Gene sequences

How To ▶︎

JA

EN

TOP > About the Species(Solanum tuberosum ) > genome data >Gene sequences

Search

By Traits

Let’s Analyze!!

SNP Detection
(lang=JA only)

Other Tools

Data List

All

Trait-Related Loci

Solanum tuberosum

CDS Sequence

CDS ID	PGSC0003DMT400092088
CDS Infomation	pacid=37468019 polypeptide=PGSC0003DMP400063763 locus=PGSC0003DMG400041659 ID=PGSC0003DMT400092088.v4.03 annot-version=v4.03
Sequence	ATGGCAGGTTGGGCAGAGCTTCCCAACGATCTTATTGCTCACATTACAAATCGTGTTAAA GTGATCGAAGATTTCATTGCTTTTCGTGCCGTTTGTACTACTTGGCGAATTGCCGCTACA AAGGACAATTTTGATGTGTTTCACCCTCAAGTTCCGTTGTTTATGCTGGGTGCTAAAGAT GACAATTTTCAAGAGTTTTATTCTCTTTCGAAGAAGAAAGTTTCGCACATATTTCTCCCC GAAGTTAGAGGGACAGAGTATCTATCAACAGAGGGATGGCTCTGCACCGTGGTAAATGAT ACGGGAGAGATGAATTTGTTGCACCCTTTCTCTCGCAAAAAAATACAACTACCCTCTCGA AAAGCCCTTTTTACTTTCCATGATCTCGATGCTTTCGAAAAACATCATTGGCTCTGTATA GACAGAGCTGTCTTGTCTGCGAATCCTTCTCTTACGTCAGATTATGTATTGATGGTGCAT CATTATGTAGCTGGTTGTTGTTTGTCGTTTTGGCGACCTGGAGACCTCGACTGGACTCAT ATTGATGTTAGTCATATTCACAGCAGAGTCGCCGCTCTAATTTATCACAAAGGCAAGTTT TATTCCACTGATAATGATGGCGAAATATGGGCTCATCAAGTTGGTGCTGATCAACCAATC GTAACGACACGCTTGGTTGCCGAGATTAACCAACTTAATGAGATGAACGAGCATATGTTT ATGTTTCGTTTGCACCTAGTTGAGTTATCAGGTGCACTATTAGTTGTCTCTCGATTTGAT GACGATTCAAATGGTACTTTTCACACCTTCAAATATAAAGTCTATGAAGTAGACGTAATC AGAGGTGAATTGAAGAAGGAGATGAAAGCCTTGGGAGATTCGTCCATCTTCTTGGGTCTC AATTGGGGAATTTGCATTGACTCTTCTAAATTTATCGGAATCAAACCTAATCACATATAT TTTGCCGGTGATGTGTTAGAAGAACTCACAGAAGATATGGGTGCTTATAATTTGGAAGAT GGAAAAATTGAATCTTTCTATCCTGGACAATCAACAAGTTTAATTTATCCGCCAACTTGG ATTATGCCATCACTAATAATGTGA

Peptide Sequence

PEP ID	PGSC0003DMP400063763
PEP Infomation	pacid=37468019 transcript=PGSC0003DMT400092088 locus=PGSC0003DMG400041659 ID=PGSC0003DMT400092088.v4.03 annot-version=v4.03
Sequence	MAGWAELPNDLIAHITNRVKVIEDFIAFRAVCTTWRIAATKDNFDVFHPQVPLFMLGAKD DNFQEFYSLSKKKVSHIFLPEVRGTEYLSTEGWLCTVVNDTGEMNLLHPFSRKKIQLPSR KALFTFHDLDAFEKHHWLCIDRAVLSANPSLTSDYVLMVHHYVAGCCLSFWRPGDLDWTH IDVSHIHSRVAALIYHKGKFYSTDNDGEIWAHQVGADQPIVTTRLVAEINQLNEMNEHMF MFRLHLVELSGALLVVSRFDDDSNGTFHTFKYKVYEVDVIRGELKKEMKALGDSSIFLGL NWGICIDSSKFIGIKPNHIYFAGDVLEELTEDMGAYNLEDGKIESFYPGQSTSLIYPPTW IMPSLIM*

Transcript Sequence

Transcript ID	PGSC0003DMT400092088
Transcript Infomation	pacid=37468019 locus=PGSC0003DMG400041659 ID=PGSC0003DMT400092088.v4.03 annot-version=v4.03
Sequence	ATGGCAGGTTGGGCAGAGCTTCCCAACGATCTTATTGCTCACATTACAAATCGTGTTAAA GTGATCGAAGATTTCATTGCTTTTCGTGCCGTTTGTACTACTTGGCGAATTGCCGCTACA AAGGACAATTTTGATGTGTTTCACCCTCAAGTTCCGTTGTTTATGCTGGGTGCTAAAGAT GACAATTTTCAAGAGTTTTATTCTCTTTCGAAGAAGAAAGTTTCGCACATATTTCTCCCC GAAGTTAGAGGGACAGAGTATCTATCAACAGAGGGATGGCTCTGCACCGTGGTAAATGAT ACGGGAGAGATGAATTTGTTGCACCCTTTCTCTCGCAAAAAAATACAACTACCCTCTCGA AAAGCCCTTTTTACTTTCCATGATCTCGATGCTTTCGAAAAACATCATTGGCTCTGTATA GACAGAGCTGTCTTGTCTGCGAATCCTTCTCTTACGTCAGATTATGTATTGATGGTGCAT CATTATGTAGCTGGTTGTTGTTTGTCGTTTTGGCGACCTGGAGACCTCGACTGGACTCAT ATTGATGTTAGTCATATTCACAGCAGAGTCGCCGCTCTAATTTATCACAAAGGCAAGTTT TATTCCACTGATAATGATGGCGAAATATGGGCTCATCAAGTTGGTGCTGATCAACCAATC GTAACGACACGCTTGGTTGCCGAGATTAACCAACTTAATGAGATGAACGAGCATATGTTT ATGTTTCGTTTGCACCTAGTTGAGTTATCAGGTGCACTATTAGTTGTCTCTCGATTTGAT GACGATTCAAATGGTACTTTTCACACCTTCAAATATAAAGTCTATGAAGTAGACGTAATC AGAGGTGAATTGAAGAAGGAGATGAAAGCCTTGGGAGATTCGTCCATCTTCTTGGGTCTC AATTGGGGAATTTGCATTGACTCTTCTAAATTTATCGGAATCAAACCTAATCACATATAT TTTGCCGGTGATGTGTTAGAAGAACTCACAGAAGATATGGGTGCTTATAATTTGGAAGAT GGAAAAATTGAATCTTTCTATCCTGGACAATCAACAAGTTTAATTTATCCGCCAACTTGG ATTATGCCATCACTAATAATGTGA