Plant GARDEN
How To ▶︎

JA

EN

TOP > About the Species(Solanum tuberosum ) > genome data >Gene sequences

Search

By Species By Keywords Genes By Markers By Traits

Let’s Analyze!!

SNP Detection
(lang=JA only) Sequences Other Tools

Data List

All Markers Trait-Related Loci
Solanum tuberosum

CDS Sequence

CDS ID

PGSC0003DMT400094521
CDS Infomation

pacid=37453866 polypeptide=PGSC0003DMP400066196 locus=PGSC0003DMG400044092 ID=PGSC0003DMT400094521.v4.03 annot-version=v4.03
Sequence

ATGGCTTGTCTCCTCCTTCACCAGCATTTAACGACTCAATTTCGTGCTGTTTCATCAACA
CTTGGATATAAATGGATGGAACATTTCCCTGGACGATTTACAACACTTGCAGCAGCAAAC
CAAATGCACCCAAACAACTACAGGAAAACTTTTTCCCATTTATACCAAGAATGTGCAAAA
CACTGCATCCAGGAACCAGGCAGGCAAGCCCATGCTCGGATGATAATTTCTGGGTTTCAA
CCCACTGTTTTTGTCACTAATTGTTTGATTCAAATGTACATAAAATGCTCCAACTTGGGT
TATGCTGATAAAGTGTTTGATAAAATGCCTCTAAGAGATACGGTTTCTTGGAATGCTATG
ATTTTTGGGTATTCCATGGTAAGTGAATTGGAGAAGGCACAATTAATGTTTGATTTGATG
CCTGAAAGAGATGCAATTTCATGGAATTCTTTGATTTCCGGGTATATGCAAAATGGTAAT
TATGGGAAATCTATTCAAACTTTTCTGGAAATGGGAAGAGATGGTATTGCTTTTGACAGA
ACAACTTTTGCTGTTATTTTGAAAGCTTGTTCGGGTATTGAAGATTCTTGGTTAGGGGTG
CAGGTGCATGGGTTGGTCGTCAAATTAGGTCTTGCTACTGATGTGGTGACAGGGAGTGCA
ATGGTGGATATGTATTCGAAATGCAAGAGATTGAATGAGTCAATATGTTTCTTCAATGAG
ATGCCTGAAAAGAACTGGGTTTCTTGGAGTGCTCTGATAGCAGGTTGCGTTCAAAATAAC
AAGTTTGCCAATGGATTACACCTCTTCAAGAATATGCAAAAAGGAGGAGTAGGGGTGAGT
CAATCTACTTATGCTAGTGTCTTCAGGTCTTGTGCCGGGTTATCAGACTTAAAATTGGGT
TCTCAATTGCACGGTCATGCACTGAAAACTGATTTTGGTTCTGATGTCATTGTAGCTACT
GCCACTTTGGACATGTATGCCAAATGTAACAGTTTGTCTGATGCTAGGAAGGTATTCAAC
TTGTTGCCAAACCATAATTTGCAATCCTATAATGCCTTGATTGTTGGGTTTGCTCGAGGT
GATCAAGGATATGAAGCTGTAATACTATTCCGGCTTTTGCTGAAGTCTTATCTTGGGTTT
GATGAAATAAGCCTATCTGGTGCATTTAGCGCATGTGCAGTATTCAAAGGGCATTTAGAG
GGAATGCAACTACATGGTGTAGCTTGTAAGACCCCCTTTTTGTCCAATGTTTGTGTTGCA
AATGCCATTATGGACATGTATGGCAAATGTGAAGCACCACAAGAAGCTCTACGTTTGTTT
GACGAAATGGAAATAAGAGATGCAGTGTCTTGGAATGCAATAATTGCAGCTTATGAGCAG
AATGGACACGAGGATGAAACTTTGATACTATTTTTTCGGATGCTTAAGTCAAGGATGGAA
CCAGATGAATTCACTTATGGTAGCGTTTTAAAGGCCTGTGCAGCTCGTCAAGATTTTAAC
ACTGGCATGGTGATCCACAATAGGATCATAAAATCAGGGATGGGTTTGGAGTGCTTCATT
GGGAGTGCTGTAATAGATATGTACTGCAAATGTGAAAAGGTAGAAGAGGCAGAGAAACTC
CATGAGAGAATGAAGGAACAAACAATCGTTTCTTGGAATGCAATCATATCGGGCTTCTCA
TTGCGTGAACAAAGTGAGGAAGCTCAGAAATTCTTCTCTAGAATGCTGGAAGAGGGAATA
AAACCTGATAACTTTACCTTTGCAACAGTTCTTGATACCTGTGCCAATCTAGCTACTGTT
GGGCTGGGAAAGCAAATTCATGCTCAAATTATAAAGCAAGAATTGCAATCAGATGTGTTT
ATAACTAGCACTCTTGTTGACATGTACTCAAAATGTGGAAACATGCAGGATTCTAGGTTG
ATGTTTGAAAAAGCACCAAAAAAGGATTTTGTCACATGGAATGCTCTGGTTTGTGGCTAT
GCACAACATGGTCTTGGAGAAGAGGCTTTGCAGATCTTTGAAAAGATGCAGCTCGAGGAT
GTAAGACCAAATCATGCAGCTTTTCTTGCAGTCTTAAGAGCTTGTGCACATATAGGGCTT
GTTGAAATAGGACTGCAACACTTCAATTCAATGTCGAATAACTATGGATTAGATCCTCAA
TTAGAACATTACTCATGTATGGTAGACATATTAGGGAGAGCGGGGCAAATTAGTGATGCA
CTGAAGCTTATTCAAGACATGCCTCTTGAGGCTGATGATGTGATTTGGAGAACTCTGCTT
AGTATGTGTAAGATGCACAGGAATGTGGAGGTAGCAGAAAAAGCAGCAAAGTGTCTCTTG
GAATTGGACCCTGAGGACTCGTCTTCTCATATACTTTTGTCAAATATTTATGCTGATGCA
GGAATGTGGAAAGAAGTTGCTGAAATGAGGAAAGCGATGAGGTATGGCGGGCTCAAGAAG
GAGCCAGGTTGTAGCTGGATTGAGATAAAGTCTGTGCTACACATGTTTCTTGTTGGTGAT
AAAGCCCATCCAAGATGCAACGAGATATATGAAAACCTTGACACATTGATATCTGAAATG
AAGCGAGTGTCACATATACTAGATAATGAATTTTTGCTCAGCTGTGAGGCTACAGAAGAT
GAACATCAACATCCATTTCCCGAATGCAGAGTTTCTTCATTTTAG

Peptide Sequence

PEP ID

PGSC0003DMP400066196
PEP Infomation

pacid=37453866 transcript=PGSC0003DMT400094521 locus=PGSC0003DMG400044092 ID=PGSC0003DMT400094521.v4.03 annot-version=v4.03
Sequence

MACLLLHQHLTTQFRAVSSTLGYKWMEHFPGRFTTLAAANQMHPNNYRKTFSHLYQECAK
HCIQEPGRQAHARMIISGFQPTVFVTNCLIQMYIKCSNLGYADKVFDKMPLRDTVSWNAM
IFGYSMVSELEKAQLMFDLMPERDAISWNSLISGYMQNGNYGKSIQTFLEMGRDGIAFDR
TTFAVILKACSGIEDSWLGVQVHGLVVKLGLATDVVTGSAMVDMYSKCKRLNESICFFNE
MPEKNWVSWSALIAGCVQNNKFANGLHLFKNMQKGGVGVSQSTYASVFRSCAGLSDLKLG
SQLHGHALKTDFGSDVIVATATLDMYAKCNSLSDARKVFNLLPNHNLQSYNALIVGFARG
DQGYEAVILFRLLLKSYLGFDEISLSGAFSACAVFKGHLEGMQLHGVACKTPFLSNVCVA
NAIMDMYGKCEAPQEALRLFDEMEIRDAVSWNAIIAAYEQNGHEDETLILFFRMLKSRME
PDEFTYGSVLKACAARQDFNTGMVIHNRIIKSGMGLECFIGSAVIDMYCKCEKVEEAEKL
HERMKEQTIVSWNAIISGFSLREQSEEAQKFFSRMLEEGIKPDNFTFATVLDTCANLATV
GLGKQIHAQIIKQELQSDVFITSTLVDMYSKCGNMQDSRLMFEKAPKKDFVTWNALVCGY
AQHGLGEEALQIFEKMQLEDVRPNHAAFLAVLRACAHIGLVEIGLQHFNSMSNNYGLDPQ
LEHYSCMVDILGRAGQISDALKLIQDMPLEADDVIWRTLLSMCKMHRNVEVAEKAAKCLL
ELDPEDSSSHILLSNIYADAGMWKEVAEMRKAMRYGGLKKEPGCSWIEIKSVLHMFLVGD
KAHPRCNEIYENLDTLISEMKRVSHILDNEFLLSCEATEDEHQHPFPECRVSSF*

Transcript Sequence

Transcript ID

PGSC0003DMT400094521
Transcript Infomation

pacid=37453866 locus=PGSC0003DMG400044092 ID=PGSC0003DMT400094521.v4.03 annot-version=v4.03
Sequence

ATGGCTTGTCTCCTCCTTCACCAGCATTTAACGACTCAATTTCGTGCTGTTTCATCAACA
CTTGGATATAAATGGATGGAACATTTCCCTGGACGATTTACAACACTTGCAGCAGCAAAC
CAAATGCACCCAAACAACTACAGGAAAACTTTTTCCCATTTATACCAAGAATGTGCAAAA
CACTGCATCCAGGAACCAGGCAGGCAAGCCCATGCTCGGATGATAATTTCTGGGTTTCAA
CCCACTGTTTTTGTCACTAATTGTTTGATTCAAATGTACATAAAATGCTCCAACTTGGGT
TATGCTGATAAAGTGTTTGATAAAATGCCTCTAAGAGATACGGTTTCTTGGAATGCTATG
ATTTTTGGGTATTCCATGGTAAGTGAATTGGAGAAGGCACAATTAATGTTTGATTTGATG
CCTGAAAGAGATGCAATTTCATGGAATTCTTTGATTTCCGGGTATATGCAAAATGGTAAT
TATGGGAAATCTATTCAAACTTTTCTGGAAATGGGAAGAGATGGTATTGCTTTTGACAGA
ACAACTTTTGCTGTTATTTTGAAAGCTTGTTCGGGTATTGAAGATTCTTGGTTAGGGGTG
CAGGTGCATGGGTTGGTCGTCAAATTAGGTCTTGCTACTGATGTGGTGACAGGGAGTGCA
ATGGTGGATATGTATTCGAAATGCAAGAGATTGAATGAGTCAATATGTTTCTTCAATGAG
ATGCCTGAAAAGAACTGGGTTTCTTGGAGTGCTCTGATAGCAGGTTGCGTTCAAAATAAC
AAGTTTGCCAATGGATTACACCTCTTCAAGAATATGCAAAAAGGAGGAGTAGGGGTGAGT
CAATCTACTTATGCTAGTGTCTTCAGGTCTTGTGCCGGGTTATCAGACTTAAAATTGGGT
TCTCAATTGCACGGTCATGCACTGAAAACTGATTTTGGTTCTGATGTCATTGTAGCTACT
GCCACTTTGGACATGTATGCCAAATGTAACAGTTTGTCTGATGCTAGGAAGGTATTCAAC
TTGTTGCCAAACCATAATTTGCAATCCTATAATGCCTTGATTGTTGGGTTTGCTCGAGGT
GATCAAGGATATGAAGCTGTAATACTATTCCGGCTTTTGCTGAAGTCTTATCTTGGGTTT
GATGAAATAAGCCTATCTGGTGCATTTAGCGCATGTGCAGTATTCAAAGGGCATTTAGAG
GGAATGCAACTACATGGTGTAGCTTGTAAGACCCCCTTTTTGTCCAATGTTTGTGTTGCA
AATGCCATTATGGACATGTATGGCAAATGTGAAGCACCACAAGAAGCTCTACGTTTGTTT
GACGAAATGGAAATAAGAGATGCAGTGTCTTGGAATGCAATAATTGCAGCTTATGAGCAG
AATGGACACGAGGATGAAACTTTGATACTATTTTTTCGGATGCTTAAGTCAAGGATGGAA
CCAGATGAATTCACTTATGGTAGCGTTTTAAAGGCCTGTGCAGCTCGTCAAGATTTTAAC
ACTGGCATGGTGATCCACAATAGGATCATAAAATCAGGGATGGGTTTGGAGTGCTTCATT
GGGAGTGCTGTAATAGATATGTACTGCAAATGTGAAAAGGTAGAAGAGGCAGAGAAACTC
CATGAGAGAATGAAGGAACAAACAATCGTTTCTTGGAATGCAATCATATCGGGCTTCTCA
TTGCGTGAACAAAGTGAGGAAGCTCAGAAATTCTTCTCTAGAATGCTGGAAGAGGGAATA
AAACCTGATAACTTTACCTTTGCAACAGTTCTTGATACCTGTGCCAATCTAGCTACTGTT
GGGCTGGGAAAGCAAATTCATGCTCAAATTATAAAGCAAGAATTGCAATCAGATGTGTTT
ATAACTAGCACTCTTGTTGACATGTACTCAAAATGTGGAAACATGCAGGATTCTAGGTTG
ATGTTTGAAAAAGCACCAAAAAAGGATTTTGTCACATGGAATGCTCTGGTTTGTGGCTAT
GCACAACATGGTCTTGGAGAAGAGGCTTTGCAGATCTTTGAAAAGATGCAGCTCGAGGAT
GTAAGACCAAATCATGCAGCTTTTCTTGCAGTCTTAAGAGCTTGTGCACATATAGGGCTT
GTTGAAATAGGACTGCAACACTTCAATTCAATGTCGAATAACTATGGATTAGATCCTCAA
TTAGAACATTACTCATGTATGGTAGACATATTAGGGAGAGCGGGGCAAATTAGTGATGCA
CTGAAGCTTATTCAAGACATGCCTCTTGAGGCTGATGATGTGATTTGGAGAACTCTGCTT
AGTATGTGTAAGATGCACAGGAATGTGGAGGTAGCAGAAAAAGCAGCAAAGTGTCTCTTG
GAATTGGACCCTGAGGACTCGTCTTCTCATATACTTTTGTCAAATATTTATGCTGATGCA
GGAATGTGGAAAGAAGTTGCTGAAATGAGGAAAGCGATGAGGTATGGCGGGCTCAAGAAG
GAGCCAGGTTGTAGCTGGATTGAGATAAAGTCTGTGCTACACATGTTTCTTGTTGGTGAT
AAAGCCCATCCAAGATGCAACGAGATATATGAAAACCTTGACACATTGATATCTGAAATG
AAGCGAGTGTCACATATACTAGATAATGAATTTTTGCTCAGCTGTGAGGCTACAGAAGAT
GAACATCAACATCCATTTCCCGAATGCAGAGTTTCTTCATTTTAG