Plant GARDEN
How To ▶︎

JA

EN

TOP > About the Species(Solanum tuberosum ) > genome data >Gene sequences

Search

By Species By Keywords Genes By Markers By Traits

Let’s Analyze!!

SNP Detection
(lang=JA only) Sequences Other Tools

Data List

All Markers Trait-Related Loci
Solanum tuberosum

CDS Sequence

CDS ID

PGSC0003DMT400088885
CDS Infomation

pacid=37469818 polypeptide=PGSC0003DMP400060560 locus=PGSC0003DMG400038456 ID=PGSC0003DMT400088885.v4.03 annot-version=v4.03
Sequence

ATGACTCCCATGGTACAAGAACTTAATTTTCCTCAACTTCAAATACCTCTAACCATCAAT
TCAATTTCTCCAATCTTACCATCAAGTCCCATCCCTCCATCCTATGGTGACACCCTTTAC
CTCTCAAATCTTGATGATATGATTGGATCTCGCGTTTTTACTCCAACCATGTATTTCTAT
CGATCCAATGGGAAAATGGATGTGATGACAATCATCAATGTGTTAAAAGAATCTCTTGCA
AGTGTATTGGTACCATACTATCCTTTCTCAGGTAGGTTACGCGAAACAAAGGAGGGGAAG
TTAGAAGTATTTTTTGGGCCTAAACAAGGTGTGCTTCTAGTTGAGGCTTGTTCAGAGATG
ACGATACTAAATCTTGGTGATTTAACAGTCCCAAATCCTGCATGGAAAAACTTGGTTTAC
ACATTCCCAAATGAAGAACAATATAAAGTTATTGATATGCCATTGCTAATAGCACAAGTA
ACACGTTTTAGCTGTGGTGGATTTAGTCTTGGTTTGAGAGTTTGTCATTGTCTTTGTGAC
GGGGTTGGAGCAATGCAATTCCTAAGTGCATGGGCTTCAACCGCGAGTTTGAACAAATTG
ACAGTCAATCCCAAACCATGTTGGGATCGAGAGACACTTATCCCTAATGATCCGCCATTG
ATTCAATACCCACACATAGAATTCAAAAGAATAGATGATGCATTTAGTTTCATGAGGAGA
CTTTGTTTAGTCAAGCCTGTTCAAAAATGTTATCGTGTTACTCGAGACTTCCAAGCTCAT
TTGAAGACCTTAGTTGGTCCTAACATTTCATGTACCACCTTTGATGCAATGGCAGCTCAT
GTGTGGAGGTCATGGGTCAAGGCACTGATCAATGTTAGCCCTCTCGATTACGAGCTAAGG
CTAACATTTTCAGTAAATTGTAGATCTAGACTTACAAATCCACCACTCAAATCAGGTTTC
TATGGGAATGCAGTATCTGTGGCATGTGCTACTAGTAATGTCTCGGGAATCGTTAATGGA
CCTATCTCTGATACCATATGTTTGGTACGTAATGCAAGGCTTTCGGTCTCTGAGGCATAT
TTGAGGTCAACTATTGATTATATCCAAGTTAATAGGCCTACAAAGCTAGAATTTGGTGGT
AAACTTACTATAACCCAATGGACTAGATTTTCAATGTATGAATCTGCTGATTTTGGTTGG
GGAAAGCCCATTTATGCTGGCCCAATTGATCTCACACCAACACCACAAGTTTGTGTTTTT
TTGCCACAAGATGATTCTGATGGAGCTATGCTTGTTTGCATTTGTTTGCCAGAGGATGCT
TCACATAGATTTACTGACATTTTCTGCCTCTTAAATTAA

Peptide Sequence

PEP ID

PGSC0003DMP400060560
PEP Infomation

pacid=37469818 transcript=PGSC0003DMT400088885 locus=PGSC0003DMG400038456 ID=PGSC0003DMT400088885.v4.03 annot-version=v4.03
Sequence

MTPMVQELNFPQLQIPLTINSISPILPSSPIPPSYGDTLYLSNLDDMIGSRVFTPTMYFY
RSNGKMDVMTIINVLKESLASVLVPYYPFSGRLRETKEGKLEVFFGPKQGVLLVEACSEM
TILNLGDLTVPNPAWKNLVYTFPNEEQYKVIDMPLLIAQVTRFSCGGFSLGLRVCHCLCD
GVGAMQFLSAWASTASLNKLTVNPKPCWDRETLIPNDPPLIQYPHIEFKRIDDAFSFMRR
LCLVKPVQKCYRVTRDFQAHLKTLVGPNISCTTFDAMAAHVWRSWVKALINVSPLDYELR
LTFSVNCRSRLTNPPLKSGFYGNAVSVACATSNVSGIVNGPISDTICLVRNARLSVSEAY
LRSTIDYIQVNRPTKLEFGGKLTITQWTRFSMYESADFGWGKPIYAGPIDLTPTPQVCVF
LPQDDSDGAMLVCICLPEDASHRFTDIFCLLN*

Transcript Sequence

Transcript ID

PGSC0003DMT400088885
Transcript Infomation

pacid=37469818 locus=PGSC0003DMG400038456 ID=PGSC0003DMT400088885.v4.03 annot-version=v4.03
Sequence

ATGACTCCCATGGTACAAGAACTTAATTTTCCTCAACTTCAAATACCTCTAACCATCAAT
TCAATTTCTCCAATCTTACCATCAAGTCCCATCCCTCCATCCTATGGTGACACCCTTTAC
CTCTCAAATCTTGATGATATGATTGGATCTCGCGTTTTTACTCCAACCATGTATTTCTAT
CGATCCAATGGGAAAATGGATGTGATGACAATCATCAATGTGTTAAAAGAATCTCTTGCA
AGTGTATTGGTACCATACTATCCTTTCTCAGGTAGGTTACGCGAAACAAAGGAGGGGAAG
TTAGAAGTATTTTTTGGGCCTAAACAAGGTGTGCTTCTAGTTGAGGCTTGTTCAGAGATG
ACGATACTAAATCTTGGTGATTTAACAGTCCCAAATCCTGCATGGAAAAACTTGGTTTAC
ACATTCCCAAATGAAGAACAATATAAAGTTATTGATATGCCATTGCTAATAGCACAAGTA
ACACGTTTTAGCTGTGGTGGATTTAGTCTTGGTTTGAGAGTTTGTCATTGTCTTTGTGAC
GGGGTTGGAGCAATGCAATTCCTAAGTGCATGGGCTTCAACCGCGAGTTTGAACAAATTG
ACAGTCAATCCCAAACCATGTTGGGATCGAGAGACACTTATCCCTAATGATCCGCCATTG
ATTCAATACCCACACATAGAATTCAAAAGAATAGATGATGCATTTAGTTTCATGAGGAGA
CTTTGTTTAGTCAAGCCTGTTCAAAAATGTTATCGTGTTACTCGAGACTTCCAAGCTCAT
TTGAAGACCTTAGTTGGTCCTAACATTTCATGTACCACCTTTGATGCAATGGCAGCTCAT
GTGTGGAGGTCATGGGTCAAGGCACTGATCAATGTTAGCCCTCTCGATTACGAGCTAAGG
CTAACATTTTCAGTAAATTGTAGATCTAGACTTACAAATCCACCACTCAAATCAGGTTTC
TATGGGAATGCAGTATCTGTGGCATGTGCTACTAGTAATGTCTCGGGAATCGTTAATGGA
CCTATCTCTGATACCATATGTTTGGTACGTAATGCAAGGCTTTCGGTCTCTGAGGCATAT
TTGAGGTCAACTATTGATTATATCCAAGTTAATAGGCCTACAAAGCTAGAATTTGGTGGT
AAACTTACTATAACCCAATGGACTAGATTTTCAATGTATGAATCTGCTGATTTTGGTTGG
GGAAAGCCCATTTATGCTGGCCCAATTGATCTCACACCAACACCACAAGTTTGTGTTTTT
TTGCCACAAGATGATTCTGATGGAGCTATGCTTGTTTGCATTTGTTTGCCAGAGGATGCT
TCACATAGATTTACTGACATTTTCTGCCTCTTAAATTAA