Plant GARDEN
How To ▶︎

JA

EN

TOP > About the Species(Solanum tuberosum ) > genome data >Gene sequences

Search

By Species By Keywords Genes By Markers By Traits

Let’s Analyze!!

SNP Detection
(lang=JA only) Sequences Other Tools

Data List

All Markers Trait-Related Loci
Solanum tuberosum

CDS Sequence

CDS ID

PGSC0003DMT400096449
CDS Infomation

pacid=37440557 polypeptide=PGSC0003DMP400068124 locus=PGSC0003DMG400046020 ID=PGSC0003DMT400096449.v4.03 annot-version=v4.03
Sequence

ATGGAACTTCCCTCAAATTTATCACCAGACGAGGCAAGTCCGGAATGGATGAACAAAGGT
GACAACGCGTGGCAGCTCACGGCTGCCACCCTAGTCGGGCTCCAGTGTGTGCCCGGCTTA
GTCATTCTCTATGGTGGCATGGTGAAGAAGAAATGGGCAATTAATTCCGCTTTCATGGCA
CTCTATGCCTTTGCCTCCGTTCTCATATGTTGGGTTGGATGGGGCTACCGGATGTCATTC
GGTGACAAGCTCGTGGCCTTCTGGGGAAAACCGTCTGTCGCCTTGGATGAGAAGTATCTT
CTTGGACAAGCATTTCTGGGATACTTCCCCACAGCAACAATGGTGTTTTTTCAGTTTGTT
TTCGCAGCCATTACGCCAATCTTGATCGCTGGGGCTCTTCTTGGGAGGATGAATTTTATA
GCTTGGATGTTGTTCGTGCCTTTGTGGCATACTTTTTCGTATACCATTGGCACATTTAGC
ATTTGGTGCCCAGATGGATGGCTGTCCAAGCTAGGAGTGATTGATTTTGCAGGAGGCTTT
GTTATTCATCTCTCTTCTGGTGTTGCTGGATTTACTGCGGCTTATTGGGTAGGTCCCAGG
CTGGACAAAGACAGAGAGAGGTTTCCACCAAACAACATTCTCATGATGTTAGCCGGCGCC
GGCCTTTTATGGATGGGTTGGACTGGGTTCAACGGAGGAGCACCTTATACTGCCAGCACT
GACGCCTCCTTAGCCATATTGAATACACATGTCTGCACCGCCACCAGCCTCCTTACTTGG
CTGGTCCTAGATATTGCTGTTTCTGGCAAACCCTCTGTGATCGGAGCTGTTAATGGCATG
ATCACCGGCCTTGTTTGCATCACCCCTGGTGCAGGAGTTGTTCAAAGTTGGGCGGCCATC
CTAATGGGCTTAATTTCAGGAAGTGTTCCATGGTACACAATGACAATCCTTCACAAGAAG
GTCAAGCTCTTAAGGCATGTCGACGACACCTTATCTGTCTTCCATACCCATGCCCTAGCG
GGGATTTTAGGCGGTATCCTCACTGGATTTTTTGCTGTGCCAAAACTCTGTAGGCTATTT
TACCTCGTACCTGAATGGGAAAGGTACATCGGCCTAGCCTATGGTTTGCAGACAGGCCGG
ACCTCAGCTGGGCTACGGCAAATGGGAGCTCAACTAGCTGGTATCGGATTCATAGTATGT
CTAAATATTGTCACGACAAGCTTGGTCTGTCTGTTCATCAAGTTGATAGTGCCTCTTAGG
TTGGACGAAGGGGTGCTGCAAATTGGAGATGACGCTATCCATGGAGAGGAAGCATATGTA
TTATGGGATGATGAAGAGAAATATGAAAATACCCAGGTTAATTCTGCATATGATGCTGAT
GAGTATCCATCAGCTGTTTCAAAGACTTTGAGTGAACTCCAAATGGTATGA

Peptide Sequence

PEP ID

PGSC0003DMP400068124
PEP Infomation

pacid=37440557 transcript=PGSC0003DMT400096449 locus=PGSC0003DMG400046020 ID=PGSC0003DMT400096449.v4.03 annot-version=v4.03
Sequence

MELPSNLSPDEASPEWMNKGDNAWQLTAATLVGLQCVPGLVILYGGMVKKKWAINSAFMA
LYAFASVLICWVGWGYRMSFGDKLVAFWGKPSVALDEKYLLGQAFLGYFPTATMVFFQFV
FAAITPILIAGALLGRMNFIAWMLFVPLWHTFSYTIGTFSIWCPDGWLSKLGVIDFAGGF
VIHLSSGVAGFTAAYWVGPRLDKDRERFPPNNILMMLAGAGLLWMGWTGFNGGAPYTAST
DASLAILNTHVCTATSLLTWLVLDIAVSGKPSVIGAVNGMITGLVCITPGAGVVQSWAAI
LMGLISGSVPWYTMTILHKKVKLLRHVDDTLSVFHTHALAGILGGILTGFFAVPKLCRLF
YLVPEWERYIGLAYGLQTGRTSAGLRQMGAQLAGIGFIVCLNIVTTSLVCLFIKLIVPLR
LDEGVLQIGDDAIHGEEAYVLWDDEEKYENTQVNSAYDADEYPSAVSKTLSELQMV*

Transcript Sequence

Transcript ID

PGSC0003DMT400096449
Transcript Infomation

pacid=37440557 locus=PGSC0003DMG400046020 ID=PGSC0003DMT400096449.v4.03 annot-version=v4.03
Sequence

ATGGAACTTCCCTCAAATTTATCACCAGACGAGGCAAGTCCGGAATGGATGAACAAAGGT
GACAACGCGTGGCAGCTCACGGCTGCCACCCTAGTCGGGCTCCAGTGTGTGCCCGGCTTA
GTCATTCTCTATGGTGGCATGGTGAAGAAGAAATGGGCAATTAATTCCGCTTTCATGGCA
CTCTATGCCTTTGCCTCCGTTCTCATATGTTGGGTTGGATGGGGCTACCGGATGTCATTC
GGTGACAAGCTCGTGGCCTTCTGGGGAAAACCGTCTGTCGCCTTGGATGAGAAGTATCTT
CTTGGACAAGCATTTCTGGGATACTTCCCCACAGCAACAATGGTGTTTTTTCAGTTTGTT
TTCGCAGCCATTACGCCAATCTTGATCGCTGGGGCTCTTCTTGGGAGGATGAATTTTATA
GCTTGGATGTTGTTCGTGCCTTTGTGGCATACTTTTTCGTATACCATTGGCACATTTAGC
ATTTGGTGCCCAGATGGATGGCTGTCCAAGCTAGGAGTGATTGATTTTGCAGGAGGCTTT
GTTATTCATCTCTCTTCTGGTGTTGCTGGATTTACTGCGGCTTATTGGGTAGGTCCCAGG
CTGGACAAAGACAGAGAGAGGTTTCCACCAAACAACATTCTCATGATGTTAGCCGGCGCC
GGCCTTTTATGGATGGGTTGGACTGGGTTCAACGGAGGAGCACCTTATACTGCCAGCACT
GACGCCTCCTTAGCCATATTGAATACACATGTCTGCACCGCCACCAGCCTCCTTACTTGG
CTGGTCCTAGATATTGCTGTTTCTGGCAAACCCTCTGTGATCGGAGCTGTTAATGGCATG
ATCACCGGCCTTGTTTGCATCACCCCTGGTGCAGGAGTTGTTCAAAGTTGGGCGGCCATC
CTAATGGGCTTAATTTCAGGAAGTGTTCCATGGTACACAATGACAATCCTTCACAAGAAG
GTCAAGCTCTTAAGGCATGTCGACGACACCTTATCTGTCTTCCATACCCATGCCCTAGCG
GGGATTTTAGGCGGTATCCTCACTGGATTTTTTGCTGTGCCAAAACTCTGTAGGCTATTT
TACCTCGTACCTGAATGGGAAAGGTACATCGGCCTAGCCTATGGTTTGCAGACAGGCCGG
ACCTCAGCTGGGCTACGGCAAATGGGAGCTCAACTAGCTGGTATCGGATTCATAGTATGT
CTAAATATTGTCACGACAAGCTTGGTCTGTCTGTTCATCAAGTTGATAGTGCCTCTTAGG
TTGGACGAAGGGGTGCTGCAAATTGGAGATGACGCTATCCATGGAGAGGAAGCATATGTA
TTATGGGATGATGAAGAGAAATATGAAAATACCCAGGTTAATTCTGCATATGATGCTGAT
GAGTATCCATCAGCTGTTTCAAAGACTTTGAGTGAACTCCAAATGGTATGA