Plant GARDEN
How To ▶︎

JA

EN

TOP > About the Species(Solanum tuberosum ) > genome data >Gene sequences

Search

By Species By Keywords Genes By Markers By Traits

Let’s Analyze!!

SNP Detection
(lang=JA only) Sequences Other Tools

Data List

All Markers Trait-Related Loci
Solanum tuberosum

CDS Sequence

CDS ID

PGSC0003DMT400097397
CDS Infomation

pacid=37425816 polypeptide=PGSC0003DMP400069072 locus=PGSC0003DMG400046968 ID=PGSC0003DMT400097397.v4.03 annot-version=v4.03
Sequence

ATGATCAAAAAGACAATAGCAAGCAGGAGTTCAAATCTTCACCGACAATCATCACTATGG
AGCAAATGCAAAGATGTCCAATCCCTAAAGCAAATTCATGCTTTGATGATCATCAATGGC
TTCAACTCCAATCGCATTGCTCTCAGGGAGCTCATACATGCTTCTGCTGTTACTTTCTCA
GCATCTATTCACTATGCCCACAAGCTGTTTGCTCAAATTACTCAACCAGATCTCTTCATG
TGGAACACCATGCTTAGAGGGTCAGCTCAGAGTCACAGGCCTTCTCTTGCTGTTTCCGTT
TATACCCAGATGGAAAAACGTTCCATACTTCCGGATAGTTATACTTTTCCGTTTCTACTC
AAAGCATGTACCAAGCTTTCTTGGCTTGTTTCTGGCCTTACCGTACATGGGAAAATTGTG
AAACATGGGTTTGAATCTAATAAATTTGCGAGGAATACCCTTATATATTTTCACGCTAAT
GTTGGAGATATAAGAATTGCAGGCCAACTTTTTGATGGTTCTGCTAAGAGGGACGTTGTT
GCTTGGTCTGCTTTGACTGCTGGATATGCGAGGAGAGGGGAATTGGATGCGGCAAGGAGG
CTTTTTGATGATATGCCGGTTAAAGACTTGGTTTCTTGGAATGTAATGATCACTGGGTAT
GTGAAGCAAGGGAAGATGGAGAATGCGAGGGAGATGTTTGATATTGTGCCAAAGAGGGAT
GTTGTGACTTGGAATGCCATGATTTCTGGATATGTGCTTTGTGGAGAAAATGAGAAGGCT
TTGAAAATGTACGAAGAGATGAGAGGTGCAGGGGAATACCCTGATGAAGTCACTATGTTG
CACCTTTTATCCGCTTGCACGGATTCAGCATTCTTGGATGTTGGCGAGCAGATACATCGA
TCAATTATTGAGATGGGTGCAGGCGAGTTAAGCGTATTTCTTGGTAATGCACTTGTAGAC
ATGTATGCTAGGTGTGGCAGCATTAGTAAGGCACTTGAAGTGTTTCAAGGCATGAGAGAG
AAGGACGTGTCGTCTTGGAACATAATTATATTAGGATTAGCTTTCCATGGTCATTCTGAA
GAATGTATCTCTCTTTTTGAAGATATGAGGAGAATGAAGTATATCCCTAATGAAATTACT
TTTGTTGGTGTATTGGTTGCTTGTAGTCACGCTGGTAAAGTTGATTATGGCCAAGAATAT
TTCAACATGATGAGAACTGACTACAATATTGAGACAAACATAAGGCACTATGGTTGTATG
GTGGATATGCTAGCACGTGCAGGACTATTGAATGAAGCGTTTGAATTCATAAACACGATG
GAGATTAAACCTAATGCTATTATATGGAGAACACTGCTAGGAGCTTGTAAAGTTCATTCC
AATGTCGAGCTGGGAAGGTATGCTAATGAGCAGTTGCTTAAATTGGGAAGGGAAGACAGT
GGGGACTATGTCTTACTGTCTAATATCTATGCGTCAAGGGATGAATGGGATGGTGTTGAA
AGGGTGAGGAAGTTGATGGATGACAATGGGGTTTGGAAAGAACCTGGTTGTACTTTAATT
GAGGCTGATGATTATGATCTCAAGAATTTTTGTTTTGATTCCAAGCGTAAACACTCTTGA

Peptide Sequence

PEP ID

PGSC0003DMP400069072
PEP Infomation

pacid=37425816 transcript=PGSC0003DMT400097397 locus=PGSC0003DMG400046968 ID=PGSC0003DMT400097397.v4.03 annot-version=v4.03
Sequence

MIKKTIASRSSNLHRQSSLWSKCKDVQSLKQIHALMIINGFNSNRIALRELIHASAVTFS
ASIHYAHKLFAQITQPDLFMWNTMLRGSAQSHRPSLAVSVYTQMEKRSILPDSYTFPFLL
KACTKLSWLVSGLTVHGKIVKHGFESNKFARNTLIYFHANVGDIRIAGQLFDGSAKRDVV
AWSALTAGYARRGELDAARRLFDDMPVKDLVSWNVMITGYVKQGKMENAREMFDIVPKRD
VVTWNAMISGYVLCGENEKALKMYEEMRGAGEYPDEVTMLHLLSACTDSAFLDVGEQIHR
SIIEMGAGELSVFLGNALVDMYARCGSISKALEVFQGMREKDVSSWNIIILGLAFHGHSE
ECISLFEDMRRMKYIPNEITFVGVLVACSHAGKVDYGQEYFNMMRTDYNIETNIRHYGCM
VDMLARAGLLNEAFEFINTMEIKPNAIIWRTLLGACKVHSNVELGRYANEQLLKLGREDS
GDYVLLSNIYASRDEWDGVERVRKLMDDNGVWKEPGCTLIEADDYDLKNFCFDSKRKHS*

Transcript Sequence

Transcript ID

PGSC0003DMT400097397
Transcript Infomation

pacid=37425816 locus=PGSC0003DMG400046968 ID=PGSC0003DMT400097397.v4.03 annot-version=v4.03
Sequence

ATGATCAAAAAGACAATAGCAAGCAGGAGTTCAAATCTTCACCGACAATCATCACTATGG
AGCAAATGCAAAGATGTCCAATCCCTAAAGCAAATTCATGCTTTGATGATCATCAATGGC
TTCAACTCCAATCGCATTGCTCTCAGGGAGCTCATACATGCTTCTGCTGTTACTTTCTCA
GCATCTATTCACTATGCCCACAAGCTGTTTGCTCAAATTACTCAACCAGATCTCTTCATG
TGGAACACCATGCTTAGAGGGTCAGCTCAGAGTCACAGGCCTTCTCTTGCTGTTTCCGTT
TATACCCAGATGGAAAAACGTTCCATACTTCCGGATAGTTATACTTTTCCGTTTCTACTC
AAAGCATGTACCAAGCTTTCTTGGCTTGTTTCTGGCCTTACCGTACATGGGAAAATTGTG
AAACATGGGTTTGAATCTAATAAATTTGCGAGGAATACCCTTATATATTTTCACGCTAAT
GTTGGAGATATAAGAATTGCAGGCCAACTTTTTGATGGTTCTGCTAAGAGGGACGTTGTT
GCTTGGTCTGCTTTGACTGCTGGATATGCGAGGAGAGGGGAATTGGATGCGGCAAGGAGG
CTTTTTGATGATATGCCGGTTAAAGACTTGGTTTCTTGGAATGTAATGATCACTGGGTAT
GTGAAGCAAGGGAAGATGGAGAATGCGAGGGAGATGTTTGATATTGTGCCAAAGAGGGAT
GTTGTGACTTGGAATGCCATGATTTCTGGATATGTGCTTTGTGGAGAAAATGAGAAGGCT
TTGAAAATGTACGAAGAGATGAGAGGTGCAGGGGAATACCCTGATGAAGTCACTATGTTG
CACCTTTTATCCGCTTGCACGGATTCAGCATTCTTGGATGTTGGCGAGCAGATACATCGA
TCAATTATTGAGATGGGTGCAGGCGAGTTAAGCGTATTTCTTGGTAATGCACTTGTAGAC
ATGTATGCTAGGTGTGGCAGCATTAGTAAGGCACTTGAAGTGTTTCAAGGCATGAGAGAG
AAGGACGTGTCGTCTTGGAACATAATTATATTAGGATTAGCTTTCCATGGTCATTCTGAA
GAATGTATCTCTCTTTTTGAAGATATGAGGAGAATGAAGTATATCCCTAATGAAATTACT
TTTGTTGGTGTATTGGTTGCTTGTAGTCACGCTGGTAAAGTTGATTATGGCCAAGAATAT
TTCAACATGATGAGAACTGACTACAATATTGAGACAAACATAAGGCACTATGGTTGTATG
GTGGATATGCTAGCACGTGCAGGACTATTGAATGAAGCGTTTGAATTCATAAACACGATG
GAGATTAAACCTAATGCTATTATATGGAGAACACTGCTAGGAGCTTGTAAAGTTCATTCC
AATGTCGAGCTGGGAAGGTATGCTAATGAGCAGTTGCTTAAATTGGGAAGGGAAGACAGT
GGGGACTATGTCTTACTGTCTAATATCTATGCGTCAAGGGATGAATGGGATGGTGTTGAA
AGGGTGAGGAAGTTGATGGATGACAATGGGGTTTGGAAAGAACCTGGTTGTACTTTAATT
GAGGCTGATGATTATGATCTCAAGAATTTTTGTTTTGATTCCAAGCGTAAACACTCTTGA