Plant GARDEN
How To ▶︎

JA

EN

TOP > About the Species(Solanum tuberosum ) > genome data >Gene sequences

Search

By Species By Keywords Genes By Markers By Traits

Let’s Analyze!!

SNP Detection
(lang=JA only) Sequences Other Tools

Data List

All Markers Trait-Related Loci
Solanum tuberosum

CDS Sequence

CDS ID

PGSC0003DMT400096862
CDS Infomation

pacid=37447995 polypeptide=PGSC0003DMP400068537 locus=PGSC0003DMG400046433 ID=PGSC0003DMT400096862.v4.03 annot-version=v4.03
Sequence

ATGACACTCTCTTTACCTATCACTATCCTCCACTTTATCCCAAGCTCAGATCCCCCTTAC
AAACTCCTCCAAACTCATCCATCTTTTTCCCTCTTATCCAAATGCAAAAACATGGAAGAT
CTCAAGAAAGTTCATTCCCATTTCATCAAATTTGGTTTACACAATACCCAATTTGCACTA
AGCAAATTACTTGAATTTTGTGCCACTAAACCATATGGTGATTTCTCATATGCTTTATCA
ATCTTTAATACTACTGATGAACCTAATCACGTTATGTATAACATGATAATTAGAGGATAT
TCATTGAGTTCATCTCCAAGTTTCGCCATTGATTTCTATGAAAAAATGCTTTTTTCGGGT
AATCGACCGAATTCGTATACATTTCCGTTTCTTTTAAAATCTTGTGCGAAAATAATGGAT
ACCCAGATGGGGAAAATGATTCATGGACATGTTTTTAAGCTTGGGTTGATGACTGATGTT
TATGTACATGCTTCACTTATCAATATGTATGCTCAAAATGGTGAAATGGATGATGCAAGA
TTGGTGTTTGATAAAAGTTCTAAGAGAGATGCTGTGTCGTTCACCGCGTTGATTAATGGG
TATGCGTTGAAGGGACGTGTCGGTGATGCTCGGGAACTGTTTGATGAAATGCCTGTGAGA
GATGTTGTTTCGTGGAATGCAATGATTTCAGGGTATGCTCAGGTGGGACGGTTTGAGGAG
GCGTTAGTGTTGTTTGAGGAGATGAGAAATGTGAATGTGGAACCTTCGGTGAGCACGTTG
TTGAGTGTTCTATCTGCGTGTGCTCGTGTAGGTGAACTTAAATTGGGGAATTGGGTGAGA
TCATGGATTGAAGATCATGGACTTGGTTTGAATATTCGTCTTGTTAATGCACTTATTGAT
ATGTACGCAAAATGTGGCGATGTGAAGACGGCAAGGATGTTATTCGAGGGTCTAGAGGAG
AAAGATCTCGTGTCGTGGAATGTTATGATTGGGGGTTATACACATACTGGCTATTATAAA
GATGCATTGTCTGTTTTTCATCGAATGCAGCAAGAAGTTATCGATCCTAATGATGTTACA
TTGCTGAGCATACTTCCAGCTTGTGCACATTTAGGTGCTCTAGATCTTGGTAAGTGGATA
CATGTCTATATTGACAAGCATTATCAACACTTGCAAAACACTTCTCTATGGACTAGTCTG
ATAAATATGTATGCAAAATGTGGAGCCATCGCAGCAGCAAAACAAGTCTTTCAGGGAATG
AAAATGAAAACTTTAGCTTCGTATAATGTGATGATCTCAGGGCTAGCAATGCATGGTGAT
GCTTATGAAGCTCTGGAGCTGTTCCGTAAAATGACAGAGGAAAGTATGAAGCCAGATGAT
ATAACATTTGTTAGTGTTTTATCAGCTTGTAATCACGCTGGTCTAGTGGATCTTGGTCGA
GAATATTTTAATACCATGATCCAAAGCTACAAGTACACACCAAAGTTGCAGCATTATGGA
TGTATGATTGACCTTCTAGGACGAGCAGGAAAATTCGATGAAGCAATGACCATGATCGAA
AGCATGGAGATTAAACCCGATGGTGCAATATGGGGTTCCTTGCTAGGTTCTTGTAGAATC
CACAAGAATCTTGAGTTGGGTGAATATGCTGCCAAGAATTTATTTGAACTAGAACCCGAG
AATCCTGGTGCCTATGTACTCTTATCCAACATCTATGCCGGTGCTGGAAATTGGGACAAA
GTAGCATCGATAAGAACTTTTTTAAATGATCAAGGAATGAAGAAAGTTCCTGGTTGTACC
TCCATTGAGATTGATAGAGTAGTCCATGAGTTTCTTGTTAGTGATAGAACACATCCGCAA
AGCAACGACATTTATAAAATGTTGGATGAAGTCGATAGGCTATTGGAAATGGCTGGCCAT
GCTCCAGATACATCAGAGGTACATTATGAAATGGATGAGGAGTGGAAGGAAGAAAAACTA
AATCAACATAGCGAGAAGTTGGCGATTGCCTTTGGATTGATCAGCACAAAGCCAGGGACA
ACTCTCAGGATTGTTAAGAACCTTAGAGTGTGTGGGAATTGTCATGAAGCCACGAAGATG
ATATCGAAGATATTTAACAGGGAGATCATCGCAAGAGACAGGAATCGATTTCACCATTTC
AAAAACGGTTCTTGCTCGTGCTTGGACTATTGGTGA

Peptide Sequence

PEP ID

PGSC0003DMP400068537
PEP Infomation

pacid=37447995 transcript=PGSC0003DMT400096862 locus=PGSC0003DMG400046433 ID=PGSC0003DMT400096862.v4.03 annot-version=v4.03
Sequence

MTLSLPITILHFIPSSDPPYKLLQTHPSFSLLSKCKNMEDLKKVHSHFIKFGLHNTQFAL
SKLLEFCATKPYGDFSYALSIFNTTDEPNHVMYNMIIRGYSLSSSPSFAIDFYEKMLFSG
NRPNSYTFPFLLKSCAKIMDTQMGKMIHGHVFKLGLMTDVYVHASLINMYAQNGEMDDAR
LVFDKSSKRDAVSFTALINGYALKGRVGDARELFDEMPVRDVVSWNAMISGYAQVGRFEE
ALVLFEEMRNVNVEPSVSTLLSVLSACARVGELKLGNWVRSWIEDHGLGLNIRLVNALID
MYAKCGDVKTARMLFEGLEEKDLVSWNVMIGGYTHTGYYKDALSVFHRMQQEVIDPNDVT
LLSILPACAHLGALDLGKWIHVYIDKHYQHLQNTSLWTSLINMYAKCGAIAAAKQVFQGM
KMKTLASYNVMISGLAMHGDAYEALELFRKMTEESMKPDDITFVSVLSACNHAGLVDLGR
EYFNTMIQSYKYTPKLQHYGCMIDLLGRAGKFDEAMTMIESMEIKPDGAIWGSLLGSCRI
HKNLELGEYAAKNLFELEPENPGAYVLLSNIYAGAGNWDKVASIRTFLNDQGMKKVPGCT
SIEIDRVVHEFLVSDRTHPQSNDIYKMLDEVDRLLEMAGHAPDTSEVHYEMDEEWKEEKL
NQHSEKLAIAFGLISTKPGTTLRIVKNLRVCGNCHEATKMISKIFNREIIARDRNRFHHF
KNGSCSCLDYW*

Transcript Sequence

Transcript ID

PGSC0003DMT400096862
Transcript Infomation

pacid=37447995 locus=PGSC0003DMG400046433 ID=PGSC0003DMT400096862.v4.03 annot-version=v4.03
Sequence

ATGACACTCTCTTTACCTATCACTATCCTCCACTTTATCCCAAGCTCAGATCCCCCTTAC
AAACTCCTCCAAACTCATCCATCTTTTTCCCTCTTATCCAAATGCAAAAACATGGAAGAT
CTCAAGAAAGTTCATTCCCATTTCATCAAATTTGGTTTACACAATACCCAATTTGCACTA
AGCAAATTACTTGAATTTTGTGCCACTAAACCATATGGTGATTTCTCATATGCTTTATCA
ATCTTTAATACTACTGATGAACCTAATCACGTTATGTATAACATGATAATTAGAGGATAT
TCATTGAGTTCATCTCCAAGTTTCGCCATTGATTTCTATGAAAAAATGCTTTTTTCGGGT
AATCGACCGAATTCGTATACATTTCCGTTTCTTTTAAAATCTTGTGCGAAAATAATGGAT
ACCCAGATGGGGAAAATGATTCATGGACATGTTTTTAAGCTTGGGTTGATGACTGATGTT
TATGTACATGCTTCACTTATCAATATGTATGCTCAAAATGGTGAAATGGATGATGCAAGA
TTGGTGTTTGATAAAAGTTCTAAGAGAGATGCTGTGTCGTTCACCGCGTTGATTAATGGG
TATGCGTTGAAGGGACGTGTCGGTGATGCTCGGGAACTGTTTGATGAAATGCCTGTGAGA
GATGTTGTTTCGTGGAATGCAATGATTTCAGGGTATGCTCAGGTGGGACGGTTTGAGGAG
GCGTTAGTGTTGTTTGAGGAGATGAGAAATGTGAATGTGGAACCTTCGGTGAGCACGTTG
TTGAGTGTTCTATCTGCGTGTGCTCGTGTAGGTGAACTTAAATTGGGGAATTGGGTGAGA
TCATGGATTGAAGATCATGGACTTGGTTTGAATATTCGTCTTGTTAATGCACTTATTGAT
ATGTACGCAAAATGTGGCGATGTGAAGACGGCAAGGATGTTATTCGAGGGTCTAGAGGAG
AAAGATCTCGTGTCGTGGAATGTTATGATTGGGGGTTATACACATACTGGCTATTATAAA
GATGCATTGTCTGTTTTTCATCGAATGCAGCAAGAAGTTATCGATCCTAATGATGTTACA
TTGCTGAGCATACTTCCAGCTTGTGCACATTTAGGTGCTCTAGATCTTGGTAAGTGGATA
CATGTCTATATTGACAAGCATTATCAACACTTGCAAAACACTTCTCTATGGACTAGTCTG
ATAAATATGTATGCAAAATGTGGAGCCATCGCAGCAGCAAAACAAGTCTTTCAGGGAATG
AAAATGAAAACTTTAGCTTCGTATAATGTGATGATCTCAGGGCTAGCAATGCATGGTGAT
GCTTATGAAGCTCTGGAGCTGTTCCGTAAAATGACAGAGGAAAGTATGAAGCCAGATGAT
ATAACATTTGTTAGTGTTTTATCAGCTTGTAATCACGCTGGTCTAGTGGATCTTGGTCGA
GAATATTTTAATACCATGATCCAAAGCTACAAGTACACACCAAAGTTGCAGCATTATGGA
TGTATGATTGACCTTCTAGGACGAGCAGGAAAATTCGATGAAGCAATGACCATGATCGAA
AGCATGGAGATTAAACCCGATGGTGCAATATGGGGTTCCTTGCTAGGTTCTTGTAGAATC
CACAAGAATCTTGAGTTGGGTGAATATGCTGCCAAGAATTTATTTGAACTAGAACCCGAG
AATCCTGGTGCCTATGTACTCTTATCCAACATCTATGCCGGTGCTGGAAATTGGGACAAA
GTAGCATCGATAAGAACTTTTTTAAATGATCAAGGAATGAAGAAAGTTCCTGGTTGTACC
TCCATTGAGATTGATAGAGTAGTCCATGAGTTTCTTGTTAGTGATAGAACACATCCGCAA
AGCAACGACATTTATAAAATGTTGGATGAAGTCGATAGGCTATTGGAAATGGCTGGCCAT
GCTCCAGATACATCAGAGGTACATTATGAAATGGATGAGGAGTGGAAGGAAGAAAAACTA
AATCAACATAGCGAGAAGTTGGCGATTGCCTTTGGATTGATCAGCACAAAGCCAGGGACA
ACTCTCAGGATTGTTAAGAACCTTAGAGTGTGTGGGAATTGTCATGAAGCCACGAAGATG
ATATCGAAGATATTTAACAGGGAGATCATCGCAAGAGACAGGAATCGATTTCACCATTTC
AAAAACGGTTCTTGCTCGTGCTTGGACTATTGGTGA