Plant GARDEN
How To ▶︎

JA

EN

TOP > About the Species(Solanum tuberosum ) > genome data >Gene sequences

Search

By Species By Keywords Genes By Markers By Traits

Let’s Analyze!!

SNP Detection
(lang=JA only) Sequences Other Tools

Data List

All Markers Trait-Related Loci
Solanum tuberosum

CDS Sequence

CDS ID

PGSC0003DMT400093900
CDS Infomation

pacid=37425765 polypeptide=PGSC0003DMP400065575 locus=PGSC0003DMG400043471 ID=PGSC0003DMT400093900.v4.03 annot-version=v4.03
Sequence

ATGGAAAATAAGTTTCATTTTTTTCATTATATCCATTTCTTGTTGCTTCTATCTTCCTCT
TGCTTTTCACTTGTTGCCTTTTCTTGGATTCCATATAATGAAAACAAGAACTATGAAGGC
TCCTCTGATCTTGTTAATCTTGAATACCATATGGGACCTGTTCTTTCTTCTCCTATAAAA
CTTTATGTAATATGGTATGGCCATTGGAACCCTTCTCATCAAGCCACAATTAGAGACTTT
CTCAACTCCTTTTCATCTTCTTATGCACCTCATCCTTCTGTAGCTGATTGGTGGCGAACC
GTTCGTCTTTACACAGATCAAACTGGCCAAAACATCTCAACTATTTCACTTTCTGGTGAA
TTCTTTGACTTTAAGTACTCACAAGGGAAGTACCTTAGCAGATTATCAATGCAATATGTG
ATCAAGAATGCAGTAAGATCATACCGTGTATCTATACCGTTGAATTATAAGAATGGAGTT
TACTTAGTGTTAACATCTTATGATGTTCAAGTTCAAGAATTTTGTAGGGCTGTATGTGGT
TTTCATTACTTTACATTTCCATCAATTCTTGGAGTGACAGTCCCTTATGCTTGGGTTGGT
TATAGTGGAAAACAATGTCCTGGTTTTTGTGCTTATCCTTTTGCTTGGCCTAAGAATTCA
GGGAAGCCACCACCAAACACAAGAAATGGAGGAAACAACTTAATGGGGGCGCCAAATGGT
GATCCGGGAGTCGATGGAATGATCAGTGTGATAGCTCATGAGCTAGCTGAGGTCTCTAGT
AACCCTCTTGTGAATGCTTGGTATGCTGGGGATAATCCTATTTCACCTACTGAGATTGCT
GATTTGTGTTTGGGAGTTTATGGGACTGGTGCTGGTGGTGGATATGTTGGACAAGTTTAT
AAGGATTTTTGGGGGAATGGTTTCAATTTACATGGTGTGAAAGGGAGAAAGTTTCTTGTT
CAATGGGTCTGGAATCCTCTCAGGAGAAGATGCTTTGGTCCTAATGCCATGGATTAG

Peptide Sequence

PEP ID

PGSC0003DMP400065575
PEP Infomation

pacid=37425765 transcript=PGSC0003DMT400093900 locus=PGSC0003DMG400043471 ID=PGSC0003DMT400093900.v4.03 annot-version=v4.03
Sequence

MENKFHFFHYIHFLLLLSSSCFSLVAFSWIPYNENKNYEGSSDLVNLEYHMGPVLSSPIK
LYVIWYGHWNPSHQATIRDFLNSFSSSYAPHPSVADWWRTVRLYTDQTGQNISTISLSGE
FFDFKYSQGKYLSRLSMQYVIKNAVRSYRVSIPLNYKNGVYLVLTSYDVQVQEFCRAVCG
FHYFTFPSILGVTVPYAWVGYSGKQCPGFCAYPFAWPKNSGKPPPNTRNGGNNLMGAPNG
DPGVDGMISVIAHELAEVSSNPLVNAWYAGDNPISPTEIADLCLGVYGTGAGGGYVGQVY
KDFWGNGFNLHGVKGRKFLVQWVWNPLRRRCFGPNAMD*

Transcript Sequence

Transcript ID

PGSC0003DMT400093900
Transcript Infomation

pacid=37425765 locus=PGSC0003DMG400043471 ID=PGSC0003DMT400093900.v4.03 annot-version=v4.03
Sequence

ATGGAAAATAAGTTTCATTTTTTTCATTATATCCATTTCTTGTTGCTTCTATCTTCCTCT
TGCTTTTCACTTGTTGCCTTTTCTTGGATTCCATATAATGAAAACAAGAACTATGAAGGC
TCCTCTGATCTTGTTAATCTTGAATACCATATGGGACCTGTTCTTTCTTCTCCTATAAAA
CTTTATGTAATATGGTATGGCCATTGGAACCCTTCTCATCAAGCCACAATTAGAGACTTT
CTCAACTCCTTTTCATCTTCTTATGCACCTCATCCTTCTGTAGCTGATTGGTGGCGAACC
GTTCGTCTTTACACAGATCAAACTGGCCAAAACATCTCAACTATTTCACTTTCTGGTGAA
TTCTTTGACTTTAAGTACTCACAAGGGAAGTACCTTAGCAGATTATCAATGCAATATGTG
ATCAAGAATGCAGTAAGATCATACCGTGTATCTATACCGTTGAATTATAAGAATGGAGTT
TACTTAGTGTTAACATCTTATGATGTTCAAGTTCAAGAATTTTGTAGGGCTGTATGTGGT
TTTCATTACTTTACATTTCCATCAATTCTTGGAGTGACAGTCCCTTATGCTTGGGTTGGT
TATAGTGGAAAACAATGTCCTGGTTTTTGTGCTTATCCTTTTGCTTGGCCTAAGAATTCA
GGGAAGCCACCACCAAACACAAGAAATGGAGGAAACAACTTAATGGGGGCGCCAAATGGT
GATCCGGGAGTCGATGGAATGATCAGTGTGATAGCTCATGAGCTAGCTGAGGTCTCTAGT
AACCCTCTTGTGAATGCTTGGTATGCTGGGGATAATCCTATTTCACCTACTGAGATTGCT
GATTTGTGTTTGGGAGTTTATGGGACTGGTGCTGGTGGTGGATATGTTGGACAAGTTTAT
AAGGATTTTTGGGGGAATGGTTTCAATTTACATGGTGTGAAAGGGAGAAAGTTTCTTGTT
CAATGGGTCTGGAATCCTCTCAGGAGAAGATGCTTTGGTCCTAATGCCATGGATTAG