Plant GARDEN
How To ▶︎

JA

EN

TOP > About the Species(Solanum tuberosum ) > genome data >Gene sequences

Search

By Species By Keywords Genes By Markers By Traits

Let’s Analyze!!

SNP Detection
(lang=JA only) Sequences Other Tools

Data List

All Markers Trait-Related Loci
Solanum tuberosum

CDS Sequence

CDS ID

PGSC0003DMT400094545
CDS Infomation

pacid=37425445 polypeptide=PGSC0003DMP400066220 locus=PGSC0003DMG400044116 ID=PGSC0003DMT400094545.v4.03 annot-version=v4.03
Sequence

ATGCTGGCTCATCCCCTCCATCTTCAGCTCCTTTCTGCTGTGGATAGCTCGGTAACTGTC
TTGGAGGGATTTAAGTACAATAGTATTGATGGTGAGCTTGTTGGTGTTGTTGGAGACTCA
TGGATATTGAAGAGTGACCCTGTTTCTGTAACATGGCATTCCATTAAAGGTGTTAAGGAG
GAGGCATGTTTAGAAATAATTGATTCGTTGAATAAGGATGTTGCTGCCTTGGATTCAAAG
GGAGTATCTACAACATCATCTTATTTTTTTGGAAAATTGATTGCAAGAGCAGCAAGGCTG
GCATTGATAGCTGAAGAGGTTTGTCACCTTGATGTTATCCCGGCAATCCGCAAATTCTTG
AAGGATACAGTTGAACCATGGTTGGAGGGGACTTTTCAAGAAAATGGTTTCTTTTATGAA
TCAAAATGGGGTGGAATTGTGACTAAGCAAGGGGCGTTGGATTCGGGAGCTGACTTTGGT
TTTGGGGTCTATAATGATCACCATTTTCATATTGGTCATTTCCTTTATGCAATTGCAGTG
CTAGCCAAGATAGATCCCATCTGGGGGAGGAAGTATAAGCCACAAGCTTATGCACTTATG
GCGGATTTTATGAATTTAAGCAGGCGATCAAATTCAAAGTATGCCCGGTTGAGGTGTTTT
GACTTGTGGAAGCTGCACTCTTGGGCTGGAGGATTGACAGAGTTTGCTGATGGACGAAAC
CAGGAGAGCACAAGTGAAGCAGTTAATGCATACTATTCAGCAGCTTTAATGGGTTTGGCC
TATGGGGATACCCATCTTGTTGCCATTGGATCGACCCTTTCAGCTTTAGAGATTCATTCT
GCACAGACTTGGTGGCATGTGAAAGAGGGAAGCACTTTATATGGGGAAGAATTCACAAAA
AACAACAGGGTGGTGGGTGTTTTATGGTCTAACAAAAGGGATAGCGGCCTTTGGTTTGCT
CCACCTGAATGGAAAGAGTGTAGACTTGGAATTCAGGTCTTACCAATATTGCCCATTACT
GAACTTCTGTTTTCAGACGTGCAGTTTGTGAAGCAGTTGGTCGAATGGACACTGCCAGCT
CTGGCAAGGGAAGGGGTTGGGGAAGGGTGGAAAGGGTTTGTGTATACTTTGGAAGCAATA
TATGATAAAGTGGGTGCTCTAAACAAAACTAGGAGCTTAACTGGGTTTGATGATGGAAAT
TCTCTTTCAAATCTTCTATGGTGGATTCATTCTAGAGATGATGAAGTGGGGGAATCTGAT
AGAGCAAGCAAGTTCTGCTGGTTCAGACACTACTCTCATTGA

Peptide Sequence

PEP ID

PGSC0003DMP400066220
PEP Infomation

pacid=37425445 transcript=PGSC0003DMT400094545 locus=PGSC0003DMG400044116 ID=PGSC0003DMT400094545.v4.03 annot-version=v4.03
Sequence

MLAHPLHLQLLSAVDSSVTVLEGFKYNSIDGELVGVVGDSWILKSDPVSVTWHSIKGVKE
EACLEIIDSLNKDVAALDSKGVSTTSSYFFGKLIARAARLALIAEEVCHLDVIPAIRKFL
KDTVEPWLEGTFQENGFFYESKWGGIVTKQGALDSGADFGFGVYNDHHFHIGHFLYAIAV
LAKIDPIWGRKYKPQAYALMADFMNLSRRSNSKYARLRCFDLWKLHSWAGGLTEFADGRN
QESTSEAVNAYYSAALMGLAYGDTHLVAIGSTLSALEIHSAQTWWHVKEGSTLYGEEFTK
NNRVVGVLWSNKRDSGLWFAPPEWKECRLGIQVLPILPITELLFSDVQFVKQLVEWTLPA
LAREGVGEGWKGFVYTLEAIYDKVGALNKTRSLTGFDDGNSLSNLLWWIHSRDDEVGESD
RASKFCWFRHYSH*

Transcript Sequence

Transcript ID

PGSC0003DMT400094545
Transcript Infomation

pacid=37425445 locus=PGSC0003DMG400044116 ID=PGSC0003DMT400094545.v4.03 annot-version=v4.03
Sequence

ATGCTGGCTCATCCCCTCCATCTTCAGCTCCTTTCTGCTGTGGATAGCTCGGTAACTGTC
TTGGAGGGATTTAAGTACAATAGTATTGATGGTGAGCTTGTTGGTGTTGTTGGAGACTCA
TGGATATTGAAGAGTGACCCTGTTTCTGTAACATGGCATTCCATTAAAGGTGTTAAGGAG
GAGGCATGTTTAGAAATAATTGATTCGTTGAATAAGGATGTTGCTGCCTTGGATTCAAAG
GGAGTATCTACAACATCATCTTATTTTTTTGGAAAATTGATTGCAAGAGCAGCAAGGCTG
GCATTGATAGCTGAAGAGGTTTGTCACCTTGATGTTATCCCGGCAATCCGCAAATTCTTG
AAGGATACAGTTGAACCATGGTTGGAGGGGACTTTTCAAGAAAATGGTTTCTTTTATGAA
TCAAAATGGGGTGGAATTGTGACTAAGCAAGGGGCGTTGGATTCGGGAGCTGACTTTGGT
TTTGGGGTCTATAATGATCACCATTTTCATATTGGTCATTTCCTTTATGCAATTGCAGTG
CTAGCCAAGATAGATCCCATCTGGGGGAGGAAGTATAAGCCACAAGCTTATGCACTTATG
GCGGATTTTATGAATTTAAGCAGGCGATCAAATTCAAAGTATGCCCGGTTGAGGTGTTTT
GACTTGTGGAAGCTGCACTCTTGGGCTGGAGGATTGACAGAGTTTGCTGATGGACGAAAC
CAGGAGAGCACAAGTGAAGCAGTTAATGCATACTATTCAGCAGCTTTAATGGGTTTGGCC
TATGGGGATACCCATCTTGTTGCCATTGGATCGACCCTTTCAGCTTTAGAGATTCATTCT
GCACAGACTTGGTGGCATGTGAAAGAGGGAAGCACTTTATATGGGGAAGAATTCACAAAA
AACAACAGGGTGGTGGGTGTTTTATGGTCTAACAAAAGGGATAGCGGCCTTTGGTTTGCT
CCACCTGAATGGAAAGAGTGTAGACTTGGAATTCAGGTCTTACCAATATTGCCCATTACT
GAACTTCTGTTTTCAGACGTGCAGTTTGTGAAGCAGTTGGTCGAATGGACACTGCCAGCT
CTGGCAAGGGAAGGGGTTGGGGAAGGGTGGAAAGGGTTTGTGTATACTTTGGAAGCAATA
TATGATAAAGTGGGTGCTCTAAACAAAACTAGGAGCTTAACTGGGTTTGATGATGGAAAT
TCTCTTTCAAATCTTCTATGGTGGATTCATTCTAGAGATGATGAAGTGGGGGAATCTGAT
AGAGCAAGCAAGTTCTGCTGGTTCAGACACTACTCTCATTGA