Plant GARDEN
How To ▶︎

JA

EN

TOP > About the Species(Solanum tuberosum ) > genome data >Gene sequences

Search

By Species By Keywords Genes By Markers By Traits

Let’s Analyze!!

SNP Detection
(lang=JA only) Sequences Other Tools

Data List

All Markers Trait-Related Loci
Solanum tuberosum

CDS Sequence

CDS ID

PGSC0003DMT400092929
CDS Infomation

pacid=37442613 polypeptide=PGSC0003DMP400064604 locus=PGSC0003DMG400042500 ID=PGSC0003DMT400092929.v4.03 annot-version=v4.03
Sequence

ATGCTGAGATACGTACTGGGCAGAAGACAGCCCTGGACGGGATTTGCAACCTTTCCAGCA
TCCCATTTCTGGGCTCTGTCTTGGCACTGCCAATTCTCATCCCAATCCCTCCCCTTGTCG
AAAGAGCAATACACGAATTTGGAAATTTCATCTTTCAATTCTTCTGCATACGCCAATGTG
CTTCAGAATTGCATAAAGAACAGGGATTTCATCGTTGGAAAGGCACTCCACTGCGATGTT
TTAAAGAGAGGAGGATGTTTAGACCTATTTGGCCAGAACATTTTGCTCAACTTTTATATC
AAGTCTGAGTTATTACATGATGCAGTTCAGCTGTTCGATGAAATGTCTACGAAAAATGTG
GTTTCATTTGTTACTTTACTTCAGGGTCATTTGCAGGCAGAGGAGTATATTACAGCTGTT
GAATTGTTTGTTAGATTGCATAGAGAAGGTCATGAGCTGAACCCATTTGTATTCACAACA
ATCTTGAAAGTGCTTGTGGGTATGGATGAAGCAGAGATGGGTTGGAGAATTCATGCGTGT
ATTTATAAGCTTGGATTTGACTCTAATCCTTTTGTCAGCACTTCCCTCATTGATGCTTAC
TCTGTTTCTGGACTTGTTGATTTTTCCAGGGACGTTTTTGATGGCATTATTGACAAGGAC
ATGGTTTCTTGGACAGGGATGGTTACTTGTTATGCGGAAAATGATTACTTTGAAGAAGCA
CTGGGATGCTTCTCCCAAATGAGGTTGGCAGGTTGGATGCCAAATAACTACACATTCACG
AGTGTCATAAAGGCTTGCCTTGGTCTACAGGCCATTGATGTGGGCAAGAGTGTTCATGGA
TGTATACTGAAAACTAGGTACGAGATGGATCCTTCCGTTGGTATTTCGTTGCTTGACCTA
TACTGTAAATCTGGAGGTTTGAATGATGCTGCGTGTGTATTTCAAGAGATACCTGAGCGT
GATGTAGTTCATTGGAGTTTTATTATAGCACGATATTCACAGAGTGACCGCTGTGATGAG
GCACTGAAGTTCTTTTCCCAAATGAGGAGAGCATTAATTGTTCCAAACCAGTTTACTTTT
GCTAGTGTGCTGCAGGCATGTGCATCTGTGGAGGCTTTAGACCTTGGGATGCAAATCCAC
TGCTACGTGACAAAGTTTGGTCTTGATTCAGATGTGTTTGTTAGAAATGCCCTCATGGAT
GTGTATGCTAAGTGTGGAAAGGTGGAAAATACAGTAGACATGTTTCTGGAGACCGAAAAC
ATAAATGATGTATCATGGAACACTATTATTGTTGGCCATGTACAATGTGGAGATGGAGAG
AAGGCACTAGCTCTGTTTATTGATATGCATGAAGCTCAAGTGCGAGCTTCATCGGTGACA
TATTCGTCTCTGCTGCGTGCTTGTGCAACCCTGGCTGCATTGGAGCCAGGTCTTCAAATT
CACTCTTTTACTATAAAAACCATTTACGATCAAGATCTTGCTGTTGGAAATGCTTTAGTG
GATATGTATGCAAAATGTGGGAGTATTAAGGATGCTCGGTTAGTGTTTGAAACGATGATT
GAGCGTGATGTTGTATCATGGAATGCTATGGTTTCAGCATATTCCATGCATGGTCTTGGG
AATGAAGCTCTCAGTATCTTTGAGAGAATGCGCAGAACGCATGTCAAACCTAATCAATTA
ACATTTCTTGGTGTTCTTTCAGCATGTAGCAATTCAGGATCTTTGAATCAAGGATATGCA
TATCTCTCTTTGATGCTGGATGATTATGGTATTGAACCTTGCGTTGAACATTATACATGC
ATGGTATCACTTTTGGGGCGCTTAGGTCACCTTGATAAGGCTCTTAAGTTGATCGAAGAC
ATCCCATTTGAGCCAAGTGTCATGGTATGGCGTGCTTTGCTTGGTGCCTGTGTTCTTCAT
AATGAAGTTGATCTTGGGAAAACAGCTGCTCAGCGTGTGCTTGAATTGGAACCACAAGAT
GAAGCGACTTATGTGTTGTTATCAAATATGTATGCCACTTCGAAAAGGTGGAATAATGTA
GCTTTTGTCCGGAAAACTATGAAGAAAAAACGACTAAAGAAGGAACCAGGACTTAGTTGG
GTTGAAAACCAGGGTAGTGTTCATTATTTCTCTGTTGGTGATGCTTCACATCCTGATATC
AAACTTATACACGGAATGTTGGAATGGTTTAACTTGAAGAGTAAGGGGGGAGGTTACGTT
CCTAATTCTGATGTTGTTCTACTTGATGTGGACGATGATGAAAAGATACGTCTCCTATGG
TTACATAGTGAGAGATTAGCTTTAGCCTTTGCTTTATTAAGAACGCCGCCTGGAAGCCCA
ATTCGGATTATTAAAAATCTACGAATATGTTTGGACTGTCATGCAGCAATCAAGTTTATA
TCAACACTTGTGCAGCGAGAAATTGTTATAAGGGATATAAATAGGTTTCACCACTTCCAA
AACGGAGCTTGTTCATGTGGTGATTACTGGTAA

Peptide Sequence

PEP ID

PGSC0003DMP400064604
PEP Infomation

pacid=37442613 transcript=PGSC0003DMT400092929 locus=PGSC0003DMG400042500 ID=PGSC0003DMT400092929.v4.03 annot-version=v4.03
Sequence

MLRYVLGRRQPWTGFATFPASHFWALSWHCQFSSQSLPLSKEQYTNLEISSFNSSAYANV
LQNCIKNRDFIVGKALHCDVLKRGGCLDLFGQNILLNFYIKSELLHDAVQLFDEMSTKNV
VSFVTLLQGHLQAEEYITAVELFVRLHREGHELNPFVFTTILKVLVGMDEAEMGWRIHAC
IYKLGFDSNPFVSTSLIDAYSVSGLVDFSRDVFDGIIDKDMVSWTGMVTCYAENDYFEEA
LGCFSQMRLAGWMPNNYTFTSVIKACLGLQAIDVGKSVHGCILKTRYEMDPSVGISLLDL
YCKSGGLNDAACVFQEIPERDVVHWSFIIARYSQSDRCDEALKFFSQMRRALIVPNQFTF
ASVLQACASVEALDLGMQIHCYVTKFGLDSDVFVRNALMDVYAKCGKVENTVDMFLETEN
INDVSWNTIIVGHVQCGDGEKALALFIDMHEAQVRASSVTYSSLLRACATLAALEPGLQI
HSFTIKTIYDQDLAVGNALVDMYAKCGSIKDARLVFETMIERDVVSWNAMVSAYSMHGLG
NEALSIFERMRRTHVKPNQLTFLGVLSACSNSGSLNQGYAYLSLMLDDYGIEPCVEHYTC
MVSLLGRLGHLDKALKLIEDIPFEPSVMVWRALLGACVLHNEVDLGKTAAQRVLELEPQD
EATYVLLSNMYATSKRWNNVAFVRKTMKKKRLKKEPGLSWVENQGSVHYFSVGDASHPDI
KLIHGMLEWFNLKSKGGGYVPNSDVVLLDVDDDEKIRLLWLHSERLALAFALLRTPPGSP
IRIIKNLRICLDCHAAIKFISTLVQREIVIRDINRFHHFQNGACSCGDYW*

Transcript Sequence

Transcript ID

PGSC0003DMT400092929
Transcript Infomation

pacid=37442613 locus=PGSC0003DMG400042500 ID=PGSC0003DMT400092929.v4.03 annot-version=v4.03
Sequence

ATGCTGAGATACGTACTGGGCAGAAGACAGCCCTGGACGGGATTTGCAACCTTTCCAGCA
TCCCATTTCTGGGCTCTGTCTTGGCACTGCCAATTCTCATCCCAATCCCTCCCCTTGTCG
AAAGAGCAATACACGAATTTGGAAATTTCATCTTTCAATTCTTCTGCATACGCCAATGTG
CTTCAGAATTGCATAAAGAACAGGGATTTCATCGTTGGAAAGGCACTCCACTGCGATGTT
TTAAAGAGAGGAGGATGTTTAGACCTATTTGGCCAGAACATTTTGCTCAACTTTTATATC
AAGTCTGAGTTATTACATGATGCAGTTCAGCTGTTCGATGAAATGTCTACGAAAAATGTG
GTTTCATTTGTTACTTTACTTCAGGGTCATTTGCAGGCAGAGGAGTATATTACAGCTGTT
GAATTGTTTGTTAGATTGCATAGAGAAGGTCATGAGCTGAACCCATTTGTATTCACAACA
ATCTTGAAAGTGCTTGTGGGTATGGATGAAGCAGAGATGGGTTGGAGAATTCATGCGTGT
ATTTATAAGCTTGGATTTGACTCTAATCCTTTTGTCAGCACTTCCCTCATTGATGCTTAC
TCTGTTTCTGGACTTGTTGATTTTTCCAGGGACGTTTTTGATGGCATTATTGACAAGGAC
ATGGTTTCTTGGACAGGGATGGTTACTTGTTATGCGGAAAATGATTACTTTGAAGAAGCA
CTGGGATGCTTCTCCCAAATGAGGTTGGCAGGTTGGATGCCAAATAACTACACATTCACG
AGTGTCATAAAGGCTTGCCTTGGTCTACAGGCCATTGATGTGGGCAAGAGTGTTCATGGA
TGTATACTGAAAACTAGGTACGAGATGGATCCTTCCGTTGGTATTTCGTTGCTTGACCTA
TACTGTAAATCTGGAGGTTTGAATGATGCTGCGTGTGTATTTCAAGAGATACCTGAGCGT
GATGTAGTTCATTGGAGTTTTATTATAGCACGATATTCACAGAGTGACCGCTGTGATGAG
GCACTGAAGTTCTTTTCCCAAATGAGGAGAGCATTAATTGTTCCAAACCAGTTTACTTTT
GCTAGTGTGCTGCAGGCATGTGCATCTGTGGAGGCTTTAGACCTTGGGATGCAAATCCAC
TGCTACGTGACAAAGTTTGGTCTTGATTCAGATGTGTTTGTTAGAAATGCCCTCATGGAT
GTGTATGCTAAGTGTGGAAAGGTGGAAAATACAGTAGACATGTTTCTGGAGACCGAAAAC
ATAAATGATGTATCATGGAACACTATTATTGTTGGCCATGTACAATGTGGAGATGGAGAG
AAGGCACTAGCTCTGTTTATTGATATGCATGAAGCTCAAGTGCGAGCTTCATCGGTGACA
TATTCGTCTCTGCTGCGTGCTTGTGCAACCCTGGCTGCATTGGAGCCAGGTCTTCAAATT
CACTCTTTTACTATAAAAACCATTTACGATCAAGATCTTGCTGTTGGAAATGCTTTAGTG
GATATGTATGCAAAATGTGGGAGTATTAAGGATGCTCGGTTAGTGTTTGAAACGATGATT
GAGCGTGATGTTGTATCATGGAATGCTATGGTTTCAGCATATTCCATGCATGGTCTTGGG
AATGAAGCTCTCAGTATCTTTGAGAGAATGCGCAGAACGCATGTCAAACCTAATCAATTA
ACATTTCTTGGTGTTCTTTCAGCATGTAGCAATTCAGGATCTTTGAATCAAGGATATGCA
TATCTCTCTTTGATGCTGGATGATTATGGTATTGAACCTTGCGTTGAACATTATACATGC
ATGGTATCACTTTTGGGGCGCTTAGGTCACCTTGATAAGGCTCTTAAGTTGATCGAAGAC
ATCCCATTTGAGCCAAGTGTCATGGTATGGCGTGCTTTGCTTGGTGCCTGTGTTCTTCAT
AATGAAGTTGATCTTGGGAAAACAGCTGCTCAGCGTGTGCTTGAATTGGAACCACAAGAT
GAAGCGACTTATGTGTTGTTATCAAATATGTATGCCACTTCGAAAAGGTGGAATAATGTA
GCTTTTGTCCGGAAAACTATGAAGAAAAAACGACTAAAGAAGGAACCAGGACTTAGTTGG
GTTGAAAACCAGGGTAGTGTTCATTATTTCTCTGTTGGTGATGCTTCACATCCTGATATC
AAACTTATACACGGAATGTTGGAATGGTTTAACTTGAAGAGTAAGGGGGGAGGTTACGTT
CCTAATTCTGATGTTGTTCTACTTGATGTGGACGATGATGAAAAGATACGTCTCCTATGG
TTACATAGTGAGAGATTAGCTTTAGCCTTTGCTTTATTAAGAACGCCGCCTGGAAGCCCA
ATTCGGATTATTAAAAATCTACGAATATGTTTGGACTGTCATGCAGCAATCAAGTTTATA
TCAACACTTGTGCAGCGAGAAATTGTTATAAGGGATATAAATAGGTTTCACCACTTCCAA
AACGGAGCTTGTTCATGTGGTGATTACTGGTAA