Plant GARDEN
How To ▶︎

JA

EN

TOP > About the Species(Solanum tuberosum ) > genome data >Gene sequences

Search

By Species By Keywords Genes By Markers By Traits

Let’s Analyze!!

SNP Detection
(lang=JA only) Sequences Other Tools

Data List

All Markers Trait-Related Loci
Solanum tuberosum

CDS Sequence

CDS ID

PGSC0003DMT400090109
CDS Infomation

pacid=37434034 polypeptide=PGSC0003DMP400061784 locus=PGSC0003DMG400039680 ID=PGSC0003DMT400090109.v4.03 annot-version=v4.03
Sequence

ATGGGAATAGGCATTCTTGGTTCTTTTCTGCTTTTGACTGTGTTCTTTAGGCCTTTGCTT
TGCCAACAGCCAAACACTGATGGATTTTTTGTGTCTGATTTTCTTCAAAAGATGGGGGTT
GCTAAAGTTCACAACTTTTCAGCTCACTTTTGTTCTTGGAAAGGGGTGGGATGTGATTCC
AAGGATGAAAATGTTGTTAATTTGACAGCTAAAAGTTTTGGTTTATCTGGTGTGATTCCT
GATAACACCATTGGTAAACTCACAAAGCTGAAGTATTTGGATCTGAGCAACAATAAACTC
ACTGGTTTGCCTTCTGATATATGGAGTTTAGGTTCACTAAAGTACCTTAACCTCTCACAT
AACCATATCTCTGGTGACCTTTCAAGTAACATAGGCAATTTTGGTGGTCTTGAAATCATG
GACTTTTCTGTCAACAATTTCTCTGGGAAAATCCCAGATGCCATTAGCTCCCTTTCAAGT
TTGCATTCTCTTAATCTTAGTAAGAACTTGTTTGATTCAGAAATCCCTTCTGGAATTTTG
GGCTGTCATTCTTTGGAATCCCTTGATCTTTCAGAAAACAGACTCACTGGTTTTCCTAAT
GATTTTGGTTCTACATTTCACAAGCTCAAGTTCTTGAATCTTGCAGAAAATGAGATTCTT
GGTAAAGATTCAGATTTTTCAAGAATGGGTTCAATCACTCATATCAATATTTCAGGCAAT
CTGTTTAAGGGTTCTGTTGTTGGTCTTTTTGAGGGGCCATTGGAAGTGATTGATTTGAGT
AGAAACCAGTTTGATGGTCACATTTCTCAGGTAAACTTCAGTTCCAGCTTCAATTGGTCT
CATTTGGTTTATCTTGATTTATCTGAGAATCACCTTAGTGGAGGGATCATTAGAGAATTA
AAGAATGCTCGAAATCTTCTATACCTTAATCTTGCAGATAATAGATTTTCACATCAAGAA
TTTCCACAAACTGATATGTTATCTAGCTTAGAGTATCTGAATTTGTCTGGAACTAGTTTG
ATTGGCCAAATTCCTCAAGAGCTCTCGTCGTTGAGTCGCTTGAAAATCCTTGATATATCC
AAAAACCATCTTAGTAAACGCATTCCTCCGCTGAGCAATAGAAATCTCCTGGTTCTTGAT
GTTTCATACAACAATTTGACTGGTGATATCCCATTGCCACTTGTAGAGATACTTCCAAGG
ATGGAAAGGTTCAATTTTTCTTACAACAATCTAACTCTTTGTGCTACTGAATTCTCCCCT
AAAACACTCCTTTCGGCGTTTATCGGGTCATCAAATGGATGTCCTATTGCTGCCAACCCA
GCTCTCTTCCACAAGAAAGCTCCGAAACACAGAGGACTTAAACTTGCTTTGGCATTAACT
TTCTCTATGGTTTTTCTGCTTCTTGGTTTACTGTTCTTGGCATTTGGTTGTCGAAGGAAA
ACCACGATATGGGCGGTTAAACAGAACTCTTACAAGGAAGAACAGACTATTTCTGGTCCT
TTTTCATTCCAGACTGATTCAACAACTTGGGTTGCTGATGTTAAGCAAGCAAACTCAGTG
CCTGTTGTGATTTTCGAGAAGCCACTGTTGAATTTCACATTTGCAGATCTCTTATCTGCA
ACTTCTAATTTCGATCGAGGCACATTGTTAGCTGAAGGGAGGTTTGGTCCTGTTTATAGA
GGCTTTTTACCAGGTGGCATTCATGTGGCAGTGAAAGTTCTTGTTCATGGTTCCACTATG
ACAGACCATGAAGCTGCAAGAGAGCTCGAGTATCTTGGCCGGATAAAACATCCTAATCTT
GTTCCATTGACAGGATACTGCTTGGCTGGTGAGCAAAGAATTGCCATTTATGATTACATG
GAGAACGGGAATTTGCAGAACTTGCTTCATGACTTGCCACTCGGGGTTCGAACTACTACT
GAAGACTGGAGCACGGACACGTGGGAAGAGGAGGATGATAATAACAGTATTCAGAATGTT
GGTTCTGAAGGATTGTTAACCACTTGGAGATTTAGGCACAAAATCGCGCTTGGCACTGCT
AGAGCACTTGCATTTCTACACCATGGTTGTTCACCTCCCATTATACATAGAGATGTCAAA
GCCAGCAGTGTTTATCTTGATATGAACTTGGAGCCTAGACTATCCGATTTCGGATTGGCC
AAAATCTTTGGCACGGGACCCGAGGATGAGATCACTCGCGGTTCACCTGGATACATTCCC
CCAGAATTTCTTCATCCAGAGAGCAGCTCACCTAAATATCCTACACCAAAGTCAGATGTG
TATGGATTTGGAGTCATCCTTTTCGAGCTAATTACCGGGAAAAAACCAGTTGAAGATGAT
TATCCACAACACAATGATGCGAATTTGGTTGGTTGGGTTAGAGGATTAGTAAGGAACAAC
GAGGGATCAAGAGTTATCGATCCAAAAATTCGTGGAACTGCATCACAGACACAAATACTA
GAAGCCTTGAAAATCGGTTATCTATGCACAGCTGAAGTTCCCGCGAAACGACCAAGTATG
CATCAAGTAGTTGGACTGCTTAAGGATATTGAGCCTACACAACAATGA

Peptide Sequence

PEP ID

PGSC0003DMP400061784
PEP Infomation

pacid=37434034 transcript=PGSC0003DMT400090109 locus=PGSC0003DMG400039680 ID=PGSC0003DMT400090109.v4.03 annot-version=v4.03
Sequence

MGIGILGSFLLLTVFFRPLLCQQPNTDGFFVSDFLQKMGVAKVHNFSAHFCSWKGVGCDS
KDENVVNLTAKSFGLSGVIPDNTIGKLTKLKYLDLSNNKLTGLPSDIWSLGSLKYLNLSH
NHISGDLSSNIGNFGGLEIMDFSVNNFSGKIPDAISSLSSLHSLNLSKNLFDSEIPSGIL
GCHSLESLDLSENRLTGFPNDFGSTFHKLKFLNLAENEILGKDSDFSRMGSITHINISGN
LFKGSVVGLFEGPLEVIDLSRNQFDGHISQVNFSSSFNWSHLVYLDLSENHLSGGIIREL
KNARNLLYLNLADNRFSHQEFPQTDMLSSLEYLNLSGTSLIGQIPQELSSLSRLKILDIS
KNHLSKRIPPLSNRNLLVLDVSYNNLTGDIPLPLVEILPRMERFNFSYNNLTLCATEFSP
KTLLSAFIGSSNGCPIAANPALFHKKAPKHRGLKLALALTFSMVFLLLGLLFLAFGCRRK
TTIWAVKQNSYKEEQTISGPFSFQTDSTTWVADVKQANSVPVVIFEKPLLNFTFADLLSA
TSNFDRGTLLAEGRFGPVYRGFLPGGIHVAVKVLVHGSTMTDHEAARELEYLGRIKHPNL
VPLTGYCLAGEQRIAIYDYMENGNLQNLLHDLPLGVRTTTEDWSTDTWEEEDDNNSIQNV
GSEGLLTTWRFRHKIALGTARALAFLHHGCSPPIIHRDVKASSVYLDMNLEPRLSDFGLA
KIFGTGPEDEITRGSPGYIPPEFLHPESSSPKYPTPKSDVYGFGVILFELITGKKPVEDD
YPQHNDANLVGWVRGLVRNNEGSRVIDPKIRGTASQTQILEALKIGYLCTAEVPAKRPSM
HQVVGLLKDIEPTQQ*

Transcript Sequence

Transcript ID

PGSC0003DMT400090109
Transcript Infomation

pacid=37434034 locus=PGSC0003DMG400039680 ID=PGSC0003DMT400090109.v4.03 annot-version=v4.03
Sequence

ATGGGAATAGGCATTCTTGGTTCTTTTCTGCTTTTGACTGTGTTCTTTAGGCCTTTGCTT
TGCCAACAGCCAAACACTGATGGATTTTTTGTGTCTGATTTTCTTCAAAAGATGGGGGTT
GCTAAAGTTCACAACTTTTCAGCTCACTTTTGTTCTTGGAAAGGGGTGGGATGTGATTCC
AAGGATGAAAATGTTGTTAATTTGACAGCTAAAAGTTTTGGTTTATCTGGTGTGATTCCT
GATAACACCATTGGTAAACTCACAAAGCTGAAGTATTTGGATCTGAGCAACAATAAACTC
ACTGGTTTGCCTTCTGATATATGGAGTTTAGGTTCACTAAAGTACCTTAACCTCTCACAT
AACCATATCTCTGGTGACCTTTCAAGTAACATAGGCAATTTTGGTGGTCTTGAAATCATG
GACTTTTCTGTCAACAATTTCTCTGGGAAAATCCCAGATGCCATTAGCTCCCTTTCAAGT
TTGCATTCTCTTAATCTTAGTAAGAACTTGTTTGATTCAGAAATCCCTTCTGGAATTTTG
GGCTGTCATTCTTTGGAATCCCTTGATCTTTCAGAAAACAGACTCACTGGTTTTCCTAAT
GATTTTGGTTCTACATTTCACAAGCTCAAGTTCTTGAATCTTGCAGAAAATGAGATTCTT
GGTAAAGATTCAGATTTTTCAAGAATGGGTTCAATCACTCATATCAATATTTCAGGCAAT
CTGTTTAAGGGTTCTGTTGTTGGTCTTTTTGAGGGGCCATTGGAAGTGATTGATTTGAGT
AGAAACCAGTTTGATGGTCACATTTCTCAGGTAAACTTCAGTTCCAGCTTCAATTGGTCT
CATTTGGTTTATCTTGATTTATCTGAGAATCACCTTAGTGGAGGGATCATTAGAGAATTA
AAGAATGCTCGAAATCTTCTATACCTTAATCTTGCAGATAATAGATTTTCACATCAAGAA
TTTCCACAAACTGATATGTTATCTAGCTTAGAGTATCTGAATTTGTCTGGAACTAGTTTG
ATTGGCCAAATTCCTCAAGAGCTCTCGTCGTTGAGTCGCTTGAAAATCCTTGATATATCC
AAAAACCATCTTAGTAAACGCATTCCTCCGCTGAGCAATAGAAATCTCCTGGTTCTTGAT
GTTTCATACAACAATTTGACTGGTGATATCCCATTGCCACTTGTAGAGATACTTCCAAGG
ATGGAAAGGTTCAATTTTTCTTACAACAATCTAACTCTTTGTGCTACTGAATTCTCCCCT
AAAACACTCCTTTCGGCGTTTATCGGGTCATCAAATGGATGTCCTATTGCTGCCAACCCA
GCTCTCTTCCACAAGAAAGCTCCGAAACACAGAGGACTTAAACTTGCTTTGGCATTAACT
TTCTCTATGGTTTTTCTGCTTCTTGGTTTACTGTTCTTGGCATTTGGTTGTCGAAGGAAA
ACCACGATATGGGCGGTTAAACAGAACTCTTACAAGGAAGAACAGACTATTTCTGGTCCT
TTTTCATTCCAGACTGATTCAACAACTTGGGTTGCTGATGTTAAGCAAGCAAACTCAGTG
CCTGTTGTGATTTTCGAGAAGCCACTGTTGAATTTCACATTTGCAGATCTCTTATCTGCA
ACTTCTAATTTCGATCGAGGCACATTGTTAGCTGAAGGGAGGTTTGGTCCTGTTTATAGA
GGCTTTTTACCAGGTGGCATTCATGTGGCAGTGAAAGTTCTTGTTCATGGTTCCACTATG
ACAGACCATGAAGCTGCAAGAGAGCTCGAGTATCTTGGCCGGATAAAACATCCTAATCTT
GTTCCATTGACAGGATACTGCTTGGCTGGTGAGCAAAGAATTGCCATTTATGATTACATG
GAGAACGGGAATTTGCAGAACTTGCTTCATGACTTGCCACTCGGGGTTCGAACTACTACT
GAAGACTGGAGCACGGACACGTGGGAAGAGGAGGATGATAATAACAGTATTCAGAATGTT
GGTTCTGAAGGATTGTTAACCACTTGGAGATTTAGGCACAAAATCGCGCTTGGCACTGCT
AGAGCACTTGCATTTCTACACCATGGTTGTTCACCTCCCATTATACATAGAGATGTCAAA
GCCAGCAGTGTTTATCTTGATATGAACTTGGAGCCTAGACTATCCGATTTCGGATTGGCC
AAAATCTTTGGCACGGGACCCGAGGATGAGATCACTCGCGGTTCACCTGGATACATTCCC
CCAGAATTTCTTCATCCAGAGAGCAGCTCACCTAAATATCCTACACCAAAGTCAGATGTG
TATGGATTTGGAGTCATCCTTTTCGAGCTAATTACCGGGAAAAAACCAGTTGAAGATGAT
TATCCACAACACAATGATGCGAATTTGGTTGGTTGGGTTAGAGGATTAGTAAGGAACAAC
GAGGGATCAAGAGTTATCGATCCAAAAATTCGTGGAACTGCATCACAGACACAAATACTA
GAAGCCTTGAAAATCGGTTATCTATGCACAGCTGAAGTTCCCGCGAAACGACCAAGTATG
CATCAAGTAGTTGGACTGCTTAAGGATATTGAGCCTACACAACAATGA