Plant GARDEN How To ▶︎

JA

EN

Solanum tuberosum

CDS Sequence

CDS ID

PGSC0003DMT400090181

CDS Infomation

pacid=37462189 polypeptide=PGSC0003DMP400061856 locus=PGSC0003DMG400039752 ID=PGSC0003DMT400090181.v4.03 annot-version=v4.03

Sequence

ATGGCGGCGACTATTGAAGGACAAGATAGGGTTCTTGCAGCAGCTCAACAGATCGTCAAG
AGTCTCAACACCTCTACAAATGTTGATACTGAAGATATGCTTATGATTTTATCTAATTTT
GATAATCGTTTATCTAAGCTCTCTAATATGATGACCACCACCACTTCATCTTCATCAACT
CCTACATCCGCTAGATCAGCTGCTGCTGCTGCTGCCGTAGCCGAAACCGATCATTCTTAT
ACTGATCTTGTGTTTGAAGAGGCTGCGAAGCTTGTGCTTGAATGGGACTCTCCTCCTAAC
GCCGATCCTGATTCCACCTCTGAATATCTCAACGCTGTTGACGAGATTATTAAGAAGACC
GAGGATCTGAATGTTCTGTCGTCCGATATGGACCGAGCTGAGGCTGCTCTTCAGCATGCT
ATGGCTCATTTGGAGGAGGAGTTTCGTCATGTTCTCATTGGAAATACTGTTCCTTTCGAT
GTTGGCCGTCTCCATGAGTCCTCTTTCATTCGCCGTTGTTCTATCTCTTCATCTGCTGTT
GCAATTCCTGATTTTGAAACAGGTACTTTGTCCGAGGATCAGGAGGATGTTAGCAGTGCA
AGGTACAATCACGTCAAAGGGAAGAGCCTTGGAGCGGATGATTTCTCCCTTGATTTGGTA
TATAATGATGCTATAATTGATCTGCGAGAGATTGCTAACCGTATGATTAAATCTGGATAT
GAAAAGGAATGTTGCCAGGTGTACTCTAGTGTTCGCAGAGAGGTGCTTGACGAGTGTTTA
GCAATTCTTGGCATTGAGAAACTGAGCATTGAGGAGGTCCATAGGATTGATTGGCAGTCG
CTGGATGAGAAAATGAAAAAATGGATTTATGCTGTAAAAGTTCTGGTGAGAATTCTTCTA
TCTGCTGAAAAGAGCTTATGTGACCAGGTTTTTGGAGACTCGGAGTTGATTAAAGAAGTG
TGCTTTATGGAAACTGCAAAGGGCTGTGTAATGCAGCTCTTGAATTTTGGAGAAGCTGTG
GCAATAGGGCGAAGGTCGTCGGAGAAGTTATTTAGGATTCTGGATATGTATGATGCCCTG
GCAGATGTTTTGTCTGACATAGAGCTGCTTTTTTGTGATGAAGATGGTGAATTGGTGTGT
GGTGAGTCAAAGGGGGTGTTAGATGGCCTAGGAGAAGCAGCTATTGGGACATTTGTGGAG
TTTGAAAATGCTGTTGAGCGGGAGATTTCAAAGAAACCAACACAAGGCGGTGAAATCCAT
CCATTGACTCGTTATGTTATGAATTATGTTAAATTGCTGGTTGATTATAGTGATACATTG
AATGGACTTTTAGAGAAGTTAGAGAGTTGCATGGAACATGACCCTTCCGCAACTGATAAT
GGTGATAACTTGGAGTTGGAGAATGTTGCACCACTGGCGAGGCGGTTGATGTTACTGATC
AAGTCTTTGGAAGGTAATCTGGAGGGGAAGTCGAGAATGTATGAAGATTGTGGAATGCCG
TATATATTTTTGATGAATAATGTACATTACATCGTTCAGAAAGTGAAAGATTCGGAGCTT
CAAAAACTTTTAGGTGATCAGTGGGTCAGAAAGCGGAGGGGTCAGATTCGACAACATGCT
ACAAGCTATCTTAGAGCTTCATGGAGCAAGGTTTTATCTTGTTTGAAGGACGAAGGACTT
AGCGGAAGCTCAAGCAATGCTTCAAAGGTAGCCCTCAAGGAGAGGTTTAAGAACTTCAAC
GCATGTTTTGAAGAAATTTACAGAATCCAGACTGGTTGGAAGGTCCCAGATCCTCAACTG
CGCGAAGAACTCAGGATTTCTATTTCTGAAAAGGTGCTTCCTGCATATCGCTCATTTCTA
GGAAGATTTGGGAGTCATTTAGAGAGTGGAAGAAATGCTGGGAAGTACATAAAGTATACT
CTAGAGGACTTAGAAGGTTATTTGTTGGATCTATTTGAAGGAACACCTCTTGTTTTGCAC
CATATGAGAAGAAAAGGCACGTAA

Peptide Sequence

PEP ID

PGSC0003DMP400061856

PEP Infomation

pacid=37462189 transcript=PGSC0003DMT400090181 locus=PGSC0003DMG400039752 ID=PGSC0003DMT400090181.v4.03 annot-version=v4.03

Sequence

MAATIEGQDRVLAAAQQIVKSLNTSTNVDTEDMLMILSNFDNRLSKLSNMMTTTTSSSST
PTSARSAAAAAAVAETDHSYTDLVFEEAAKLVLEWDSPPNADPDSTSEYLNAVDEIIKKT
EDLNVLSSDMDRAEAALQHAMAHLEEEFRHVLIGNTVPFDVGRLHESSFIRRCSISSSAV
AIPDFETGTLSEDQEDVSSARYNHVKGKSLGADDFSLDLVYNDAIIDLREIANRMIKSGY
EKECCQVYSSVRREVLDECLAILGIEKLSIEEVHRIDWQSLDEKMKKWIYAVKVLVRILL
SAEKSLCDQVFGDSELIKEVCFMETAKGCVMQLLNFGEAVAIGRRSSEKLFRILDMYDAL
ADVLSDIELLFCDEDGELVCGESKGVLDGLGEAAIGTFVEFENAVEREISKKPTQGGEIH
PLTRYVMNYVKLLVDYSDTLNGLLEKLESCMEHDPSATDNGDNLELENVAPLARRLMLLI
KSLEGNLEGKSRMYEDCGMPYIFLMNNVHYIVQKVKDSELQKLLGDQWVRKRRGQIRQHA
TSYLRASWSKVLSCLKDEGLSGSSSNASKVALKERFKNFNACFEEIYRIQTGWKVPDPQL
REELRISISEKVLPAYRSFLGRFGSHLESGRNAGKYIKYTLEDLEGYLLDLFEGTPLVLH
HMRRKGT*

Transcript Sequence

Transcript ID

PGSC0003DMT400090181

Transcript Infomation

pacid=37462189 locus=PGSC0003DMG400039752 ID=PGSC0003DMT400090181.v4.03 annot-version=v4.03

Sequence

ATGGCGGCGACTATTGAAGGACAAGATAGGGTTCTTGCAGCAGCTCAACAGATCGTCAAG
AGTCTCAACACCTCTACAAATGTTGATACTGAAGATATGCTTATGATTTTATCTAATTTT
GATAATCGTTTATCTAAGCTCTCTAATATGATGACCACCACCACTTCATCTTCATCAACT
CCTACATCCGCTAGATCAGCTGCTGCTGCTGCTGCCGTAGCCGAAACCGATCATTCTTAT
ACTGATCTTGTGTTTGAAGAGGCTGCGAAGCTTGTGCTTGAATGGGACTCTCCTCCTAAC
GCCGATCCTGATTCCACCTCTGAATATCTCAACGCTGTTGACGAGATTATTAAGAAGACC
GAGGATCTGAATGTTCTGTCGTCCGATATGGACCGAGCTGAGGCTGCTCTTCAGCATGCT
ATGGCTCATTTGGAGGAGGAGTTTCGTCATGTTCTCATTGGAAATACTGTTCCTTTCGAT
GTTGGCCGTCTCCATGAGTCCTCTTTCATTCGCCGTTGTTCTATCTCTTCATCTGCTGTT
GCAATTCCTGATTTTGAAACAGGTACTTTGTCCGAGGATCAGGAGGATGTTAGCAGTGCA
AGGTACAATCACGTCAAAGGGAAGAGCCTTGGAGCGGATGATTTCTCCCTTGATTTGGTA
TATAATGATGCTATAATTGATCTGCGAGAGATTGCTAACCGTATGATTAAATCTGGATAT
GAAAAGGAATGTTGCCAGGTGTACTCTAGTGTTCGCAGAGAGGTGCTTGACGAGTGTTTA
GCAATTCTTGGCATTGAGAAACTGAGCATTGAGGAGGTCCATAGGATTGATTGGCAGTCG
CTGGATGAGAAAATGAAAAAATGGATTTATGCTGTAAAAGTTCTGGTGAGAATTCTTCTA
TCTGCTGAAAAGAGCTTATGTGACCAGGTTTTTGGAGACTCGGAGTTGATTAAAGAAGTG
TGCTTTATGGAAACTGCAAAGGGCTGTGTAATGCAGCTCTTGAATTTTGGAGAAGCTGTG
GCAATAGGGCGAAGGTCGTCGGAGAAGTTATTTAGGATTCTGGATATGTATGATGCCCTG
GCAGATGTTTTGTCTGACATAGAGCTGCTTTTTTGTGATGAAGATGGTGAATTGGTGTGT
GGTGAGTCAAAGGGGGTGTTAGATGGCCTAGGAGAAGCAGCTATTGGGACATTTGTGGAG
TTTGAAAATGCTGTTGAGCGGGAGATTTCAAAGAAACCAACACAAGGCGGTGAAATCCAT
CCATTGACTCGTTATGTTATGAATTATGTTAAATTGCTGGTTGATTATAGTGATACATTG
AATGGACTTTTAGAGAAGTTAGAGAGTTGCATGGAACATGACCCTTCCGCAACTGATAAT
GGTGATAACTTGGAGTTGGAGAATGTTGCACCACTGGCGAGGCGGTTGATGTTACTGATC
AAGTCTTTGGAAGGTAATCTGGAGGGGAAGTCGAGAATGTATGAAGATTGTGGAATGCCG
TATATATTTTTGATGAATAATGTACATTACATCGTTCAGAAAGTGAAAGATTCGGAGCTT
CAAAAACTTTTAGGTGATCAGTGGGTCAGAAAGCGGAGGGGTCAGATTCGACAACATGCT
ACAAGCTATCTTAGAGCTTCATGGAGCAAGGTTTTATCTTGTTTGAAGGACGAAGGACTT
AGCGGAAGCTCAAGCAATGCTTCAAAGGTAGCCCTCAAGGAGAGGTTTAAGAACTTCAAC
GCATGTTTTGAAGAAATTTACAGAATCCAGACTGGTTGGAAGGTCCCAGATCCTCAACTG
CGCGAAGAACTCAGGATTTCTATTTCTGAAAAGGTGCTTCCTGCATATCGCTCATTTCTA
GGAAGATTTGGGAGTCATTTAGAGAGTGGAAGAAATGCTGGGAAGTACATAAAGTATACT
CTAGAGGACTTAGAAGGTTATTTGTTGGATCTATTTGAAGGAACACCTCTTGTTTTGCAC
CATATGAGAAGAAAAGGCACGTAA