Gene sequences

How To ▶︎

JA

EN

TOP > About the Species(Solanum tuberosum ) > genome data >Gene sequences

Search

By Traits

Let’s Analyze!!

SNP Detection
(lang=JA only)

Other Tools

Data List

All

Trait-Related Loci

Solanum tuberosum

CDS Sequence

CDS ID	PGSC0003DMT400087761
CDS Infomation	pacid=37473490 polypeptide=PGSC0003DMP400059436 locus=PGSC0003DMG400037332 ID=PGSC0003DMT400087761.v4.03 annot-version=v4.03
Sequence	ATGAGCTTTACCTCCAAAACCCAACAACTCATAGCTCTTCTCAGTTTTTGTTCTTCTCTG AAACATGTTTTCCAAATTCATACTCAAATCATAATCTCAGGACTATCTCAACAAAATTGC ATCCTCCTCAAAATTGTCAACTTTTTTGCTTCTCATACTCCCATAAACTCATCTTCTTAC GCCGGTCTTCTCATCAAACAATCGCAAAATTCGTCTAATTCATGGTGGAATATCCTCATT AGGAATTATGCTACAGGTGAATACTGTTCACATAGTGAAGCCATTCGGTTTTTTGTTGAA ATGCGGCGTTCTGGAGCTGCTTCTGATGAATTCACATACCCTTTTCTCTTCAAGGCTTGT TCGTCTTTTTTGGGTTTGAAAGAAGGGAAACAGATTCATTGTGATGTCATCAAGATGGGT ATTTGTAACAATGTGTATGTACAGAACACTTTGATTCATTTTTATGGGTCTTGCAAGAAG ATTGTGGATGCATACAAGGTGTTTGATGTAATGTCGCTTAGAACTGTTGTTACTTGGAAT TCGATAATTTCGGCTTGTGTGGGAAGCTGTTGGTATTATGATGCGATTGAAATTTTTCGT TTGATGAGAAAATGTGGGGTTCAACCGGACGAGACAACTATGGTGATTTTGCTTTCTGCT TGTGCTGAGTTGGGTGACTTGATTTTAGGGAAATGGATTCATTGTCAAGTGATTGAGCAA GGCATGTATGTGAATTGTCAATTGGGAACTTCCCTTATTGACATGTATGCTAAATGTGGA GCAGTGGATTATGCTCGTTTGATCTTCGATAGGATTGGTGAAAGAAATGTGTGGACATGG AGTGCGATGATTCTTGGATTAGCTCAGCATGGATTTGCTGCACAAGCCTTGGAACTCTTT TCGAAAATGAAGGATTGTTCTGTGAAGCCTAATTATGTGTCCTTTCTTGGTGTGCTTTGT GCTTGTAGCCATGTTGGGATGGTAGAAGAAGGGCATCGTTTGTTTCAAGGGATGGAAAGT CTCCATAGCATCAAGCCTATGATGGCACATTATGGTGCCATGGTAGATATCTTGAGTCGT GCTGGACGTCTGGATGAAGCATACAAATTCATAGTTGACATGCCCATTGAGGCTGATGCA GTCATATGGAGGACTTTGCTCAGTGCATGCCACATTCATGATATTAGCGACTATACTGGA GTGGGAGAGAAGGTCAGAAAGAGGTTGCTTGGATTGGAGCCTAAAAGGAATGGGAATTTG GTCATGGTAGCAAATAAGTATGCTGAAACTGGATTATGGGAGAAAGCAGCAAAATTGAGA AGAGGTATGAAAGAGAGACGACTTAAGAAGACCGCTGGAGAAAGCTGTGTATCAGTTTTT CAGAATCGATAG

Peptide Sequence

PEP ID	PGSC0003DMP400059436
PEP Infomation	pacid=37473490 transcript=PGSC0003DMT400087761 locus=PGSC0003DMG400037332 ID=PGSC0003DMT400087761.v4.03 annot-version=v4.03
Sequence	MSFTSKTQQLIALLSFCSSLKHVFQIHTQIIISGLSQQNCILLKIVNFFASHTPINSSSY AGLLIKQSQNSSNSWWNILIRNYATGEYCSHSEAIRFFVEMRRSGAASDEFTYPFLFKAC SSFLGLKEGKQIHCDVIKMGICNNVYVQNTLIHFYGSCKKIVDAYKVFDVMSLRTVVTWN SIISACVGSCWYYDAIEIFRLMRKCGVQPDETTMVILLSACAELGDLILGKWIHCQVIEQ GMYVNCQLGTSLIDMYAKCGAVDYARLIFDRIGERNVWTWSAMILGLAQHGFAAQALELF SKMKDCSVKPNYVSFLGVLCACSHVGMVEEGHRLFQGMESLHSIKPMMAHYGAMVDILSR AGRLDEAYKFIVDMPIEADAVIWRTLLSACHIHDISDYTGVGEKVRKRLLGLEPKRNGNL VMVANKYAETGLWEKAAKLRRGMKERRLKKTAGESCVSVFQNR*

Transcript Sequence

Transcript ID	PGSC0003DMT400087761
Transcript Infomation	pacid=37473490 locus=PGSC0003DMG400037332 ID=PGSC0003DMT400087761.v4.03 annot-version=v4.03
Sequence	ATGAGCTTTACCTCCAAAACCCAACAACTCATAGCTCTTCTCAGTTTTTGTTCTTCTCTG AAACATGTTTTCCAAATTCATACTCAAATCATAATCTCAGGACTATCTCAACAAAATTGC ATCCTCCTCAAAATTGTCAACTTTTTTGCTTCTCATACTCCCATAAACTCATCTTCTTAC GCCGGTCTTCTCATCAAACAATCGCAAAATTCGTCTAATTCATGGTGGAATATCCTCATT AGGAATTATGCTACAGGTGAATACTGTTCACATAGTGAAGCCATTCGGTTTTTTGTTGAA ATGCGGCGTTCTGGAGCTGCTTCTGATGAATTCACATACCCTTTTCTCTTCAAGGCTTGT TCGTCTTTTTTGGGTTTGAAAGAAGGGAAACAGATTCATTGTGATGTCATCAAGATGGGT ATTTGTAACAATGTGTATGTACAGAACACTTTGATTCATTTTTATGGGTCTTGCAAGAAG ATTGTGGATGCATACAAGGTGTTTGATGTAATGTCGCTTAGAACTGTTGTTACTTGGAAT TCGATAATTTCGGCTTGTGTGGGAAGCTGTTGGTATTATGATGCGATTGAAATTTTTCGT TTGATGAGAAAATGTGGGGTTCAACCGGACGAGACAACTATGGTGATTTTGCTTTCTGCT TGTGCTGAGTTGGGTGACTTGATTTTAGGGAAATGGATTCATTGTCAAGTGATTGAGCAA GGCATGTATGTGAATTGTCAATTGGGAACTTCCCTTATTGACATGTATGCTAAATGTGGA GCAGTGGATTATGCTCGTTTGATCTTCGATAGGATTGGTGAAAGAAATGTGTGGACATGG AGTGCGATGATTCTTGGATTAGCTCAGCATGGATTTGCTGCACAAGCCTTGGAACTCTTT TCGAAAATGAAGGATTGTTCTGTGAAGCCTAATTATGTGTCCTTTCTTGGTGTGCTTTGT GCTTGTAGCCATGTTGGGATGGTAGAAGAAGGGCATCGTTTGTTTCAAGGGATGGAAAGT CTCCATAGCATCAAGCCTATGATGGCACATTATGGTGCCATGGTAGATATCTTGAGTCGT GCTGGACGTCTGGATGAAGCATACAAATTCATAGTTGACATGCCCATTGAGGCTGATGCA GTCATATGGAGGACTTTGCTCAGTGCATGCCACATTCATGATATTAGCGACTATACTGGA GTGGGAGAGAAGGTCAGAAAGAGGTTGCTTGGATTGGAGCCTAAAAGGAATGGGAATTTG GTCATGGTAGCAAATAAGTATGCTGAAACTGGATTATGGGAGAAAGCAGCAAAATTGAGA AGAGGTATGAAAGAGAGACGACTTAAGAAGACCGCTGGAGAAAGCTGTGTATCAGTTTTT CAGAATCGATAG