Plant GARDEN
How To ▶︎

JA

EN

TOP > About the Species(Solanum tuberosum ) > genome data >Gene sequences

Search

By Species By Keywords Genes By Markers By Traits

Let’s Analyze!!

SNP Detection
(lang=JA only) Sequences Other Tools

Data List

All Markers Trait-Related Loci
Solanum tuberosum

CDS Sequence

CDS ID

PGSC0003DMT400096031
CDS Infomation

pacid=37457336 polypeptide=PGSC0003DMP400067706 locus=PGSC0003DMG400045602 ID=PGSC0003DMT400096031.v4.03 annot-version=v4.03
Sequence

ATGAAACATCTCAAGAAATTTCATGGCCATTTCATCACAAATGGCCTTTCAAATGACACC
CTTTTCCTCAGTGCTGTTCTTTCCTTTACAGCACTTTCTCCTACTGGAAATTTAGCATAT
GCCCACTTGGTTTTTAACCAAATTGATTTACCCAATACTTTCATGTTCAATACTATGATT
AGAGGTTATGGTTCTAGCTCTAATCCAAGTGAAGTAATGAGTTTTTACGTCAAAATGTTG
CGATATGGTTTTTTCCCTAATCATTATACTTACCCTTTTGTGATTAAAGCAGTGTGCAGG
ACTCAAAATTACATTCTTGGTGAAGCATTGCATTGTTCTGTGATAAAATTTGGGCATGTT
TTGGACCTTCATATAGCAAATTCACTTTTACATATGTATGCAAAGTTTGGGTTTTTCGTC
GAGATCATGTACCTGTTTGATGAAATGCCTGAACCAGATGTAGTTTCTTGGAATGTGGTT
ATTGATGATTTTGTTAAAAATGGTTGTTTTGATGAGGTTTTGGCTGCGGTTAACGAAATG
TGTTGGAACGGGGTTGAGCCTAACGCGGTTACACTTCTTGGACTTGTTTCGTGTTCTTTG
AAAATGGGGGATTTTGGTTTAGGTAAGTTGATACATTTGTATATTATGAAAAGAGGAATA
CATATGAGTGAAAATCTTGGTAATGGGTTGATTGATATGTATGCTAAGTTTGGAGATATG
GAGTCAGCTGAGAAGTTGTTCGATAGGATGCAAATGAAGACGGTTTTCTCATGGACTTCA
CTTCTTGATGGTTTTATACAAAAGGGTGAACTAGAAAGAGCTGGTGTTGTTTTTAGTCAG
ATGCCTAAGGATACTACTGCTTGGAATGTCATGCTTAGTGGGTATTCTGAGGCAGGTGAT
ATGAGTTCAGCAGAGACTATCTTTCGAGCAATGCCAGATAGAGATTTAGTCTCATGGAAC
ACTATGATTCTTGGTTATACTCAGAACAAGATGTATATGAAGTCCTTAGAGTTGCTAAGA
GATATGTTCAGGTTTGGATTGAAACCTGATCGGATAACGTTAGTTGGGTTGTTCTCAGTT
TGTGGATATGCAGGTGTACTGCATATCGGTGAAGCCATCCACTCTTTCATGGAAAAACAG
AACATAAAGGAGGAAGAAGTTGAGGTAGCTTTGTTGGATATGTATAGCAAGTGTGGCGAT
CCTGAGAAAGCTCTTACAGTATTTTACACGATACGGAGAAAAAAATCAGTGTTGGCTTGG
ACTAACATGATCGTTGGACTAGCAATGAATGGTCTTGCAAATGAAGCTCTTATGTTGTTC
CATCAAATGTGTGATGAGGGAACAAGTCCTAATGAGATAACATATTTAGGTGTTTTATGT
GCTTGCAGCTATGCAGGATTAGTTAAAGAAGGCAAATGGCTGTTCAATGCTATGAGTAAA
GTACATGGCATTACACCAAGATCTGAGCACTATGGTTGTATGGTTGATCTTCTCGGTCGG
GCGGGTTTGCTTGAAGAAGCAGAGATGTTTATTCAAGATATGCCTGAAAAAGCTGATGCT
GGCATCTGGGGTGCCTTGCTAGGGGCTTGTAGGATGCATGGTGAGGTTCAAATGGGTGAA
AGGATAGCCAAGATTGTGACTCAAATGGACCCGTATCACTCGGGGCGTTACATTCTTCTC
TCCAACATTTATGCTGCAGAAAACAGATGGTTTGATGCTGAAAAAGTAAGGAAGAAGATG
AAAACTGAAGGTATACACAAAACACCAGGATTCAGTTTGGTTGAAATGAAAGGTGAAATG
CACCAATTCATAGTAGCATGA

Peptide Sequence

PEP ID

PGSC0003DMP400067706
PEP Infomation

pacid=37457336 transcript=PGSC0003DMT400096031 locus=PGSC0003DMG400045602 ID=PGSC0003DMT400096031.v4.03 annot-version=v4.03
Sequence

MKHLKKFHGHFITNGLSNDTLFLSAVLSFTALSPTGNLAYAHLVFNQIDLPNTFMFNTMI
RGYGSSSNPSEVMSFYVKMLRYGFFPNHYTYPFVIKAVCRTQNYILGEALHCSVIKFGHV
LDLHIANSLLHMYAKFGFFVEIMYLFDEMPEPDVVSWNVVIDDFVKNGCFDEVLAAVNEM
CWNGVEPNAVTLLGLVSCSLKMGDFGLGKLIHLYIMKRGIHMSENLGNGLIDMYAKFGDM
ESAEKLFDRMQMKTVFSWTSLLDGFIQKGELERAGVVFSQMPKDTTAWNVMLSGYSEAGD
MSSAETIFRAMPDRDLVSWNTMILGYTQNKMYMKSLELLRDMFRFGLKPDRITLVGLFSV
CGYAGVLHIGEAIHSFMEKQNIKEEEVEVALLDMYSKCGDPEKALTVFYTIRRKKSVLAW
TNMIVGLAMNGLANEALMLFHQMCDEGTSPNEITYLGVLCACSYAGLVKEGKWLFNAMSK
VHGITPRSEHYGCMVDLLGRAGLLEEAEMFIQDMPEKADAGIWGALLGACRMHGEVQMGE
RIAKIVTQMDPYHSGRYILLSNIYAAENRWFDAEKVRKKMKTEGIHKTPGFSLVEMKGEM
HQFIVA*

Transcript Sequence

Transcript ID

PGSC0003DMT400096031
Transcript Infomation

pacid=37457336 locus=PGSC0003DMG400045602 ID=PGSC0003DMT400096031.v4.03 annot-version=v4.03
Sequence

ATGAAACATCTCAAGAAATTTCATGGCCATTTCATCACAAATGGCCTTTCAAATGACACC
CTTTTCCTCAGTGCTGTTCTTTCCTTTACAGCACTTTCTCCTACTGGAAATTTAGCATAT
GCCCACTTGGTTTTTAACCAAATTGATTTACCCAATACTTTCATGTTCAATACTATGATT
AGAGGTTATGGTTCTAGCTCTAATCCAAGTGAAGTAATGAGTTTTTACGTCAAAATGTTG
CGATATGGTTTTTTCCCTAATCATTATACTTACCCTTTTGTGATTAAAGCAGTGTGCAGG
ACTCAAAATTACATTCTTGGTGAAGCATTGCATTGTTCTGTGATAAAATTTGGGCATGTT
TTGGACCTTCATATAGCAAATTCACTTTTACATATGTATGCAAAGTTTGGGTTTTTCGTC
GAGATCATGTACCTGTTTGATGAAATGCCTGAACCAGATGTAGTTTCTTGGAATGTGGTT
ATTGATGATTTTGTTAAAAATGGTTGTTTTGATGAGGTTTTGGCTGCGGTTAACGAAATG
TGTTGGAACGGGGTTGAGCCTAACGCGGTTACACTTCTTGGACTTGTTTCGTGTTCTTTG
AAAATGGGGGATTTTGGTTTAGGTAAGTTGATACATTTGTATATTATGAAAAGAGGAATA
CATATGAGTGAAAATCTTGGTAATGGGTTGATTGATATGTATGCTAAGTTTGGAGATATG
GAGTCAGCTGAGAAGTTGTTCGATAGGATGCAAATGAAGACGGTTTTCTCATGGACTTCA
CTTCTTGATGGTTTTATACAAAAGGGTGAACTAGAAAGAGCTGGTGTTGTTTTTAGTCAG
ATGCCTAAGGATACTACTGCTTGGAATGTCATGCTTAGTGGGTATTCTGAGGCAGGTGAT
ATGAGTTCAGCAGAGACTATCTTTCGAGCAATGCCAGATAGAGATTTAGTCTCATGGAAC
ACTATGATTCTTGGTTATACTCAGAACAAGATGTATATGAAGTCCTTAGAGTTGCTAAGA
GATATGTTCAGGTTTGGATTGAAACCTGATCGGATAACGTTAGTTGGGTTGTTCTCAGTT
TGTGGATATGCAGGTGTACTGCATATCGGTGAAGCCATCCACTCTTTCATGGAAAAACAG
AACATAAAGGAGGAAGAAGTTGAGGTAGCTTTGTTGGATATGTATAGCAAGTGTGGCGAT
CCTGAGAAAGCTCTTACAGTATTTTACACGATACGGAGAAAAAAATCAGTGTTGGCTTGG
ACTAACATGATCGTTGGACTAGCAATGAATGGTCTTGCAAATGAAGCTCTTATGTTGTTC
CATCAAATGTGTGATGAGGGAACAAGTCCTAATGAGATAACATATTTAGGTGTTTTATGT
GCTTGCAGCTATGCAGGATTAGTTAAAGAAGGCAAATGGCTGTTCAATGCTATGAGTAAA
GTACATGGCATTACACCAAGATCTGAGCACTATGGTTGTATGGTTGATCTTCTCGGTCGG
GCGGGTTTGCTTGAAGAAGCAGAGATGTTTATTCAAGATATGCCTGAAAAAGCTGATGCT
GGCATCTGGGGTGCCTTGCTAGGGGCTTGTAGGATGCATGGTGAGGTTCAAATGGGTGAA
AGGATAGCCAAGATTGTGACTCAAATGGACCCGTATCACTCGGGGCGTTACATTCTTCTC
TCCAACATTTATGCTGCAGAAAACAGATGGTTTGATGCTGAAAAAGTAAGGAAGAAGATG
AAAACTGAAGGTATACACAAAACACCAGGATTCAGTTTGGTTGAAATGAAAGGTGAAATG
CACCAATTCATAGTAGCATGA