Gene sequences

How To ▶︎

JA

EN

TOP > About the Species(Sorghum bicolor ) > genome data >Gene sequences

Search

By Traits

Let’s Analyze!!

SNP Detection
(lang=JA only)

Other Tools

Data List

All

Trait-Related Loci

Sorghum bicolor

CDS Sequence

CDS ID	EER95348
CDS Infomation	cds chromosome:Sorghum_bicolor_NCBIv3:1:74490882:74499055:-1 gene:SORBI_3001G472600 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding description:hypothetical protein
Sequence	ATGTCGACACAGGCCTCTAACCGGTCATACAGATATCCAGACAATACCCAACTACTGTAC CACAATGGCAATCCAATGCATGTTGGGGGCAATGGTAATTACTATGTGCAACAAAATCAT GATGATGTTAACTACATTTCCTCTGATGATGGATCACAGAGCAGTAATTCTAGAGCTCAA GGTTTTCAAGCACAGTTTTGCACCCTAGACTCGTCTTCGGCCAATTGTGTTTATCCTGCA CATAGCTCTACCTCTTCTCAGAGCATAAGTGGAAGCCCTCTGTCTCAGCAAGAGAGCCAC TCTGATCATGCATATGGTTCCTCTCCAAGTGCATCGTGCATTACTCAGGTTCCCACCTGG ACACTTAAGGATCTAGAAAATGTGATGCTTGGACCCGATTCTGACATATGTAGCCCTGAC AGTTCCTTTCTGCCTGGCACTGCCTTGCATGAAAATAACTGGAGAGAACTTTTGGGAATT CAAACTGGGGATTTGAGGCAGTTAATTATAGCATGTGGTAAGGCTGTTGACGAGAATGCT TTCTATATGGATGCACTGATGTCTGAGTTAAGGCCGATGGTTTCTGTCTCTGGTGAACCG ATGCAACGTCTGGGAGCTTACATGTTGGAAGGTCTCATTGCGAGGCTTTCTTTCACTGGA CATGCCCTGTATAAATCTCTGAAGTGCAAAGAGCCTGTGGCTACAAGTTCTGAGCTCATG TCCTATATGCATCTTCTTTATGAGATCTGTCCATTCTTCAAGTTCGGTTACATGTCTGCC AATGGTGCCATAGCTGATGCTGTTAAGGGTGAAGACATTATTCACATCATCGATTTCCAA ATCGCTCAGGGTAGTCAGTGGATGACTATGATACATGCCCTTGCTTCAAGGCCTGGGAGG CGACCATACCTAAGAATAACTGGCATAGATGACTCGAATTCTGCTCATGCCCGAGGTGGT GGACTGGATATGGTTGGACAGAGGTTGCACACAGTGGCCCAGTCGTGTGGTCTGCCCTTC GAGTTCAATGCTGTGCCAGCAGCTAGTCATGAGGTTGTGTTTGAAGATCTTTGTGTAAGA CCTGGTGAGGCCATCGTTGTCAATTTTGCTTATCAGCTGCATCATACTCCTGATGAGAGT GTGGGCACAGAAAACCATCGTGATAGAATCTTGAGAATGGTCAAGAGCCTCTCTCCTAGG GTGGTAACTCTTGTAGAGCAGGAGGCAAACACAAACACGGCACCTTTCTTTCTTAGATAC ATGGAGACTCTTGATTATTACACAGCAATGTTTGAGGCAATAGATGTTGCTTGCCCCAGG GATGATAAGAAGCGCATTAGCACAGAGCAGCACTGTGTTGCAAGGGATATCGTCAATTTA ATTGCTTGTGAAGGTACAGAAAGAATAGAGAGGCATGAGCCTTTTGGAAAATGGAGGGCA AGGCTTGCAATGGCTGGGTTTAGACCATACCCGTTAAGTCCAGTGGTGAACAGAACCATC AAAACACTGCTCGACAGTTACCACAGCTATTACAGGCTTGAGGAGAGAGATGGCATCCTT TATCTTGGCTGGAAGAACAGAAAGCTGGTCGTATCTTCTGCCTGGTGCTGA

Peptide Sequence

PEP ID	EER95348
PEP Infomation	pep chromosome:Sorghum_bicolor_NCBIv3:1:74490882:74499055:-1 gene:SORBI_3001G472600 transcript:EER95348 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding description:hypothetical protein
Sequence	MSTQASNRSYRYPDNTQLLYHNGNPMHVGGNGNYYVQQNHDDVNYISSDDGSQSSNSRAQ GFQAQFCTLDSSSANCVYPAHSSTSSQSISGSPLSQQESHSDHAYGSSPSASCITQVPTW TLKDLENVMLGPDSDICSPDSSFLPGTALHENNWRELLGIQTGDLRQLIIACGKAVDENA FYMDALMSELRPMVSVSGEPMQRLGAYMLEGLIARLSFTGHALYKSLKCKEPVATSSELM SYMHLLYEICPFFKFGYMSANGAIADAVKGEDIIHIIDFQIAQGSQWMTMIHALASRPGR RPYLRITGIDDSNSAHARGGGLDMVGQRLHTVAQSCGLPFEFNAVPAASHEVVFEDLCVR PGEAIVVNFAYQLHHTPDESVGTENHRDRILRMVKSLSPRVVTLVEQEANTNTAPFFLRY METLDYYTAMFEAIDVACPRDDKKRISTEQHCVARDIVNLIACEGTERIERHEPFGKWRA RLAMAGFRPYPLSPVVNRTIKTLLDSYHSYYRLEERDGILYLGWKNRKLVVSSAWC

Transcript Sequence

Transcript ID	EER95348
Transcript Infomation	cdna chromosome:Sorghum_bicolor_NCBIv3:1:74490882:74499055:-1 gene:SORBI_3001G472600 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding description:hypothetical protein
Sequence	ATTCTCCTCGCAACGGCGAGTCGGTGAGGCAGCGGACGCCTCCCCCCCCCCCAGTCCCGA TTCCCGAACCCTCGTTTCGCCTTCTCCGTTTCCGCGAACCTGGTTGCCTCGTCGTCCCCA CCACACAGCCGACCACGCGGCCGCGCCCCGCGTTCCACTCGAGCGAAGCTACTCTACTCG ACCCAGAATCATCTTCTACCCGTGGTAGTCCTCCTCCTCCGCCTCTCTACTACTGCTTGC CGTGGGCGGTGCCGTGGAGTGGGGATCCGTCCGGACTTTCTACCTTTCGCTGGTAAGGAA ACATTGGGTTGCTAGGATGGATTATTGTATTGTTCAAAGCTGTGGAGTTCTGTTCTGCAG GAATCAGCATCTCTTGTTTGCTCTCGAGCAATGGAATTATCGAATCCGAATCCTGCTGGC CGGGATAAAATTCGGAAGCCCCAGCCCATCCGGCTTCTTGTAGATTTGTGTGTTTGTTGT CCGGAGCACCAGTAGTAGTTTGTTTTCCAGAAATTTTGGTGGTTCTGGAAAAGGGAAAAA AAAAAACCCCCGCTCCTCATGTTCAGCTCTTTTTCTCTGATGACTCCGTGTTCATATCGG TCGCTAGGTATAGGGAAATTTTTGCATGAGATAGGTGATAGCTGGGAACAAAGTTCTGGA GAACGTGAACTGCATGACATCAGGCACCGTTAGTTCATCATCTCAGCTTTTTTGACTGCC TGTTTGGTGGGTGAACGTGGTCGTCGGATGCCATGTTTGCTGGGGTGCGATCATGCGTCA CCCAGTTGGCAAGACTGCCTATTTCGTGTATGGACCACGATTTATGGTTTATTATGGTGG CCTTAGGCCTTGTTTAGTTCGCGAAATTTTGGTTTTTTTGGCTACTGTAGCACTTTCGTT TTTATTTGACAAACATTGTCCAATCACGGAGTAACTAGGCTCAAAAGATTCATCTCACAA ATTTCAGTTAAACTGTGTAATTAGTTTTTATTTTTATCTTTATTTAATGCTCCATGCATG CGACCAAAGATTCGATGTGACGGGGAATCTTGAAAATTTTTGCGAACTAAACAAGGCCTT AGTTGCTCTCAAAACGTTGCTGCCACACCAGATCCGATTGGATTTTCGGGCACCCCAGTT AAATGGTGCTATTAACTCCTCTGGATCAGAAAATGACATCTCTCTTGTTTTCTTTGTTTT TCTCTGCTGTCCTTTTGCGTTTGCTCTTGTTCTGCTGCTCTAAGCAGGTGGCTTCCATTC CATCCTAATCCGAGTCTACTCAGCAAGGTTGAGGGGGACTTTGGATACTCGTTACTGTTA GGGAGCCGGTCTACTAGCACATCATGATAGGCTAATAAGTTGGAGTTTAATAATTTGTTT CAGCTTTGAGACATTCATATGTTTAGGAATTACTTTTTTTTTTGTCTAAGTATATAGGAA TATATCAGGATTTGCTTGTGAAACTACTGGGATTCAACTGCAGATTTAATGGATGCACGT GTCCTTTCCCATGCCACACTTCAATGACATATATCTGTGGTATGTCAAGTTGTCAACAAA ACAAACTTTACAGCATATTTATGATGTCCACAAACCCTGCCTTGATGTGTATGTCAAGTT GTCAACAAAACAAACTTTACAGCATATTTATGATGTCCACAAACCCTGCCTTGATGTGCT TGAGCCTCCAAGCTCAATTCCTTGACTCGTCATATCTGCAATTGTCTTGGCGACTATGGT TGTATCTATTTATGTGTTTCGTGTCCAGTTACAGCACACATATAATCATAGGCATCGTGT TTTATATCTTATCTGCAAGTATTTTGCTTACTTTTGTTCTTCCCTTTTATGTTGAACTCA AGAGCAATTTAATATCGAGCACTGCAGGCGAAATGCAATATTCCACTTGTATATAGTAAA GAAAAGAGAGTACCTAGGAACACATAGGTATCCTTTCTCCCACAAAAGAAAAAAAAAATA GGCATCTAAGAAAGATACCAGAATCACAGCTGACAAGGGTAAAGGGTTCAAACCCTAGTG GTGGCGCCTTTCACCCAAAGCTCTGACCAATGAAGCTAGACTTTGTTCCTTACATACCAG TGGACACAATTCCTTATGTCCCTATGTCCTATGATATCATGGTTCACAGAATATCACATG TGGTACTCCTGCAGGCAGGGCCGCAGGGGCGAAGCTAGGATAAAATAGTACCGGGGACGG TCTGACACACAGTACCACTCACTTCGTGATTGTAATAACTAGCAAACGTGTCCGTGCGCT GTAATGGGAGAAAAAAAAATCAAATGTGCATGGGAACGACGATGACAATGATACATATCT ATTTATTTTTTATCATTTCTATAAAATTTAAAATCGATAATTTATTTTATGACGATCATG ACATCCGTAATATAAGTTAATGTTGGCAATAATATAACAGTGCCCTATTAAGCCTGTATC GAAATGAAATACAACCTTGATTGTTTTTTTGTCTCCCCTTGTGAAGCACAGAAATATTCA GAAGTAAATATACTATAAATTAACTTTTCTTATTATCCATCTGCTGCTATAGTAATACGA AGTTTCGAGGACCCATATAAATATGTAGTTCTAATCGCCATGGACGTGAATGAGGAAACA TGAACTCACAGACGTGATGAAGTAAAAAAAACAAACTATCAATGTGAAAGTAGCCATTCA TAGTTACATATGATTTATAATAATAAATTCACTAGTTTACTTGGATGATATTTTCTAGAA TAATAGATACTGCATGTGCAAAGTTAACTCAGAAATTTGTTGGAAAAAGAACTAATCCAC ACGTAAACAATCTCAATCTAGTTCTATCATCTATATAGTAACATATGGCAAGGGTGTCTA TGAACGGAGAGTCTCAGAGTGATTTATCTAGAAATGTGATTATATTCGATTTTCATTGAT GGGGAATCACAGTTTTTTTTGGAGCAAAACAAATCGATAAGATTTGTGGCGTTTTGGGCT GCTAGCATGCAGTAGTGATTAGTGAATAGATCATTAGCTTTGTCACTAGATGGGCTTATT AGCAACCGGGCCGGGGTCATGCTTATTTTTGACCAGGGTCTGTGCTGGTGAAAATTCGCA GGCTACATGGGCTAGTGTCAGGTTGTCGGGGTCGGCCGACCCCGACAACTCAACATAGCT TCGCTCCTGCCAGCGGGTGCTATAATACGAGCATTGACACAACACGCAGCATTAAATGCT ATACAACACAGTATGGATACGGAATCGGACATTTCACTAAAGTTGCCACTACAATGGTGT GGGGCCGTGGACCTTCAAGGGTAAAAAGCATCAAGCATGCAAACATACAATTATCTAACT TCTCATAGTACCAATTTGTTATGTATTGATTATAGCTATTGATTTCACAAGCTGATGACA TAGGTGGTCGCAGTTTCCTATAACATTTTGCTGTTAGCTTATGACCTTATGTCCTATTTG TAAGGGGTACATAAGTTAGCTATGACAAACAAGTTGTTTATGGCATTTTGTTGCTAAGCA CACCACATGGGGGTGCACTATAATTTTGTTGGATATGGCTGACATGTTTAGATTGGGAGT TACACCTAACATGGTTTGCGCTGTGTACCCTTAAGTCTTACCAGAATTATCTCTGCACCC TTTACTTGCCATTTGAACTACAGTTGTTTGCATGACTGCAAATAATTTGGATTGGAGTTT GAATTGTTGTAGGCTCTTCGAGACCAACTAATATTAATTAACCCATTAAATGACTGTATA TGCATCTTTTCTCTGCTGTTTGTTAATTCTCAATCACGGAGAGAAATGTTGCCTGTGGTT GAATCCAGCTTCTCATAGTAGCATTTATCTTATTAAATTTTGTTTTACATTCTGCAATTC TGGGCATTACTTTATGCTTATTTACAGACATTTTTAATTATTTTTTTAACCTAAAGGTTG ACTAAATCTAAATAATAGATTCTAGTTTCCGACCTTGGGAAGAATTCCAATGATAGAGGA AAGGCCGTCCACTACTATATGGGAATGGGGCCCCTGCCTAAGTGCCTTCCTGAGATCGGA CTCAAGGGAAGGGAAGATATCCCTCCAGGAGGTGAGATAGTTAATAAATATTCGTATAGA TAGGGATCTATACGTATATTTATACGGTCTATCAAATAAACTCTATAGATTTATTTAGCT ATCATAGAATTGTATGTATACCCACCCCCTCTGAGGGGTGCCCATCCTCTACTTCACCTC CCGGGAAGGTATGGAAATCTGAAAAAGCAATGGAGTGAACGAAGAACACTCCTCAACTAC CTTGGAGGAGTGTTCGGCGTAGAGAACGGAGTGTAGGCTGAGCTTTTAGGTATAGATTAG CTTGTCTTTTCCGTTAAGGGAAGAGGTTGTTAGCTGTGTTTATCCCTTAAAGGAATTGGG CAATTTCTCTAATAGTAGTGAACCTAACCACTGAATTAAATCCGAAATAGATAGGTTCAC TGATCCATACTTTTTTGGAAAGGGGGTTCAGGGGAAAACCTTTTATAAGGGGTTAAACCT TTCCTGATGTCTTTGGTTGGCAAAAGAATAGGCGTTTCGGATACATAGAGTTCCAATTTT GTATATACGGGTTCTGGTGTCTTCATTAGGGAATTTAGTATGTTGCAATAAAACATCGTG TATTTAGTGCACATTTAGTTAACTAAGTCATAAAAATCCAGCATCAGATTCATCCTAGAC GTCAAGAAATAAGATAAACAATCAATCTGGAACCTTGATAACAAATATAAATTTGAATAA TTTTATTTTTGCATGTTTAATTAGCTTTCTGTACTACGTACGTGGTTTTCAATGACATTT TAGGAACATTGTCACATGTTGTATCATTGTATATTCACTAATGGGGACCCAGAACCCCTG GTCACTAATGAATTCCCCCAGATATATTATGGTCTGTTCTTGCACGCATGTTGTAGTCAG TAGCCATTTATTTTAGTAAAAAGTTCCCTATTGTTTTCTTTCCACATTGTAGTTGATATT ATTCCTTCTCTAGTAATGAAATTGTAATCGTATCCAAGATACATTCATATACAAAAGATG CAAATCTGAGTAGCACCTTACCAGCCAACAGTTCTGTGTAGTTGAACTGGTGATTCTTTT ATATGCTTGAGAGTCCTCAAGCATTTTTTATTTCTCGAAACGCAATCTCTCAGAGCTCTC AAAGTATCTCTTGAACACTAGTTTGTAACGGGATAATTTTTTTTTCCCTATGAACTAGTG TTTCCACTTTTCACCCCAGGGATCATCCACACCTCAAACAGTAAGAACCAAATGTGGTTC CACTGGGCAGTTTATTTTAAGTAGTAATGGTCATTTGATTTCATGTGTTGAATGGAAAAT CAATGTGTCTTCTTTCTTCCTTGCAAGTTCACACTACTGATTTGTCGTTTCTTTAATATC TACCATTATCTTGTTTATGTATAACTTCAGTTTATCTTATCTCTGTCTGTTTGTCATATC TAGTTGATGTCATCATGCTGAGCATTTTGTGGTAGAGACGACAAGATCTTCTCTTTGGGT TCCAGCATACAACTCCTGCCCACAAAATTTGCACTAGAAAATATGTCGACACAGGCCTCT AACCGGTCATACAGATATCCAGACAATACCCAACTACTGTACCACAATGGCAATCCAATG CATGTTGGGGGCAATGGTAATTACTATGTGCAACAAAATCATGATGATGTTAACTACATT TCCTCTGATGATGGATCACAGAGCAGTAATTCTAGAGCTCAAGGTTTTCAAGCACAGTTT TGCACCCTAGACTCGTCTTCGGCCAATTGTGTTTATCCTGCACATAGCTCTACCTCTTCT CAGAGCATAAGTGGAAGCCCTCTGTCTCAGCAAGAGAGCCACTCTGATCATGCATATGGT TCCTCTCCAAGTGCATCGTGCATTACTCAGGTTCCCACCTGGACACTTAAGGATCTAGAA AATGTGATGCTTGGACCCGATTCTGACATATGTAGCCCTGACAGTTCCTTTCTGCCTGGC ACTGCCTTGCATGAAAATAACTGGAGAGAACTTTTGGGAATTCAAACTGGGGATTTGAGG CAGTTAATTATAGCATGTGGTAAGGCTGTTGACGAGAATGCTTTCTATATGGATGCACTG ATGTCTGAGTTAAGGCCGATGGTTTCTGTCTCTGGTGAACCGATGCAACGTCTGGGAGCT TACATGTTGGAAGGTCTCATTGCGAGGCTTTCTTTCACTGGACATGCCCTGTATAAATCT CTGAAGTGCAAAGAGCCTGTGGCTACAAGTTCTGAGCTCATGTCCTATATGCATCTTCTT TATGAGATCTGTCCATTCTTCAAGTTCGGTTACATGTCTGCCAATGGTGCCATAGCTGAT GCTGTTAAGGGTGAAGACATTATTCACATCATCGATTTCCAAATCGCTCAGGGTAGTCAG TGGATGACTATGATACATGCCCTTGCTTCAAGGCCTGGGAGGCGACCATACCTAAGAATA ACTGGCATAGATGACTCGAATTCTGCTCATGCCCGAGGTGGTGGACTGGATATGGTTGGA CAGAGGTTGCACACAGTGGCCCAGTCGTGTGGTCTGCCCTTCGAGTTCAATGCTGTGCCA GCAGCTAGTCATGAGGTTGTGTTTGAAGATCTTTGTGTAAGACCTGGTGAGGCCATCGTT GTCAATTTTGCTTATCAGCTGCATCATACTCCTGATGAGAGTGTGGGCACAGAAAACCAT CGTGATAGAATCTTGAGAATGGTCAAGAGCCTCTCTCCTAGGGTGGTAACTCTTGTAGAG CAGGAGGCAAACACAAACACGGCACCTTTCTTTCTTAGATACATGGAGACTCTTGATTAT TACACAGCAATGTTTGAGGCAATAGATGTTGCTTGCCCCAGGGATGATAAGAAGCGCATT AGCACAGAGCAGCACTGTGTTGCAAGGGATATCGTCAATTTAATTGCTTGTGAAGGTACA GAAAGAATAGAGAGGCATGAGCCTTTTGGAAAATGGAGGGCAAGGCTTGCAATGGCTGGG TTTAGACCATACCCGTTAAGTCCAGTGGTGAACAGAACCATCAAAACACTGCTCGACAGT TACCACAGCTATTACAGGCTTGAGGAGAGAGATGGCATCCTTTATCTTGGCTGGAAGAAC AGAAAGCTGGTCGTATCTTCTGCCTGGTGCTGATATTTCCATTTTTTTTGAAGAAGCTTT GTTAAGGTATATTGCTGGCATCTCACAGATCTTGAACTGCTTATTATTCCAAACGTAGGC ATGTCTGTGACAACTTAAAGTTTCCAAGCTTGGGACCACTTCAGGTCTTGTAGGTGACTT GGTATATCTTCCATTTTGGCAAGGAAACCAATTAATAATAATATCTGTCTCAGTGATTGC TACTTTCCAAGCTTGGAATTGCCAGTCTTTTTGGTGGCAATATAGTTCTGTACTTAGGGG AGGAAACAAATCAATGATAGGTTCCATACTCACATTGTACCTTTCCATTAAAATTTGACT GGGATTATAGCCCAATGTGAATGTCTTCTACCTGAAGTCCCTGTATAGAATTGCCGCATT GGTTTTGCCAAATCTCATAATCTTACAGAACAATGGACTGTTATGCTTATTCGGTGGGCT GTTGCTTGATGCATTTTATGCTGTATTGCTGCATGATGACATAATGTCTATCGAGAAAAG TTTGTTTATAGCTTGACCTATTCATGCCATTCATACGCATATTCCTTTAAAGAACATTGT TGCTTAGTTTCTTTCTATTTTGTTCCCTGCAGGTGCTTTCGCGGCTTTGTGTTCAGCACA TGAATCCAAAGGTGGAACCTAAACTTAAATATGATGACTAAACAATCATAAACAAGCTGG TTGCTTCCTTACTGTTTGTTGCCCAGCTTTGCAACTCTCCCATGCTCACCATCATCTCGG ACTAGCTGGTTCATCTCTGATGTACTTACCATATGACTCAGTTCCATCCTTATATAGGTG CAAACAGTAGTTTCATCACCCTCTTGTACTGGTCTTAATACTTACCATATGACTCAGTTC CATCCTTATATGTTGCTAGAATCTGGTATCAGCTTCCGAATCTGGACTGCTGAATCATGT ATGTTCCATTTAGC