Plant GARDEN
How To ▶︎

JA

EN

TOP > About the Species(Solanum tuberosum ) > genome data >Gene sequences

Search

By Species By Keywords Genes By Markers By Traits

Let’s Analyze!!

SNP Detection
(lang=JA only) Sequences Other Tools

Data List

All Markers Trait-Related Loci
Solanum tuberosum

CDS Sequence

CDS ID

PGSC0003DMT400095846
CDS Infomation

pacid=37456418 polypeptide=PGSC0003DMP400067521 locus=PGSC0003DMG400045417 ID=PGSC0003DMT400095846.v4.03 annot-version=v4.03
Sequence

ATGCGCTTGTTACCACATGAACTCAAACCTCTCCTATTGACATGTAAACATAATGCATTG
ATTTCTCAAATTCACGCTCTTCTGGTAGTATCTGGGTTATTTTCCCATGGAAACTCCATT
GCCCCATTAATATCATCATATGCCAAAGTGGGTGATCTCAAATCTGCCCACAAATTGTTT
GATAAAAGTCCCCTGAGGAGAGTAGATTCTTGGAATGCTATGATCATTGCCTATTCAAAA
AATGAGTTCCCTTTTGAGGTTGTAAATGTTTATAATCAAATGGTCCTTGAAGGTGTCAAA
CCTGATAGCTCAACTTTTACTGTGGTACTTAAGGCGTGTACGATATTGCAGGATTTGGAG
AAGGGTGAAGAGATTTGGGACAAGGTAGTTGAGTGTGGGTATAAAAATGATGTCTTTGTT
GGGTCCTCTGTTTTGAACCTGTATGCCAAATGTGGGAAGATGGATAAAGCAGGAGCTGTA
TTTGAGAAAATGCAGAGGAGGGATGTTGTTTGTTGGACTACGATGATAACGGGTTTTGTA
CAGAGTGGGAAAGGGAGAGAGGCTGTGGATTTGTATAGGAGGATGCAAAGGGAAGGTATG
GTAGGTGATGGTGTTGTTATGTTGGGTTTGATGCAGGCTTCTGCTAATATTGCAGACACG
AAATTGGGTTCGTCAGTTCATGGCTATATGATCCGCAGAGCCCTTCCTATGGATGTCAAT
ATACTGACTAGCCTTGTTGATATGTATGCTAAGAATGGAGAGTTGGAGATAGCTACTCGT
GTATTTCGGAAAATGCCTTTTAGGAATACTGTTACTTGGAGTGCTTTGATTTCTGGCTAT
GCTCAAAATGGCTTTGCTGTTAATGCTCTTCAACTGCTGATAGAGATGCAACTGTTAGGA
TTCACACCTGATGTAGCTTCACTTGTAAGTGCACTTCTAGCATGTTCTGACGTTGGCTCT
TTAAGATTGGGTAGATCAATTCATGGTTATGCTGCCAGGAAAGTCATCATGGATCAAGTT
TTAAGTACTGGATTGATTGATATGTATGCTAAATGTGGGCTCATTTCTTGTGCCCGTTCC
ATTTACGACCGCATCAGTTCTAAGGACTTGATATGTTGGAATACGATTATAGCATGCTAT
GGGATCCATGGGCAAGGAAGAGAGGCACTTACCCTTTTCCAGCAGATGAAGGACGAGATA
GAACCAGATCATGCAACTTTTGCTGCTCTTCTTTCAGCTTTGAGTCACTCGGGATTAGTG
GAGGAAGGTCGACATTGGTTTGATGTCATGGTGAATGAATACAAAATTAAACCTTCTGAG
AAGCATTATGCTTGTTCAGTTGATCTTTTGGCTCGAGCTGGTGAAGTTGAAGAAGCTAAA
GAACTCATCACTTCTATGGAAACTAAACCTGGGCTTGCTGTTTGGGTTGCCCTTCTATCT
GGTTGCCACATACATAAGAAATTTTCCATTGGAGAATTGGCAGCAAACAGGGTACTTGAA
TTAATTCCCGAGAACACAGGTACTTTCGTGTTGGTAGCGAATTTCTTTGCAGCAGCAAAA
ATGTGGGATAAAGCAGCTTCTGTGAGGAAGCTTATGAAAAAGACAGGGATGACAAAAGTT
CCTGGCTACAGTGCTGTAGAGGTAAATGGGAGACTCCATGCTTTTCTTATGGATGATACA
AGTCACCCTCAATATGAACAGATAATGGGACTTCTATGCAATCTGGAAAATGAGATGAAA
GCTATGGGCTATGTCCCAAAGACTGACTTTGTGCTGCAGAATCTTGAAGAAGATGTCAAA
GTGAAAATGTTGGGTATTCATAGTGAGAGACTTGCCATTGCTTTTGGGCTCTTAAACACC
GCACCAGGAACCAGATTACTTATCACAAAGAACCTGAGGGTCTGTGGTGACTGCCATGAA
GTAACAAAGTTTATCTCTGTTATAGTAAAAAGAGAGATTATCGTAAGGGATGTTAAACGA
TTTCATCACTTTAAGGATGGAACATGTTCCTGTGGTGACTACTGGTGA

Peptide Sequence

PEP ID

PGSC0003DMP400067521
PEP Infomation

pacid=37456418 transcript=PGSC0003DMT400095846 locus=PGSC0003DMG400045417 ID=PGSC0003DMT400095846.v4.03 annot-version=v4.03
Sequence

MRLLPHELKPLLLTCKHNALISQIHALLVVSGLFSHGNSIAPLISSYAKVGDLKSAHKLF
DKSPLRRVDSWNAMIIAYSKNEFPFEVVNVYNQMVLEGVKPDSSTFTVVLKACTILQDLE
KGEEIWDKVVECGYKNDVFVGSSVLNLYAKCGKMDKAGAVFEKMQRRDVVCWTTMITGFV
QSGKGREAVDLYRRMQREGMVGDGVVMLGLMQASANIADTKLGSSVHGYMIRRALPMDVN
ILTSLVDMYAKNGELEIATRVFRKMPFRNTVTWSALISGYAQNGFAVNALQLLIEMQLLG
FTPDVASLVSALLACSDVGSLRLGRSIHGYAARKVIMDQVLSTGLIDMYAKCGLISCARS
IYDRISSKDLICWNTIIACYGIHGQGREALTLFQQMKDEIEPDHATFAALLSALSHSGLV
EEGRHWFDVMVNEYKIKPSEKHYACSVDLLARAGEVEEAKELITSMETKPGLAVWVALLS
GCHIHKKFSIGELAANRVLELIPENTGTFVLVANFFAAAKMWDKAASVRKLMKKTGMTKV
PGYSAVEVNGRLHAFLMDDTSHPQYEQIMGLLCNLENEMKAMGYVPKTDFVLQNLEEDVK
VKMLGIHSERLAIAFGLLNTAPGTRLLITKNLRVCGDCHEVTKFISVIVKREIIVRDVKR
FHHFKDGTCSCGDYW*

Transcript Sequence

Transcript ID

PGSC0003DMT400095846
Transcript Infomation

pacid=37456418 locus=PGSC0003DMG400045417 ID=PGSC0003DMT400095846.v4.03 annot-version=v4.03
Sequence

ATGCGCTTGTTACCACATGAACTCAAACCTCTCCTATTGACATGTAAACATAATGCATTG
ATTTCTCAAATTCACGCTCTTCTGGTAGTATCTGGGTTATTTTCCCATGGAAACTCCATT
GCCCCATTAATATCATCATATGCCAAAGTGGGTGATCTCAAATCTGCCCACAAATTGTTT
GATAAAAGTCCCCTGAGGAGAGTAGATTCTTGGAATGCTATGATCATTGCCTATTCAAAA
AATGAGTTCCCTTTTGAGGTTGTAAATGTTTATAATCAAATGGTCCTTGAAGGTGTCAAA
CCTGATAGCTCAACTTTTACTGTGGTACTTAAGGCGTGTACGATATTGCAGGATTTGGAG
AAGGGTGAAGAGATTTGGGACAAGGTAGTTGAGTGTGGGTATAAAAATGATGTCTTTGTT
GGGTCCTCTGTTTTGAACCTGTATGCCAAATGTGGGAAGATGGATAAAGCAGGAGCTGTA
TTTGAGAAAATGCAGAGGAGGGATGTTGTTTGTTGGACTACGATGATAACGGGTTTTGTA
CAGAGTGGGAAAGGGAGAGAGGCTGTGGATTTGTATAGGAGGATGCAAAGGGAAGGTATG
GTAGGTGATGGTGTTGTTATGTTGGGTTTGATGCAGGCTTCTGCTAATATTGCAGACACG
AAATTGGGTTCGTCAGTTCATGGCTATATGATCCGCAGAGCCCTTCCTATGGATGTCAAT
ATACTGACTAGCCTTGTTGATATGTATGCTAAGAATGGAGAGTTGGAGATAGCTACTCGT
GTATTTCGGAAAATGCCTTTTAGGAATACTGTTACTTGGAGTGCTTTGATTTCTGGCTAT
GCTCAAAATGGCTTTGCTGTTAATGCTCTTCAACTGCTGATAGAGATGCAACTGTTAGGA
TTCACACCTGATGTAGCTTCACTTGTAAGTGCACTTCTAGCATGTTCTGACGTTGGCTCT
TTAAGATTGGGTAGATCAATTCATGGTTATGCTGCCAGGAAAGTCATCATGGATCAAGTT
TTAAGTACTGGATTGATTGATATGTATGCTAAATGTGGGCTCATTTCTTGTGCCCGTTCC
ATTTACGACCGCATCAGTTCTAAGGACTTGATATGTTGGAATACGATTATAGCATGCTAT
GGGATCCATGGGCAAGGAAGAGAGGCACTTACCCTTTTCCAGCAGATGAAGGACGAGATA
GAACCAGATCATGCAACTTTTGCTGCTCTTCTTTCAGCTTTGAGTCACTCGGGATTAGTG
GAGGAAGGTCGACATTGGTTTGATGTCATGGTGAATGAATACAAAATTAAACCTTCTGAG
AAGCATTATGCTTGTTCAGTTGATCTTTTGGCTCGAGCTGGTGAAGTTGAAGAAGCTAAA
GAACTCATCACTTCTATGGAAACTAAACCTGGGCTTGCTGTTTGGGTTGCCCTTCTATCT
GGTTGCCACATACATAAGAAATTTTCCATTGGAGAATTGGCAGCAAACAGGGTACTTGAA
TTAATTCCCGAGAACACAGGTACTTTCGTGTTGGTAGCGAATTTCTTTGCAGCAGCAAAA
ATGTGGGATAAAGCAGCTTCTGTGAGGAAGCTTATGAAAAAGACAGGGATGACAAAAGTT
CCTGGCTACAGTGCTGTAGAGGTAAATGGGAGACTCCATGCTTTTCTTATGGATGATACA
AGTCACCCTCAATATGAACAGATAATGGGACTTCTATGCAATCTGGAAAATGAGATGAAA
GCTATGGGCTATGTCCCAAAGACTGACTTTGTGCTGCAGAATCTTGAAGAAGATGTCAAA
GTGAAAATGTTGGGTATTCATAGTGAGAGACTTGCCATTGCTTTTGGGCTCTTAAACACC
GCACCAGGAACCAGATTACTTATCACAAAGAACCTGAGGGTCTGTGGTGACTGCCATGAA
GTAACAAAGTTTATCTCTGTTATAGTAAAAAGAGAGATTATCGTAAGGGATGTTAAACGA
TTTCATCACTTTAAGGATGGAACATGTTCCTGTGGTGACTACTGGTGA