TCATACATCATGTCACAAGCAACGACAATGGTTAGTCATGGCACACTAACCGACATCTCG
GGTGGGAGATGAAGCGGTGGTAATAAGATACAAGTAGATTGGCACTACTAATTATTGTAC
TTGTACTTGTGTATGCTATGGAGACATGAGGTTTTGGGCTTTTGGAATAA