Plant GARDEN
How To ▶︎

JA

EN

TOP > About the Species(Solanum tuberosum ) > genome data >Gene sequences

Search

By Species By Keywords Genes By Markers By Traits

Let’s Analyze!!

SNP Detection
(lang=JA only) Sequences Other Tools

Data List

All Markers Trait-Related Loci
Solanum tuberosum

CDS Sequence

CDS ID

PGSC0003DMT400092318
CDS Infomation

pacid=37478153 polypeptide=PGSC0003DMP400063993 locus=PGSC0003DMG400041889 ID=PGSC0003DMT400092318.v4.03 annot-version=v4.03
Sequence

ATGGATGGTTGTCTGGCTAATTCCCCTGAAGATATAGTGAAGGAGATTTTGTTGAGGTGT
CCTGTGAAGTCATTGTTGAGATTCAAATGCGTCTGTAAGAATTGGTGTGCTCTTATCAAA
ACCCCTGAATTTGTTCAACAACACTTGAAAAATCATAGCCCCCCACAACTCTTGATTTAT
GATAATGGTGACATTGATGATGACGACGACCTTACCATAACCTTGATTTCCGAAGAACAT
CTTCGAAGGTTCATAGGTATGAAACAACTCTTCGGTTCTATGGATGGCTTATTTTTTATG
GTTGGAGAAATTGATTGTGAGGTTTCATGTGCATTATGGAATCCTGTGACTAGGGAGGTG
AGACCCCTCCGTCTCCCTATCCCAGTAGCCACAATCCATGATGCCCCGGTGTTCGGGTTT
GGATTGGACCCTTTGACTTATGACTATAAAGTGGTTTACTTTCACATTAATAATTTGTGT
GAACATTATGCATCGGTCTACTCGTGTTCTAGGGACTTGTGGAGAATTTTCAAACCTAAA
ATCCCCTACTTTACAGACGTGAAACACTCATTTTGTACTGCTTATTTGAATGGAGCTTAT
TACTGGCTGCTAACTAGGGGCCGCCATAGTAATTACACCATTCTTTTGTTCGACTTTGGG
AGTGAAATGTTTAAAGAGATTGAAGGGCCATATCATCAATTTGTTGATACTAACATGTTG
GGTTTGATGTCGGTTGATAGTTCCATTGCCATCTTGAACTTGAACCCGCGTACTATGTTT
GCTTATGATATATGGGTAATGATCCAACCAGGTGTATGGAACAAACTTGTTACCTTTCAA
TGCTTCTTTAGGATTAAGTCTTGTTATGATAGCTCTCTCATTTTGGCAGCTAAAGATTTT
CAACTGGTCTCCTATGATGTTCGGACTAACAAGACGAGGCATCTTGGATTTCTAACATCC
GGGGCTTGA

Peptide Sequence

PEP ID

PGSC0003DMP400063993
PEP Infomation

pacid=37478153 transcript=PGSC0003DMT400092318 locus=PGSC0003DMG400041889 ID=PGSC0003DMT400092318.v4.03 annot-version=v4.03
Sequence

MDGCLANSPEDIVKEILLRCPVKSLLRFKCVCKNWCALIKTPEFVQQHLKNHSPPQLLIY
DNGDIDDDDDLTITLISEEHLRRFIGMKQLFGSMDGLFFMVGEIDCEVSCALWNPVTREV
RPLRLPIPVATIHDAPVFGFGLDPLTYDYKVVYFHINNLCEHYASVYSCSRDLWRIFKPK
IPYFTDVKHSFCTAYLNGAYYWLLTRGRHSNYTILLFDFGSEMFKEIEGPYHQFVDTNML
GLMSVDSSIAILNLNPRTMFAYDIWVMIQPGVWNKLVTFQCFFRIKSCYDSSLILAAKDF
QLVSYDVRTNKTRHLGFLTSGA*

Transcript Sequence

Transcript ID

PGSC0003DMT400092318
Transcript Infomation

pacid=37478153 locus=PGSC0003DMG400041889 ID=PGSC0003DMT400092318.v4.03 annot-version=v4.03
Sequence

ATGGATGGTTGTCTGGCTAATTCCCCTGAAGATATAGTGAAGGAGATTTTGTTGAGGTGT
CCTGTGAAGTCATTGTTGAGATTCAAATGCGTCTGTAAGAATTGGTGTGCTCTTATCAAA
ACCCCTGAATTTGTTCAACAACACTTGAAAAATCATAGCCCCCCACAACTCTTGATTTAT
GATAATGGTGACATTGATGATGACGACGACCTTACCATAACCTTGATTTCCGAAGAACAT
CTTCGAAGGTTCATAGGTATGAAACAACTCTTCGGTTCTATGGATGGCTTATTTTTTATG
GTTGGAGAAATTGATTGTGAGGTTTCATGTGCATTATGGAATCCTGTGACTAGGGAGGTG
AGACCCCTCCGTCTCCCTATCCCAGTAGCCACAATCCATGATGCCCCGGTGTTCGGGTTT
GGATTGGACCCTTTGACTTATGACTATAAAGTGGTTTACTTTCACATTAATAATTTGTGT
GAACATTATGCATCGGTCTACTCGTGTTCTAGGGACTTGTGGAGAATTTTCAAACCTAAA
ATCCCCTACTTTACAGACGTGAAACACTCATTTTGTACTGCTTATTTGAATGGAGCTTAT
TACTGGCTGCTAACTAGGGGCCGCCATAGTAATTACACCATTCTTTTGTTCGACTTTGGG
AGTGAAATGTTTAAAGAGATTGAAGGGCCATATCATCAATTTGTTGATACTAACATGTTG
GGTTTGATGTCGGTTGATAGTTCCATTGCCATCTTGAACTTGAACCCGCGTACTATGTTT
GCTTATGATATATGGGTAATGATCCAACCAGGTGTATGGAACAAACTTGTTACCTTTCAA
TGCTTCTTTAGGATTAAGTCTTGTTATGATAGCTCTCTCATTTTGGCAGCTAAAGATTTT
CAACTGGTCTCCTATGATGTTCGGACTAACAAGACGAGGCATCTTGGATTTCTAACATCC
GGGGCTTGA